More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_1006 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_1006  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase small chain  100 
 
 
170 aa  350  5.9999999999999994e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10990  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase small chain  92.94 
 
 
170 aa  324  3e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.699106  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0635  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase subunit  60.95 
 
 
171 aa  218  1.9999999999999999e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.543019  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04221  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase component  60.12 
 
 
170 aa  211  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3711  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase subunit  60.12 
 
 
170 aa  211  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.390593  normal  0.865335 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4575  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase component  60.12 
 
 
170 aa  211  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04187  hypothetical protein  60.12 
 
 
170 aa  211  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4881  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase component  60.12 
 
 
170 aa  211  4.9999999999999996e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2506  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase component  58.79 
 
 
216 aa  209  2e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.64515  normal  0.945303 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2167  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase subunit  60.13 
 
 
179 aa  209  2e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5089  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase subunit  60.13 
 
 
184 aa  207  4e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.683964 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5345  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase subunit  60.76 
 
 
181 aa  207  4e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0297424  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3609  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase subunit  58.79 
 
 
181 aa  208  4e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.537664  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1162  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase component  58.68 
 
 
170 aa  204  4e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.444908  normal  0.733145 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1057  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase component  58.68 
 
 
170 aa  204  4e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3515  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase subunit  60.13 
 
 
181 aa  204  4e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.440753  normal  0.0189937 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1173  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase component  58.68 
 
 
170 aa  204  5e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3911  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase subunit  58.18 
 
 
181 aa  204  5e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.888906 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1193  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase component  58.08 
 
 
170 aa  204  7e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1208  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase component  58.08 
 
 
170 aa  204  7e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1639  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase component  63.16 
 
 
165 aa  203  8e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2452  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase subunit  63.16 
 
 
165 aa  203  8e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2356  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase component  63.16 
 
 
165 aa  203  8e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0316  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase component  60 
 
 
180 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00660064  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6112  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase subunit  50.3 
 
 
186 aa  186  1e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.980333  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2309  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase coupling protein  49.38 
 
 
183 aa  181  5.0000000000000004e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0320999  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2213  flavin reductase domain-containing protein  54.09 
 
 
165 aa  171  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5076  flavin reductase domain-containing protein  48.77 
 
 
175 aa  165  2.9999999999999998e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.848453  normal  0.150836 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5028  flavin reductase domain protein FMN-binding  51.28 
 
 
181 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.296353  normal  0.178556 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1244  putative flavin reductase rutF  49.37 
 
 
164 aa  159  1e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01010  predicted oxidoreductase, flavin:NADH component  49.37 
 
 
164 aa  159  2e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2588  flavin reductase domain-containing protein  49.37 
 
 
164 aa  159  2e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0976378 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01017  hypothetical protein  49.37 
 
 
164 aa  159  2e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2118  putative flavin reductase rutF  49.37 
 
 
164 aa  159  2e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1125  putative flavin reductase rutF  49.37 
 
 
164 aa  159  2e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1122  putative flavin reductase rutF  49.37 
 
 
164 aa  159  2e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2635  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  48.73 
 
 
164 aa  157  6e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0712  flavin reductase-like, FMN-binding  47.83 
 
 
169 aa  155  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.195047  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1520  flavin reductase domain-containing protein  49.68 
 
 
164 aa  156  2e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.377691 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1819  flavin reductase domain-containing protein  45.57 
 
 
175 aa  154  6e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.988242  hitchhiker  0.00551903 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1153  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  47.44 
 
 
180 aa  154  8e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2488  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  48.1 
 
 
181 aa  151  4e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0995  flavin reductase-like  45.4 
 
 
178 aa  150  8.999999999999999e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3898  flavin reductase-like, FMN-binding  49.06 
 
 
176 aa  149  1e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.69994 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1180  flavin reductase-like, FMN-binding  47.77 
 
 
165 aa  147  5e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.669714  normal  0.14091 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4843  flavin reductase domain protein FMN-binding  47.06 
 
 
180 aa  145  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2148  flavin reductase domain protein FMN-binding  46.84 
 
 
181 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1830  flavin reductase domain-containing protein  48.43 
 
 
167 aa  144  5e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0710863  normal  0.62797 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3021  flavin reductase domain-containing protein  45.86 
 
 
172 aa  143  1e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0740785  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3246  flavin reductase domain protein FMN-binding  45.86 
 
 
172 aa  143  1e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.376116 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00765  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  39.29 
 
 
176 aa  142  2e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3210  flavin reductase domain protein FMN-binding  43.83 
 
 
184 aa  138  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2053  flavin reductase domain protein FMN-binding  45.62 
 
