More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4700 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_4700  flavin reductase domain protein FMN-binding  100 
 
 
179 aa  353  8.999999999999999e-97  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.403241  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4081  flavin reductase domain protein FMN-binding  62.75 
 
 
163 aa  177  9e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.395144  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4109  flavin reductase domain protein FMN-binding  56.9 
 
 
174 aa  175  3e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2695  flavin reductase domain-containing protein  54.17 
 
 
178 aa  174  6e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.2164  normal  0.150119 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6997  flavin reductase-like, FMN-binding protein  60.65 
 
 
179 aa  166  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00974297 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6349  flavin reductase domain protein FMN-binding  49.08 
 
 
183 aa  166  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00500234  hitchhiker  0.000771796 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0553  flavin reductase domain-containing protein  57.32 
 
 
173 aa  152  2e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00870813 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2035  flavin reductase domain protein FMN-binding  46.63 
 
 
166 aa  119  3e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6600  Conserved protein/domain typically associated with flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family  43.03 
 
 
430 aa  117  7.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.023971  normal  0.547709 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2409  flavin reductase domain-containing protein  46.84 
 
 
181 aa  115  5e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3100  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  42.24 
 
 
155 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2574  flavin reductase domain-containing protein  46.84 
 
 
181 aa  112  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5034  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  40.76 
 
 
171 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3861  flavin reductase-like, FMN-binding  45.1 
 
 
214 aa  109  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.657973  normal  0.52723 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4448  flavin reductase domain protein FMN-binding  44.3 
 
 
165 aa  108  5e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6241  flavin reductase domain-containing protein  40.52 
 
 
170 aa  107  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1723  flavin reductase domain protein FMN-binding  46.5 
 
 
196 aa  107  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2092  Conserved protein/domain typically associated with flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family  40.83 
 
 
207 aa  106  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.934907  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2773  flavin reductase domain-containing protein  39.49 
 
 
204 aa  106  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.827464  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8752  flavin reductase domain protein FMN-binding  40.38 
 
 
162 aa  105  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.125188 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5120  flavin reductase domain protein FMN-binding  46.2 
 
 
163 aa  104  5e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1133  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  41.1 
 
 
170 aa  104  6e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0252  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  38.75 
 
 
177 aa  104  6e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26130  conserved protein of DIM6/NTAB family  37.97 
 
 
179 aa  104  7e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.861848  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0221  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  49.24 
 
 
135 aa  103  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6253  flavin reductase domain-containing protein  41.78 
 
 
311 aa  101  4e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.103541  normal  0.25638 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3405  flavin reductase-like, FMN-binding  35 
 
 
180 aa  102  4e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2179  flavin reductase domain protein FMN-binding  38.51 
 
 
178 aa  102  4e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0890  flavin reductase-like, FMN-binding  38.75 
 
 
408 aa  100  8e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5504  flavin reductase domain protein FMN-binding  39.51 
 
 
330 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.414218  decreased coverage  0.000482944 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6086  flavoprotein oxidoreductase  41.3 
 
 
306 aa  99.4  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.414273  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3141  flavin reductase domain protein FMN-binding  37.5 
 
 
165 aa  99.8  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0938  flavin reductase-like, FMN-binding  36.48 
 
 
180 aa  99.4  3e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.940093  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4057  flavin reductase-like, FMN-binding  39.22 
 
 
172 aa  98.6  4e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3842  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  35.37 
 
 
190 aa  98.6  5e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0349  flavin reductase domain-containing protein  36.3 
 
 
160 aa  97.8  7e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0196  flavin reductase-like protein, FMN-binding  40.83 
 
 
162 aa  97.4  9e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.869968 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1792  flavin reductase domain-containing protein  40.74 
 
 
175 aa  97.4  9e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.688973 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5501  flavin reductase domain protein FMN-binding  37.34 
 
 
311 aa  97.1  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4324  flavin reductase domain-containing protein  38.51 
 
 
327 aa  97.1  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.160185 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3173  flavin reductase domain protein FMN-binding  37.27 
 
 
155 aa  97.4  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.213746  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13600  oxidoreductase  32.92 
 
 
187 aa  95.9  2e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.295254  normal  0.297766 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2876  flavin reductase domain-containing protein  41.51 
 
 
185 aa  96.7  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3055  flavin reductase domain-containing protein  33.75 
 
 
169 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4843  flavin reductase domain-containing protein  40.59 
 
 
170 aa  96.7  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0580  flavin reductase-like  29.34 
 
 
163 aa  95.5  3e-19  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00229165  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0334  flavin reductase domain protein FMN-binding  41.77 
 
 
168 aa  95.9  3e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0953  flavin reductase-like, FMN-binding protein  45.16 
 
 
212 aa  95.9  3e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4322  flavin reductase domain-containing protein  39.42 
 
 
156 aa  95.1  4e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.495347 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0092  flavin reductase domain-containing protein  37.97 
 
 
172 aa  95.1  4e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.817561  normal  0.852259 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0713  flavin reductase domain-containing protein  38.24 
 
