More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0853 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010524  Lcho_0853  flavin reductase domain-containing protein  100 
 
 
185 aa  377  1e-104  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6111  flavin reductase domain protein FMN-binding  41.55 
 
 
374 aa  124  6e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.575038  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3612  flavin reductase domain-containing protein  41.51 
 
 
191 aa  123  2e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.613426  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2006  flavin reductase domain-containing protein  42.07 
 
 
203 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1029  flavin reductase domain-containing protein  42.07 
 
 
226 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.736467  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2295  flavin reductase domain-containing protein  42.07 
 
 
226 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1316  flavin reductase domain-containing protein  42.07 
 
 
226 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3186  flavin reductase domain-containing protein  42.33 
 
 
226 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.528706  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2298  flavin reductase domain-containing protein  42.5 
 
 
226 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3059  flavin reductase domain-containing protein  42.5 
 
 
228 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1403  flavin reductase domain-containing protein  41.88 
 
 
228 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7128  flavoprotein oxidoreductase  40 
 
 
167 aa  109  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4109  flavin reductase domain-containing protein  39.76 
 
 
162 aa  108  5e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2059  flavin reductase-like, FMN-binding  39.29 
 
 
170 aa  107  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000000136887  normal  0.155549 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3189  flavin reductase domain-containing protein  39.57 
 
 
172 aa  106  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0202  flavin reductase domain-containing protein  41.82 
 
 
176 aa  106  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.635021  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0225  flavin reductase domain-containing protein  35.76 
 
 
180 aa  105  5e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1727  putative flavoprotein oxidoreductase  30.41 
 
 
168 aa  100  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3957  flavoprotein oxidoreductase  37.5 
 
 
175 aa  99  3e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1415  flavin reductase-like, FMN-binding  35.47 
 
 
172 aa  98.2  6e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0331151  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1544  flavin reductase-like, FMN-binding  36.59 
 
 
174 aa  97.8  9e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.917406  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1153  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  32.5 
 
 
180 aa  94.7  6e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2625  flavin reductase domain-containing protein  35.04 
 
 
175 aa  93.6  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1705  flavin reductase domain-containing protein  35.58 
 
 
170 aa  90.5  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.190876 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3898  flavin reductase-like, FMN-binding  37.78 
 
 
176 aa  90.1  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.69994 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3697  hypothetical protein  35.37 
 
 
168 aa  89.4  3e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.416114  normal  0.561141 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1003  flavin reductase-like, FMN-binding  34.78 
 
 
173 aa  89  4e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2385  flavin reductase-like, FMN-binding  32.41 
 
 
162 aa  88.2  6e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.289949  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1694  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  34.01 
 
 
166 aa  87  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0487183  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2880  flavin reductase domain protein FMN-binding  37.09 
 
 
189 aa  87.4  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1173  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase component  33.8 
 
 
170 aa  87  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5724  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.8 
 
 
179 aa  86.7  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1162  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase component  34.04 
 
 
170 aa  86.7  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.444908  normal  0.733145 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1057  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase component  34.04 
 
 
170 aa  86.7  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1208  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase component  33.33 
 
 
170 aa  85.9  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1193  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase component  33.33 
 
 
170 aa  85.9  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0953  flavin reductase-like, FMN-binding protein  38.98 
 
 
212 aa  85.9  3e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0934  flavin reductase domain-containing protein  35.29 
 
 
186 aa  84.7  8e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.351151  normal  0.609948 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0995  flavin reductase-like  32.47 
 
 
178 aa  84.3  8e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5433  flavin reductase-like, FMN-binding  31.87 
 
 
174 aa  83.6  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0697  flavin reductase-like, FMN-binding  33.8 
 
 
174 aa  83.6  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.318628  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1106  flavin reductase-like, FMN-binding  33.71 
 
 
173 aa  83.6  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.321657  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3755  flavin reductase-like, FMN-binding  32.28 
 
 
154 aa  84  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04221  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase component  32.62 
 
 
170 aa  82.8  0.000000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4575  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase component  32.62 
 
 
170 aa  82.8  0.000000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4881  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase component  32.62 
 
 
170 aa  82.8  0.000000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0635  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase subunit  30.82 
 
 
171 aa  82.8  0.000000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.543019  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3711  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase subunit  32.62 
 
 
170 aa  82.8  0.000000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.390593  normal  0.865335 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04187  hypothetical protein  32.62 
 
 
170 aa  82.8  0.000000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3691  flavin reductase domain-containing protein  32.14 
 
