More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5758 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_5758  flavin reductase domain-containing protein  100 
 
 
183 aa  360  8e-99  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4109  flavin reductase domain protein FMN-binding  42.21 
 
 
174 aa  109  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2695  flavin reductase domain-containing protein  35.81 
 
 
178 aa  85.9  3e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.2164  normal  0.150119 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0945  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  38.41 
 
 
170 aa  84  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.930099  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4081  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.94 
 
 
163 aa  82.8  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.395144  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4187  flavin reductase domain-containing protein  32.28 
 
 
156 aa  82.4  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.344162  hitchhiker  0.00000247222 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2574  flavin reductase domain-containing protein  36.73 
 
 
181 aa  80.1  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2124  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  33.78 
 
 
184 aa  79.7  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.159244  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0162  flavin reductase-like protein  36.71 
 
 
167 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4322  flavin reductase domain-containing protein  32.28 
 
 
156 aa  79.7  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.495347 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3173  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.21 
 
 
155 aa  79.3  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.213746  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2409  flavin reductase domain-containing protein  36.73 
 
 
181 aa  79.3  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3429  flavin reductase domain-containing protein  39.23 
 
 
172 aa  77.4  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.170118  normal  0.316172 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0553  flavin reductase domain-containing protein  35.88 
 
 
173 aa  77.4  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00870813 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1694  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  34.93 
 
 
166 aa  76.3  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0487183  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6997  flavin reductase-like, FMN-binding protein  32.33 
 
 
179 aa  76.6  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00974297 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4700  flavin reductase domain protein FMN-binding  37.4 
 
 
179 aa  73.6  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.403241  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3141  flavin reductase domain protein FMN-binding  37.16 
 
 
165 aa  74.3  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1909  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.31 
 
 
160 aa  73.2  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0686  flavin reductase-like, FMN-binding  31.33 
 
 
193 aa  72  0.000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.520782  normal  0.880219 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1006  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase small chain  36.5 
 
 
170 aa  72.4  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2880  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.79 
 
 
189 aa  72  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2283  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.94 
 
 
191 aa  71.2  0.000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0153986  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3691  flavin reductase domain-containing protein  33.56 
 
 
158 aa  71.2  0.000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00123529  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4939  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  37.35 
 
 
178 aa  71.2  0.000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.372031  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2035  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.33 
 
 
166 aa  71.2  0.000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6495  flavin reductase domain protein FMN-binding  40.82 
 
 
168 aa  70.5  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4010  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  35.33 
 
 
176 aa  70.9  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0934  flavin reductase domain-containing protein  32.7 
 
 
186 aa  70.5  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.351151  normal  0.609948 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3055  flavin reductase domain-containing protein  31.82 
 
 
169 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4363  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  35.37 
 
 
174 aa  70.5  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5305  flavin reductase domain-containing protein  31.65 
 
 
188 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.843488  normal  0.297216 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1371  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  38.17 
 
 
169 aa  69.7  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.361303  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0938  flavin reductase-like, FMN-binding  35.42 
 
 
180 aa  70.1  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.940093  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3100  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  30.72 
 
 
155 aa  70.1  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1536  flavin reductase-like, FMN-binding protein  34.67 
 
 
163 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.543924  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1559  flavin reductase domain-containing protein  34.67 
 
 
163 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.426657  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2697  flavin reductase domain-containing protein  31.82 
 
 
193 aa  68.9  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.235681 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1607  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  35.67 
 
 
168 aa  69.3  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10990  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase small chain  34.31 
 
 
170 aa  68.9  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.699106  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5091  flavin reductase domain-containing protein  32.1 
 
 
188 aa  68.9  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.504417 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4706  flavin reductase-like, FMN-binding protein  32.1 
 
 
204 aa  68.9  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4792  flavin reductase domain-containing protein  32.1 
 
 
188 aa  68.9  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.971177  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1331  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  30.2 
 
 
157 aa  68.2  0.00000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0131046  normal  0.0375915 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2385  flavin reductase-like, FMN-binding  28.39 
 
 
162 aa  67.8  0.00000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.289949  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1345  flavin reductase-like, FMN-binding  34.78 
 
 
174 aa  67  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000569792  hitchhiker  0.00000938161 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1643  flavin reductase-like protein  39.62 
 
 
170 aa  67  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.170463  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3405  flavin reductase-like, FMN-binding  34.03 
 
 
180 aa  67.4  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1795  flavin reductase domain-containing protein  40.4 
 
 
164 aa  67.4  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.629541  normal  0.120123 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0221  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  33.07 
 
