More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0697 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007778  RPB_0697  flavin reductase-like, FMN-binding  100 
 
 
174 aa  353  7.999999999999999e-97  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.318628  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3898  flavin reductase-like, FMN-binding  40.91 
 
 
176 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.69994 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1830  flavin reductase domain-containing protein  36.31 
 
 
167 aa  123  2e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0710863  normal  0.62797 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1212  flavin reductase domain-containing protein  37.89 
 
 
185 aa  123  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2213  flavin reductase domain-containing protein  36.67 
 
 
165 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2278  flavin reductase domain-containing protein  38.18 
 
 
170 aa  119  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.663724 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5076  flavin reductase domain-containing protein  39.22 
 
 
175 aa  117  6e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.848453  normal  0.150836 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1003  flavin reductase-like, FMN-binding  39.33 
 
 
173 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5028  flavin reductase domain protein FMN-binding  38.06 
 
 
181 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.296353  normal  0.178556 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0316  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase component  41.72 
 
 
180 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00660064  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1380  putative oxygenase  36.84 
 
 
166 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.436  normal  0.571719 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1106  flavin reductase-like, FMN-binding  41.18 
 
 
173 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.321657  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4599  flavin reductase domain-containing protein  36.65 
 
 
191 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0843412  normal  0.0587176 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5345  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase subunit  40 
 
 
181 aa  112  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0297424  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0903  flavin reductase-like, FMN-binding  37.11 
 
 
171 aa  112  4.0000000000000004e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.426778  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3609  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase subunit  40 
 
 
181 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.537664  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2053  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.48 
 
 
201 aa  111  5e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.490233  normal  0.271048 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2880  flavin reductase domain protein FMN-binding  39.61 
 
 
189 aa  111  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2506  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase component  39.33 
 
 
216 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.64515  normal  0.945303 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0712  flavin reductase-like, FMN-binding  34.81 
 
 
169 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.195047  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5060  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.98 
 
 
190 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.533074  normal  0.376116 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3210  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.54 
 
 
184 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1079  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.58 
 
 
202 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.155431  normal  0.0275132 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3957  flavoprotein oxidoreductase  38.51 
 
 
175 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2167  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase subunit  38.41 
 
 
179 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3515  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase subunit  39.33 
 
 
181 aa  108  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.440753  normal  0.0189937 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15070  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, small subunit  38.18 
 
 
183 aa  108  4.0000000000000004e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0341961  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0847  flavin reductase protein  37.11 
 
 
171 aa  108  5e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.543841 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00765  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  32.69 
 
 
176 aa  108  5e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3911  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase subunit  39.33 
 
 
181 aa  108  5e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.888906 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0903  flavin reductase-like, FMN-binding  38.75 
 
 
183 aa  107  6e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000520403  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5217  flavoprotein oxidoreductase  36.24 
 
 
149 aa  107  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5770  flavin reductase-like, FMN-binding  36.08 
 
 
183 aa  105  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0995  flavin reductase-like  35.88 
 
 
178 aa  105  4e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7128  flavoprotein oxidoreductase  36.54 
 
 
167 aa  104  5e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1734  flavin reductase domain-containing protein  36.18 
 
 
202 aa  104  5e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.521212  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0934  flavin reductase domain-containing protein  37.72 
 
 
186 aa  104  5e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.351151  normal  0.609948 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5089  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase subunit  37.33 
 
 
184 aa  103  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.683964 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1520  flavin reductase domain-containing protein  35.71 
 
 
164 aa  103  1e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.377691 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2464  flavin reductase-like, FMN-binding  33.77 
 
 
170 aa  103  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0945  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  40.13 
 
 
170 aa  102  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.930099  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1153  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  33.53 
 
 
180 aa  102  3e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6111  flavin reductase domain protein FMN-binding  38.89 
 
 
374 aa  102  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.575038  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4322  flavin reductase domain-containing protein  32.7 
 
 
156 aa  102  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.495347 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1955  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.37 
 
 
204 aa  102  3e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.925053  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1225  flavin:NADH reductase  37.16 
 
 
147 aa  102  3e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00730125  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1819  flavin reductase domain-containing protein  33.33 
 
 
175 aa  102  4e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.988242  hitchhiker  0.00551903 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3021  flavin reductase domain-containing protein  35.15 
 
 
172 aa  101  5e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0740785  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3246  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.15 
 
 
172 aa  101  5e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.376116 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1006  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase small chain  36.6 
 
