263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3444 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_3444  flavin reductase domain-containing protein  100 
 
 		 216 aa  447  1e-125  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.280033  unclonable  0.00000709652 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2479  flavin reductase domain protein FMN-binding  52.11 
 
 		 186 aa  205  5e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.261608 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1555  flavin reductase domain-containing protein  49.47 
 
 		 186 aa  186  2e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1855  flavin reductase domain-containing protein  47.59 
 
 		 186 aa  186  2e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.165677  normal  0.56563 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0995  hypothetical protein  41.27 
 
 		 185 aa  163  2.0000000000000002e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.418174  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0347  flavin reductase domain-containing protein  42.19 
 
 		 191 aa  161  6e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.643208  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1572  flavin reductase domain protein FMN-binding  39.79 
 
 		 190 aa  151  8e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0678  flavoredoxin  42.13 
 
 		 184 aa  150  1e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.616599 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2210  flavin reductase domain-containing protein  40.43 
 
 		 189 aa  149  4e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2549  flavin reductase domain-containing protein  36.7 
 
 		 190 aa  146  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.355058  normal  0.136226 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2846  flavin reductase domain-containing protein  38.22 
 
 		 200 aa  145  5e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000500824  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0437  flavin reductase domain protein FMN-binding  39.27 
 
 		 185 aa  144  9e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0123004 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0126  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.7 
 
 		 194 aa  144  1e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1443  flavin reductase-like, FMN-binding  37.23 
 
 		 189 aa  144  1e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0014  flavin reductase domain-containing protein  37.37 
 
 		 189 aa  143  2e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1524  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.57 
 
 		 215 aa  141  7e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1189  flavin reductase domain protein FMN-binding  37.77 
 
 		 186 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00243403  normal  0.450798 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0642  flavin reductase domain protein FMN-binding  38.22 
 
 		 190 aa  139  3e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0563737  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0805  flavin reductase-like, FMN-binding  37.77 
 
 		 188 aa  139  3e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3349  flavoredoxin Flr  38.42 
 
 		 188 aa  137  1e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0445888 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0259  flavoredoxin  38.3 
 
 		 189 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0520  flavin reductase domain protein FMN-binding  37.7 
 
 		 189 aa  135  4e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2701  flavin reductase domain protein FMN-binding  38.1 
 
 		 189 aa  132  3e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3486  flavin reductase domain protein FMN-binding  37.1 
 
 		 192 aa  131  6e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2040  flavin reductase domain protein FMN-binding  39.53 
 
 		 186 aa  130  1.0000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.228084  hitchhiker  0.0000000489831 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0922  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.51 
 
 		 195 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2181  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.98 
 
 		 190 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0187  flavoredoxin  35.94 
 
 		 190 aa  129  3e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.871882  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2036  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.46 
 
 		 190 aa  127  9.000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000423527  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0078  flavoredoxin  36.32 
 
 		 189 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00025705  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0883  hypothetical protein  40 
 
 		 165 aa  126  3e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0253557  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2225  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.52 
 
 		 195 aa  121  7e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00650  conserved protein of DIM6/NTAB family  36.56 
 
 		 194 aa  120  1.9999999999999998e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0359  flavin reductase domain-containing protein  35.64 
 
 		 195 aa  117  1.9999999999999998e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.184245 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1144  flavin reductase-like, FMN-binding  31.75 
 
 		 189 aa  115  5e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.467484  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1592  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  38.54 
 
 		 193 aa  111  9e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0343  flavin reductase-like, FMN-binding  32.78 
 
 		 200 aa  108  6e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.37872  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3881  flavin reductase domain-containing protein  31.36 
 
 		 209 aa  107  1e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1141  flavin reductase domain-containing protein  29.88 
 
 		 183 aa  90.1  2e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.494396  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1661  flavoredoxin  30.21 
 
 		 192 aa  89  5e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.600705  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1399  flavin reductase, putative  30.21 
 
 		 192 aa  89  5e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0187374  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1228  flavin reductase domain-containing protein  31.08 
 
 		 192 aa  88.6  6e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25740  conserved protein of DIM6/NTAB family  31.18 
 
 		 187 aa  88.2  9e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0382  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  29.81 
 
 		 160 aa  86.3  3e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.610168  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1145  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  33.09 
 
 		 197 aa  82.8  0.000000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0743  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.56 
 
 		 185 aa  78.2  0.00000000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2839  flavin reductase-like, FMN-binding  35.96 
 
 		 202 aa  75.9  0.0000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0986  flavin reductase domain-containing protein  24.86 
 
 		 244 aa  75.1  0.0000000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.354559 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2978  flavin reductase-like, FMN-binding  31.25 
 