 
158 aa  82.4  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00123529  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3210  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.6 
 
 
184 aa  81.6  0.000000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4109  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.93 
 
 
174 aa  81.3  0.000000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1006  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase small chain  31.29 
 
 
170 aa  81.3  0.000000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2278  flavin reductase domain-containing protein  29.34 
 
 
170 aa  81.3  0.000000000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.663724 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3643  oxidoreductase, putative  32.52 
 
 
161 aa  80.9  0.000000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0302568  normal  0.0898299 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6858  flavin reductase-like, FMN-binding  33.56 
 
 
175 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.798449 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0922  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  30.71 
 
 
190 aa  80.5  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0737  putative flavin reductase-like protein  33.12 
 
 
169 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4081  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.46 
 
 
163 aa  80.5  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.395144  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15070  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, small subunit  31.33 
 
 
183 aa  80.5  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0341961  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0349  flavin reductase domain-containing protein  29.34 
 
 
160 aa  80.1  0.00000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2088  flavin reductase domain-containing protein  33.13 
 
 
161 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000731585  normal  0.792508 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5028  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.83 
 
 
181 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.296353  normal  0.178556 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0080  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.24 
 
 
316 aa  79.7  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5060  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.57 
 
 
190 aa  79.7  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.533074  normal  0.376116 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0140  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.52 
 
 
169 aa  79.7  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.829164  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2261  flavin reductase domain-containing protein  31.9 
 
 
161 aa  79  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5477  hypothetical protein  29.66 
 
 
182 aa  79.3  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3225  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.93 
 
 
169 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5770  flavin reductase-like, FMN-binding  33.33 
 
 
183 aa  78.6  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4599  flavin reductase domain-containing protein  32.14 
 
 
191 aa  79  0.00000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0843412  normal  0.0587176 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2266  flavin reductase domain-containing protein  31.9 
 
 
161 aa  78.6  0.00000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2949  flavin reductase domain-containing protein  32.45 
 
 
178 aa  78.2  0.00000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5217  flavoprotein oxidoreductase  31.33 
 
 
149 aa  78.2  0.00000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1380  putative oxygenase  32.35 
 
 
166 aa  78.2  0.00000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.436  normal  0.571719 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2599  flavin reductase domain-containing protein  35.19 
 
 
169 aa  77.8  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1964  flavin reductase-like, FMN-binding  35.19 
 
 
169 aa  77.8  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.277567  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1536  flavin reductase-like, FMN-binding protein  33.57 
 
 
163 aa  77.8  0.00000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.543924  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2575  flavin reductase domain-containing protein  35.19 
 
 
169 aa  77.8  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1559  flavin reductase domain-containing protein  33.57 
 
 
163 aa  77.8  0.00000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.426657  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0355  flavin reductase domain-containing protein  32.1 
 
 
171 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0401487  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2695  flavin reductase domain-containing protein  30.59 
 
 
178 aa  77.4  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.2164  normal  0.150119 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0580  flavin reductase-like  25.31 
 
 
163 aa  77.4  0.0000000000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00229165  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1057  flavin reductase domain-containing protein  32.1 
 
 
171 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.667997  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0895  flavin reductase family protein  32.1 
 
 
171 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0770098  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5906  flavin reductase-like, FMN-binding  35.19 
 
 
169 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.812224 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0653  flavin reductase domain-containing protein  32.1 
 
 
171 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0962723  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0101  flavin reductase domain-containing protein  32.1 
 
 
171 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0532908  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2488  flavin reductase domain-containing protein  32.1 
 
 
171 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.276719  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0898  flavin reductase family protein  32.1 
 
 
171 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0264693  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1331  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  32.03 
 
 
157 aa  77  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0131046  normal  0.0375915 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1819  flavin reductase domain-containing protein  34.35 
 
 
175 aa  77  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.988242  hitchhiker  0.00551903 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0847  flavin reductase protein  26.88 
 
 
171 aa  76.6  0.0000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.543841 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3100  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  31.16 
 
 
155 aa  76.3  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4106  flavin reductase domain-containing protein  31.69 
 
 
170 aa  76.6  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000156501 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4448  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.72 
 
 
165 aa  76.3  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4641  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.91 
 
 
179 aa  76.6  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3173  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.65 
 
 
155 aa  76.6  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.213746  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1955  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.41 
 
 
204 aa  76.3  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.925053  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6241  flavin reductase domain-containing protein  30.66 
 
 
170 aa  76.3  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>