More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0343 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0343  flavin reductase-like, FMN-binding  100 
 
 		 200 aa  412  1e-114  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.37872  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2225  flavin reductase domain protein FMN-binding  70.62 
 
 		 195 aa  291  3e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3881  flavin reductase domain-containing protein  53.73 
 
 		 209 aa  225  4e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0359  flavin reductase domain-containing protein  50.78 
 
 		 195 aa  210  9e-54  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.184245 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1661  flavoredoxin  48.95 
 
 		 192 aa  185  5e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.600705  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1399  flavin reductase, putative  48.95 
 
 		 192 aa  185  5e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0187374  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2040  flavin reductase domain protein FMN-binding  46.91 
 
 		 186 aa  178  4.999999999999999e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.228084  hitchhiker  0.0000000489831 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2181  flavin reductase domain protein FMN-binding  38.1 
 
 		 190 aa  135  3.0000000000000003e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2036  flavin reductase domain protein FMN-binding  37.04 
 
 		 190 aa  135  4e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000423527  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0078  flavoredoxin  36.46 
 
 		 189 aa  131  7.999999999999999e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00025705  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2549  flavin reductase domain-containing protein  37.34 
 
 		 190 aa  129  3e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.355058  normal  0.136226 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0126  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.39 
 
 		 194 aa  125  3e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2701  flavin reductase domain protein FMN-binding  37.43 
 
 		 189 aa  124  7e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2846  flavin reductase domain-containing protein  36.17 
 
 		 200 aa  124  8.000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000500824  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0805  flavin reductase-like, FMN-binding  37.08 
 
 		 188 aa  124  8.000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1443  flavin reductase-like, FMN-binding  38.41 
 
 		 189 aa  124  9e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0520  flavin reductase domain protein FMN-binding  37.36 
 
 		 189 aa  123  1e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0642  flavin reductase domain protein FMN-binding  40.28 
 
 		 190 aa  122  3e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0563737  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0347  flavin reductase domain-containing protein  34.08 
 
 		 191 aa  122  5e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.643208  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1572  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.47 
 
 		 190 aa  121  6e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3349  flavoredoxin Flr  38.32 
 
 		 188 aa  121  8e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0445888 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2210  flavin reductase domain-containing protein  34.83 
 
 		 189 aa  120  9e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0259  flavoredoxin  34.83 
 
 		 189 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3486  flavin reductase domain protein FMN-binding  37.5 
 
 		 192 aa  118  6e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0187  flavoredoxin  33.69 
 
 		 190 aa  111  5e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.871882  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1144  flavin reductase-like, FMN-binding  33.75 
 
 		 189 aa  109  3e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.467484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0922  flavin reductase domain protein FMN-binding  37.24 
 
 		 195 aa  109  3e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3444  flavin reductase domain-containing protein  32.78 
 
 		 216 aa  108  5e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.280033  unclonable  0.00000709652 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0743  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.71 
 
 		 185 aa  108  6e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1524  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.84 
 
 		 215 aa  101  7e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2479  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.37 
 
 		 186 aa  97.8  9e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.261608 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1855  flavin reductase domain-containing protein  32.77 
 
 		 186 aa  97.4  1e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.165677  normal  0.56563 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0382  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  32.24 
 
 		 160 aa  97.4  1e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.610168  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0678  flavoredoxin  32.14 
 
 		 184 aa  96.3  3e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.616599 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00650  conserved protein of DIM6/NTAB family  28.31 
 
 		 194 aa  94.7  8e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0995  hypothetical protein  30.73 
 
 		 185 aa  93.6  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.418174  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0014  flavin reductase domain-containing protein  29.55 
 
 		 189 aa  89  4e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5713  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.5 
 
 		 189 aa  87.8  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.483715  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1592  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  32.94 
 
 		 193 aa  87.8  1e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4219  hypothetical protein  32.43 
 
 		 205 aa  86.7  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.269485 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0883  hypothetical protein  31.13 
 
 		 165 aa  84.7  9e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0253557  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1555  flavin reductase domain-containing protein  32.02 
 
 		 186 aa  84.3  0.000000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40150  Flavin reductase-like protein  31.54 
 
 		 177 aa  84.3  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.710187  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2205  flavin reductase-like, FMN-binding  34.25 
 
 		 162 aa  84.3  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.361259  normal  0.347764 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1189  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.61 
 
 		 186 aa  83.6  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00243403  normal  0.450798 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1145  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  31.65 
 
 		 197 aa  82.4  0.000000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0862  flavin reductase-like, FMN-binding  30.67 
 
 		 178 aa  82.4  0.000000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.374228  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1925  flavin reductase-like protein  31.61 
 
