More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1752 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_1752  flavin reductase domain-containing protein  100 
 
 
152 aa  306  5.9999999999999995e-83  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.503981  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0769  flavin reductase domain-containing protein  44.97 
 
 
149 aa  154  5.0000000000000005e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0792  flavin reductase domain-containing protein  44.3 
 
 
149 aa  152  1e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0162  flavin reductase-like protein  38.52 
 
 
167 aa  103  6e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0643  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.36 
 
 
159 aa  103  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0543494  normal  0.644181 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2464  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.92 
 
 
159 aa  100  7e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1253  flavin reductase-like, FMN-binding protein  30.07 
 
 
164 aa  99.4  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.516374  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1919  flavin reductase-like, FMN-binding  36.36 
 
 
159 aa  99  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0340675 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2602  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.57 
 
 
160 aa  95.5  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3504  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.57 
 
 
160 aa  95.5  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.507811  normal  0.0756522 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08811  hypothetical protein  33.09 
 
 
160 aa  95.5  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000102678 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0382  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  36.72 
 
 
160 aa  94  7e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.610168  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3173  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.86 
 
 
155 aa  91.3  4e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.213746  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14951  hypothetical protein  34.92 
 
 
168 aa  91.3  4e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.431741 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3170  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.53 
 
 
160 aa  91.3  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0001  flavin reductase domain-containing protein  36.05 
 
 
171 aa  90.1  9e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.117623  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1141  flavin reductase domain-containing protein  36.07 
 
 
183 aa  89.7  1e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.494396  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2124  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  28.99 
 
 
184 aa  88.2  3e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.159244  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1694  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  30.26 
 
 
166 aa  87  8e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0487183  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3691  flavin reductase domain-containing protein  33.8 
 
 
158 aa  87  8e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00123529  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0917  hypothetical protein  37.5 
 
 
162 aa  86.7  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.00504908  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1536  flavin reductase-like, FMN-binding protein  31.61 
 
 
163 aa  86.7  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.543924  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1559  flavin reductase domain-containing protein  31.61 
 
 
163 aa  86.7  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.426657  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0327  hypothetical protein  29.63 
 
 
160 aa  85.5  2e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.217088  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09761  hypothetical protein  37.61 
 
 
162 aa  85.9  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.432138  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10001  hypothetical protein  29.63 
 
 
160 aa  85.5  2e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.537095  normal  0.391839 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09781  hypothetical protein  37.61 
 
 
162 aa  85.9  2e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09651  hypothetical protein  37.27 
 
 
162 aa  85.1  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5034  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  29.8 
 
 
171 aa  84.7  4e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1114  hypothetical protein  33.33 
 
 
160 aa  84.3  6e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0349  flavin reductase domain-containing protein  32.33 
 
 
160 aa  84  7e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1628  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  29.79 
 
 
191 aa  84  7e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.96202  normal  0.763872 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0580  flavin reductase-like  31.94 
 
 
163 aa  83.6  8e-16  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00229165  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2008  hypothetical protein  33.33 
 
 
160 aa  83.6  9e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2205  flavin reductase-like, FMN-binding  29.53 
 
 
162 aa  83.6  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.361259  normal  0.347764 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5343  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  31.4 
 
 
157 aa  82.8  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1364  hypothetical protein  30.95 
 
 
160 aa  82.4  0.000000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.290853 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3603  putative oxygenase  34.97 
 
 
172 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000000048428  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5077  nitrilotriacetate monooxygenase  28.37 
 
 
202 aa  82  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.332011  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2713  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.92 
 
 
227 aa  81.6  0.000000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.120734 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1255  flavin reductase domain-containing protein  29.08 
 
 
216 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3119  flavin reductase-like, FMN-binding  32.84 
 
 
220 aa  81.6  0.000000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0252  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  29.32 
 
 
177 aa  80.5  0.000000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1034  flavin reductase domain-containing protein  28.37 
 
 
164 aa  80.5  0.000000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0873  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  33.8 
 
 
169 aa  80.5  0.000000000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000143727  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2394  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.56 
 
 
216 aa  80.5  0.000000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00571453  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2570  flavin reductase domain-containing protein  32.12 
 
 
178 aa  80.5  0.000000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3262  flavin reductase-like, FMN-binding  33.81 
 
 
161 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0281543 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0343  flavin reductase-like, FMN-binding  35.46 
 
 
200 aa  80.1  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.37872  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2406  flavin reductase-like  33.81 
 
 
161 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.17627  normal  0.747967 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1643  flavin reductase-like protein  31.82 
 
 
170 aa  79.3  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.170463  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5531  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.62 
 
 
183 aa  79  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0259957  decreased coverage  0.00000136774 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2083  flavin reductase domain-containing protein  32.62 
 
