More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1727 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1727  putative flavoprotein oxidoreductase  100 
 
 		 168 aa  349  1e-95  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1415  flavin reductase-like, FMN-binding  40.65 
 
 		 172 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0331151  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1544  flavin reductase-like, FMN-binding  37.97 
 
 		 174 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.917406  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2059  flavin reductase-like, FMN-binding  39.74 
 
 		 170 aa  115  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000000136887  normal  0.155549 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6111  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.99 
 
 		 374 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.575038  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3957  flavoprotein oxidoreductase  38 
 
 		 175 aa  106  2e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6858  flavin reductase-like, FMN-binding  35.22 
 
 		 175 aa  104  5e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.798449 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3189  flavin reductase domain-containing protein  36.91 
 
 		 172 aa  102  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1212  flavin reductase domain-containing protein  38.56 
 
 		 185 aa  102  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2385  flavin reductase-like, FMN-binding  34.87 
 
 		 162 aa  102  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.289949  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7128  flavoprotein oxidoreductase  36.18 
 
 		 167 aa  101  4e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5724  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.97 
 
 		 179 aa  101  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0853  flavin reductase domain-containing protein  30.41 
 
 		 185 aa  100  1e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1705  flavin reductase domain-containing protein  36.65 
 
 		 170 aa  99  3e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.190876 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5770  flavin reductase-like, FMN-binding  33.77 
 
 		 183 aa  95.1  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2278  flavin reductase domain-containing protein  36.94 
 
 		 170 aa  94  8e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.663724 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0903  flavin reductase-like, FMN-binding  34.36 
 
 		 171 aa  93.6  1e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.426778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1955  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.71 
 
 		 204 aa  93.2  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.925053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3755  flavin reductase-like, FMN-binding  33.33 
 
 		 154 aa  92  3e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00765  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  35.06 
 
 		 176 aa  92  4e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2148  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.94 
 
 		 181 aa  91.7  5e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6253  flavin reductase domain-containing protein  36.6 
 
 		 311 aa  90.9  7e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.103541  normal  0.25638 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2464  flavin reductase-like, FMN-binding  32.47 
 
 		 170 aa  90.9  7e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2488  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  34.34 
 
 		 181 aa  89.4  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1893  flavin reductase domain-containing protein  33.54 
 
 		 196 aa  89.7  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1858  GntR family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 393 aa  88.6  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000920069  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1292  monooxygenase, putative  33.54 
 
 		 173 aa  88.6  4e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2006  flavin reductase domain-containing protein  32.9 
 
 		 203 aa  88.6  4e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3186  flavin reductase domain-containing protein  32.9 
 
 		 226 aa  88.2  4e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.528706  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2295  flavin reductase domain-containing protein  32.9 
 
 		 226 aa  88.6  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1029  flavin reductase domain-containing protein  32.9 
 
 		 226 aa  88.6  4e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.736467  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1316  flavin reductase domain-containing protein  32.9 
 
 		 226 aa  88.6  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2080  flavin reductase domain protein FMN-binding  37.01 
 
 		 175 aa  88.6  4e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2575  flavin reductase domain-containing protein  34.64 
 
 		 169 aa  87.4  9e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1225  flavin:NADH reductase  37.41 
 
 		 147 aa  87  1e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00730125  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4109  flavin reductase domain-containing protein  28.39 
 
 		 162 aa  87  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1486  flavin reductase domain-containing protein  34.21 
 
 		 166 aa  87  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0134699 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0847  flavin reductase protein  32.3 
 
 		 171 aa  85.9  2e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.543841 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1403  flavin reductase domain-containing protein  32.03 
 
 		 228 aa  85.9  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2298  flavin reductase domain-containing protein  31.58 
 
 		 226 aa  85.9  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2625  flavin reductase domain-containing protein  30.26 
 
 		 175 aa  85.9  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1003  flavin reductase-like, FMN-binding  33.33 
 
 		 173 aa  85.9  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1255  putative monooxygenase  32.93 
 
 		 210 aa  85.9  2e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.218566  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0855  flavin reductase family protein  34.19 
 
 		 169 aa  86.3  2e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0181581  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3059  flavin reductase domain-containing protein  32.03 
 
 		 228 aa  85.5  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4599  flavin reductase domain-containing protein  30.57 
 
 		 191 aa  85.1  4e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0843412  normal  0.0587176 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1079  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.97 
 
 		 202 aa  85.1  4e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.155431  normal  0.0275132 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5585  flavin reductase domain protein FMN-binding  37.01 
 
 		 311 aa  84  9e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.144422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2053  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.39 
 
 		 201 aa  83.6  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.490233  normal  0.271048 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6349  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.94 
 
 		 183 aa  84  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00500234  hitchhiker  0.000771796 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1520  flavin reductase domain-containing protein  32.68 
 
