More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_5217 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011988  Avi_5217  flavoprotein oxidoreductase  100 
 
 
149 aa  311  1.9999999999999998e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4843  flavin reductase domain protein FMN-binding  40.69 
 
 
180 aa  122  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1819  flavin reductase domain-containing protein  40.41 
 
 
175 aa  122  2e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.988242  hitchhiker  0.00551903 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3210  flavin reductase domain protein FMN-binding  42.57 
 
 
184 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2278  flavin reductase domain-containing protein  36.84 
 
 
170 aa  119  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.663724 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00765  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  41.73 
 
 
176 aa  117  4.9999999999999996e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0903  flavin reductase-like, FMN-binding  38.06 
 
 
171 aa  117  6e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.426778  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0995  flavin reductase-like  41.26 
 
 
178 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3898  flavin reductase-like, FMN-binding  41.78 
 
 
176 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.69994 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0635  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase subunit  39.04 
 
 
171 aa  115  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.543019  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1153  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  41.22 
 
 
180 aa  115  3e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1830  flavin reductase domain-containing protein  40.43 
 
 
167 aa  115  3e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0710863  normal  0.62797 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3021  flavin reductase domain-containing protein  40.41 
 
 
172 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0740785  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3246  flavin reductase domain protein FMN-binding  40.41 
 
 
172 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.376116 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1244  putative flavin reductase rutF  38.51 
 
 
164 aa  112  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4430  flavin reductase domain protein FMN-binding  43.97 
 
 
170 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01010  predicted oxidoreductase, flavin:NADH component  38.51 
 
 
164 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2635  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  38.51 
 
 
164 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2118  putative flavin reductase rutF  38.51 
 
 
164 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1125  putative flavin reductase rutF  38.51 
 
 
164 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01017  hypothetical protein  38.51 
 
 
164 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2588  flavin reductase domain-containing protein  38.51 
 
 
164 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0976378 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1122  putative flavin reductase rutF  38.51 
 
 
164 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0847  flavin reductase protein  37.66 
 
 
171 aa  111  3e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.543841 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1225  flavin:NADH reductase  38.85 
 
 
147 aa  110  6e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00730125  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1520  flavin reductase domain-containing protein  37.84 
 
 
164 aa  110  7.000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.377691 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1006  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase small chain  36.49 
 
 
170 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10990  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase small chain  35.81 
 
 
170 aa  108  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.699106  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1289  flavin reductase-like, FMN-binding  39.01 
 
 
164 aa  107  4.0000000000000004e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.100023  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2148  flavin reductase domain protein FMN-binding  40.29 
 
 
181 aa  107  5e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1292  monooxygenase, putative  37.93 
 
 
173 aa  107  6e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1079  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.3 
 
 
202 aa  107  6e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.155431  normal  0.0275132 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1057  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase component  38.36 
 
 
170 aa  107  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1173  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase component  38.36 
 
 
170 aa  107  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1162  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase component  38.36 
 
 
170 aa  107  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.444908  normal  0.733145 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0697  flavin reductase-like, FMN-binding  36.24 
 
 
174 aa  107  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.318628  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1255  putative monooxygenase  37.93 
 
 
210 aa  106  1e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.218566  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1734  flavin reductase domain-containing protein  37.84 
 
 
202 aa  105  1e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.521212  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1193  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase component  37.67 
 
 
170 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1893  flavin reductase domain-containing protein  36.55 
 
 
196 aa  105  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1208  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase component  37.67 
 
 
170 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2464  flavin reductase-like, FMN-binding  38.3 
 
 
170 aa  105  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2213  flavin reductase domain-containing protein  38.73 
 
 
165 aa  105  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2053  flavin reductase domain protein FMN-binding  37.84 
 
 
201 aa  105  3e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.490233  normal  0.271048 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0316  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase component  36.67 
 
 
180 aa  103  7e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00660064  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7128  flavoprotein oxidoreductase  40 
 
 
167 aa  103  9e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6111  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.25 
 
 
374 aa  102  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.575038  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2488  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  38.13 
 
 
181 aa  102  1e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2167  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase subunit  37.33 
 
 
179 aa  102  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2452  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase subunit  36.3 
 
 
165 aa  102  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1639  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase component  36.3 
 
 
165 aa  102  2e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2356  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase component  36.3 
 
 
165 aa  102  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5028  flavin reductase domain protein FMN-binding  37.14 
 
 
181 aa  102  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.296353  normal  0.178556 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04221  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase component  33.56 
 
