More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A4453 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A4453  putative flavin-dependent reductase  100 
 
 
193 aa  394  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.3227  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4109  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.84 
 
 
174 aa  100  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6253  flavin reductase domain-containing protein  38.86 
 
 
311 aa  94.4  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.103541  normal  0.25638 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4187  flavin reductase domain-containing protein  30 
 
 
156 aa  90.5  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.344162  hitchhiker  0.00000247222 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4322  flavin reductase domain-containing protein  30.87 
 
 
156 aa  89.4  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.495347 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0903  flavin reductase-like, FMN-binding  33.13 
 
 
171 aa  88.2  7e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.426778  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2035  flavin reductase domain protein FMN-binding  38.51 
 
 
166 aa  87.4  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2574  flavin reductase domain-containing protein  35.57 
 
 
181 aa  85.9  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2278  flavin reductase domain-containing protein  29.59 
 
 
170 aa  85.9  4e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.663724 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4363  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  31.76 
 
 
174 aa  85.5  5e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2409  flavin reductase domain-containing protein  34.46 
 
 
181 aa  85.1  6e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3173  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.21 
 
 
155 aa  85.1  6e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.213746  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0847  flavin reductase protein  30.06 
 
 
171 aa  84  0.000000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.543841 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6495  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.53 
 
 
168 aa  84  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6548  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.88 
 
 
311 aa  84  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.43019  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0349  flavin reductase domain-containing protein  25.17 
 
 
160 aa  83.2  0.000000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5585  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.58 
 
 
311 aa  83.2  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.144422  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6241  flavin reductase domain-containing protein  34.39 
 
 
170 aa  83.6  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6600  Conserved protein/domain typically associated with flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family  31.33 
 
 
430 aa  83.2  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.023971  normal  0.547709 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1331  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  33.77 
 
 
157 aa  83.2  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0131046  normal  0.0375915 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6086  flavoprotein oxidoreductase  35.11 
 
 
306 aa  82.4  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.414273  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0140  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.33 
 
 
169 aa  82.4  0.000000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.829164  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5305  flavin reductase domain-containing protein  30.26 
 
 
188 aa  82  0.000000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.843488  normal  0.297216 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1466  flavin reductase domain-containing protein  30.92 
 
 
188 aa  82  0.000000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2695  flavin reductase domain-containing protein  33.54 
 
 
178 aa  82  0.000000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.2164  normal  0.150119 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1498  putative flavin-dependent reductase  33.55 
 
 
174 aa  80.9  0.00000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13600  oxidoreductase  30.92 
 
 
187 aa  80.9  0.00000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.295254  normal  0.297766 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3141  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.9 
 
 
165 aa  80.9  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1934  flavin reductase domain-containing protein  36.71 
 
 
193 aa  80.9  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5977  flavin reductase domain-containing protein  37.3 
 
 
226 aa  79.7  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957349  normal  0.320583 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2124  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  33.33 
 
 
184 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.159244  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5028  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.22 
 
 
181 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.296353  normal  0.178556 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1841  flavin reductase-like, FMN-binding  32.26 
 
 
161 aa  79.7  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0126  flavin reductase-like, FMN-binding  33.33 
 
 
186 aa  80.1  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.765055 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0945  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  31.29 
 
 
170 aa  80.5  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.930099  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3697  hypothetical protein  32.45 
 
 
168 aa  80.1  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.416114  normal  0.561141 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2919  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  35.71 
 
 
178 aa  79.7  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.15426  normal  0.385823 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0252  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  26.16 
 
 
177 aa  80.1  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2213  flavin reductase domain-containing protein  32.48 
 
 
165 aa  79.3  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0127  flavin reductase domain-containing protein  32.67 
 
 
173 aa  79.3  0.00000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4010  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  33.76 
 
 
176 aa  79  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1180  flavin reductase-like, FMN-binding  34.18 
 
 
165 aa  78.2  0.00000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.669714  normal  0.14091 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0092  flavin reductase domain-containing protein  32 
 
 
172 aa  78.2  0.00000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.817561  normal  0.852259 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3898  flavin reductase-like, FMN-binding  29.87 
 
 
176 aa  78.2  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.69994 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3492  flavin reductase domain-containing protein  30 
 
 
196 aa  77.8  0.00000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.649548 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1795  flavin reductase domain-containing protein  31.47 
 
 
164 aa  77.4  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.629541  normal  0.120123 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4706  flavin reductase-like, FMN-binding protein  29.61 
 
 
204 aa  77.8  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5091  flavin reductase domain-containing protein  29.61 
 
 
188 aa  77.4  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.504417 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4792  flavin reductase domain-containing protein  29.61 
 
 
188 aa  77.4  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.971177  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5938  flavin reductase domain-containing protein  35.71 
 
