More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3898 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007778  RPB_3898  flavin reductase-like, FMN-binding  100 
 
 
176 aa  362  2e-99  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.69994 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1819  flavin reductase domain-containing protein  56.88 
 
 
175 aa  194  7e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.988242  hitchhiker  0.00551903 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4843  flavin reductase domain protein FMN-binding  56.02 
 
 
180 aa  185  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5028  flavin reductase domain protein FMN-binding  57.42 
 
 
181 aa  186  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.296353  normal  0.178556 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2213  flavin reductase domain-containing protein  53.7 
 
 
165 aa  185  4e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2053  flavin reductase domain protein FMN-binding  54.94 
 
 
201 aa  180  8.000000000000001e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.490233  normal  0.271048 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2635  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  55.41 
 
 
164 aa  179  1e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01010  predicted oxidoreductase, flavin:NADH component  55.41 
 
 
164 aa  179  2e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01017  hypothetical protein  55.41 
 
 
164 aa  179  2e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1125  putative flavin reductase rutF  55.41 
 
 
164 aa  179  2e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2588  flavin reductase domain-containing protein  55.41 
 
 
164 aa  179  2e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0976378 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1122  putative flavin reductase rutF  55.41 
 
 
164 aa  179  2e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2118  putative flavin reductase rutF  55.41 
 
 
164 aa  179  2e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1244  putative flavin reductase rutF  55.41 
 
 
164 aa  178  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1734  flavin reductase domain-containing protein  55.26 
 
 
202 aa  176  1e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.521212  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1830  flavin reductase domain-containing protein  54 
 
 
167 aa  174  4e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0710863  normal  0.62797 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6513  flavin reductase domain-containing protein  51.79 
 
 
168 aa  175  4e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.226456  normal  0.292834 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2148  flavin reductase domain protein FMN-binding  53.42 
 
 
181 aa  174  5e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0712  flavin reductase-like, FMN-binding  50.92 
 
 
169 aa  174  5e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.195047  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1180  flavin reductase-like, FMN-binding  54.55 
 
 
165 aa  173  9.999999999999999e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.669714  normal  0.14091 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4906  flavin reductase-like, FMN-binding  52.1 
 
 
193 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3257  flavin reductase domain-containing protein  52.1 
 
 
193 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.347082 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1520  flavin reductase domain-containing protein  51.9 
 
 
164 aa  172  2.9999999999999996e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.377691 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0903  flavin reductase-like, FMN-binding  51.52 
 
 
171 aa  171  3.9999999999999995e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.426778  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2488  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  50.92 
 
 
181 aa  169  1e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2278  flavin reductase domain-containing protein  52.8 
 
 
170 aa  169  2e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.663724 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0995  flavin reductase-like  51.59 
 
 
178 aa  166  1e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0847  flavin reductase protein  49.7 
 
 
171 aa  166  1e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.543841 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1153  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  50.62 
 
 
180 aa  162  3e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1079  flavin reductase domain protein FMN-binding  51.23 
 
 
202 aa  162  3e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.155431  normal  0.0275132 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1955  flavin reductase domain protein FMN-binding  47.37 
 
 
204 aa  160  7e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.925053  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6112  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase subunit  49.12 
 
 
186 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.980333  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3246  flavin reductase domain protein FMN-binding  49.68 
 
 
172 aa  154  8e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.376116 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3021  flavin reductase domain-containing protein  49.68 
 
 
172 aa  154  8e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0740785  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00765  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  45.18 
 
 
176 aa  153  1e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10990  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase small chain  48.73 
 
 
170 aa  151  4e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.699106  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2080  flavin reductase domain protein FMN-binding  48.37 
 
 
175 aa  151  5e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2309  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase coupling protein  48.21 
 
 
183 aa  150  8.999999999999999e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0320999  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1006  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase small chain  49.06 
 
 
170 aa  149  1e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0316  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase component  49.68 
 
 
180 aa  149  2e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00660064  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5076  flavin reductase domain-containing protein  50.32 
 
 
175 aa  149  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.848453  normal  0.150836 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2167  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase subunit  48.08 
 
 
179 aa  148  4e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3911  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase subunit  47.2 
 
 
181 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.888906 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3515  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase subunit  47.83 
 
 
181 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.440753  normal  0.0189937 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0855  flavin reductase family protein  44.65 
 
 
169 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0181581  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3609  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase subunit  47.2 
 
 
181 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.537664  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5345  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase subunit  47.2 
 
 
181 aa  144  6e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0297424  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2356  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase component  48.34 
 
 
165 aa  144  8.000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1639  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase component  48.34 
 
