More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2513 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A2513  putative PAH-inducible ring hydroxylating monooxygenase small subunit  100 
 
 
158 aa  317  3e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0458261 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1723  flavin reductase domain protein FMN-binding  88.05 
 
 
196 aa  252  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2035  flavin reductase domain protein FMN-binding  48.55 
 
 
166 aa  121  4e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2574  flavin reductase domain-containing protein  47.76 
 
 
181 aa  117  4.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2409  flavin reductase domain-containing protein  49.19 
 
 
181 aa  116  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0221  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  44.27 
 
 
135 aa  108  3e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4109  flavin reductase domain protein FMN-binding  42.86 
 
 
174 aa  94.7  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3100  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  40.58 
 
 
155 aa  94  7e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2695  flavin reductase domain-containing protein  42.03 
 
 
178 aa  90.9  6e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.2164  normal  0.150119 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4700  flavin reductase domain protein FMN-binding  45.45 
 
 
179 aa  90.9  6e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.403241  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0334  flavin reductase domain protein FMN-binding  38.62 
 
 
168 aa  90.9  7e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0196  flavin reductase-like protein, FMN-binding  44.44 
 
 
162 aa  90.1  1e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.869968 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3861  flavin reductase-like, FMN-binding  42.55 
 
 
214 aa  89.7  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.657973  normal  0.52723 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6997  flavin reductase-like, FMN-binding protein  40.3 
 
 
179 aa  89.4  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00974297 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3691  flavin reductase domain-containing protein  34.88 
 
 
158 aa  80.5  0.000000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00123529  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6349  flavin reductase domain protein FMN-binding  37.16 
 
 
183 aa  77  0.00000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00500234  hitchhiker  0.000771796 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0868  flavin reductase domain-containing protein  38.36 
 
 
237 aa  76.6  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.240136  normal  0.360955 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6600  Conserved protein/domain typically associated with flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family  35.62 
 
 
430 aa  76.6  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.023971  normal  0.547709 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19500  conserved protein of DIM6/NTAB family  43.17 
 
 
484 aa  75.9  0.0000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.224099  decreased coverage  0.00249696 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0442  flavin reductase domain protein FMN-binding  37.69 
 
 
166 aa  76.3  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4322  flavin reductase domain-containing protein  34.85 
 
 
156 aa  76.3  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.495347 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2119  flavin reductase domain-containing protein  35.77 
 
 
322 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6010  flavin reductase domain-containing protein  33.56 
 
 
175 aa  74.3  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4081  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.94 
 
 
163 aa  74.3  0.0000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.395144  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6306  flavin reductase domain-containing protein  34.97 
 
 
175 aa  73.9  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.836569  normal  0.357776 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0938  flavin reductase-like, FMN-binding  35.61 
 
 
180 aa  73.6  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.940093  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3405  flavin reductase-like, FMN-binding  33.86 
 
 
180 aa  73.6  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4187  flavin reductase domain-containing protein  33.33 
 
 
156 aa  72  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.344162  hitchhiker  0.00000247222 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3603  putative oxygenase  34.27 
 
 
172 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000000048428  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4436  hypothetical protein  33.58 
 
 
175 aa  70.5  0.000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6241  flavin reductase domain-containing protein  34.25 
 
 
170 aa  70.5  0.000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5120  flavin reductase domain protein FMN-binding  41.48 
 
 
163 aa  70.5  0.000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3141  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.26 
 
 
165 aa  70.5  0.000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5305  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.33 
 
 
184 aa  70.1  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2645  flavin reductase domain-containing protein  32.87 
 
 
178 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.833226  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6362  flavin reductase domain-containing protein  34.48 
 
 
175 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5488  flavin reductase-like, FMN-binding  34.48 
 
 
175 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.968149  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2616  flavin reductase-like, FMN-binding protein  32.87 
 
 
178 aa  70.1  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6774  flavin reductase domain-containing protein  34.48 
 
 
175 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.589184 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2660  flavin reductase domain-containing protein  32.87 
 
 
178 aa  70.1  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0383927  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3318  flavin reductase-like, FMN-binding  36.57 
 
 
170 aa  68.9  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000349305  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1792  flavin reductase domain-containing protein  35.82 
 
 
175 aa  68.9  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.688973 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2570  flavin reductase domain-containing protein  34.59 
 
 
178 aa  68.9  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0953  flavin reductase-like, FMN-binding protein  34.53 
 
 
212 aa  68.6  0.00000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2124  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  32.1 
 
 
184 aa  67.8  0.00000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.159244  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1934  flavin reductase domain-containing protein  32.28 
 
 
193 aa  67.8  0.00000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0871  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.31 
 
