More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_34260 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_34260  conserved protein of DIM6/NTAB family  100 
 
 
174 aa  344  4e-94  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.57247  normal  0.191166 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2919  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  68.15 
 
 
178 aa  206  9e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.15426  normal  0.385823 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1979  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  62.99 
 
 
166 aa  166  2e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2298  flavin reductase domain protein FMN-binding  55.77 
 
 
184 aa  157  8e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2404  flavin reductase-like, FMN-binding  49.32 
 
 
197 aa  145  4.0000000000000006e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0203545 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3669  flavin reductase domain-containing protein  42.67 
 
 
207 aa  114  6.9999999999999995e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0350  flavin reductase domain-containing protein  45.39 
 
 
169 aa  110  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.500094 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7215  flavin reductase domain-containing protein  47.44 
 
 
212 aa  109  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1725  flavin reductase domain protein FMN-binding  42.69 
 
 
190 aa  106  1e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0223332 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5034  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  37.75 
 
 
171 aa  101  5e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2092  Conserved protein/domain typically associated with flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family  37.09 
 
 
207 aa  93.6  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.934907  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1583  flavin reductase domain-containing protein  36.3 
 
 
166 aa  92  4e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4939  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  40.41 
 
 
178 aa  91.7  5e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.372031  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1583  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.62 
 
 
166 aa  91.3  6e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00544341 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1498  putative flavin-dependent reductase  35.95 
 
 
174 aa  90.9  7e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4106  flavin reductase domain-containing protein  35.76 
 
 
170 aa  89  3e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000156501 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1836  hypothetical protein  36.91 
 
 
183 aa  88.6  4e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0567658  normal  0.110727 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1607  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  37.5 
 
 
168 aa  88.2  6e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1781  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.77 
 
 
170 aa  87  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000326211 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4448  flavin reductase domain protein FMN-binding  39.19 
 
 
165 aa  86.7  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11968  oxidoreductase  30.36 
 
 
171 aa  85.5  3e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0356349  normal  0.857674 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0127  flavin reductase domain-containing protein  35.95 
 
 
173 aa  85.5  3e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5305  flavin reductase domain-containing protein  32.68 
 
 
188 aa  85.5  4e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.843488  normal  0.297216 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4201  flavin reductase domain-containing protein  33.92 
 
 
186 aa  85.1  5e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.313285  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0250  flavin reductase-like, FMN-binding protein  30.97 
 
 
161 aa  85.1  5e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.181299  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0260  flavin reductase domain-containing protein  30.97 
 
 
161 aa  85.1  5e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.132892 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6241  flavin reductase domain-containing protein  33.33 
 
 
170 aa  84.3  7e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8752  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.45 
 
 
162 aa  84.3  7e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.125188 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0221  flavin reductase domain-containing protein  38.16 
 
 
393 aa  83.6  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1792  flavin reductase domain-containing protein  35.95 
 
 
175 aa  82.8  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.688973 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0399  flavin reductase domain-containing protein  28.39 
 
 
166 aa  83.2  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.312372 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4001  flavin reductase domain-containing protein  32.67 
 
 
172 aa  82.8  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.371931  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4101  flavin reductase domain-containing protein  32.47 
 
 
184 aa  82.4  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6600  Conserved protein/domain typically associated with flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family  35.26 
 
 
430 aa  82  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.023971  normal  0.547709 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1371  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  37.4 
 
 
169 aa  82  0.000000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.361303  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1345  flavin reductase-like, FMN-binding  37.09 
 
 
174 aa  81.6  0.000000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000569792  hitchhiker  0.00000938161 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0240  flavin reductase domain-containing protein  30.32 
 
 
161 aa  81.6  0.000000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.695925  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0470  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  34.59 
 
 
170 aa  81.6  0.000000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3225  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.15 
 
 
169 aa  80.9  0.000000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10248  oxidoreductase  27.39 
 
 
162 aa  80.5  0.00000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.712736 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0922  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  35.14 
 
 
190 aa  80.1  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0279  flavin reductase domain-containing protein  28.48 
 
 
167 aa  80.5  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.932981  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5091  flavin reductase domain-containing protein  30.77 
 
 
188 aa  79.7  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.504417 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1466  flavin reductase domain-containing protein  31.37 
 
 
188 aa  79.7  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02120  conserved protein of DIM6/NTAB family  33.33 
 
 
193 aa  79.7  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8271  flavin reductase domain-containing protein  36.15 
 
 
168 aa  79.3  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.125627 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4706  flavin reductase-like, FMN-binding protein  30.77 
 
 
204 aa  79.7  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2144  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  35.94 
 
 
162 aa  79.3  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.438455  normal  0.0344476 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4792  flavin reductase domain-containing protein  30.77 
 
 
188 aa  79.7  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.971177  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2866  flavin reductase domain-containing protein  35.37 
 