 
161 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2261  flavin reductase domain-containing protein  32.62 
 
 
161 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4569  flavin reductase domain-containing protein  27.86 
 
 
168 aa  79  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.168404 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2731  flavin reductase-like domain-containing protein  27.45 
 
 
164 aa  78.6  0.00000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.066131  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1288  flavin reductase-like, FMN-binding  30.28 
 
 
229 aa  78.6  0.00000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000609223 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6600  Conserved protein/domain typically associated with flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family  22.73 
 
 
430 aa  78.6  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.023971  normal  0.547709 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4187  flavin reductase domain-containing protein  29.05 
 
 
156 aa  78.6  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.344162  hitchhiker  0.00000247222 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0922  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  26.76 
 
 
190 aa  78.2  0.00000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2256  flavin reductase domain-containing protein  33.1 
 
 
161 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.550172  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4322  flavin reductase domain-containing protein  29.05 
 
 
156 aa  77.8  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.495347 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3881  flavin reductase domain-containing protein  35.59 
 
 
209 aa  78.2  0.00000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3647  oxidoreductase, putative  31.91 
 
 
161 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0722443  normal  0.161696 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6349  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.68 
 
 
183 aa  77.4  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00500234  hitchhiker  0.000771796 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0388  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  26.87 
 
 
159 aa  77.4  0.00000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1462  flavin reductase-like, FMN-binding  30.5 
 
 
172 aa  77.4  0.00000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.194965  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3234  flavin reductase-like, FMN-binding  33.81 
 
 
161 aa  77  0.00000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1909  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.08 
 
 
160 aa  77  0.00000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3440  flavin reductase domain-containing protein  31.21 
 
 
161 aa  77  0.00000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.540454  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3349  flavoredoxin Flr  31.25 
 
 
188 aa  76.3  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0445888 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0160  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.37 
 
 
159 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2695  flavin reductase domain-containing protein  26.81 
 
 
178 aa  76.3  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.2164  normal  0.150119 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1795  flavin reductase domain-containing protein  31.21 
 
 
164 aa  76.6  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.629541  normal  0.120123 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3451  flavin reductase domain-containing protein  33.81 
 
 
161 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.299495  normal  0.309521 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0713  flavin reductase domain-containing protein  28.08 
 
 
171 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.497373  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3295  putative monooxygenase/flavin reductase-like, FMN-binding  29.05 
 
 
190 aa  76.3  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.940039  normal  0.148638 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1607  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  28.57 
 
 
168 aa  75.5  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0994  flavin reductase domain-containing protein  29.17 
 
 
173 aa  75.9  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1212  flavin reductase domain-containing protein  26.06 
 
 
185 aa  75.9  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3643  oxidoreductase, putative  33.09 
 
 
161 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0302568  normal  0.0898299 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3100  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  32.61 
 
 
155 aa  75.5  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32170  Flavin reductase domain protein  31.25 
 
 
313 aa  75.1  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5977  flavin reductase domain-containing protein  30.65 
 
 
226 aa  75.5  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957349  normal  0.320583 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6121  flavin reductase domain-containing protein  31.78 
 
 
311 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.272267  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2261  flavin reductase domain-containing protein  32.37 
 
 
161 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0763  putative monooxygenase oxidoreductase protein  31.4 
 
 
191 aa  75.1  0.0000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.205709 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0127  flavin reductase domain-containing protein  31.94 
 
 
173 aa  74.7  0.0000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1986  flavin reductase domain-containing protein  30.22 
 
 
166 aa  74.7  0.0000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0442  putative flavin reductase  33.83 
 
 
164 aa  74.7  0.0000000000004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0378  flavin reductase domain-containing protein  24.44 
 
 
168 aa  74.7  0.0000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.557848  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2266  flavin reductase domain-containing protein  31.65 
 
 
161 aa  75.1  0.0000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0871  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.15 
 
 
175 aa  74.7  0.0000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.190746 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2488  flavin reductase domain-containing protein  28.08 
 
 
171 aa  74.7  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.276719  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0898  flavin reductase family protein  28.08 
 
 
171 aa  74.7  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0264693  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0355  flavin reductase domain-containing protein  28.08 
 
 
171 aa  74.7  0.0000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0401487  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0101  flavin reductase domain-containing protein  28.08 
 
 
171 aa  74.7  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0532908  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1057  flavin reductase domain-containing protein  28.08 
 
 
171 aa  74.7  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.667997  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0653  flavin reductase domain-containing protein  28.08 
 
 
171 aa  74.7  0.0000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0962723  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0895  flavin reductase family protein  28.08 
 
 
171 aa  74.7  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0770098  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>