More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3669 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_3669  flavin reductase domain-containing protein  100 
 
 
207 aa  408  1e-113  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7215  flavin reductase domain-containing protein  67.1 
 
 
212 aa  182  5.0000000000000004e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2404  flavin reductase-like, FMN-binding  45.4 
 
 
197 aa  139  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0203545 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0350  flavin reductase domain-containing protein  43.92 
 
 
169 aa  120  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.500094 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2919  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  46 
 
 
178 aa  116  1.9999999999999998e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.15426  normal  0.385823 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5034  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  40.85 
 
 
171 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1607  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  41.51 
 
 
168 aa  112  3e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4939  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  41.95 
 
 
178 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.372031  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34260  conserved protein of DIM6/NTAB family  42.67 
 
 
174 aa  107  1e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.57247  normal  0.191166 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2298  flavin reductase domain protein FMN-binding  42.58 
 
 
184 aa  105  7e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1498  putative flavin-dependent reductase  44.14 
 
 
174 aa  103  1e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0470  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  42.95 
 
 
170 aa  103  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6217  flavin reductase domain protein FMN-binding  43.84 
 
 
158 aa  102  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1371  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  43.65 
 
 
169 aa  101  7e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.361303  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1979  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  41.83 
 
 
166 aa  99.8  3e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6241  flavin reductase domain-containing protein  37.58 
 
 
170 aa  98.2  7e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26130  conserved protein of DIM6/NTAB family  36.31 
 
 
179 aa  98.2  7e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.861848  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4106  flavin reductase domain-containing protein  42.96 
 
 
170 aa  97.1  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000156501 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0096  flavin reductase domain-containing protein  39.87 
 
 
167 aa  97.1  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8271  flavin reductase domain-containing protein  42.86 
 
 
168 aa  95.5  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.125627 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3318  flavin reductase-like, FMN-binding  40.79 
 
 
170 aa  95.1  6e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000349305  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3091  flavin reductase domain-containing protein  35.26 
 
 
169 aa  95.1  6e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5977  flavin reductase domain-containing protein  34.94 
 
 
226 aa  93.2  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957349  normal  0.320583 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3055  flavin reductase domain-containing protein  33.33 
 
 
169 aa  92.8  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1583  flavin reductase domain-containing protein  41.56 
 
 
166 aa  92.4  4e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0922  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  36.42 
 
 
190 aa  90.1  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3504  flavin reductase domain-containing protein  38.71 
 
 
309 aa  89.4  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0504926  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6495  flavin reductase domain protein FMN-binding  40.51 
 
 
168 aa  89.7  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1583  flavin reductase domain protein FMN-binding  42.36 
 
 
166 aa  89.4  4e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00544341 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6044  flavin reductase domain-containing protein  34.34 
 
 
226 aa  89.4  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.347531  normal  0.729214 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5938  flavin reductase domain-containing protein  34.34 
 
 
226 aa  89.4  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0245052 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0510  flavin reductase domain-containing protein  36.47 
 
 
174 aa  88.6  6e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.094349  normal  0.146674 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7368  flavin reductase-like, FMN-binding  33.13 
 
 
169 aa  88.6  6e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.256607 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1781  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.26 
 
 
170 aa  87.4  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000326211 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2517  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  38.32 
 
 
174 aa  87.4  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.118991  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0763  putative monooxygenase oxidoreductase protein  35.62 
 
 
191 aa  87  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.205709 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1909  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.19 
 
 
160 aa  86.7  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2488  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  32.02 
 
 
181 aa  86.3  3e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1858  GntR family transcriptional regulator  36.73 
 
 
393 aa  86.3  3e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000920069  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2697  flavin reductase domain-containing protein  32.69 
 
 
193 aa  85.5  5e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.235681 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6086  flavoprotein oxidoreductase  34.06 
 
 
306 aa  85.5  6e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.414273  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3225  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.84 
 
 
169 aa  85.5  6e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8752  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.72 
 
 
162 aa  85.1  7e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.125188 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0713  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.43 
 
 
192 aa  85.1  7e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0114519  normal  0.0515265 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0737  putative flavin reductase-like protein  34.84 
 
 
169 aa  84.7  8e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6253  flavin reductase domain-containing protein  36.3 
 
 
311 aa  84.7  8e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.103541  normal  0.25638 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2119  flavin reductase domain-containing protein  36.71 
 
 
322 aa  84.7  9e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0779  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.62 
 
 
192 aa  84  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0273259  normal  0.15291 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0355  flavin reductase domain-containing protein  36.13 
 
