More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2080 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_2080  flavin reductase domain protein FMN-binding  100 
 
 
175 aa  355  1.9999999999999998e-97  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3246  flavin reductase domain protein FMN-binding  53.59 
 
 
172 aa  157  9e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.376116 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3021  flavin reductase domain-containing protein  53.59 
 
 
172 aa  157  9e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0740785  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2053  flavin reductase domain protein FMN-binding  49.68 
 
 
201 aa  156  2e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.490233  normal  0.271048 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1734  flavin reductase domain-containing protein  49.02 
 
 
202 aa  151  4e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.521212  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3898  flavin reductase-like, FMN-binding  48.37 
 
 
176 aa  151  5e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.69994 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1079  flavin reductase domain protein FMN-binding  49.04 
 
 
202 aa  149  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.155431  normal  0.0275132 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2464  flavin reductase-like, FMN-binding  44.65 
 
 
170 aa  147  7e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6513  flavin reductase domain-containing protein  44.03 
 
 
168 aa  142  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.226456  normal  0.292834 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4906  flavin reductase-like, FMN-binding  43.4 
 
 
193 aa  141  4e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3257  flavin reductase domain-containing protein  43.4 
 
 
193 aa  141  4e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.347082 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3210  flavin reductase domain protein FMN-binding  48.45 
 
 
184 aa  138  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1289  flavin reductase-like, FMN-binding  43.79 
 
 
164 aa  137  7.999999999999999e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.100023  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0855  flavin reductase family protein  42.21 
 
 
169 aa  136  2e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0181581  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1292  monooxygenase, putative  43.95 
 
 
173 aa  135  3.0000000000000003e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1255  putative monooxygenase  43.95 
 
 
210 aa  135  4e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.218566  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4843  flavin reductase domain protein FMN-binding  44.24 
 
 
180 aa  133  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1893  flavin reductase domain-containing protein  42.68 
 
 
196 aa  133  9.999999999999999e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1819  flavin reductase domain-containing protein  39.87 
 
 
175 aa  131  3.9999999999999996e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.988242  hitchhiker  0.00551903 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2213  flavin reductase domain-containing protein  41.06 
 
 
165 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1180  flavin reductase-like, FMN-binding  40.26 
 
 
165 aa  130  6e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.669714  normal  0.14091 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4430  flavin reductase domain protein FMN-binding  44.44 
 
 
170 aa  130  6.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0995  flavin reductase-like  40.52 
 
 
178 aa  129  3e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2575  flavin reductase domain-containing protein  44.3 
 
 
169 aa  128  4.0000000000000003e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1520  flavin reductase domain-containing protein  39.49 
 
 
164 aa  127  6e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.377691 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0712  flavin reductase-like, FMN-binding  39.87 
 
 
169 aa  127  8.000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.195047  normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3957  flavoprotein oxidoreductase  45.18 
 
 
175 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1486  flavin reductase domain-containing protein  40.76 
 
 
166 aa  125  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0134699 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2488  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  41.56 
 
 
181 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10990  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase small chain  39.24 
 
 
170 aa  125  3e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.699106  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2423  flavoprotein oxidoreductase  42.28 
 
 
150 aa  125  4.0000000000000003e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.284229  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1153  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  39.22 
 
 
180 aa  124  5e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2341  flavin reductase-like, FMN-binding  44.81 
 
 
165 aa  124  5e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.236422  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1006  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase small chain  39.24 
 
 
170 aa  123  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0847  flavin reductase protein  39.24 
 
 
171 aa  123  1e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.543841 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1830  flavin reductase domain-containing protein  38.22 
 
 
167 aa  123  1e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0710863  normal  0.62797 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2278  flavin reductase domain-containing protein  38.51 
 
 
170 aa  123  1e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.663724 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2635  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  38.22 
 
 
164 aa  121  4e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00765  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  39.74 
 
 
176 aa  121  4e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1244  putative flavin reductase rutF  38.22 
 
 
164 aa  122  4e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01010  predicted oxidoreductase, flavin:NADH component  38.22 
 
 
164 aa  121  5e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2118  putative flavin reductase rutF  38.22 
 
 
164 aa  121  5e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2588  flavin reductase domain-containing protein  38.22 
 
 
164 aa  121  5e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0976378 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1125  putative flavin reductase rutF  38.22 
 
 
164 aa  121  5e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01017  hypothetical protein  38.22 
 
 
164 aa  121  5e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0903  flavin reductase-like, FMN-binding  37.97 
 
 
171 aa  121  5e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.426778  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1122  putative flavin reductase rutF  38.22 
 
 
164 aa  121  5e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1955  flavin reductase domain protein FMN-binding  40.62 
 