 		 205 aa  73.2  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1253  flavin reductase-like, FMN-binding protein  29.53 
 
 		 164 aa  72.8  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.516374  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40150  Flavin reductase-like protein  29.37 
 
 		 177 aa  72.4  0.000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.710187  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2205  flavin reductase-like, FMN-binding  30.53 
 
 		 162 aa  71.6  0.000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.361259  normal  0.347764 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1222  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.96 
 
 		 215 aa  70.9  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.996876  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3068  flavin reductase domain-containing protein  28.8 
 
 		 176 aa  69.7  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.293275  normal  0.441099 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0249  flavoredoxin, putative  26.11 
 
 		 187 aa  68.9  0.00000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000303002  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5713  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.01 
 
 		 189 aa  67  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.483715  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2664  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.71 
 
 		 180 aa  65.1  0.0000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4765  flavin reductase-like, FMN-binding  32.46 
 
 		 199 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.119665 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1232  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.94 
 
 		 215 aa  64.3  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0124  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.72 
 
 		 186 aa  63.9  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0862  flavin reductase-like, FMN-binding  27.2 
 
 		 178 aa  63.5  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.374228  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1944  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.78 
 
 		 180 aa  62.8  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.334773  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1226  flavin reductase domain-containing protein  24.59 
 
 		 248 aa  62.8  0.000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.384707 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1062  flavin reductase domain-containing protein  29.5 
 
 		 180 aa  62  0.000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0519  flavin reductase domain-containing protein  28 
 
 		 176 aa  62  0.000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.348159  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1899  hypothetical protein  22.1 
 
 		 202 aa  62  0.000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.843142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5217  flavin reductase domain-containing protein  27.14 
 
 		 182 aa  61.6  0.000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2185  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  30.53 
 
 		 189 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00717772  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1925  flavin reductase-like protein  26.4 
 
 		 178 aa  60.1  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.802506 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2498  flavin reductase domain-containing protein  30 
 
 		 180 aa  60.5  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.198101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1327  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.11 
 
 		 192 aa  60.5  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.646818  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01420  hypothetical protein  34.69 
 
 		 189 aa  60.1  0.00000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01432  hypothetical protein  34.69 
 
 		 189 aa  60.1  0.00000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1712  flavin reductase domain-containing protein  34.69 
 
 		 189 aa  59.7  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.190889  normal  0.0473113 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1643  flavin reductase domain-containing protein  34.69 
 
 		 189 aa  60.1  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2194  flavin reductase domain-containing protein  34.69 
 
 		 189 aa  59.3  0.00000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1546  flavin reductase domain-containing protein  29.77 
 
 		 189 aa  58.9  0.00000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.917994  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1034  flavin reductase domain-containing protein  25.95 
 
 		 164 aa  58.5  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0053  hypothetical protein  23.43 
 
 		 210 aa  58.5  0.00000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.234931  normal  0.568294 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1998  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  26.28 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.172615  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0699  hypothetical protein  26.28 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0606  flavin reductase family protein  26.28 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0590  hypothetical protein  34.95 
 
 		 185 aa  58.2  0.00000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.237388 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1150  flavoprotein oxygenase  22.29 
 
 		 207 aa  57.4  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.462825 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2155  flavin reductase domain-containing protein  26.63 
 
 		 192 aa  57  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0457399 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5770  flavin reductase-like, FMN-binding  26.35 
 
 		 183 aa  57.4  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0720  flavin reductase domain protein FMN-binding  25.66 
 
 		 195 aa  57  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1916  putative flavin reductase-like protein  26.28 
 
 		 177 aa  57  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0609748  normal  0.257395 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0524  hypothetical protein  27.82 
 
 		 184 aa  57.4  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000000440007  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2083  flavin reductase-like, FMN-binding  25.34 
 
 		 208 aa  56.2  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2072  flavin reductase domain-containing protein  27.27 
 
 		 190 aa  56.2  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3970  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.63 
 
 		 193 aa  55.8  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.169391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3293  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  24.57 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.902968  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4083  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.63 
 
 		 225 aa  56.2  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.575581 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0249  putative flavin reductase  26.45 
 
 		 195 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.688531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3722  flavin reductase domain protein FMN-binding  24.8 
 
 		 176 aa  55.8  0.0000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0423931 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2393  flavin reductase-like  26.67 
 
 		 194 aa  55.5  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.791312  normal  0.804831 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3226  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.21 
 
 		 185 aa  55.1  0.0000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.352328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0626  flavin reductase domain-containing protein  29.36 
 
 		 198 aa  55.1  0.0000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0832  hypothetical protein  22.86 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.158602  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>