 
165 aa  144  8.000000000000001e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2452  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase subunit  48.34 
 
 
165 aa  144  8.000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0635  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase subunit  47.68 
 
 
171 aa  142  2e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.543019  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1292  monooxygenase, putative  44.03 
 
 
173 aa  142  3e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2506  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase component  45.96 
 
 
216 aa  141  4e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.64515  normal  0.945303 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1225  flavin:NADH reductase  43.92 
 
 
147 aa  140  7e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00730125  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3806  flavin reductase domain-containing protein  46.78 
 
 
171 aa  139  9.999999999999999e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3210  flavin reductase domain protein FMN-binding  45.4 
 
 
184 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1255  putative monooxygenase  43.4 
 
 
210 aa  139  1.9999999999999998e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.218566  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1289  flavin reductase-like, FMN-binding  40.99 
 
 
164 aa  138  3.9999999999999997e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.100023  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2464  flavin reductase-like, FMN-binding  43.04 
 
 
170 aa  137  7e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1584  flavin reductase-like, FMN-binding  43.27 
 
 
186 aa  137  8.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5089  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase subunit  45.34 
 
 
184 aa  136  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.683964 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1893  flavin reductase domain-containing protein  42.77 
 
 
196 aa  136  1e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04221  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase component  44.52 
 
 
170 aa  134  8e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3711  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase subunit  44.52 
 
 
170 aa  134  8e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.390593  normal  0.865335 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4881  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase component  44.52 
 
 
170 aa  134  8e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04187  hypothetical protein  44.52 
 
 
170 aa  134  8e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4575  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase component  44.52 
 
 
170 aa  134  8e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4430  flavin reductase domain protein FMN-binding  44.85 
 
 
170 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1193  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase component  42.58 
 
 
170 aa  127  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1208  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase component  42.58 
 
 
170 aa  127  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1173  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase component  42.58 
 
 
170 aa  127  8.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1057  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase component  42.58 
 
 
170 aa  127  9.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1162  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase component  42.58 
 
 
170 aa  127  9.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.444908  normal  0.733145 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3957  flavoprotein oxidoreductase  42.26 
 
 
175 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0697  flavin reductase-like, FMN-binding  40.91 
 
 
174 aa  124  5e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.318628  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2385  flavin reductase-like, FMN-binding  38.75 
 
 
162 aa  120  8e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.289949  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2575  flavin reductase domain-containing protein  42.41 
 
 
169 aa  119  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1486  flavin reductase domain-containing protein  38.56 
 
 
166 aa  117  6e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0134699 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7128  flavoprotein oxidoreductase  35.58 
 
 
167 aa  116  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1916  flavin reductase domain protein FMN-binding  37.91 
 
 
164 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1003  flavin reductase-like, FMN-binding  34.84 
 
 
173 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2123  flavin reductase domain protein FMN-binding  37.25 
 
 
164 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00527978 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15070  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, small subunit  41.46 
 
 
183 aa  115  3e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0341961  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5217  flavoprotein oxidoreductase  41.78 
 
 
149 aa  115  3.9999999999999997e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5770  flavin reductase-like, FMN-binding  40.99 
 
 
183 aa  112  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0903  flavin reductase-like, FMN-binding  37.8 
 
 
183 aa  111  6e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000520403  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1212  flavin reductase domain-containing protein  38.31 
 
 
185 aa  108  4.0000000000000004e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2059  flavin reductase-like, FMN-binding  35.76 
 
 
170 aa  107  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000000136887  normal  0.155549 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2341  flavin reductase-like, FMN-binding  37.42 
 
 
165 aa  105  5e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.236422  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0950  putative flavoprotein reductase  41.4 
 
 
177 aa  104  5e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2423  flavoprotein oxidoreductase  35.37 
 
 
150 aa  103  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.284229  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4357  flavin reductase domain-containing protein  38.96 
 
 
186 aa  99.8  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0934  flavin reductase domain-containing protein  34.55 
 
 
186 aa  99.8  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.351151  normal  0.609948 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6111  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.99 
 
 
374 aa  99  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.575038  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4322  flavin reductase domain-containing protein  31.85 
 
 
156 aa  97.4  8e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.495347 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4109  flavin reductase domain-containing protein  33.97 
 
 
162 aa  97.4  8e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1544  flavin reductase-like, FMN-binding  31.85 
 
 
174 aa  97.4  9e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.917406  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1106  flavin reductase-like, FMN-binding  35.71 
 
 
173 aa  97.1  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.321657  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1858  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
393 aa  97.1  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000920069  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6441  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.15 
 
 
179 aa  96.7  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0182942 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>