 
201 aa  136  1e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.490233  normal  0.271048 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1893  flavin reductase domain-containing protein  39.74 
 
 
196 aa  135  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2464  flavin reductase-like, FMN-binding  44 
 
 
170 aa  135  2e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6513  flavin reductase domain-containing protein  41.82 
 
 
168 aa  135  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.226456  normal  0.292834 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4906  flavin reductase-like, FMN-binding  42.59 
 
 
193 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3257  flavin reductase domain-containing protein  42.59 
 
 
193 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.347082 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1289  flavin reductase-like, FMN-binding  40.65 
 
 
164 aa  134  4e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.100023  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1292  monooxygenase, putative  39.1 
 
 
173 aa  133  9.999999999999999e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1734  flavin reductase domain-containing protein  44.03 
 
 
202 aa  133  9.999999999999999e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.521212  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1255  putative monooxygenase  38.85 
 
 
210 aa  132  1.9999999999999998e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.218566  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0847  flavin reductase protein  42.04 
 
 
171 aa  131  3.9999999999999996e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.543841 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2278  flavin reductase domain-containing protein  43.95 
 
 
170 aa  131  3.9999999999999996e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.663724 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1079  flavin reductase domain protein FMN-binding  45.62 
 
 
202 aa  131  5e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.155431  normal  0.0275132 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4430  flavin reductase domain protein FMN-binding  45.33 
 
 
170 aa  128  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1955  flavin reductase domain protein FMN-binding  42.31 
 
 
204 aa  128  4.0000000000000003e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.925053  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0855  flavin reductase family protein  37.42 
 
 
169 aa  127  8.000000000000001e-29  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0181581  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0903  flavin reductase-like, FMN-binding  42.04 
 
 
171 aa  127  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.426778  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2080  flavin reductase domain protein FMN-binding  39.24 
 
 
175 aa  123  1e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1486  flavin reductase domain-containing protein  38.27 
 
 
166 aa  121  4e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0134699 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1225  flavin:NADH reductase  40.27 
 
 
147 aa  119  1.9999999999999998e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00730125  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3806  flavin reductase domain-containing protein  42.68 
 
 
171 aa  114  6e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0903  flavin reductase-like, FMN-binding  41.18 
 
 
183 aa  114  6.9999999999999995e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000520403  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1584  flavin reductase-like, FMN-binding  38.46 
 
 
186 aa  112  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2880  flavin reductase domain protein FMN-binding  37.18 
 
 
189 aa  112  3e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1003  flavin reductase-like, FMN-binding  35.22 
 
 
173 aa  110  8.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5217  flavoprotein oxidoreductase  36.49 
 
 
149 aa  109  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2059  flavin reductase-like, FMN-binding  38.16 
 
 
170 aa  109  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000000136887  normal  0.155549 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15070  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, small subunit  41.18 
 
 
183 aa  107  8.000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0341961  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1916  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.33 
 
 
164 aa  105  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2423  flavoprotein oxidoreductase  35.33 
 
 
150 aa  104  6e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.284229  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0934  flavin reductase domain-containing protein  37.66 
 
 
186 aa  102  4e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.351151  normal  0.609948 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0697  flavin reductase-like, FMN-binding  36.6 
 
 
174 aa  101  5e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.318628  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2123  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.68 
 
 
164 aa  100  9e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00527978 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0945  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  37.95 
 
 
170 aa  99.8  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.930099  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2575  flavin reductase domain-containing protein  34.84 
 
 
169 aa  98.6  4e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6111  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.62 
 
 
374 aa  98.6  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.575038  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3173  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.97 
 
 
155 aa  97.4  8e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.213746  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7406  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase reductase component  33.33 
 
 
211 aa  97.4  8e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.46542  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3957  flavoprotein oxidoreductase  35.85 
 
 
175 aa  94  8e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4322  flavin reductase domain-containing protein  31.17 
 
 
156 aa  94  9e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.495347 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6241  flavin reductase domain-containing protein  33.33 
 
 
170 aa  93.6  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4109  flavin reductase domain-containing protein  34.18 
 
 
162 aa  91.3  6e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4187  flavin reductase domain-containing protein  29.63 
 
 
156 aa  90.1  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.344162  hitchhiker  0.00000247222 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5770  flavin reductase-like, FMN-binding  39.53 
 
 
183 aa  89.7  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1415  flavin reductase-like, FMN-binding  36.05 
 
 
172 aa  89.4  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0331151  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1106  flavin reductase-like, FMN-binding  33.33 
 
 
173 aa  89.7  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.321657  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1705  flavin reductase domain-containing protein  36.6 
 
 
170 aa  89.7  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.190876 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5477  hypothetical protein  35.17 
 
 
182 aa  89  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>