 
170 aa  101  5e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2309  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase coupling protein  34.64 
 
 
183 aa  101  5e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0320999  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1858  GntR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
393 aa  101  5e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000920069  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10990  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase small chain  35.95 
 
 
170 aa  101  7e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.699106  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4187  flavin reductase domain-containing protein  32.08 
 
 
156 aa  100  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.344162  hitchhiker  0.00000247222 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1289  flavin reductase-like, FMN-binding  31.65 
 
 
164 aa  99.4  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.100023  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2385  flavin reductase-like, FMN-binding  32.7 
 
 
162 aa  99.8  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.289949  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4843  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.14 
 
 
180 aa  99  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0635  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase subunit  33.77 
 
 
171 aa  98.6  3e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.543019  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0855  flavin reductase family protein  31.68 
 
 
169 aa  98.6  4e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0181581  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6112  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase subunit  33.33 
 
 
186 aa  97.8  7e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.980333  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4430  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.31 
 
 
170 aa  97.4  9e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4906  flavin reductase-like, FMN-binding  32.68 
 
 
193 aa  97.1  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3257  flavin reductase domain-containing protein  32.68 
 
 
193 aa  97.1  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.347082 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1244  putative flavin reductase rutF  32.28 
 
 
164 aa  96.3  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01010  predicted oxidoreductase, flavin:NADH component  32.28 
 
 
164 aa  95.1  4e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1122  putative flavin reductase rutF  32.28 
 
 
164 aa  95.1  4e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2118  putative flavin reductase rutF  32.28 
 
 
164 aa  95.1  4e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01017  hypothetical protein  32.28 
 
 
164 aa  95.1  4e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2588  flavin reductase domain-containing protein  32.28 
 
 
164 aa  95.1  4e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0976378 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1125  putative flavin reductase rutF  32.28 
 
 
164 aa  95.1  4e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6513  flavin reductase domain-containing protein  32.03 
 
 
168 aa  95.1  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.226456  normal  0.292834 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4109  flavin reductase domain-containing protein  36.24 
 
 
162 aa  95.1  5e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0252  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  32.73 
 
 
177 aa  94.4  7e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2635  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  32.28 
 
 
164 aa  94.4  8e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5477  hypothetical protein  29.75 
 
 
182 aa  93.6  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1893  flavin reductase domain-containing protein  33.54 
 
 
196 aa  94  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0349  flavin reductase domain-containing protein  29.49 
 
 
160 aa  93.6  1e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2575  flavin reductase domain-containing protein  33.12 
 
 
169 aa  93.6  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1584  flavin reductase-like, FMN-binding  30.38 
 
 
186 aa  93.2  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0950  putative flavoprotein reductase  35.93 
 
 
177 aa  92.8  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3189  flavin reductase domain-containing protein  33.97 
 
 
172 aa  92.4  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1292  monooxygenase, putative  31.01 
 
 
173 aa  92  4e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2124  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  30.77 
 
 
184 aa  92  4e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.159244  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1415  flavin reductase-like, FMN-binding  36.3 
 
 
172 aa  91.3  5e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0331151  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1255  putative monooxygenase  31.01 
 
 
210 aa  91.7  5e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.218566  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2517  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  34.16 
 
 
174 aa  91.3  6e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.118991  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2059  flavin reductase-like, FMN-binding  32.26 
 
 
170 aa  91.3  6e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000000136887  normal  0.155549 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6441  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.54 
 
 
179 aa  91.3  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0182942 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4570  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.23 
 
 
259 aa  90.9  9e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.880752 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1486  flavin reductase domain-containing protein  30.72 
 
 
166 aa  89.7  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0134699 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1909  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.48 
 
 
160 aa  89.7  2e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2123  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.01 
 
 
164 aa  89.4  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00527978 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1705  flavin reductase domain-containing protein  33.73 
 
 
170 aa  89.4  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.190876 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1916  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.38 
 
 
164 aa  89  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3755  flavin reductase-like, FMN-binding  33.77 
 
 
154 aa  89  3e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0686  flavin reductase-like, FMN-binding  32.9 
 
 
193 aa  88.6  4e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.520782  normal  0.880219 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4641  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.3 
 
 
179 aa  88.2  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3091  flavin reductase domain-containing protein  30.77 
 
 
169 aa  87.8  6e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2488  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  31.58 
 
 
181 aa  88.2  6e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2148  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.92 
 
 
181 aa  87.8  6e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>