 
171 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0401487  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0895  flavin reductase family protein  36.13 
 
 
171 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0770098  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1057  flavin reductase domain-containing protein  36.13 
 
 
171 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.667997  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7180  flavin reductase-like, FMN-binding  35.9 
 
 
175 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.050322 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0898  flavin reductase family protein  36.13 
 
 
171 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0264693  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3842  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  34.81 
 
 
190 aa  83.2  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0653  flavin reductase domain-containing protein  36.13 
 
 
171 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0962723  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0101  flavin reductase domain-containing protein  36.13 
 
 
171 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0532908  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2488  flavin reductase domain-containing protein  36.13 
 
 
171 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.276719  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2494  flavin reductase domain-containing protein  35.48 
 
 
169 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.116898  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2623  flavin reductase domain-containing protein  35.48 
 
 
169 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.906028  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4843  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.64 
 
 
180 aa  82.4  0.000000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6306  flavin reductase domain-containing protein  37.01 
 
 
175 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.836569  normal  0.357776 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2575  flavin reductase domain-containing protein  34.62 
 
 
169 aa  82  0.000000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4324  flavin reductase domain-containing protein  33.12 
 
 
327 aa  82  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.160185 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0722  flavin reductase domain-containing protein  35.67 
 
 
169 aa  81.6  0.000000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.1645 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32170  Flavin reductase domain protein  35.76 
 
 
313 aa  80.9  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0945  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  35.76 
 
 
170 aa  80.5  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.930099  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2599  flavin reductase domain-containing protein  34.84 
 
 
169 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0713  flavin reductase domain-containing protein  34.84 
 
 
171 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.497373  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1964  flavin reductase-like, FMN-binding  34.84 
 
 
169 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.277567  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6010  flavin reductase domain-containing protein  36.84 
 
 
175 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2575  flavin reductase domain-containing protein  34.84 
 
 
169 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3189  flavin reductase domain-containing protein  33.53 
 
 
304 aa  80.5  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0938  flavin reductase-like, FMN-binding  35.33 
 
 
180 aa  80.5  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.940093  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5906  flavin reductase-like, FMN-binding  34.84 
 
 
169 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.812224 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0092  flavin reductase domain-containing protein  38.18 
 
 
172 aa  80.1  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.817561  normal  0.852259 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4569  flavin reductase domain-containing protein  31.65 
 
 
168 aa  79.7  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.168404 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2144  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  35.38 
 
 
162 aa  80.1  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.438455  normal  0.0344476 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0811  flavin reductase-like, FMN-binding  33.92 
 
 
186 aa  79.7  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2148  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.34 
 
 
181 aa  79.7  0.00000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6362  flavin reductase domain-containing protein  35.26 
 
 
175 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5488  flavin reductase-like, FMN-binding  35.26 
 
 
175 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.968149  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6774  flavin reductase domain-containing protein  35.26 
 
 
175 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.589184 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4101  flavin reductase domain-containing protein  36.02 
 
 
184 aa  79.3  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0442  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.55 
 
 
166 aa  79  0.00000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0068  flavin reductase domain-containing protein  35.33 
 
 
186 aa  79.3  0.00000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2773  flavin reductase domain-containing protein  35.9 
 
 
204 aa  79.3  0.00000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.827464  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6121  flavin reductase domain-containing protein  33.13 
 
 
311 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.272267  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5433  flavin reductase-like, FMN-binding  33.33 
 
 
174 aa  79  0.00000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0087  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.33 
 
 
186 aa  79  0.00000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2092  Conserved protein/domain typically associated with flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family  34.48 
 
 
207 aa  78.6  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.934907  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0576  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  33.33 
 
 
188 aa  78.2  0.00000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6548  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.16 
 
 
311 aa  78.2  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.43019  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3697  hypothetical protein  38.3 
 
 
168 aa  78.2  0.00000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.416114  normal  0.561141 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4448  flavin reductase domain protein FMN-binding  38.57 
 
 
165 aa  77.8  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2053  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.31 
 
 
201 aa  77.4  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.490233  normal  0.271048 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2646  flavin reductase-like, FMN-binding  30.73 
 
 
204 aa  77.4  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0890  flavin reductase-like, FMN-binding  34.66 
 
 
408 aa  77.8  0.0000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2755  flavin reductase domain protein  35.93 
 
 
177 aa  77.4  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0570474 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2880  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.33 
 
 
189 aa  76.6  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5310  flavoprotein oxidoreductase  33.53 
 
 
181 aa  77  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00829883  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>