 		 164 aa  83.6  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.377691 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6548  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.6 
 
 		 311 aa  83.6  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.43019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4322  flavin reductase domain-containing protein  34.87 
 
 		 156 aa  83.2  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.495347 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4357  flavin reductase domain-containing protein  33.12 
 
 		 186 aa  83.2  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0697  flavin reductase-like, FMN-binding  32.21 
 
 		 174 aa  83.2  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.318628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1819  flavin reductase domain-containing protein  35.38 
 
 		 175 aa  82.8  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.988242  hitchhiker  0.00551903 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4187  flavin reductase domain-containing protein  34.64 
 
 		 156 aa  82.8  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.344162  hitchhiker  0.00000247222 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3806  flavin reductase domain-containing protein  34.18 
 
 		 171 aa  82  0.000000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5060  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.52 
 
 		 190 aa  82  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.533074  normal  0.376116 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2880  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.67 
 
 		 189 aa  82  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4843  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.86 
 
 		 180 aa  82  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1830  flavin reductase domain-containing protein  35.29 
 
 		 167 aa  82  0.000000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0710863  normal  0.62797 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5217  flavoprotein oxidoreductase  34.04 
 
 		 149 aa  82  0.000000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1734  flavin reductase domain-containing protein  34.48 
 
 		 202 aa  81.6  0.000000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.521212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3246  flavin reductase domain protein FMN-binding  37.4 
 
 		 172 aa  81.3  0.000000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.376116 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1331  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  35.37 
 
 		 157 aa  81.3  0.000000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0131046  normal  0.0375915 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3021  flavin reductase domain-containing protein  35.48 
 
 		 172 aa  81.3  0.000000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0740785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2213  flavin reductase domain-containing protein  33.33 
 
 		 165 aa  80.5  0.000000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1153  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  31.13 
 
 		 180 aa  80.9  0.000000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15070  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, small subunit  33.13 
 
 		 183 aa  80.1  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0341961  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3898  flavin reductase-like, FMN-binding  31.37 
 
 		 176 aa  80.5  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.69994 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0903  flavin reductase-like, FMN-binding  30.57 
 
 		 183 aa  79.7  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000520403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0934  flavin reductase domain-containing protein  31.21 
 
 		 186 aa  79  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.351151  normal  0.609948 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1244  putative flavin reductase rutF  32.26 
 
 		 164 aa  79  0.00000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1106  flavin reductase-like, FMN-binding  33.33 
 
 		 173 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.321657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0995  flavin reductase-like  30.46 
 
 		 178 aa  78.6  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6086  flavoprotein oxidoreductase  33.99 
 
 		 306 aa  78.6  0.00000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.414273  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0945  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  35.29 
 
 		 170 aa  78.2  0.00000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.930099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5977  flavin reductase domain-containing protein  32.03 
 
 		 226 aa  77.8  0.00000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957349  normal  0.320583 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4430  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.47 
 
 		 170 aa  77.4  0.00000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01010  predicted oxidoreductase, flavin:NADH component  31.61 
 
 		 164 aa  76.6  0.0000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1122  putative flavin reductase rutF  31.61 
 
 		 164 aa  76.6  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1125  putative flavin reductase rutF  31.61 
 
 		 164 aa  76.6  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2588  flavin reductase domain-containing protein  31.61 
 
 		 164 aa  76.6  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0976378 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0953  flavin reductase-like, FMN-binding protein  31.65 
 
 		 212 aa  77  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01017  hypothetical protein  31.61 
 
 		 164 aa  76.6  0.0000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2118  putative flavin reductase rutF  31.61 
 
 		 164 aa  76.6  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2635  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  30.97 
 
 		 164 aa  75.5  0.0000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5028  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.89 
 
 		 181 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.296353  normal  0.178556 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3822  flavin reductase domain-containing protein  28.76 
 
 		 175 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.57201 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2124  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  31.41 
 
 		 184 aa  75.5  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.159244  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1916  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.24 
 
 		 164 aa  75.1  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5305  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.3 
 
 		 184 aa  74.7  0.0000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1006  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase small chain  30.32 
 
 		 170 aa  75.1  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3210  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.88 
 
 		 184 aa  75.1  0.0000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4664  flavin reductase-like, FMN-binding  28.76 
 
 		 191 aa  74.7  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3699  flavin reductase domain-containing protein  28.76 
 
 		 191 aa  74.7  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.927223  normal  0.318352 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6441  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.54 
 
 		 179 aa  74.3  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0182942 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2423  flavoprotein oxidoreductase  32.21 
 
 		 150 aa  74.3  0.0000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.284229  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2341  flavin reductase-like, FMN-binding  35.48 
 
 		 165 aa  73.9  0.0000000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.236422  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>