 
175 aa  67.4  0.00000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.190746 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2313  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  37.6 
 
 
159 aa  67.4  0.00000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5504  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.25 
 
 
330 aa  67.4  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.414218  decreased coverage  0.000482944 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7180  flavin reductase-like, FMN-binding  33.33 
 
 
175 aa  67.4  0.00000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.050322 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32170  Flavin reductase domain protein  34.29 
 
 
313 aa  67  0.00000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4835  flavin reductase-like, FMN-binding  32.24 
 
 
186 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3189  flavin reductase domain-containing protein  33.55 
 
 
304 aa  66.6  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0068  flavin reductase domain-containing protein  36.23 
 
 
186 aa  66.6  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3173  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.07 
 
 
155 aa  65.9  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.213746  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3429  flavin reductase domain-containing protein  38.46 
 
 
172 aa  66.2  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.170118  normal  0.316172 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3822  flavin reductase domain-containing protein  37.6 
 
 
175 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.57201 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2008  hypothetical protein  32.64 
 
 
160 aa  65.1  0.0000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4664  flavin reductase-like, FMN-binding  37.6 
 
 
191 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3699  flavin reductase domain-containing protein  37.6 
 
 
191 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.927223  normal  0.318352 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3468  flavin reductase-like, FMN-binding  31.34 
 
 
174 aa  64.7  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.235276  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0580  flavin reductase-like  30.66 
 
 
163 aa  64.7  0.0000000005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00229165  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3558  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.86 
 
 
182 aa  64.7  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0349  flavin reductase domain-containing protein  27.59 
 
 
160 aa  64.3  0.0000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0092  flavin reductase domain-containing protein  36.51 
 
 
172 aa  64.3  0.0000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.817561  normal  0.852259 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2411  flavin reductase-like, FMN-binding  38.4 
 
 
182 aa  64.3  0.0000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1916  flavin reductase domain-containing protein  34.29 
 
 
166 aa  64.3  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.751349 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4507  flavin reductase-like, FMN-binding  32.84 
 
 
162 aa  63.9  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.657354  normal  0.212557 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3504  flavin reductase domain-containing protein  33.86 
 
 
309 aa  63.9  0.0000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0504926  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1909  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.39 
 
 
160 aa  63.5  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1133  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  36.36 
 
 
170 aa  63.2  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0087  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.51 
 
 
186 aa  63.5  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4324  flavin reductase domain-containing protein  34.51 
 
 
327 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.160185 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3697  hypothetical protein  37.8 
 
 
168 aa  63.5  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.416114  normal  0.561141 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0442  putative flavin reductase  27.69 
 
 
164 aa  62.8  0.000000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4057  flavin reductase-like, FMN-binding  35.51 
 
 
172 aa  62.4  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4109  flavin reductase domain-containing protein  31.94 
 
 
162 aa  62.8  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5724  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.22 
 
 
179 aa  62.4  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0553  flavin reductase domain-containing protein  38.18 
 
 
173 aa  62  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00870813 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0252  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  31.54 
 
 
177 aa  61.6  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2523  flavin reductase-like, FMN-binding  33.85 
 
 
346 aa  61.2  0.000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2602  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.56 
 
 
160 aa  61.2  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3504  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.56 
 
 
160 aa  61.2  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.507811  normal  0.0756522 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5501  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.33 
 
 
311 aa  60.8  0.000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1265  flavin reductase domain-containing protein  34.38 
 
 
166 aa  60.8  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.463145 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2607  nitrilotriacetate monooxygenase component B  34.38 
 
 
166 aa  60.8  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.396427  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0126  flavin reductase-like, FMN-binding  36.51 
 
 
186 aa  60.8  0.000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.765055 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3523  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  34.31 
 
 
191 aa  60.8  0.000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.30752  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5585  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.08 
 
 
311 aa  60.1  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.144422  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6548  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.08 
 
 
311 aa  59.7  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.43019  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6116  flavin reductase domain-containing protein  34.96 
 
 
320 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.362693  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4363  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  30.14 
 
 
174 aa  59.3  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2478  flavin reductase domain-containing protein  33.86 
 
 
302 aa  59.3  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.375829  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6253  flavin reductase domain-containing protein  33.94 
 
 
311 aa  59.7  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.103541  normal  0.25638 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6217  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.55 
 
 
158 aa  59.3  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2394  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.68 
 
 
216 aa  58.9  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00571453  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09651  hypothetical protein  33.58 
 
 
162 aa  58.9  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0890  flavin reductase-like, FMN-binding  32.81 
 
 
408 aa  58.9  0.00000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0140  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.82 
 
 
169 aa  58.9  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.829164  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0382  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  33.09 
 
 
160 aa  58.9  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.610168  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>