275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2479 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_2479  flavin reductase domain protein FMN-binding  100 
 
 		 186 aa  386  1e-107  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.261608 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1855  flavin reductase domain-containing protein  73.91 
 
 		 186 aa  300  1e-80  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.165677  normal  0.56563 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1555  flavin reductase domain-containing protein  69.35 
 
 		 186 aa  283  9e-76  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3444  flavin reductase domain-containing protein  52.11 
 
 		 216 aa  205  4e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.280033  unclonable  0.00000709652 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0678  flavoredoxin  45.35 
 
 		 184 aa  160  7e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.616599 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0437  flavin reductase domain protein FMN-binding  41.08 
 
 		 185 aa  159  2e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0123004 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0014  flavin reductase domain-containing protein  42.31 
 
 		 189 aa  146  2.0000000000000003e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0995  hypothetical protein  34.25 
 
 		 185 aa  142  3e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.418174  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1524  flavin reductase domain protein FMN-binding  38.5 
 
 		 215 aa  141  6e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1189  flavin reductase domain protein FMN-binding  38.46 
 
 		 186 aa  137  7.999999999999999e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00243403  normal  0.450798 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0347  flavin reductase domain-containing protein  37.7 
 
 		 191 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.643208  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2701  flavin reductase domain protein FMN-binding  39.36 
 
 		 189 aa  134  9e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3349  flavoredoxin Flr  37.5 
 
 		 188 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0445888 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1572  flavin reductase domain protein FMN-binding  38.3 
 
 		 190 aa  130  9e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2549  flavin reductase domain-containing protein  36.36 
 
 		 190 aa  129  3e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.355058  normal  0.136226 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1443  flavin reductase-like, FMN-binding  37.63 
 
 		 189 aa  124  9e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0259  flavoredoxin  39.25 
 
 		 189 aa  123  1e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2210  flavin reductase domain-containing protein  38.04 
 
 		 189 aa  122  3e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0126  flavin reductase domain protein FMN-binding  37.43 
 
 		 194 aa  121  5e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2846  flavin reductase domain-containing protein  35.94 
 
 		 200 aa  121  6e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000500824  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2040  flavin reductase domain protein FMN-binding  38.64 
 
 		 186 aa  117  9e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.228084  hitchhiker  0.0000000489831 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0805  flavin reductase-like, FMN-binding  36.02 
 
 		 188 aa  116  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3486  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.76 
 
 		 192 aa  115  3e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0187  flavoredoxin  36.93 
 
 		 190 aa  115  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.871882  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0642  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.41 
 
 		 190 aa  115  3.9999999999999997e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0563737  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2225  flavin reductase domain protein FMN-binding  37.29 
 
 		 195 aa  114  6e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3881  flavin reductase domain-containing protein  37.14 
 
 		 209 aa  114  6.9999999999999995e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0078  flavoredoxin  35.87 
 
 		 189 aa  112  3e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00025705  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0883  hypothetical protein  33.57 
 
 		 165 aa  112  3e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0253557  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0922  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.09 
 
 		 195 aa  112  3e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2181  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.98 
 
 		 190 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1592  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  36.99 
 
 		 193 aa  108  3e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0359  flavin reductase domain-containing protein  38.27 
 
 		 195 aa  108  5e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.184245 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0520  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.7 
 
 		 189 aa  107  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2036  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.92 
 
 		 190 aa  106  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000423527  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1144  flavin reductase-like, FMN-binding  31.91 
 
 		 189 aa  97.8  8e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.467484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0343  flavin reductase-like, FMN-binding  32.37 
 
 		 200 aa  97.8  8e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.37872  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00650  conserved protein of DIM6/NTAB family  35.52 
 
 		 194 aa  94.7  6e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1661  flavoredoxin  27.96 
 
 		 192 aa  87.8  8e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.600705  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1399  flavin reductase, putative  27.96 
 
 		 192 aa  87.8  8e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0187374  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2978  flavin reductase-like, FMN-binding  36.49 
 
 		 205 aa  85.9  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1145  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  36.15 
 
 		 197 aa  85.5  4e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4765  flavin reductase-like, FMN-binding  36.11 
 
 		 199 aa  85.5  4e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.119665 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1228  flavin reductase domain-containing protein  34.29 
 
 		 192 aa  85.5  4e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2839  flavin reductase-like, FMN-binding  35.42 
 
 		 202 aa  84.7  6e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0249  flavoredoxin, putative  32.11 
 
 		 187 aa  81.3  0.000000000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000303002  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0743  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.14 
 
 		 185 aa  75.5  0.0000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1222  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.78 
 
 		 215 aa  75.5  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.996876  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1141  flavin reductase domain-containing protein  28.93 
 