 		 178 aa  81.6  0.000000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.802506 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1141  flavin reductase domain-containing protein  28.99 
 
 		 183 aa  81.3  0.000000000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.494396  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1398  hypothetical protein  30 
 
 		 201 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.709674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1215  hypothetical protein  30.54 
 
 		 208 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4002  hypothetical protein  31.03 
 
 		 207 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.548606  normal  0.130195 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4325  hypothetical protein  30 
 
 		 201 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.590963 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4414  hypothetical protein  30 
 
 		 201 aa  80.5  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1242  hypothetical protein  30.54 
 
 		 208 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1752  flavin reductase domain-containing protein  35.46 
 
 		 152 aa  80.1  0.00000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.503981  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0519  flavin reductase domain-containing protein  32.56 
 
 		 176 aa  80.1  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.348159  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4298  hypothetical protein  31.03 
 
 		 207 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2217  hypothetical protein  31.08 
 
 		 207 aa  80.1  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0565603 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25740  conserved protein of DIM6/NTAB family  30.52 
 
 		 187 aa  79.7  0.00000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3753  flavin reductase-like, FMN-binding  33.09 
 
 		 186 aa  78.2  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.722732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1039  hypothetical protein  30.41 
 
 		 201 aa  78.2  0.00000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.708626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2510  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.81 
 
 		 186 aa  77.8  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.365491  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1232  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.09 
 
 		 215 aa  77.4  0.0000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4462  hypothetical protein  34.4 
 
 		 209 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.70984  normal  0.854602 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1133  hypothetical protein  29.94 
 
 		 208 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.311037 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4899  hypothetical protein  29.53 
 
 		 205 aa  77.8  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2781  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  29.66 
 
 		 167 aa  77.4  0.0000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000373643  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0249  flavoredoxin, putative  31.52 
 
 		 187 aa  76.6  0.0000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000303002  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0590  hypothetical protein  29.14 
 
 		 185 aa  76.6  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.237388 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0761  hypothetical protein  30.63 
 
 		 208 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1122  hypothetical protein  29.94 
 
 		 221 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3068  flavin reductase domain-containing protein  29.46 
 
 		 176 aa  76.3  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.293275  normal  0.441099 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1083  hypothetical protein  29.41 
 
 		 204 aa  76.3  0.0000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.2808  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6309  hypothetical protein  30.14 
 
 		 207 aa  75.9  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3970  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.03 
 
 		 193 aa  75.9  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.169391  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4083  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.72 
 
 		 225 aa  75.5  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.575581 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1469  flavoprotein oxygenase  25.89 
 
 		 212 aa  75.1  0.0000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4071  hypothetical protein  29.73 
 
 		 205 aa  75.1  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.261199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0452  flavoprotein oxygenase  28.29 
 
 		 209 aa  74.7  0.0000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3807  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.29 
 
 		 209 aa  74.7  0.0000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0458  flavoprotein oxygenase  28.29 
 
 		 209 aa  74.7  0.0000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3989  flavoprotein oxygenase  28.29 
 
 		 209 aa  74.7  0.0000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07162  conserved hypothetical protein  26.04 
 
 		 241 aa  73.9  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.574629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3722  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.01 
 
 		 176 aa  74.3  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0423931 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01680  hypothetical protein  25.14 
 
 		 292 aa  74.3  0.000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1820  hypothetical protein  29.25 
 
 		 207 aa  73.9  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02270  conserved protein of DIM6/NTAB family  28.17 
 
 		 168 aa  73.6  0.000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.759277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2631  hypothetical protein  28.98 
 
 		 221 aa  73.9  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.300035  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7416  hypothetical protein  31.62 
 
 		 188 aa  72.8  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.933873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3355  flavoprotein oxygenase  27.63 
 
 		 210 aa  72.4  0.000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.522125  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1359  hypothetical protein  28.38 
 
 		 208 aa  72  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.262276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0502  flavoprotein oxygenase  25 
 
 		 208 aa  71.6  0.000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5217  flavin reductase domain-containing protein  29.94 
 
 		 182 aa  71.6  0.000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3864  flavoprotein oxygenase  27.63 
 
 		 209 aa  71.6  0.000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1150  flavoprotein oxygenase  27.12 
 
 		 207 aa  71.6  0.000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.462825 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0492  flavoprotein oxygenase  25 
 
 		 209 aa  71.6  0.000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0124  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.81 
 
 		 186 aa  71.2  0.000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1226  flavin reductase domain-containing protein  34.09 
 
 		 248 aa  70.9  0.00000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.384707 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4215  hypothetical protein  29.27 
 
 		 184 aa  70.9  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.380151  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>