 
135 aa  67.4  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0068  flavin reductase domain-containing protein  35.53 
 
 
186 aa  67.4  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2494  flavin reductase domain-containing protein  34.16 
 
 
169 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.116898  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0578  putative reductase  36.15 
 
 
163 aa  66.2  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.637649  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1212  flavin reductase domain-containing protein  35.76 
 
 
185 aa  66.6  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2623  flavin reductase domain-containing protein  34.16 
 
 
169 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.906028  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0087  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.53 
 
 
186 aa  66.6  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3091  flavin reductase domain-containing protein  31.37 
 
 
169 aa  65.9  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0221  flavin reductase domain-containing protein  35.76 
 
 
393 aa  66.2  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3697  hypothetical protein  32.48 
 
 
168 aa  65.5  0.0000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.416114  normal  0.561141 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6241  flavin reductase domain-containing protein  34.46 
 
 
170 aa  65.5  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1003  flavin reductase-like, FMN-binding  32.61 
 
 
173 aa  65.5  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2865  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  33.33 
 
 
163 aa  65.1  0.0000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.180044  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2599  flavin reductase domain-containing protein  34.57 
 
 
169 aa  64.7  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1964  flavin reductase-like, FMN-binding  34.57 
 
 
169 aa  64.7  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.277567  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2575  flavin reductase domain-containing protein  34.57 
 
 
169 aa  64.7  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2144  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  34.65 
 
 
162 aa  64.7  0.0000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.438455  normal  0.0344476 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0311  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  32.28 
 
 
158 aa  64.7  0.0000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5906  flavin reductase-like, FMN-binding  34.57 
 
 
169 aa  64.7  0.0000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.812224 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5724  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.92 
 
 
179 aa  64.7  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6349  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.13 
 
 
183 aa  64.7  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00500234  hitchhiker  0.000771796 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2464  flavin reductase-like, FMN-binding  30.13 
 
 
170 aa  64.7  0.0000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0127  flavin reductase domain-containing protein  36.18 
 
 
173 aa  64.7  0.0000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7180  flavin reductase-like, FMN-binding  34.23 
 
 
175 aa  64.3  0.0000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.050322 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2517  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  30.91 
 
 
174 aa  64.3  0.0000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.118991  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0722  flavin reductase domain-containing protein  34.16 
 
 
169 aa  64.3  0.0000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.1645 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1858  GntR family transcriptional regulator  31.13 
 
 
393 aa  64.3  0.0000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000920069  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4430  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.77 
 
 
170 aa  64.3  0.0000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0990  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  37.12 
 
 
164 aa  63.9  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.223407  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0995  flavin reductase-like  30.61 
 
 
178 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1916  flavin reductase domain-containing protein  34.87 
 
 
166 aa  63.9  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.751349 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13600  oxidoreductase  28.98 
 
 
187 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.295254  normal  0.297766 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4570  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.19 
 
 
259 aa  63.9  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.880752 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1893  flavin reductase domain-containing protein  32.43 
 
 
196 aa  63.9  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1153  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  29.03 
 
 
180 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4448  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.29 
 
 
165 aa  63.2  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6121  flavin reductase domain-containing protein  32.86 
 
 
311 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.272267  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3861  flavin reductase-like, FMN-binding  33.56 
 
 
214 aa  63.2  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.657973  normal  0.52723 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1462  flavin reductase-like, FMN-binding  33.96 
 
 
172 aa  63.2  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.194965  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1133  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  30.2 
 
 
170 aa  63.2  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2773  flavin reductase domain-containing protein  30.46 
 
 
204 aa  63.5  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.827464  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0196  flavin reductase-like protein, FMN-binding  32.21 
 
 
162 aa  62.8  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.869968 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5501  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.25 
 
 
311 aa  62.8  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1225  flavin:NADH reductase  26 
 
 
147 aa  62.4  0.000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00730125  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3492  flavin reductase domain-containing protein  31.51 
 
 
196 aa  62.4  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.649548 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3051  flavin reductase domain-containing protein  32.21 
 
 
166 aa  62.4  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0226869 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1255  putative monooxygenase  31.03 
 
 
210 aa  62  0.000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.218566  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1466  flavin reductase domain-containing protein  29.75 
 
 
188 aa  62  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4106  flavin reductase domain-containing protein  35.37 
 
 
170 aa  62  0.000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000156501 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3246  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.93 
 
 
172 aa  62  0.000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.376116 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3318  flavin reductase-like, FMN-binding  35.71 
 
 
170 aa  62  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000349305  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>