More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4101 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_4101  flavin reductase domain-containing protein  100 
 
 
184 aa  361  3e-99  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2759  flavin reductase domain protein FMN-binding  57.89 
 
 
193 aa  180  8.000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0399  flavin reductase domain-containing protein  57.79 
 
 
166 aa  172  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.312372 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0279  flavin reductase domain-containing protein  55.19 
 
 
167 aa  166  2e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.932981  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10248  oxidoreductase  51.27 
 
 
162 aa  164  5e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.712736 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0240  flavin reductase domain-containing protein  53.9 
 
 
161 aa  162  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.695925  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4843  flavin reductase domain-containing protein  53.69 
 
 
170 aa  161  5.0000000000000005e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4001  flavin reductase domain-containing protein  53.59 
 
 
172 aa  160  7e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.371931  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0250  flavin reductase-like, FMN-binding protein  53.25 
 
 
161 aa  160  1e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.181299  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0260  flavin reductase domain-containing protein  53.25 
 
 
161 aa  160  1e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.132892 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11968  oxidoreductase  50.67 
 
 
171 aa  153  2e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0356349  normal  0.857674 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3777  flavin reductase domain protein FMN-binding  52.87 
 
 
165 aa  150  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0925  flavin reductase domain protein FMN-binding  51.95 
 
 
173 aa  148  3e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000199253  normal  0.0756553 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4310  flavin reductase domain protein FMN-binding  55.63 
 
 
203 aa  145  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4201  flavin reductase domain-containing protein  54.3 
 
 
186 aa  144  5e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.313285  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1234  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  45.91 
 
 
177 aa  142  2e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.363078  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8752  flavin reductase domain protein FMN-binding  42.5 
 
 
162 aa  135  5e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.125188 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2092  Conserved protein/domain typically associated with flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family  44.65 
 
 
207 aa  129  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.934907  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2144  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  45.8 
 
 
162 aa  116  9.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.438455  normal  0.0344476 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2622  major facilitator superfamily MFS_1  48.03 
 
 
790 aa  116  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4569  flavin reductase domain-containing protein  39.49 
 
 
168 aa  112  3e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.168404 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0221  flavin reductase domain-containing protein  42.76 
 
 
393 aa  112  3e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6241  flavin reductase domain-containing protein  40.79 
 
 
170 aa  112  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5034  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  39.61 
 
 
171 aa  110  9e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2404  flavin reductase-like, FMN-binding  40.26 
 
 
197 aa  109  3e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0203545 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6253  flavin reductase domain-containing protein  40.74 
 
 
311 aa  108  6e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.103541  normal  0.25638 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26130  conserved protein of DIM6/NTAB family  37.65 
 
 
179 aa  105  4e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.861848  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5977  flavin reductase domain-containing protein  41.01 
 
 
226 aa  104  7e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957349  normal  0.320583 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19380  conserved protein of DIM6/NTAB family  42.86 
 
 
174 aa  104  7e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.711289  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5585  flavin reductase domain protein FMN-binding  37.41 
 
 
311 aa  104  8e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.144422  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2261  flavin reductase domain-containing protein  36.31 
 
 
161 aa  104  8e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1462  flavin reductase-like, FMN-binding  40.54 
 
 
172 aa  103  1e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.194965  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2582  flavin reductase-like, FMN-binding  40.52 
 
 
162 aa  103  1e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.643746  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2773  flavin reductase domain-containing protein  37.18 
 
 
204 aa  103  1e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.827464  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6548  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.69 
 
 
311 aa  102  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.43019  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2866  flavin reductase domain-containing protein  40.14 
 
 
175 aa  103  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.567161  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3440  flavin reductase domain-containing protein  35.03 
 
 
161 aa  102  3e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.540454  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2256  flavin reductase domain-containing protein  36.94 
 
 
161 aa  102  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.550172  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6086  flavoprotein oxidoreductase  38.41 
 
 
306 aa  102  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.414273  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5938  flavin reductase domain-containing protein  40.29 
 
 
226 aa  101  5e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0245052 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6044  flavin reductase domain-containing protein  40.29 
 
 
226 aa  101  5e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.347531  normal  0.729214 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4106  flavin reductase domain-containing protein  39.87 
 
 
170 aa  101  6e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000156501 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3647  oxidoreductase, putative  35.67 
 
 
161 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0722443  normal  0.161696 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1371  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  42.41 
 
 
169 aa  100  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.361303  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1781  flavin reductase domain protein FMN-binding  37.5 
 
 
170 aa  100  1e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000326211 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2083  flavin reductase domain-containing protein  35.67 
 
 
161 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4448  flavin reductase domain protein FMN-binding  42.76 
 
 
165 aa  99.4  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3842  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  32.68 
 
 
190 aa  99  4e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2261  flavin reductase domain-containing protein  37.23 
 
 
161 aa  98.6  4e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2266  flavin reductase domain-containing protein  37.23 
 
