More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2404 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2404  flavin reductase-like, FMN-binding  100 
 
 		 197 aa  393  1e-108  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0203545 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7215  flavin reductase domain-containing protein  48.42 
 
 		 212 aa  143  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1498  putative flavin-dependent reductase  50 
 
 		 174 aa  140  8e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3669  flavin reductase domain-containing protein  45.4 
 
 		 207 aa  139  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2919  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  48.67 
 
 		 178 aa  136  2e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.15426  normal  0.385823 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0350  flavin reductase domain-containing protein  46.79 
 
 		 169 aa  134  7.000000000000001e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.500094 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34260  conserved protein of DIM6/NTAB family  49.32 
 
 		 174 aa  132  3e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.57247  normal  0.191166 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1607  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  45.64 
 
 		 168 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2298  flavin reductase domain protein FMN-binding  46.25 
 
 		 184 aa  131  6e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8271  flavin reductase domain-containing protein  48.7 
 
 		 168 aa  129  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.125627 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1979  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  47.71 
 
 		 166 aa  129  2.0000000000000002e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1371  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  46 
 
 		 169 aa  121  8e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.361303  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8752  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.84 
 
 		 162 aa  120  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.125188 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4939  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  46.62 
 
 		 178 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.372031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5034  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  38.79 
 
 		 171 aa  117  7.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1725  flavin reductase domain protein FMN-binding  43.59 
 
 		 190 aa  112  4.0000000000000004e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0223332 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26130  conserved protein of DIM6/NTAB family  40 
 
 		 179 aa  110  2.0000000000000002e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.861848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4101  flavin reductase domain-containing protein  40.26 
 
 		 184 aa  109  3e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6217  flavin reductase domain protein FMN-binding  43.26 
 
 		 158 aa  108  7.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0470  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  41.89 
 
 		 170 aa  107  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1781  flavin reductase domain protein FMN-binding  38.73 
 
 		 170 aa  106  2e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000326211 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6241  flavin reductase domain-containing protein  36.84 
 
 		 170 aa  105  5e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2092  Conserved protein/domain typically associated with flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family  37.01 
 
 		 207 aa  104  8e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.934907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4106  flavin reductase domain-containing protein  38.26 
 
 		 170 aa  103  1e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000156501 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2144  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  40.77 
 
 		 162 aa  103  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.438455  normal  0.0344476 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5977  flavin reductase domain-containing protein  38.85 
 
 		 226 aa  102  4e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957349  normal  0.320583 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3055  flavin reductase domain-containing protein  34 
 
 		 169 aa  101  7e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5938  flavin reductase domain-containing protein  39.13 
 
 		 226 aa  100  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0245052 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4448  flavin reductase domain protein FMN-binding  40.27 
 
 		 165 aa  100  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6044  flavin reductase domain-containing protein  39.13 
 
 		 226 aa  100  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.347531  normal  0.729214 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1462  flavin reductase-like, FMN-binding  36.49 
 
 		 172 aa  100  2e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.194965  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3185  flavin reductase domain-containing protein  34.97 
 
 		 182 aa  100  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.177631 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3091  flavin reductase domain-containing protein  35.1 
 
 		 169 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0221  flavin reductase domain-containing protein  38.89 
 
 		 393 aa  100  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6495  flavin reductase domain protein FMN-binding  43.31 
 
 		 168 aa  99  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2773  flavin reductase domain-containing protein  35.37 
 
 		 204 aa  96.3  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.827464  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2697  flavin reductase domain-containing protein  32.53 
 
 		 193 aa  95.9  4e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.235681 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3225  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.18 
 
 		 169 aa  95.9  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4324  flavin reductase domain-containing protein  37.91 
 
 		 327 aa  95.9  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.160185 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0737  putative flavin reductase-like protein  34.18 
 
 		 169 aa  95.1  6e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0096  flavin reductase domain-containing protein  34.57 
 
 		 167 aa  94.4  9e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3537  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.44 
 
 		 404 aa  94.4  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0890  flavin reductase-like, FMN-binding  34.22 
 
 		 408 aa  94.4  1e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5305  flavin reductase domain-containing protein  35.42 
 
 		 188 aa  94  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.843488  normal  0.297216 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1380  putative oxygenase  37.75 
 
 		 166 aa  93.2  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.436  normal  0.571719 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0763  putative monooxygenase oxidoreductase protein  33.75 
 
 		 191 aa  92.4  4e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.205709 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2582  flavin reductase-like, FMN-binding  35.57 
 
 		 162 aa  92.4  4e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.643746  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0922  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  33.54 
 
 		 190 aa  92.4  4e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5077  nitrilotriacetate monooxygenase  32.88 
 
 		 202 aa  92.4  4e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.332011  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6086  flavoprotein oxidoreductase  36.84 
 
