More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3612 on replicon NC_009427
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009427  Saro_3612  flavin reductase domain-containing protein  100 
 
 
191 aa  384  1e-106  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.613426  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0853  flavin reductase domain-containing protein  41.51 
 
 
185 aa  123  2e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2059  flavin reductase-like, FMN-binding  31.68 
 
 
170 aa  96.3  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000000136887  normal  0.155549 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6111  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.81 
 
 
374 aa  93.6  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.575038  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3186  flavin reductase domain-containing protein  32.7 
 
 
226 aa  92.4  4e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.528706  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3059  flavin reductase domain-containing protein  32.9 
 
 
228 aa  92  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2006  flavin reductase domain-containing protein  31.45 
 
 
203 aa  91.3  8e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2295  flavin reductase domain-containing protein  31.45 
 
 
226 aa  91.3  8e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1316  flavin reductase domain-containing protein  31.45 
 
 
226 aa  91.3  8e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1029  flavin reductase domain-containing protein  31.45 
 
 
226 aa  91.3  8e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.736467  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2298  flavin reductase domain-containing protein  32.26 
 
 
226 aa  89.4  3e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1403  flavin reductase domain-containing protein  32.26 
 
 
228 aa  88.6  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1415  flavin reductase-like, FMN-binding  28.48 
 
 
172 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0331151  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6858  flavin reductase-like, FMN-binding  33.94 
 
 
175 aa  82  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.798449 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5724  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.16 
 
 
179 aa  79.3  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0995  flavin reductase-like  33.33 
 
 
178 aa  79.3  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5977  flavin reductase domain-containing protein  31.68 
 
 
226 aa  77.8  0.00000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957349  normal  0.320583 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1153  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  28.86 
 
 
180 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1705  flavin reductase domain-containing protein  31.65 
 
 
170 aa  75.5  0.0000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.190876 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6253  flavin reductase domain-containing protein  31.51 
 
 
311 aa  74.3  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.103541  normal  0.25638 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5938  flavin reductase domain-containing protein  30.43 
 
 
226 aa  73.6  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0245052 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6044  flavin reductase domain-containing protein  30.43 
 
 
226 aa  73.6  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.347531  normal  0.729214 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2625  flavin reductase domain-containing protein  27.17 
 
 
175 aa  73.2  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0934  flavin reductase domain-containing protein  31.87 
 
 
186 aa  72  0.000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.351151  normal  0.609948 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3246  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.97 
 
 
172 aa  71.6  0.000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.376116 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3021  flavin reductase domain-containing protein  31.97 
 
 
172 aa  71.6  0.000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0740785  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0080  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.91 
 
 
316 aa  71.2  0.000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7128  flavoprotein oxidoreductase  27.97 
 
 
167 aa  70.5  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3189  flavin reductase domain-containing protein  25.97 
 
 
172 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2385  flavin reductase-like, FMN-binding  27.34 
 
 
162 aa  69.7  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.289949  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3755  flavin reductase-like, FMN-binding  26.92 
 
 
154 aa  69.7  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6121  flavin reductase domain-containing protein  28.9 
 
 
311 aa  68.6  0.00000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.272267  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5504  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.52 
 
 
330 aa  68.6  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.414218  decreased coverage  0.000482944 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4109  flavin reductase domain-containing protein  26.58 
 
 
162 aa  67.4  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2215  nitrilotriacetate monooxygenase  30.72 
 
 
318 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.130283  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2053  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.66 
 
 
201 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.490233  normal  0.271048 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1727  putative flavoprotein oxidoreductase  22.75 
 
 
168 aa  67.4  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1079  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.61 
 
 
202 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.155431  normal  0.0275132 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1331  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  28.48 
 
 
157 aa  67.4  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0131046  normal  0.0375915 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4322  flavin reductase domain-containing protein  29.37 
 
 
156 aa  67.4  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.495347 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1955  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.9 
 
 
204 aa  66.6  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.925053  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1734  flavin reductase domain-containing protein  27.81 
 
 
202 aa  66.2  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.521212  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0221  flavin reductase domain-containing protein  32.93 
 
 
393 aa  65.9  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4448  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.77 
 
 
165 aa  66.2  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3210  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.56 
 
 
184 aa  65.5  0.0000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0349  flavin reductase domain-containing protein  28.26 
 
 
160 aa  65.5  0.0000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3451  flavin reductase domain-containing protein  30.94 
 
 
161 aa  64.7  0.0000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.299495  normal  0.309521 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1544  flavin reductase-like, FMN-binding  26.75 
 