 
161 aa  99  4e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0087  flavin reductase domain protein FMN-binding  37.91 
 
 
186 aa  98.2  5e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0080  flavin reductase domain protein FMN-binding  38.58 
 
 
316 aa  98.2  6e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0068  flavin reductase domain-containing protein  37.91 
 
 
186 aa  98.2  6e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3234  flavin reductase-like, FMN-binding  33.76 
 
 
161 aa  97.8  8e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3697  hypothetical protein  36.71 
 
 
168 aa  97.4  9e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.416114  normal  0.561141 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3643  oxidoreductase, putative  36.5 
 
 
161 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0302568  normal  0.0898299 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2088  flavin reductase domain-containing protein  36.5 
 
 
161 aa  97.1  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000731585  normal  0.792508 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0890  flavin reductase-like, FMN-binding  36 
 
 
408 aa  96.3  2e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1408  flavin reductase domain-containing protein  42 
 
 
173 aa  95.9  3e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.913162  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5305  flavin reductase domain-containing protein  32.69 
 
 
188 aa  95.5  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.843488  normal  0.297216 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13600  oxidoreductase  30.77 
 
 
187 aa  95.1  4e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.295254  normal  0.297766 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1498  putative flavin-dependent reductase  43.62 
 
 
174 aa  95.1  5e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4706  flavin reductase-like, FMN-binding protein  29.88 
 
 
204 aa  94.7  6e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5091  flavin reductase domain-containing protein  30.77 
 
 
188 aa  94.4  8e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.504417 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4792  flavin reductase domain-containing protein  30.77 
 
 
188 aa  94.4  8e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.971177  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2406  flavin reductase-like  33.12 
 
 
161 aa  94  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.17627  normal  0.747967 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2478  flavin reductase domain-containing protein  36.03 
 
 
302 aa  94  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.375829  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0065  flavin reductase-like, FMN-binding  37.33 
 
 
166 aa  93.6  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.99238e-16  normal  0.847147 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0515  flavin reductase-like, FMN-binding  35.1 
 
 
160 aa  92.8  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0779  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.09 
 
 
192 aa  93.6  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0273259  normal  0.15291 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4324  flavin reductase domain-containing protein  38.35 
 
 
327 aa  93.2  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.160185 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1607  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  38.41 
 
 
168 aa  92.8  3e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5077  nitrilotriacetate monooxygenase  35.33 
 
 
202 aa  92.4  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.332011  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3537  flavin reductase domain protein FMN-binding  38.93 
 
 
404 aa  92.4  3e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0576  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  32.69 
 
 
188 aa  92  4e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4939  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  40.94 
 
 
178 aa  92  4e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.372031  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4057  flavin reductase-like, FMN-binding  37.11 
 
 
172 aa  91.7  5e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0713  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.5 
 
 
192 aa  91.7  5e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0114519  normal  0.0515265 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1628  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  33.56 
 
 
191 aa  91.3  7e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.96202  normal  0.763872 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7368  flavin reductase-like, FMN-binding  32.5 
 
 
169 aa  91.3  7e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.256607 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2672  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  32.48 
 
 
161 aa  90.9  9e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.058171  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0355  flavin reductase domain-containing protein  35.63 
 
 
171 aa  90.5  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0401487  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1057  flavin reductase domain-containing protein  35.63 
 
 
171 aa  90.5  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.667997  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0895  flavin reductase family protein  35.63 
 
 
171 aa  90.5  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0770098  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1466  flavin reductase domain-containing protein  30.77 
 
 
188 aa  90.5  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0101  flavin reductase domain-containing protein  35.63 
 
 
171 aa  90.5  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0532908  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0898  flavin reductase family protein  35.63 
 
 
171 aa  90.5  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0264693  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3055  flavin reductase domain-containing protein  29.68 
 
 
169 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2488  flavin reductase domain-containing protein  35.63 
 
 
171 aa  90.5  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.276719  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0653  flavin reductase domain-containing protein  35.63 
 
 
171 aa  90.5  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0962723  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8271  flavin reductase domain-containing protein  39.69 
 
 
168 aa  89.7  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.125627 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0092  flavin reductase domain-containing protein  34.78 
 
 
172 aa  89.7  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.817561  normal  0.852259 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0252  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  33.97 
 
 
177 aa  89.4  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0378  flavin reductase domain-containing protein  38.06 
 
 
168 aa  89.4  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.557848  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0922  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  31.41 
 
 
190 aa  89  4e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0737  putative flavin reductase-like protein  33.53 
 
 
169 aa  88.2  6e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3523  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  33.55 
 
 
191 aa  88.2  6e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.30752  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6121  flavin reductase domain-containing protein  36.92 
 
 
311 aa  87.8  8e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.272267  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5120  flavin reductase domain protein FMN-binding  37.82 
 
 
163 aa  87.8  8e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6306  flavin reductase domain-containing protein  35.44 
 
 
175 aa  87.8  9e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.836569  normal  0.357776 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>