More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_1003 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_1003  flavin reductase-like, FMN-binding  100 
 
 		 173 aa  347  4e-95  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1106  flavin reductase-like, FMN-binding  74.85 
 
 		 173 aa  248  3e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.321657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1212  flavin reductase domain-containing protein  50.97 
 
 		 185 aa  165  2e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4641  flavin reductase domain protein FMN-binding  48.73 
 
 		 179 aa  155  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6441  flavin reductase domain protein FMN-binding  47.47 
 
 		 179 aa  151  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0182942 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0686  flavin reductase-like, FMN-binding  43.37 
 
 		 193 aa  146  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.520782  normal  0.880219 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5477  hypothetical protein  47.24 
 
 		 182 aa  146  2.0000000000000003e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2880  flavin reductase domain protein FMN-binding  43.95 
 
 		 189 aa  142  2e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4357  flavin reductase domain-containing protein  47.44 
 
 		 186 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5060  flavin reductase domain protein FMN-binding  43.83 
 
 		 190 aa  132  3e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.533074  normal  0.376116 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3957  flavoprotein oxidoreductase  42.94 
 
 		 175 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5433  flavin reductase-like, FMN-binding  42.51 
 
 		 174 aa  128  5.0000000000000004e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4599  flavin reductase domain-containing protein  42.95 
 
 		 191 aa  127  8.000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0843412  normal  0.0587176 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3295  putative monooxygenase/flavin reductase-like, FMN-binding  39.18 
 
 		 190 aa  121  4e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.940039  normal  0.148638 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5770  flavin reductase-like, FMN-binding  41.36 
 
 		 183 aa  121  5e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2385  flavin reductase-like, FMN-binding  38.22 
 
 		 162 aa  120  9.999999999999999e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.289949  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1869  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  48.2 
 
 		 165 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1544  flavin reductase-like, FMN-binding  39.47 
 
 		 174 aa  118  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.917406  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2080  flavin reductase domain protein FMN-binding  43.14 
 
 		 175 aa  119  3e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0847  flavin reductase protein  36.59 
 
 		 171 aa  116  9.999999999999999e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.543841 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0697  flavin reductase-like, FMN-binding  39.33 
 
 		 174 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.318628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3898  flavin reductase-like, FMN-binding  34.84 
 
 		 176 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.69994 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1955  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.36 
 
 		 204 aa  116  1.9999999999999998e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.925053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0855  flavin reductase family protein  37.5 
 
 		 169 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0181581  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1893  flavin reductase domain-containing protein  39.1 
 
 		 196 aa  114  6.9999999999999995e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1705  flavin reductase domain-containing protein  39.07 
 
 		 170 aa  114  6.9999999999999995e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.190876 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2059  flavin reductase-like, FMN-binding  40.4 
 
 		 170 aa  113  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000000136887  normal  0.155549 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2278  flavin reductase domain-containing protein  36.65 
 
 		 170 aa  112  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.663724 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0903  flavin reductase-like, FMN-binding  34.15 
 
 		 171 aa  112  3e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.426778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1415  flavin reductase-like, FMN-binding  38.41 
 
 		 172 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0331151  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1292  monooxygenase, putative  37.18 
 
 		 173 aa  111  5e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1331  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  33.75 
 
 		 157 aa  111  5e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0131046  normal  0.0375915 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4109  flavin reductase domain-containing protein  37.74 
 
 		 162 aa  111  5e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15070  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, small subunit  37.34 
 
 		 183 aa  111  6e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0341961  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4906  flavin reductase-like, FMN-binding  37.66 
 
 		 193 aa  111  6e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3257  flavin reductase domain-containing protein  37.66 
 
 		 193 aa  111  6e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.347082 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1006  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase small chain  35.22 
 
 		 170 aa  110  8.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1916  flavin reductase domain protein FMN-binding  37.09 
 
 		 164 aa  110  9e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0903  flavin reductase-like, FMN-binding  36.36 
 
 		 183 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000520403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1255  putative monooxygenase  37.18 
 
 		 210 aa  110  1.0000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.218566  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2488  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  37.82 
 
 		 181 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6513  flavin reductase domain-containing protein  37.66 
 
 		 168 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.226456  normal  0.292834 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1486  flavin reductase domain-containing protein  34.42 
 
 		 166 aa  107  8.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0134699 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1289  flavin reductase-like, FMN-binding  34.84 
 
 		 164 aa  107  9.000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.100023  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4570  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.42 
 
 		 259 aa  107  1e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.880752 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3755  flavin reductase-like, FMN-binding  36.3 
 
 		 154 aa  107  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2313  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  35.98 
 
 		 159 aa  107  1e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2123  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.76 
 
 		 164 aa  106  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00527978 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1830  flavin reductase domain-containing protein  35.76 
 
