More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_0917 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007577  PMT9312_0917  hypothetical protein  100 
 
 		 162 aa  330  4e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.00504908  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09761  hypothetical protein  98.77 
 
 		 162 aa  325  1.0000000000000001e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.432138  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09781  hypothetical protein  98.77 
 
 		 162 aa  325  1.0000000000000001e-88  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09651  hypothetical protein  91.98 
 
 		 162 aa  305  2.0000000000000002e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14951  hypothetical protein  75.31 
 
 		 168 aa  261  3e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.431741 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1364  hypothetical protein  73.46 
 
 		 160 aa  252  1.0000000000000001e-66  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.290853 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0327  hypothetical protein  73.46 
 
 		 160 aa  251  4.0000000000000004e-66  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.217088  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10001  hypothetical protein  73.46 
 
 		 160 aa  251  4.0000000000000004e-66  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.537095  normal  0.391839 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1114  hypothetical protein  73.46 
 
 		 160 aa  249  9.000000000000001e-66  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08811  hypothetical protein  72.84 
 
 		 160 aa  246  9e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000102678 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2008  hypothetical protein  58.39 
 
 		 160 aa  192  2e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1919  flavin reductase-like, FMN-binding  58.13 
 
 		 159 aa  192  2e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0340675 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2602  flavin reductase domain protein FMN-binding  57.14 
 
 		 160 aa  183  7e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3504  flavin reductase domain protein FMN-binding  57.14 
 
 		 160 aa  183  7e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.507811  normal  0.0756522 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3170  flavin reductase domain protein FMN-binding  55.9 
 
 		 160 aa  182  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0643  flavin reductase domain protein FMN-binding  51.25 
 
 		 159 aa  169  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0543494  normal  0.644181 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2464  flavin reductase domain protein FMN-binding  46.25 
 
 		 159 aa  137  7.999999999999999e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0160  flavin reductase domain protein FMN-binding  41.88 
 
 		 159 aa  131  3.9999999999999996e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0388  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  36.02 
 
 		 159 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2731  flavin reductase-like domain-containing protein  31.41 
 
 		 164 aa  90.5  1e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.066131  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1253  flavin reductase-like, FMN-binding protein  32.85 
 
 		 164 aa  88.2  4e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.516374  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1752  flavin reductase domain-containing protein  37.5 
 
 		 152 aa  86.7  1e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.503981  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4322  flavin reductase domain-containing protein  31.71 
 
 		 156 aa  83.6  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.495347 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1858  GntR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 393 aa  83.2  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000920069  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4187  flavin reductase domain-containing protein  33.61 
 
 		 156 aa  81.3  0.000000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.344162  hitchhiker  0.00000247222 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0349  flavin reductase domain-containing protein  31.43 
 
 		 160 aa  75.9  0.0000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6253  flavin reductase domain-containing protein  31.2 
 
 		 311 aa  75.9  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.103541  normal  0.25638 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0770  flavin reductase-like, FMN-binding  31.21 
 
 		 574 aa  74.7  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36317  predicted protein  31.94 
 
 		 588 aa  74.3  0.0000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0769  flavin reductase domain-containing protein  28.23 
 
 		 149 aa  73.2  0.000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0792  flavin reductase domain-containing protein  29.2 
 
 		 149 aa  72.8  0.000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3189  flavin reductase domain-containing protein  29.08 
 
 		 172 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2966  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.33 
 
 		 575 aa  72.4  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.928033 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0162  flavin reductase-like protein  31.78 
 
 		 167 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1034  flavin reductase domain-containing protein  35.38 
 
 		 164 aa  72.8  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6349  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.26 
 
 		 183 aa  71.6  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00500234  hitchhiker  0.000771796 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3100  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  31.5 
 
 		 155 aa  71.2  0.000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0510  flavin reductase domain-containing protein  36.45 
 
 		 174 aa  70.5  0.000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.094349  normal  0.146674 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1459  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.28 
 
 		 573 aa  70.1  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1228  flavin reductase domain-containing protein  31.54 
 
 		 192 aa  70.5  0.00000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6086  flavoprotein oxidoreductase  31.01 
 
 		 306 aa  69.3  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.414273  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0252  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  32.2 
 
 		 177 aa  69.3  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4109  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.25 
 
 		 174 aa  69.3  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6600  Conserved protein/domain typically associated with flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family  31.5 
 
 		 430 aa  69.3  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.023971  normal  0.547709 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2124  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  27.61 
 
 		 184 aa  68.9  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.159244  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0382  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  31.69 
 
 		 160 aa  68.9  0.00000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.610168  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3504  flavin reductase domain-containing protein  31.13 
 
 		 309 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0504926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5585  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.03 
 
 		 311 aa  68.9  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.144422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1810  flavoprotein  30.47 
 
