More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2148 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012917  PC1_2148  flavin reductase domain protein FMN-binding  100 
 
 
181 aa  368  1e-101  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2488  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  89.5 
 
 
181 aa  330  7.000000000000001e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1819  flavin reductase domain-containing protein  60.26 
 
 
175 aa  209  1e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.988242  hitchhiker  0.00551903 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01010  predicted oxidoreductase, flavin:NADH component  60.26 
 
 
164 aa  197  5e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2118  putative flavin reductase rutF  60.26 
 
 
164 aa  197  5e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1122  putative flavin reductase rutF  60.26 
 
 
164 aa  197  5e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01017  hypothetical protein  60.26 
 
 
164 aa  197  5e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2588  flavin reductase domain-containing protein  60.26 
 
 
164 aa  197  5e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0976378 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1125  putative flavin reductase rutF  60.26 
 
 
164 aa  197  5e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2635  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  60.26 
 
 
164 aa  197  6e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1520  flavin reductase domain-containing protein  59.24 
 
 
164 aa  197  6e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.377691 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1244  putative flavin reductase rutF  60.26 
 
 
164 aa  197  9e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1153  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  54.22 
 
 
180 aa  189  2e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4843  flavin reductase domain protein FMN-binding  53.14 
 
 
180 aa  187  8e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0995  flavin reductase-like  56.49 
 
 
178 aa  185  2e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3898  flavin reductase-like, FMN-binding  53.42 
 
 
176 aa  174  5e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.69994 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00765  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  52.9 
 
 
176 aa  174  6e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2213  flavin reductase domain-containing protein  54.61 
 
 
165 aa  173  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2053  flavin reductase domain protein FMN-binding  51.57 
 
 
201 aa  171  5e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.490233  normal  0.271048 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0903  flavin reductase-like, FMN-binding  52.9 
 
 
171 aa  167  1e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.426778  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3246  flavin reductase domain protein FMN-binding  53.21 
 
 
172 aa  166  2e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.376116 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3021  flavin reductase domain-containing protein  51.53 
 
 
172 aa  166  2e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0740785  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1180  flavin reductase-like, FMN-binding  52.98 
 
 
165 aa  165  4e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.669714  normal  0.14091 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0712  flavin reductase-like, FMN-binding  51.92 
 
 
169 aa  164  9e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.195047  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1734  flavin reductase domain-containing protein  51.01 
 
 
202 aa  163  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.521212  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1079  flavin reductase domain protein FMN-binding  51.28 
 
 
202 aa  163  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.155431  normal  0.0275132 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0847  flavin reductase protein  51.61 
 
 
171 aa  163  2.0000000000000002e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.543841 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1225  flavin:NADH reductase  51.02 
 
 
147 aa  161  5.0000000000000005e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00730125  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5028  flavin reductase domain protein FMN-binding  51.59 
 
 
181 aa  160  8.000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.296353  normal  0.178556 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3210  flavin reductase domain protein FMN-binding  51.59 
 
 
184 aa  160  9e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2278  flavin reductase domain-containing protein  51.63 
 
 
170 aa  160  1e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.663724 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1830  flavin reductase domain-containing protein  48.41 
 
 
167 aa  159  1e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0710863  normal  0.62797 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0635  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase subunit  47.44 
 
 
171 aa  156  1e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.543019  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2356  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase component  48.05 
 
 
165 aa  150  1e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2452  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase subunit  48.05 
 
 
165 aa  150  1e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1639  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase component  48.05 
 
 
165 aa  150  1e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1955  flavin reductase domain protein FMN-binding  43.68 
 
 
204 aa  149  2e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.925053  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2167  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase subunit  45.86 
 
 
179 aa  145  3e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1006  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase small chain  46.84 
 
 
170 aa  145  3e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10990  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase small chain  45.22 
 
 
170 aa  142  4e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.699106  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2506  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase component  46.15 
 
 
216 aa  139  3e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.64515  normal  0.945303 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3609  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase subunit  45.51 
 
 
181 aa  138  3e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.537664  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5345  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase subunit  45.51 
 
 
181 aa  137  6e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0297424  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3911  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase subunit  45.51 
 
 
181 aa  136  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.888906 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2464  flavin reductase-like, FMN-binding  43.51 
 
 
170 aa  136  2e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3515  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase subunit  45.51 
 
 
181 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.440753  normal  0.0189937 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4906  flavin reductase-like, FMN-binding  43.23 
 
 
193 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3257  flavin reductase domain-containing protein  43.23 
 
 
193 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.347082 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5089  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase subunit  44.87 
 
 
184 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.683964 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1208  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase component  43.04 
 
 
170 aa  134  9e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1193  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase component  43.04 
 