 
171 aa  95.5  4e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.497373  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0378  flavin reductase domain-containing protein  40.35 
 
 
168 aa  94.7  5e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.557848  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1380  putative oxygenase  35.95 
 
 
166 aa  95.1  5e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.436  normal  0.571719 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2478  flavin reductase domain-containing protein  41.3 
 
 
302 aa  94.7  6e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.375829  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19500  conserved protein of DIM6/NTAB family  45.86 
 
 
484 aa  94.4  8e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.224099  decreased coverage  0.00249696 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2697  flavin reductase domain-containing protein  34.38 
 
 
193 aa  94  9e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.235681 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2755  flavin reductase domain protein  39.35 
 
 
177 aa  93.6  1e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0570474 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0068  flavin reductase domain-containing protein  38.06 
 
 
186 aa  94  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0126  flavin reductase-like, FMN-binding  39.61 
 
 
186 aa  93.6  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.765055 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5977  flavin reductase domain-containing protein  38.16 
 
 
226 aa  93.2  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957349  normal  0.320583 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2888  flavin reductase domain-containing protein  37.43 
 
 
172 aa  93.2  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000413066 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3091  flavin reductase domain-containing protein  34.38 
 
 
169 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4363  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  39.62 
 
 
174 aa  92.8  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2866  flavin reductase domain-containing protein  38.51 
 
 
175 aa  92.8  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.567161  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0355  flavin reductase domain-containing protein  38.75 
 
 
171 aa  92.4  3e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0401487  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4106  flavin reductase domain-containing protein  40.65 
 
 
170 aa  92.4  3e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000156501 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1057  flavin reductase domain-containing protein  38.75 
 
 
171 aa  92.4  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.667997  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0101  flavin reductase domain-containing protein  38.75 
 
 
171 aa  92.4  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0532908  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0898  flavin reductase family protein  38.75 
 
 
171 aa  92.4  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0264693  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0653  flavin reductase domain-containing protein  38.75 
 
 
171 aa  92.4  3e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0962723  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0140  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.88 
 
 
169 aa  92.4  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.829164  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2488  flavin reductase domain-containing protein  38.75 
 
 
171 aa  92.4  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.276719  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0895  flavin reductase family protein  38.75 
 
 
171 aa  92.4  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0770098  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2689  flavin reductase domain-containing protein  40.85 
 
 
181 aa  92.4  3e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0722  flavin reductase domain-containing protein  38.12 
 
 
169 aa  92  4e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.1645 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4101  flavin reductase domain-containing protein  36.76 
 
 
184 aa  92  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7368  flavin reductase-like, FMN-binding  33.13 
 
 
169 aa  92  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.256607 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4187  flavin reductase domain-containing protein  37.96 
 
 
156 aa  92  4e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.344162  hitchhiker  0.00000247222 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5305  flavin reductase domain-containing protein  33.96 
 
 
188 aa  92  4e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.843488  normal  0.297216 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0127  flavin reductase domain-containing protein  38.12 
 
 
173 aa  91.7  5e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6548  flavin reductase domain protein FMN-binding  38.73 
 
 
311 aa  91.7  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.43019  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3225  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.8 
 
 
169 aa  91.7  5e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2494  flavin reductase domain-containing protein  38.12 
 
 
169 aa  91.7  5e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.116898  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2623  flavin reductase domain-containing protein  38.12 
 
 
169 aa  91.7  5e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.906028  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2668  flavin reductase domain-containing protein  40.12 
 
 
185 aa  91.7  5e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.179398  normal  0.0727975 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0087  flavin reductase domain protein FMN-binding  37.42 
 
 
186 aa  91.3  7e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0221  flavin reductase domain-containing protein  40.38 
 
 
393 aa  91.3  7e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0713  flavin reductase domain protein FMN-binding  38.01 
 
 
192 aa  90.9  9e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0114519  normal  0.0515265 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4706  flavin reductase-like, FMN-binding protein  33.14 
 
 
204 aa  90.9  9e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2759  flavin reductase domain protein FMN-binding  38.55 
 
 
193 aa  90.5  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0576  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  32.73 
 
 
188 aa  90.1  1e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3523  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  39.08 
 
 
191 aa  90.1  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.30752  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5091  flavin reductase domain-containing protein  33.75 
 
 
188 aa  90.5  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.504417 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4792  flavin reductase domain-containing protein  33.75 
 
 
188 aa  90.5  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.971177  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1466  flavin reductase domain-containing protein  32.91 
 
 
188 aa  89.7  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0868  flavin reductase domain-containing protein  42.25 
 
 
237 aa  90.1  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.240136  normal  0.360955 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0922  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  32.53 
 
 
190 aa  89.4  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3697  hypothetical protein  38.56 
 
 
168 aa  89  3e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.416114  normal  0.561141 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2599  flavin reductase domain-containing protein  37.5 
 
 
169 aa  89  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2575  flavin reductase domain-containing protein  37.5 
 
 
169 aa  89  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>