 		 167 aa  106  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0710863  normal  0.62797 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0995  flavin reductase-like  37.01 
 
 		 178 aa  105  3e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3246  flavin reductase domain protein FMN-binding  39.13 
 
 		 172 aa  105  4e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.376116 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6111  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.91 
 
 		 374 aa  105  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.575038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3806  flavin reductase domain-containing protein  37.97 
 
 		 171 aa  104  6e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4843  flavin reductase domain protein FMN-binding  37.91 
 
 		 180 aa  104  6e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0934  flavin reductase domain-containing protein  35.8 
 
 		 186 aa  104  7e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.351151  normal  0.609948 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3021  flavin reductase domain-containing protein  40.27 
 
 		 172 aa  103  8e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0740785  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1153  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  36.54 
 
 		 180 aa  103  9e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3210  flavin reductase domain protein FMN-binding  39.49 
 
 		 184 aa  103  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7128  flavoprotein oxidoreductase  37.01 
 
 		 167 aa  103  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2148  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.26 
 
 		 181 aa  103  1e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2423  flavoprotein oxidoreductase  38.26 
 
 		 150 aa  103  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.284229  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2298  flavin reductase domain-containing protein  42 
 
 		 226 aa  102  3e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0950  putative flavoprotein reductase  38.73 
 
 		 177 aa  102  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2053  flavin reductase domain protein FMN-binding  38.46 
 
 		 201 aa  102  3e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.490233  normal  0.271048 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1520  flavin reductase domain-containing protein  33.33 
 
 		 164 aa  101  4e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.377691 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10990  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase small chain  33.33 
 
 		 170 aa  102  4e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.699106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2213  flavin reductase domain-containing protein  33.33 
 
 		 165 aa  101  4e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00765  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  30.52 
 
 		 176 aa  100  9e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1734  flavin reductase domain-containing protein  37.82 
 
 		 202 aa  100  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.521212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3173  flavin reductase domain protein FMN-binding  37.42 
 
 		 155 aa  100  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.213746  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01010  predicted oxidoreductase, flavin:NADH component  32.03 
 
 		 164 aa  98.6  3e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01017  hypothetical protein  32.03 
 
 		 164 aa  98.6  3e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1244  putative flavin reductase rutF  32.03 
 
 		 164 aa  99  3e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2588  flavin reductase domain-containing protein  32.03 
 
 		 164 aa  98.6  3e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0976378 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1125  putative flavin reductase rutF  32.03 
 
 		 164 aa  98.6  3e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2118  putative flavin reductase rutF  32.03 
 
 		 164 aa  98.6  3e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1122  putative flavin reductase rutF  32.03 
 
 		 164 aa  98.6  3e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26130  conserved protein of DIM6/NTAB family  33.91 
 
 		 179 aa  98.6  4e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.861848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2575  flavin reductase domain-containing protein  35.76 
 
 		 169 aa  98.6  4e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5028  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.77 
 
 		 181 aa  98.2  6e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.296353  normal  0.178556 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2006  flavin reductase domain-containing protein  39.1 
 
 		 203 aa  97.1  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1403  flavin reductase domain-containing protein  40 
 
 		 228 aa  96.7  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0945  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  38.56 
 
 		 170 aa  97.1  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.930099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2295  flavin reductase domain-containing protein  39.87 
 
 		 226 aa  96.7  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1029  flavin reductase domain-containing protein  39.87 
 
 		 226 aa  96.7  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.736467  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1316  flavin reductase domain-containing protein  39.87 
 
 		 226 aa  96.7  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2635  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  31.37 
 
 		 164 aa  96.7  2e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0635  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase subunit  32.03 
 
 		 171 aa  96.3  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.543019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2452  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase subunit  32.68 
 
 		 165 aa  96.7  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2356  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase component  32.68 
 
 		 165 aa  96.7  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1639  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase component  32.68 
 
 		 165 aa  96.7  2e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3186  flavin reductase domain-containing protein  39.87 
 
 		 226 aa  96.3  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.528706  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3059  flavin reductase domain-containing protein  40 
 
 		 228 aa  95.5  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2625  flavin reductase domain-containing protein  37.82 
 
 		 175 aa  95.9  3e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2341  flavin reductase-like, FMN-binding  32.68 
 
 		 165 aa  95.5  3e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.236422  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3842  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  31.33 
 
 		 190 aa  95.9  3e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1819  flavin reductase domain-containing protein  32.03 
 
 		 175 aa  95.5  4e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.988242  hitchhiker  0.00551903 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1380  putative oxygenase  36.64 
 
 		 166 aa  94.7  5e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.436  normal  0.571719 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0316  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase component  35.06 
 
 		 180 aa  94.4  7e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00660064  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0890  flavin reductase-like, FMN-binding  32.74 
 
 		 408 aa  94  9e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>