More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0162 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0162  flavin reductase-like protein  100 
 
 
167 aa  338  2e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2731  flavin reductase-like domain-containing protein  46.39 
 
 
164 aa  140  8e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.066131  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1643  flavin reductase-like protein  46.63 
 
 
170 aa  139  9.999999999999999e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.170463  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2464  flavin reductase domain protein FMN-binding  41.78 
 
 
159 aa  108  3e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1919  flavin reductase-like, FMN-binding  36.3 
 
 
159 aa  106  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0340675 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1253  flavin reductase-like, FMN-binding protein  40.14 
 
 
164 aa  106  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.516374  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1752  flavin reductase domain-containing protein  38.52 
 
 
152 aa  103  8e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.503981  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3504  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.37 
 
 
160 aa  100  8e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.507811  normal  0.0756522 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2602  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.37 
 
 
160 aa  100  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3170  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.01 
 
 
160 aa  96.7  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0382  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  37.76 
 
 
160 aa  95.5  3e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.610168  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0643  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.1 
 
 
159 aa  93.6  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0543494  normal  0.644181 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0160  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.79 
 
 
159 aa  92.4  3e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2008  hypothetical protein  38.76 
 
 
160 aa  91.7  4e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119390  Diflavin flavoprotein A 1-like protein  35 
 
 
638 aa  90.9  8e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.254321  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0388  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  30.41 
 
 
159 aa  90.5  9e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08811  hypothetical protein  33.56 
 
 
160 aa  88.6  4e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000102678 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1802  flavin reductase-like, FMN-binding  36.84 
 
 
574 aa  87  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2966  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.07 
 
 
575 aa  87  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.928033 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1212  flavin reductase domain-containing protein  35.21 
 
 
185 aa  86.3  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5034  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  34.27 
 
 
171 aa  86.7  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4322  flavin reductase domain-containing protein  30.92 
 
 
156 aa  85.1  4e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.495347 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1114  hypothetical protein  34.25 
 
 
160 aa  84.7  5e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1288  flavin reductase-like, FMN-binding  34.75 
 
 
229 aa  84.7  5e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000609223 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3842  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  35.25 
 
 
190 aa  84.7  5e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1255  flavin reductase domain-containing protein  31.82 
 
 
216 aa  84.3  6e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4187  flavin reductase domain-containing protein  31.13 
 
 
156 aa  84.3  7e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.344162  hitchhiker  0.00000247222 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0302  flavin reductase-like, FMN-binding  31.33 
 
 
575 aa  84.3  7e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.225736  normal  0.971222 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14951  hypothetical protein  35.43 
 
 
168 aa  84.3  7e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.431741 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1034  flavin reductase domain-containing protein  36.3 
 
 
164 aa  84  8e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6116  flavin reductase domain-containing protein  34.78 
 
 
320 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.362693  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6548  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.62 
 
 
311 aa  83.6  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.43019  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0685  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.09 
 
 
575 aa  82.4  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.228125  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0327  hypothetical protein  32.19 
 
 
160 aa  82.8  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.217088  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10001  hypothetical protein  32.19 
 
 
160 aa  82.8  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.537095  normal  0.391839 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1163  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  34.09 
 
 
582 aa  82.4  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1364  hypothetical protein  33.56 
 
 
160 aa  83.2  0.000000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.290853 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26130  conserved protein of DIM6/NTAB family  32.87 
 
 
179 aa  82.8  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.861848  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0666  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.09 
 
 
575 aa  82.4  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2215  nitrilotriacetate monooxygenase  34.53 
 
 
318 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.130283  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1408  flavin reductase domain-containing protein  34.92 
 
 
173 aa  82.4  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.913162  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5585  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.85 
 
 
311 aa  81.6  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.144422  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3119  flavin reductase-like, FMN-binding  31.25 
 
 
220 aa  81.3  0.000000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0001  flavin reductase domain-containing protein  26.35 
 
 
171 aa  81.3  0.000000000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.117623  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2713  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.56 
 
 
227 aa  81.3  0.000000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.120734 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1371  flavin reductase-like, FMN-binding  31.65 
 
 
576 aa  80.9  0.000000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0719317 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6253  flavin reductase domain-containing protein  34.62 
 
 
311 aa  80.9  0.000000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.103541  normal  0.25638 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0873  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  29.33 
 
 
169 aa  80.5  0.00000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000143727  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6241  flavin reductase domain-containing protein  32.56 
 