 
175 aa  79.7  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.567161  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3697  hypothetical protein  35.37 
 
 
168 aa  79.3  0.00000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.416114  normal  0.561141 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5077  nitrilotriacetate monooxygenase  33.33 
 
 
202 aa  78.6  0.00000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.332011  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6044  flavin reductase domain-containing protein  35.25 
 
 
226 aa  78.6  0.00000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.347531  normal  0.729214 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0713  flavin reductase domain-containing protein  33.77 
 
 
171 aa  78.6  0.00000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.497373  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5938  flavin reductase domain-containing protein  35.25 
 
 
226 aa  78.6  0.00000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0245052 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13600  oxidoreductase  31.74 
 
 
187 aa  78.6  0.00000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.295254  normal  0.297766 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1462  flavin reductase-like, FMN-binding  34.01 
 
 
172 aa  78.2  0.00000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.194965  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0092  flavin reductase domain-containing protein  34.64 
 
 
172 aa  78.6  0.00000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.817561  normal  0.852259 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5977  flavin reductase domain-containing protein  34.53 
 
 
226 aa  77.4  0.00000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957349  normal  0.320583 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2722  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  35.92 
 
 
171 aa  77.8  0.00000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0043012  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6306  flavin reductase domain-containing protein  34.97 
 
 
175 aa  77.4  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.836569  normal  0.357776 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0898  flavin reductase family protein  34.44 
 
 
171 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0264693  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0355  flavin reductase domain-containing protein  34.44 
 
 
171 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0401487  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0847  flavin reductase protein  30.19 
 
 
171 aa  77  0.0000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.543841 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0101  flavin reductase domain-containing protein  34.44 
 
 
171 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0532908  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0895  flavin reductase family protein  34.44 
 
 
171 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0770098  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1057  flavin reductase domain-containing protein  34.44 
 
 
171 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.667997  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7180  flavin reductase-like, FMN-binding  35.85 
 
 
175 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.050322 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0096  flavin reductase domain-containing protein  32.05 
 
 
167 aa  77  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0140  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.99 
 
 
169 aa  76.6  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.829164  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2582  flavin reductase-like, FMN-binding  31.41 
 
 
162 aa  77.4  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.643746  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2880  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.42 
 
 
189 aa  77.4  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2464  flavin reductase-like, FMN-binding  29.11 
 
 
170 aa  77.4  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2488  flavin reductase domain-containing protein  34.44 
 
 
171 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.276719  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0653  flavin reductase domain-containing protein  34.44 
 
 
171 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0962723  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3055  flavin reductase domain-containing protein  26.58 
 
 
169 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2599  flavin reductase domain-containing protein  35.03 
 
 
169 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5906  flavin reductase-like, FMN-binding  35.03 
 
 
169 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.812224 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0737  putative flavin reductase-like protein  34.44 
 
 
169 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1964  flavin reductase-like, FMN-binding  35.03 
 
 
169 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.277567  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2575  flavin reductase domain-containing protein  35.03 
 
 
169 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0126  flavin reductase-like, FMN-binding  35.29 
 
 
186 aa  75.5  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.765055 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4569  flavin reductase domain-containing protein  31.54 
 
 
168 aa  75.9  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.168404 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3318  flavin reductase-like, FMN-binding  33.33 
 
 
170 aa  75.5  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000349305  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2494  flavin reductase domain-containing protein  34.32 
 
 
169 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.116898  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0087  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.33 
 
 
186 aa  75.9  0.0000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2623  flavin reductase domain-containing protein  34.32 
 
 
169 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.906028  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6010  flavin reductase domain-containing protein  35.22 
 
 
175 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0995  flavin reductase-like  32.26 
 
 
178 aa  75.5  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0515  flavin reductase-like, FMN-binding  31.21 
 
 
160 aa  75.5  0.0000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6441  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.65 
 
 
179 aa  75.1  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0182942 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2167  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase subunit  28.9 
 
 
179 aa  74.7  0.0000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0349  flavin reductase domain-containing protein  29.41 
 
 
160 aa  74.7  0.0000000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5028  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.28 
 
 
181 aa  74.3  0.0000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.296353  normal  0.178556 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2053  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.68 
 
 
201 aa  73.9  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.490233  normal  0.271048 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0712  flavin reductase-like, FMN-binding  30.13 
 
 
169 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.195047  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0068  flavin reductase domain-containing protein  32.68 
 
 
186 aa  73.9  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0722  flavin reductase domain-containing protein  35.1 
 
 
169 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.1645 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4187  flavin reductase domain-containing protein  29.53 
 
 
156 aa  73.9  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.344162  hitchhiker  0.00000247222 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2773  flavin reductase domain-containing protein  32.92 
 
 
204 aa  73.6  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.827464  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>