 
174 aa  64.7  0.0000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.917406  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2261  flavin reductase domain-containing protein  30.94 
 
 
161 aa  64.7  0.0000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1006  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase small chain  29.14 
 
 
170 aa  64.7  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2266  flavin reductase domain-containing protein  30.43 
 
 
161 aa  64.7  0.0000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6086  flavoprotein oxidoreductase  29.25 
 
 
306 aa  64.7  0.0000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.414273  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3643  oxidoreductase, putative  30.22 
 
 
161 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0302568  normal  0.0898299 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5585  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.31 
 
 
311 aa  64.3  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.144422  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5120  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.09 
 
 
163 aa  63.9  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1380  putative oxygenase  27.45 
 
 
166 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.436  normal  0.571719 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6548  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.31 
 
 
311 aa  63.9  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.43019  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4187  flavin reductase domain-containing protein  27.97 
 
 
156 aa  63.9  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.344162  hitchhiker  0.00000247222 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5217  flavoprotein oxidoreductase  30.5 
 
 
149 aa  63.5  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3262  flavin reductase-like, FMN-binding  29.79 
 
 
161 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0281543 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2088  flavin reductase domain-containing protein  30.43 
 
 
161 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000731585  normal  0.792508 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2080  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.37 
 
 
175 aa  62.8  0.000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0580  flavin reductase-like  27.89 
 
 
163 aa  62.4  0.000000004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00229165  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1225  flavin:NADH reductase  27.08 
 
 
147 aa  62.4  0.000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00730125  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4570  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.03 
 
 
259 aa  62  0.000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.880752 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4843  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.28 
 
 
180 aa  62  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0697  flavin reductase-like, FMN-binding  32.39 
 
 
174 aa  62  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.318628  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3173  flavin reductase domain protein FMN-binding  24.53 
 
 
155 aa  61.6  0.000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.213746  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0202  flavin reductase domain-containing protein  28.24 
 
 
176 aa  61.2  0.000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.635021  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15070  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, small subunit  29.75 
 
 
183 aa  61.2  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0341961  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2478  flavin reductase domain-containing protein  28.66 
 
 
302 aa  60.8  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.375829  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2124  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  28.19 
 
 
184 aa  60.5  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.159244  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8752  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.13 
 
 
162 aa  60.1  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.125188 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0401  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  29.69 
 
 
162 aa  59.3  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4101  flavin reductase domain-containing protein  30.94 
 
 
184 aa  58.9  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4324  flavin reductase domain-containing protein  29.86 
 
 
327 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.160185 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10990  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase small chain  27.15 
 
 
170 aa  58.5  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.699106  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4939  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  34.01 
 
 
178 aa  58.5  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.372031  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2523  flavin reductase-like, FMN-binding  27.61 
 
 
346 aa  58.5  0.00000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1628  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  33 
 
 
191 aa  58.2  0.00000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.96202  normal  0.763872 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5501  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.68 
 
 
311 aa  58.2  0.00000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5770  flavin reductase-like, FMN-binding  27.01 
 
 
183 aa  57.8  0.00000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3537  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.3 
 
 
404 aa  57.8  0.00000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3051  flavin reductase domain-containing protein  29.93 
 
 
166 aa  57.8  0.00000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0226869 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26130  conserved protein of DIM6/NTAB family  28.98 
 
 
179 aa  57.4  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.861848  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5076  flavin reductase domain-containing protein  30.43 
 
 
175 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.848453  normal  0.150836 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1335  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  24.8 
 
 
221 aa  57.8  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.296407  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4599  flavin reductase domain-containing protein  27.74 
 
 
191 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0843412  normal  0.0587176 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4906  flavin reductase-like, FMN-binding  29.29 
 
 
193 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2283  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.61 
 
 
191 aa  56.6  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0153986  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3257  flavin reductase domain-containing protein  29.29 
 
 
193 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.347082 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3234  flavin reductase-like, FMN-binding  28.26 
 
 
161 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3691  flavin reductase domain-containing protein  28.03 
 
 
158 aa  56.2  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00123529  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5060  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.74 
 
 
190 aa  56.2  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.533074  normal  0.376116 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2635  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  28.57 
 
 
164 aa  55.5  0.0000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2672  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  27.54 
 
 
161 aa  55.5  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.058171  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2144  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  33.57 
 
 
162 aa  55.8  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.438455  normal  0.0344476 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0316  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase component  28.57 
 
 
180 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00660064  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0591  flavin reductase domain-containing protein  26.88 
 
 
171 aa  55.5  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.19053  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4010  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  29.61 
 
 
176 aa  55.5  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>