More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0686 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_0686  flavin reductase-like, FMN-binding  100 
 
 
193 aa  384  1e-106  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.520782  normal  0.880219 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2880  flavin reductase domain protein FMN-binding  51.34 
 
 
189 aa  177  7e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1212  flavin reductase domain-containing protein  51.33 
 
 
185 aa  156  2e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5477  hypothetical protein  49.34 
 
 
182 aa  147  1.0000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1003  flavin reductase-like, FMN-binding  43.37 
 
 
173 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1869  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  50.32 
 
 
165 aa  144  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1106  flavin reductase-like, FMN-binding  48.41 
 
 
173 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.321657  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3295  putative monooxygenase/flavin reductase-like, FMN-binding  40.35 
 
 
190 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.940039  normal  0.148638 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4641  flavin reductase domain protein FMN-binding  41.94 
 
 
179 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6441  flavin reductase domain protein FMN-binding  43.23 
 
 
179 aa  134  7.000000000000001e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0182942 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5060  flavin reductase domain protein FMN-binding  48.12 
 
 
190 aa  130  7.999999999999999e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.533074  normal  0.376116 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4599  flavin reductase domain-containing protein  46.99 
 
 
191 aa  128  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0843412  normal  0.0587176 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4357  flavin reductase domain-containing protein  43.29 
 
 
186 aa  125  3e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5433  flavin reductase-like, FMN-binding  41.29 
 
 
174 aa  114  6.9999999999999995e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0945  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  38.29 
 
 
170 aa  107  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.930099  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4109  flavin reductase domain-containing protein  37.82 
 
 
162 aa  105  3e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1380  putative oxygenase  36.6 
 
 
166 aa  103  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.436  normal  0.571719 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0934  flavin reductase domain-containing protein  31.58 
 
 
186 aa  99  4e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.351151  normal  0.609948 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1909  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.13 
 
 
160 aa  95.9  3e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2385  flavin reductase-like, FMN-binding  34.19 
 
 
162 aa  95.5  4e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.289949  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3755  flavin reductase-like, FMN-binding  36.49 
 
 
154 aa  95.1  6e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1415  flavin reductase-like, FMN-binding  37.41 
 
 
172 aa  94  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0331151  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1858  GntR family transcriptional regulator  34.36 
 
 
393 aa  94  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000920069  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2144  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  40 
 
 
162 aa  93.6  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.438455  normal  0.0344476 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1916  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.63 
 
 
164 aa  92.4  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3141  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.08 
 
 
165 aa  91.7  6e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3173  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.77 
 
 
155 aa  91.7  6e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.213746  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1607  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  33.97 
 
 
168 aa  90.5  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0855  flavin reductase family protein  29.19 
 
 
169 aa  90.5  1e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0181581  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26130  conserved protein of DIM6/NTAB family  30.46 
 
 
179 aa  90.5  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.861848  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1153  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  34 
 
 
180 aa  89.7  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0995  flavin reductase-like  34.93 
 
 
178 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6111  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.65 
 
 
374 aa  90.1  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.575038  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2123  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.63 
 
 
164 aa  90.5  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00527978 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3957  flavoprotein oxidoreductase  41.35 
 
 
175 aa  89.4  3e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3189  flavin reductase domain-containing protein  32.72 
 
 
172 aa  89  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0890  flavin reductase-like, FMN-binding  35.1 
 
 
408 aa  89  4e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0697  flavin reductase-like, FMN-binding  32.9 
 
 
174 aa  88.6  5e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.318628  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1781  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.54 
 
 
170 aa  88.6  5e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000326211 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5034  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  32.1 
 
 
171 aa  88.2  6e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0922  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  30.43 
 
 
190 aa  88.2  7e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2625  flavin reductase domain-containing protein  31.61 
 
 
175 aa  87.8  8e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4322  flavin reductase domain-containing protein  32.26 
 
 
156 aa  87.8  9e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.495347 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3246  flavin reductase domain protein FMN-binding  35 
 
 
172 aa  87.4  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.376116 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1893  flavin reductase domain-containing protein  29.09 
 
 
196 aa  87.4  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3021  flavin reductase domain-containing protein  35 
 
 
172 aa  87.4  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0740785  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1628  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  33.77 
 
 
191 aa  86.7  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.96202  normal  0.763872 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2575  flavin reductase domain-containing protein  36.03 
 
 
169 aa  86.7  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3691  flavin reductase domain-containing protein  34 
 
 
158 aa  86.3  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00123529  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1006  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase small chain  33.55 
 
 
170 aa  85.5  4e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1289  flavin reductase-like, FMN-binding  34.01 
 