 		 183 aa  74.3  0.0000000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.494396  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2393  flavin reductase-like  33.11 
 
 		 194 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.791312  normal  0.804831 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0249  putative flavin reductase  30.54 
 
 		 195 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.688531  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40150  Flavin reductase-like protein  33.59 
 
 		 177 aa  72.8  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.710187  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7131  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.54 
 
 		 194 aa  72  0.000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2155  flavin reductase domain-containing protein  34.01 
 
 		 192 aa  72  0.000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0457399 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2083  flavin reductase-like, FMN-binding  31.25 
 
 		 208 aa  71.2  0.000000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2659  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  33.11 
 
 		 194 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.125103  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5713  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.81 
 
 		 189 aa  70.1  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.483715  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0382  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  32.8 
 
 		 160 aa  68.6  0.00000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.610168  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3970  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.1 
 
 		 193 aa  67.8  0.00000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.169391  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4083  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.33 
 
 		 225 aa  67.8  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.575581 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0986  flavin reductase domain-containing protein  29.05 
 
 		 244 aa  66.6  0.0000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.354559 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25740  conserved protein of DIM6/NTAB family  31.4 
 
 		 187 aa  67  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1226  flavin reductase domain-containing protein  30.91 
 
 		 248 aa  65.9  0.0000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.384707 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0862  flavin reductase-like, FMN-binding  30.53 
 
 		 178 aa  65.9  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.374228  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01420  hypothetical protein  32.89 
 
 		 189 aa  65.9  0.0000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1343  flavin reductase domain-containing protein  29.59 
 
 		 196 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0386506 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01432  hypothetical protein  32.89 
 
 		 189 aa  65.9  0.0000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0883  flavin reductase-like, FMN-binding  28.99 
 
 		 196 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.519156  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1253  flavin reductase-like, FMN-binding protein  32.02 
 
 		 164 aa  65.9  0.0000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.516374  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1365  flavin reductase domain-containing protein  28.99 
 
 		 196 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1643  flavin reductase domain-containing protein  32.89 
 
 		 189 aa  65.9  0.0000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4577  flavin reductase domain-containing protein  28.99 
 
 		 189 aa  65.1  0.0000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2194  flavin reductase domain-containing protein  32.89 
 
 		 189 aa  65.1  0.0000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2185  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  31.74 
 
 		 189 aa  65.1  0.0000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00717772  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1712  flavin reductase domain-containing protein  32.89 
 
 		 189 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.190889  normal  0.0473113 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0720  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.05 
 
 		 195 aa  63.5  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1546  flavin reductase domain-containing protein  31.14 
 
 		 189 aa  63.9  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.917994  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1998  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  30.41 
 
 		 201 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.172615  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0606  flavin reductase family protein  30.41 
 
 		 201 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0699  hypothetical protein  30.41 
 
 		 201 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4508  flavin reductase-like, FMN-binding  28.4 
 
 		 194 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.372543 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1931  flavin reductase domain-containing protein  29.17 
 
 		 197 aa  62  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0605182 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0124  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.3 
 
 		 186 aa  61.6  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3068  flavin reductase domain-containing protein  27.48 
 
 		 176 aa  61.2  0.000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.293275  normal  0.441099 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1242  flavin reductase domain-containing protein  28.4 
 
 		 192 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.877507  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2072  flavin reductase domain-containing protein  30.72 
 
 		 190 aa  60.1  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2682  hypothetical protein  30.22 
 
 		 205 aa  60.1  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2046  hypothetical protein  28.57 
 
 		 194 aa  60.1  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.179971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0626  flavin reductase domain-containing protein  30.22 
 
 		 198 aa  59.7  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1150  flavoprotein oxygenase  29.17 
 
 		 207 aa  59.3  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.462825 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2781  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  29.75 
 
 		 167 aa  59.3  0.00000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000373643  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0687  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.19 
 
 		 192 aa  59.7  0.00000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4078  flavin reductase domain-containing protein  28.48 
 
 		 204 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3891  flavin reductase domain-containing protein  26.92 
 
 		 194 aa  58.9  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.824714  normal  0.0240386 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0980  flavin reductase domain-containing protein  27.75 
 
 		 194 aa  58.5  0.00000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1752  flavin reductase domain-containing protein  29.84 
 
 		 152 aa  58.9  0.00000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.503981  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0401  flavin reductase domain-containing protein  29.41 
 
 		 186 aa  58.5  0.00000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.181273 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1916  hypothetical protein  27.33 
 
 		 203 aa  58.2  0.00000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0769  flavin reductase domain-containing protein  32.79 
 
 		 149 aa  57.4  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0524  hypothetical protein  25 
 
 		 184 aa  57.4  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000000440007  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>