 		 306 aa  92  4e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.414273  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2088  flavin reductase domain-containing protein  34.59 
 
 		 161 aa  92  4e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000731585  normal  0.792508 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6548  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.29 
 
 		 311 aa  92.4  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.43019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7368  flavin reductase-like, FMN-binding  34.72 
 
 		 169 aa  92  5e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.256607 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0068  flavin reductase domain-containing protein  36.24 
 
 		 186 aa  91.7  6e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3697  hypothetical protein  35.29 
 
 		 168 aa  91.7  7e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.416114  normal  0.561141 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6441  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.97 
 
 		 179 aa  91.3  8e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0182942 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0355  flavin reductase domain-containing protein  32.91 
 
 		 171 aa  91.3  9e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0401487  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11968  oxidoreductase  32.24 
 
 		 171 aa  91.3  9e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0356349  normal  0.857674 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1057  flavin reductase domain-containing protein  32.91 
 
 		 171 aa  91.3  9e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.667997  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0101  flavin reductase domain-containing protein  32.91 
 
 		 171 aa  91.3  9e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0532908  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0713  flavin reductase domain-containing protein  32.91 
 
 		 171 aa  91.3  9e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.497373  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0898  flavin reductase family protein  32.91 
 
 		 171 aa  91.3  9e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0264693  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0895  flavin reductase family protein  32.91 
 
 		 171 aa  91.3  9e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0770098  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2488  flavin reductase domain-containing protein  32.91 
 
 		 171 aa  91.3  9e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.276719  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0653  flavin reductase domain-containing protein  32.91 
 
 		 171 aa  91.3  9e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0962723  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3643  oxidoreductase, putative  33.96 
 
 		 161 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0302568  normal  0.0898299 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3440  flavin reductase domain-containing protein  32.7 
 
 		 161 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.540454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3173  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.48 
 
 		 155 aa  90.5  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.213746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0510  flavin reductase domain-containing protein  34.18 
 
 		 174 aa  90.9  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.094349  normal  0.146674 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4843  flavin reductase domain-containing protein  33.75 
 
 		 170 aa  90.9  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4057  flavin reductase-like, FMN-binding  32.75 
 
 		 172 aa  90.9  1e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5585  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.29 
 
 		 311 aa  90.9  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.144422  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0576  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  33.78 
 
 		 188 aa  90.5  1e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0087  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.67 
 
 		 186 aa  90.1  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7180  flavin reductase-like, FMN-binding  38.67 
 
 		 175 aa  90.1  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.050322 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2256  flavin reductase domain-containing protein  34.59 
 
 		 161 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.550172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1466  flavin reductase domain-containing protein  33.11 
 
 		 188 aa  90.1  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2266  flavin reductase domain-containing protein  33.96 
 
 		 161 aa  89.7  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0127  flavin reductase domain-containing protein  34.9 
 
 		 173 aa  90.5  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0515  flavin reductase-like, FMN-binding  35.14 
 
 		 160 aa  89.4  3e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1909  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.95 
 
 		 160 aa  89.7  3e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6253  flavin reductase domain-containing protein  37.21 
 
 		 311 aa  89.4  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.103541  normal  0.25638 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6306  flavin reductase domain-containing protein  38.26 
 
 		 175 aa  89.4  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.836569  normal  0.357776 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4001  flavin reductase domain-containing protein  31.82 
 
 		 172 aa  89.4  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.371931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2083  flavin reductase domain-containing protein  33.96 
 
 		 161 aa  89  4e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2261  flavin reductase domain-containing protein  33.33 
 
 		 161 aa  89  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5501  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.76 
 
 		 311 aa  88.6  5e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4641  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.33 
 
 		 179 aa  88.6  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2759  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.67 
 
 		 193 aa  88.6  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3842  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  36.09 
 
 		 190 aa  88.6  6e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2494  flavin reductase domain-containing protein  33.96 
 
 		 169 aa  88.2  7e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.116898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5091  flavin reductase domain-containing protein  33.1 
 
 		 188 aa  88.2  7e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.504417 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4706  flavin reductase-like, FMN-binding protein  33.1 
 
 		 204 aa  88.2  7e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0779  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.35 
 
 		 192 aa  88.2  7e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0273259  normal  0.15291 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2623  flavin reductase domain-containing protein  33.96 
 
 		 169 aa  88.2  7e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.906028  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4792  flavin reductase domain-containing protein  33.1 
 
 		 188 aa  88.2  7e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.971177  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6600  Conserved protein/domain typically associated with flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family  35.26 
 
 		 430 aa  88.2  8e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.023971  normal  0.547709 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2119  flavin reductase domain-containing protein  36.49 
 
 		 322 aa  87.8  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0140  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.56 
 
 		 169 aa  87.4  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.829164  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2866  flavin reductase domain-containing protein  37.06 
 
 		 175 aa  87.4  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.567161  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>