 
226 aa  76.3  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0245052 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6044  flavin reductase domain-containing protein  35.71 
 
 
226 aa  76.3  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.347531  normal  0.729214 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0580  flavin reductase-like  30.61 
 
 
163 aa  75.9  0.0000000000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00229165  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4570  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.93 
 
 
259 aa  75.9  0.0000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.880752 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4569  flavin reductase domain-containing protein  31.33 
 
 
168 aa  75.9  0.0000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.168404 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2582  flavin reductase-like, FMN-binding  30.13 
 
 
162 aa  75.5  0.0000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.643746  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2261  flavin reductase domain-containing protein  33.33 
 
 
161 aa  75.5  0.0000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0334  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.87 
 
 
168 aa  75.1  0.0000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4835  flavin reductase-like, FMN-binding  33.78 
 
 
186 aa  75.1  0.0000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6310  flavin reductase-like, FMN-binding  31.17 
 
 
161 aa  74.7  0.0000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2313  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  28.85 
 
 
159 aa  74.7  0.0000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2266  flavin reductase domain-containing protein  33.33 
 
 
161 aa  74.7  0.0000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3806  flavin reductase domain-containing protein  32.68 
 
 
171 aa  74.7  0.0000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0890  flavin reductase-like, FMN-binding  32.24 
 
 
408 aa  74.7  0.0000000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1858  GntR family transcriptional regulator  29.53 
 
 
393 aa  74.7  0.0000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000920069  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2215  nitrilotriacetate monooxygenase  37.7 
 
 
318 aa  74.7  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.130283  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6349  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.72 
 
 
183 aa  74.3  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00500234  hitchhiker  0.000771796 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0697  flavin reductase-like, FMN-binding  28.29 
 
 
174 aa  73.9  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.318628  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0096  flavin reductase domain-containing protein  30.67 
 
 
167 aa  73.9  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2888  flavin reductase domain-containing protein  32.21 
 
 
172 aa  74.3  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000413066 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0350  flavin reductase domain-containing protein  31.21 
 
 
169 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.500094 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0995  flavin reductase-like  30.2 
 
 
178 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10248  oxidoreductase  30.34 
 
 
162 aa  73.2  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.712736 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0938  flavin reductase-like, FMN-binding  31.37 
 
 
180 aa  73.2  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.940093  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3210  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.68 
 
 
184 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2404  flavin reductase-like, FMN-binding  31.17 
 
 
197 aa  73.6  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0203545 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02120  conserved protein of DIM6/NTAB family  30.61 
 
 
193 aa  73.6  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2053  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.38 
 
 
201 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.490233  normal  0.271048 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3055  flavin reductase domain-containing protein  31.13 
 
 
169 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2866  flavin reductase domain-containing protein  30.92 
 
 
175 aa  73.2  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.567161  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0510  flavin reductase domain-containing protein  33.76 
 
 
174 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.094349  normal  0.146674 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5120  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.97 
 
 
163 aa  72.8  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0196  flavin reductase-like protein, FMN-binding  34 
 
 
162 aa  72.8  0.000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.869968 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3523  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  29.87 
 
 
191 aa  72.4  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.30752  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1153  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  31.13 
 
 
180 aa  72.4  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3262  flavin reductase-like, FMN-binding  32.65 
 
 
161 aa  72.4  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0281543 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1173  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase component  28.57 
 
 
170 aa  72.4  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1162  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase component  28.57 
 
 
170 aa  72.4  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.444908  normal  0.733145 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1057  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase component  28.57 
 
 
170 aa  72.4  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1193  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase component  28.57 
 
 
170 aa  72.4  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10990  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase small chain  28.48 
 
 
170 aa  72.4  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.699106  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1208  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase component  28.57 
 
 
170 aa  72.4  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3643  oxidoreductase, putative  31.97 
 
 
161 aa  72  0.000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0302568  normal  0.0898299 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3405  flavin reductase-like, FMN-binding  28.19 
 
 
180 aa  72  0.000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0712  flavin reductase-like, FMN-binding  26.74 
 
 
169 aa  71.6  0.000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.195047  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4106  flavin reductase domain-containing protein  32.68 
 
 
170 aa  71.6  0.000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000156501 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2646  flavin reductase-like, FMN-binding  30.86 
 
 
204 aa  71.6  0.000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2088  flavin reductase domain-containing protein  31.97 
 
 
161 aa  71.6  0.000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000731585  normal  0.792508 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1734  flavin reductase domain-containing protein  29.68 
 
 
202 aa  71.6  0.000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.521212  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0713  flavin reductase domain-containing protein  32.3 
 
 
171 aa  71.6  0.000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.497373  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0087  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.94 
 
 
186 aa  71.6  0.000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>