 
170 aa  80.1  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3173  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.67 
 
 
155 aa  80.1  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.213746  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5758  flavin reductase domain-containing protein  36.71 
 
 
183 aa  79.7  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3603  putative oxygenase  32.65 
 
 
172 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000000048428  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1857  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.66 
 
 
574 aa  79.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4140  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  32.58 
 
 
572 aa  79  0.00000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1858  GntR family transcriptional regulator  31.29 
 
 
393 aa  78.6  0.00000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000920069  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32170  Flavin reductase domain protein  33.57 
 
 
313 aa  79  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1466  flavin reductase domain-containing protein  33.57 
 
 
188 aa  78.6  0.00000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5305  flavin reductase domain-containing protein  32.39 
 
 
188 aa  77  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.843488  normal  0.297216 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1439  flavin reductase-like, FMN-binding  32.84 
 
 
579 aa  75.9  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0252  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  33.99 
 
 
177 aa  76.3  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2575  flavin reductase domain-containing protein  33.97 
 
 
169 aa  76.3  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09651  hypothetical protein  31.54 
 
 
162 aa  75.9  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09761  hypothetical protein  32.56 
 
 
162 aa  75.5  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.432138  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2676  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  34.19 
 
 
204 aa  75.5  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.178814  normal  0.80645 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0945  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  35.42 
 
 
170 aa  75.9  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.930099  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0770  flavin reductase-like, FMN-binding  30.88 
 
 
574 aa  75.9  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09781  hypothetical protein  32.56 
 
 
162 aa  75.5  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5343  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  30.3 
 
 
157 aa  75.1  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2919  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  33.8 
 
 
178 aa  74.7  0.0000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.15426  normal  0.385823 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1809  flavoprotein  32.56 
 
 
571 aa  74.7  0.0000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.402946 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8271  flavin reductase domain-containing protein  37.4 
 
 
168 aa  74.7  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.125627 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0221  flavin reductase domain-containing protein  39.62 
 
 
393 aa  74.3  0.0000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0479  flavin reductase domain protein FMN-binding  35 
 
 
575 aa  74.3  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2144  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  37.62 
 
 
162 aa  74.3  0.0000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.438455  normal  0.0344476 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4324  flavin reductase domain-containing protein  34.65 
 
 
327 aa  74.3  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.160185 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6441  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.17 
 
 
179 aa  74.3  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0182942 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0349  flavin reductase domain-containing protein  28.17 
 
 
160 aa  73.9  0.0000000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2478  flavin reductase domain-containing protein  32.52 
 
 
302 aa  73.6  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.375829  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2404  flavin reductase-like, FMN-binding  34.97 
 
 
197 aa  73.2  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0203545 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4057  flavin reductase-like, FMN-binding  41.35 
 
 
172 aa  73.6  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0779  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.13 
 
 
192 aa  73.6  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0273259  normal  0.15291 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00461  flavoprotein  36.03 
 
 
591 aa  73.6  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.551818  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13600  oxidoreductase  30.71 
 
 
187 aa  73.6  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.295254  normal  0.297766 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3604  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.34 
 
 
576 aa  72.8  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5433  flavin reductase-like, FMN-binding  31.65 
 
 
174 aa  73.2  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4109  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.66 
 
 
174 aa  73.2  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3189  flavin reductase domain-containing protein  32.17 
 
 
304 aa  73.2  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2880  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.93 
 
 
189 aa  72.8  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0713  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.13 
 
 
192 aa  72.8  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0114519  normal  0.0515265 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0044  flavoprotein  35.29 
 
 
591 aa  73.2  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.714834  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0917  hypothetical protein  31.78 
 
 
162 aa  73.2  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.00504908  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1810  flavoprotein  33.08 
 
 
584 aa  73.2  0.000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.361891  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1579  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  28.08 
 
 
176 aa  72.8  0.000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1734  flavin reductase domain-containing protein  31.97 
 
 
202 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.521212  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1003  flavin reductase-like, FMN-binding  32.03 
 
 
173 aa  73.2  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00441  flavoprotein  35.29 
 
 
591 aa  72.8  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2053  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.97 
 
 
201 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.490233  normal  0.271048 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2510  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.34 
 
 
576 aa  72.8  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0876298  normal  0.340192 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2866  flavin reductase domain-containing protein  32.17 
 
 
175 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.567161  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1335  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  26.03 
 
 
221 aa  72.8  0.000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.296407  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>