 		 584 aa  68.9  0.00000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.361891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1380  putative oxygenase  30.7 
 
 		 166 aa  68.6  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.436  normal  0.571719 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3173  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.09 
 
 		 155 aa  68.6  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.213746  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0763  putative monooxygenase oxidoreductase protein  35.51 
 
 		 191 aa  67.8  0.00000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.205709 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0355  flavin reductase domain-containing protein  32.2 
 
 		 171 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0401487  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1803  flavin reductase-like, FMN-binding  32.87 
 
 		 570 aa  68.2  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1057  flavin reductase domain-containing protein  32.2 
 
 		 171 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.667997  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2488  flavin reductase domain-containing protein  32.2 
 
 		 171 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.276719  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0713  flavin reductase domain-containing protein  32.2 
 
 		 171 aa  68.2  0.00000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.497373  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0101  flavin reductase domain-containing protein  32.2 
 
 		 171 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0532908  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0895  flavin reductase family protein  32.2 
 
 		 171 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0770098  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0898  flavin reductase family protein  32.2 
 
 		 171 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0264693  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0653  flavin reductase domain-containing protein  32.2 
 
 		 171 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0962723  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2646  flavin reductase-like, FMN-binding  34.58 
 
 		 204 aa  67.8  0.00000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5120  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.83 
 
 		 163 aa  67.4  0.00000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0811  flavin reductase-like, FMN-binding  34.58 
 
 		 186 aa  67.4  0.00000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0873  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  31.85 
 
 		 169 aa  67.4  0.00000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000143727  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0938  flavin reductase-like, FMN-binding  30.14 
 
 		 180 aa  67.4  0.00000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.940093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3225  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.34 
 
 		 169 aa  67  0.00000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8752  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.61 
 
 		 162 aa  67  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.125188 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4140  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  32.39 
 
 		 572 aa  66.2  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0001  flavin reductase domain-containing protein  30.07 
 
 		 171 aa  65.9  0.0000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.117623  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6548  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.58 
 
 		 311 aa  66.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.43019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0713  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.58 
 
 		 192 aa  66.2  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0114519  normal  0.0515265 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6116  flavin reductase domain-containing protein  28.06 
 
 		 320 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.362693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0737  putative flavin reductase-like protein  29.71 
 
 		 169 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0805  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.85 
 
 		 573 aa  66.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32170  Flavin reductase domain protein  33.96 
 
 		 313 aa  65.9  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0834  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.85 
 
 		 573 aa  65.5  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.293861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1371  flavin reductase-like, FMN-binding  31.97 
 
 		 576 aa  64.7  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0719317 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5305  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.05 
 
 		 184 aa  64.7  0.0000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0697  flavin reductase-like, FMN-binding  27.2 
 
 		 174 aa  64.7  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.318628  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0666  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.11 
 
 		 575 aa  64.3  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0685  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.11 
 
 		 575 aa  64.3  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.228125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2406  flavin reductase-like  30.15 
 
 		 161 aa  64.3  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.17627  normal  0.747967 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5977  flavin reductase domain-containing protein  26.39 
 
 		 226 aa  64.3  0.0000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957349  normal  0.320583 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0779  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.64 
 
 		 192 aa  64.3  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0273259  normal  0.15291 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1375  flavodoxin:flavin reductase-like domain-containing protein  28.46 
 
 		 616 aa  63.9  0.0000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.170384  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4081  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.19 
 
 		 163 aa  63.9  0.0000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.395144  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00561  flavoprotein  28.46 
 
 		 500 aa  63.9  0.0000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3691  flavin reductase domain-containing protein  26.89 
 
 		 158 aa  63.2  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00123529  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0553  flavin reductase domain-containing protein  33.64 
 
 		 173 aa  63.2  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00870813 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5504  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.37 
 
 		 330 aa  63.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.414218  decreased coverage  0.000482944 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2494  flavin reductase domain-containing protein  33.64 
 
 		 169 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.116898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2623  flavin reductase domain-containing protein  33.64 
 
 		 169 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.906028  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0722  flavin reductase domain-containing protein  32.71 
 
 		 169 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.1645 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6044  flavin reductase domain-containing protein  27.08 
 
 		 226 aa  63.2  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.347531  normal  0.729214 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5938  flavin reductase domain-containing protein  27.08 
 
 		 226 aa  63.2  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0245052 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5433  flavin reductase-like, FMN-binding  30.7 
 
 		 174 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4700  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.93 
 
 		 179 aa  62.8  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.403241  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2088  flavin reductase domain-containing protein  29.55 
 
 		 161 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000731585  normal  0.792508 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3189  flavin reductase domain-containing protein  31.13 
 
 		 304 aa  62.8  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>