 
170 aa  101  3e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04187  hypothetical protein  33.56 
 
 
170 aa  101  3e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4881  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase component  33.56 
 
 
170 aa  101  3e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4575  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase component  33.56 
 
 
170 aa  101  3e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3711  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase subunit  33.56 
 
 
170 aa  101  3e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.390593  normal  0.865335 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3755  flavin reductase-like, FMN-binding  37.68 
 
 
154 aa  101  4e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0712  flavin reductase-like, FMN-binding  36.73 
 
 
169 aa  100  7e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.195047  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0855  flavin reductase family protein  37.16 
 
 
169 aa  100  7e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0181581  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5345  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase subunit  34.67 
 
 
181 aa  99.8  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0297424  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0903  flavin reductase-like, FMN-binding  37.59 
 
 
183 aa  98.6  3e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000520403  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3806  flavin reductase domain-containing protein  36.99 
 
 
171 aa  97.4  5e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15070  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, small subunit  39.19 
 
 
183 aa  97.4  6e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0341961  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3609  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase subunit  34 
 
 
181 aa  97.1  7e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.537664  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1544  flavin reductase-like, FMN-binding  35.51 
 
 
174 aa  97.1  8e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.917406  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2506  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase component  33.33 
 
 
216 aa  96.7  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.64515  normal  0.945303 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3515  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase subunit  34 
 
 
181 aa  96.7  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.440753  normal  0.0189937 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2575  flavin reductase domain-containing protein  36.62 
 
 
169 aa  95.5  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2080  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.62 
 
 
175 aa  95.5  2e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6112  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase subunit  34.46 
 
 
186 aa  94  6e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.980333  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1415  flavin reductase-like, FMN-binding  35.71 
 
 
172 aa  93.2  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0331151  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3911  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase subunit  33.33 
 
 
181 aa  92.8  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.888906 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2309  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase coupling protein  33.78 
 
 
183 aa  92.8  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0320999  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2059  flavin reductase-like, FMN-binding  36.76 
 
 
170 aa  92  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000000136887  normal  0.155549 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4906  flavin reductase-like, FMN-binding  34.75 
 
 
193 aa  92  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6513  flavin reductase domain-containing protein  34.75 
 
 
168 aa  92.4  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.226456  normal  0.292834 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3257  flavin reductase domain-containing protein  34.75 
 
 
193 aa  92  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.347082 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1180  flavin reductase-like, FMN-binding  34.9 
 
 
165 aa  92  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.669714  normal  0.14091 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1486  flavin reductase domain-containing protein  35.37 
 
 
166 aa  91.3  4e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0134699 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5076  flavin reductase domain-containing protein  35.76 
 
 
175 aa  90.5  7e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.848453  normal  0.150836 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1955  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.25 
 
 
204 aa  90.5  7e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.925053  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0934  flavin reductase domain-containing protein  37.59 
 
 
186 aa  90.1  9e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.351151  normal  0.609948 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2385  flavin reductase-like, FMN-binding  34.56 
 
 
162 aa  90.1  9e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.289949  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4109  flavin reductase domain-containing protein  35.25 
 
 
162 aa  90.1  9e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1584  flavin reductase-like, FMN-binding  33.56 
 
 
186 aa  89  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5089  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase subunit  33.33 
 
 
184 aa  88.6  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.683964 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1380  putative oxygenase  38.1 
 
 
166 aa  88.2  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.436  normal  0.571719 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2006  flavin reductase domain-containing protein  35.51 
 
 
203 aa  87.8  5e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2880  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.59 
 
 
189 aa  87.4  5e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5770  flavin reductase-like, FMN-binding  35.11 
 
 
183 aa  87.4  6e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1316  flavin reductase domain-containing protein  35.51 
 
 
226 aa  87.4  6e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2295  flavin reductase domain-containing protein  35.51 
 
 
226 aa  87.4  6e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1029  flavin reductase domain-containing protein  35.51 
 
 
226 aa  87.4  6e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.736467  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3059  flavin reductase domain-containing protein  35.51 
 
 
228 aa  87  8e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2625  flavin reductase domain-containing protein  37.23 
 
 
175 aa  86.7  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2298  flavin reductase domain-containing protein  33.33 
 
 
226 aa  86.3  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3186  flavin reductase domain-containing protein  35.51 
 
 
226 aa  86.7  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.528706  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0890  flavin reductase-like, FMN-binding  37.68 
 
 
408 aa  85.9  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>