 
170 aa  134  9e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1162  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase component  43.04 
 
 
170 aa  134  9e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.444908  normal  0.733145 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1057  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase component  43.04 
 
 
170 aa  134  9e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1173  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase component  42.94 
 
 
170 aa  133  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0855  flavin reductase family protein  43.48 
 
 
169 aa  133  9.999999999999999e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0181581  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6513  flavin reductase domain-containing protein  42.58 
 
 
168 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.226456  normal  0.292834 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04221  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase component  40.76 
 
 
170 aa  132  3e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4881  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase component  40.76 
 
 
170 aa  132  3e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04187  hypothetical protein  40.76 
 
 
170 aa  132  3e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4575  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase component  40.76 
 
 
170 aa  132  3e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3711  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase subunit  40.76 
 
 
170 aa  132  3e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.390593  normal  0.865335 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4430  flavin reductase domain protein FMN-binding  46.1 
 
 
170 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1292  monooxygenase, putative  41.25 
 
 
173 aa  129  3e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1289  flavin reductase-like, FMN-binding  42.58 
 
 
164 aa  128  5.0000000000000004e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.100023  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1255  putative monooxygenase  41.51 
 
 
210 aa  127  6e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.218566  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2309  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase coupling protein  40.88 
 
 
183 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0320999  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3806  flavin reductase domain-containing protein  45.16 
 
 
171 aa  126  2.0000000000000002e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6112  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase subunit  40.37 
 
 
186 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.980333  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0316  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase component  46.15 
 
 
180 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00660064  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1893  flavin reductase domain-containing protein  40.25 
 
 
196 aa  125  3e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2575  flavin reductase domain-containing protein  38.65 
 
 
169 aa  119  3e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2080  flavin reductase domain protein FMN-binding  40.26 
 
 
175 aa  118  3.9999999999999996e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5076  flavin reductase domain-containing protein  40.91 
 
 
175 aa  117  6e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.848453  normal  0.150836 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2123  flavin reductase domain protein FMN-binding  37.97 
 
 
164 aa  115  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00527978 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2385  flavin reductase-like, FMN-binding  38.56 
 
 
162 aa  115  3e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.289949  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1916  flavin reductase domain protein FMN-binding  37.97 
 
 
164 aa  114  6.9999999999999995e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1584  flavin reductase-like, FMN-binding  38.89 
 
 
186 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3957  flavoprotein oxidoreductase  40.26 
 
 
175 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7128  flavoprotein oxidoreductase  36.31 
 
 
167 aa  110  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1212  flavin reductase domain-containing protein  38.31 
 
 
185 aa  108  4.0000000000000004e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5217  flavoprotein oxidoreductase  40.29 
 
 
149 aa  107  9.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2341  flavin reductase-like, FMN-binding  39.74 
 
 
165 aa  106  2e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.236422  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5770  flavin reductase-like, FMN-binding  43.38 
 
 
183 aa  103  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1003  flavin reductase-like, FMN-binding  35.26 
 
 
173 aa  103  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1486  flavin reductase domain-containing protein  36.08 
 
 
166 aa  101  6e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0134699 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2423  flavoprotein oxidoreductase  36.67 
 
 
150 aa  99.8  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.284229  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6548  flavin reductase domain protein FMN-binding  38.67 
 
 
311 aa  97.8  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.43019  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5585  flavin reductase domain protein FMN-binding  38.06 
 
 
311 aa  97.8  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.144422  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7406  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase reductase component  37.66 
 
 
211 aa  95.9  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.46542  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6253  flavin reductase domain-containing protein  35.67 
 
 
311 aa  94  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.103541  normal  0.25638 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0903  flavin reductase-like, FMN-binding  31.52 
 
 
183 aa  94  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000520403  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5477  hypothetical protein  33.97 
 
 
182 aa  94  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5977  flavin reductase domain-containing protein  35.81 
 
 
226 aa  93.6  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957349  normal  0.320583 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15070  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, small subunit  37.41 
 
 
183 aa  93.2  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0341961  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4324  flavin reductase domain-containing protein  41.01 
 
 
327 aa  92.8  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.160185 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4357  flavin reductase domain-containing protein  35.67 
 
 
186 aa  92.4  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6044  flavin reductase domain-containing protein  35.81 
 
 
226 aa  92  5e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.347531  normal  0.729214 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4322  flavin reductase domain-containing protein  30.82 
 
 
156 aa  91.7  5e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.495347 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5938  flavin reductase domain-containing protein  35.81 
 
 
226 aa  92  5e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0245052 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1727  putative flavoprotein oxidoreductase  34.94 
 
 
168 aa  91.7  6e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>