 
164 aa  85.9  4e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.100023  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3055  flavin reductase domain-containing protein  28.83 
 
 
169 aa  85.5  4e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0068  flavin reductase domain-containing protein  32.54 
 
 
186 aa  85.9  4e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0087  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.54 
 
 
186 aa  85.1  5e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4448  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.54 
 
 
165 aa  85.1  6e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15070  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, small subunit  31.41 
 
 
183 aa  85.1  6e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0341961  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5724  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.26 
 
 
179 aa  85.1  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1292  monooxygenase, putative  28.48 
 
 
173 aa  84.3  0.000000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2356  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase component  28.67 
 
 
165 aa  84  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2452  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase subunit  28.67 
 
 
165 aa  84  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3806  flavin reductase domain-containing protein  36.48 
 
 
171 aa  83.6  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1639  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase component  28.67 
 
 
165 aa  84  0.000000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1255  putative monooxygenase  28.48 
 
 
210 aa  84.3  0.000000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.218566  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1830  flavin reductase domain-containing protein  33.73 
 
 
167 aa  83.2  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0710863  normal  0.62797 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2866  flavin reductase domain-containing protein  32.45 
 
 
175 aa  83.6  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.567161  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0903  flavin reductase-like, FMN-binding  29.94 
 
 
183 aa  82.8  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000520403  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2080  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.01 
 
 
175 aa  82.4  0.000000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4187  flavin reductase domain-containing protein  31.61 
 
 
156 aa  82.4  0.000000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.344162  hitchhiker  0.00000247222 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6241  flavin reductase domain-containing protein  31.65 
 
 
170 aa  82.4  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1544  flavin reductase-like, FMN-binding  32.65 
 
 
174 aa  82  0.000000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.917406  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0096  flavin reductase domain-containing protein  31.61 
 
 
167 aa  82  0.000000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3210  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.36 
 
 
184 aa  82  0.000000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0847  flavin reductase protein  30.82 
 
 
171 aa  81.6  0.000000000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.543841 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1486  flavin reductase domain-containing protein  30.34 
 
 
166 aa  81.3  0.000000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0134699 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2488  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  29.75 
 
 
181 aa  80.9  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2148  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.37 
 
 
181 aa  80.5  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1795  flavin reductase domain-containing protein  33.33 
 
 
164 aa  80.5  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.629541  normal  0.120123 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3898  flavin reductase-like, FMN-binding  31.79 
 
 
176 aa  80.5  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.69994 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17340  conserved protein of DIM6/NTAB family  33.75 
 
 
182 aa  80.5  0.00000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00967262  normal  0.0857306 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4570  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.3 
 
 
259 aa  80.9  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.880752 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6121  flavin reductase domain-containing protein  30.9 
 
 
311 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.272267  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2773  flavin reductase domain-containing protein  28.41 
 
 
204 aa  80.5  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.827464  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3091  flavin reductase domain-containing protein  28.83 
 
 
169 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1955  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.35 
 
 
204 aa  79.7  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.925053  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2697  flavin reductase domain-containing protein  28.75 
 
 
193 aa  79.3  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.235681 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1520  flavin reductase domain-containing protein  30.97 
 
 
164 aa  79.3  0.00000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.377691 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1841  flavin reductase-like, FMN-binding  33.12 
 
 
161 aa  79.3  0.00000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5501  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.3 
 
 
311 aa  79.3  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2464  flavin reductase-like, FMN-binding  30.59 
 
 
170 aa  79.7  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6349  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.41 
 
 
183 aa  79.3  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00500234  hitchhiker  0.000771796 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3842  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  31.13 
 
 
190 aa  79.3  0.00000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2278  flavin reductase domain-containing protein  29.56 
 
 
170 aa  79  0.00000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.663724 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5076  flavin reductase domain-containing protein  33.33 
 
 
175 aa  78.6  0.00000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.848453  normal  0.150836 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5077  nitrilotriacetate monooxygenase  28.76 
 
 
202 aa  78.6  0.00000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.332011  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1331  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  31.37 
 
 
157 aa  78.2  0.00000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0131046  normal  0.0375915 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0903  flavin reductase-like, FMN-binding  30.91 
 
 
171 aa  78.6  0.00000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.426778  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3185  flavin reductase domain-containing protein  32.89 
 
 
182 aa  78.2  0.00000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.177631 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2118  putative flavin reductase rutF  29.38 
 
 
164 aa  78.2  0.00000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2588  flavin reductase domain-containing protein  29.38 
 
 
164 aa  78.2  0.00000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0976378 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01017  hypothetical protein  29.38 
 
 
164 aa  78.2  0.00000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>