 
204 aa  120  9.999999999999999e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.925053  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5028  flavin reductase domain protein FMN-binding  41.56 
 
 
181 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.296353  normal  0.178556 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1003  flavin reductase-like, FMN-binding  43.14 
 
 
173 aa  119  3e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2148  flavin reductase domain protein FMN-binding  40.26 
 
 
181 aa  118  3e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1212  flavin reductase domain-containing protein  41.51 
 
 
185 aa  119  3e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1225  flavin:NADH reductase  37.58 
 
 
147 aa  118  3.9999999999999996e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00730125  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0635  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase subunit  38.67 
 
 
171 aa  115  3e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.543019  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7406  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase reductase component  42.21 
 
 
211 aa  115  3e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.46542  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1584  flavin reductase-like, FMN-binding  36.88 
 
 
186 aa  115  3.9999999999999997e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2309  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase coupling protein  40.26 
 
 
183 aa  114  5e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0320999  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2123  flavin reductase domain protein FMN-binding  38.85 
 
 
164 aa  114  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00527978 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5770  flavin reductase-like, FMN-binding  43.59 
 
 
183 aa  114  6.9999999999999995e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2356  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase component  37.33 
 
 
165 aa  111  5e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1916  flavin reductase domain protein FMN-binding  39.49 
 
 
164 aa  111  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1639  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase component  37.33 
 
 
165 aa  111  5e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2452  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase subunit  37.33 
 
 
165 aa  111  5e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1208  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase component  39.07 
 
 
170 aa  110  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1193  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase component  39.07 
 
 
170 aa  110  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1162  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase component  39.07 
 
 
170 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.444908  normal  0.733145 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3911  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase subunit  39.39 
 
 
181 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.888906 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1057  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase component  39.07 
 
 
170 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6112  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase subunit  38.96 
 
 
186 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.980333  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3609  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase subunit  39.39 
 
 
181 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.537664  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04221  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase component  35.76 
 
 
170 aa  108  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4575  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase component  35.76 
 
 
170 aa  108  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3711  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase subunit  35.76 
 
 
170 aa  108  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.390593  normal  0.865335 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04187  hypothetical protein  35.76 
 
 
170 aa  108  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4881  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase component  35.76 
 
 
170 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1173  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase component  38.67 
 
 
170 aa  108  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2506  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase component  39.33 
 
 
216 aa  107  6e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.64515  normal  0.945303 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3515  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase subunit  40 
 
 
181 aa  106  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.440753  normal  0.0189937 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7128  flavoprotein oxidoreductase  35.44 
 
 
167 aa  106  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0316  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase component  38.31 
 
 
180 aa  105  3e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00660064  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2167  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase subunit  35.62 
 
 
179 aa  105  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5345  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase subunit  39.33 
 
 
181 aa  103  9e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0297424  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2385  flavin reductase-like, FMN-binding  37.24 
 
 
162 aa  102  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.289949  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1106  flavin reductase-like, FMN-binding  40.38 
 
 
173 aa  100  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.321657  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5076  flavin reductase domain-containing protein  37.91 
 
 
175 aa  99  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.848453  normal  0.150836 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15070  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, small subunit  40.65 
 
 
183 aa  97.4  8e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0341961  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5089  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase subunit  37.33 
 
 
184 aa  95.9  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.683964 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0903  flavin reductase-like, FMN-binding  34.64 
 
 
183 aa  95.9  3e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000520403  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5217  flavoprotein oxidoreductase  35.62 
 
 
149 aa  95.5  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0934  flavin reductase domain-containing protein  34.67 
 
 
186 aa  95.1  4e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.351151  normal  0.609948 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3806  flavin reductase domain-containing protein  35.95 
 
 
171 aa  94.7  7e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2880  flavin reductase domain protein FMN-binding  37.25 
 
 
189 aa  94  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2888  flavin reductase domain-containing protein  35.58 
 
 
172 aa  93.6  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000413066 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6111  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.56 
 
 
374 aa  92.8  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.575038  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6253  flavin reductase domain-containing protein  35.03 
 
 
311 aa  92  4e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.103541  normal  0.25638 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2059  flavin reductase-like, FMN-binding  35.76 
 
 
170 aa  91.3  7e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000000136887  normal  0.155549 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6086  flavoprotein oxidoreductase  35.67 
 
 
306 aa  90.5  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.414273  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4109  flavin reductase domain-containing protein  33.56 
 
 
162 aa  90.1  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1727  putative flavoprotein oxidoreductase  37.01 
 
 
168 aa  88.6  4e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0950  putative flavoprotein reductase  35.76 
 
 
177 aa  88.6  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>