264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_3486 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_3486  flavin reductase domain protein FMN-binding  100 
 
 
192 aa  393  1e-109  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2181  flavin reductase domain protein FMN-binding  62.77 
 
 
190 aa  263  2e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2036  flavin reductase domain protein FMN-binding  63.83 
 
 
190 aa  262  2e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000423527  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0078  flavoredoxin  62.77 
 
 
189 aa  258  5.0000000000000005e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00025705  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0126  flavin reductase domain protein FMN-binding  62.23 
 
 
194 aa  256  2e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3349  flavoredoxin Flr  60.75 
 
 
188 aa  251  4.0000000000000004e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0445888 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2846  flavin reductase domain-containing protein  59.69 
 
 
200 aa  247  8e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000500824  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1443  flavin reductase-like, FMN-binding  58.51 
 
 
189 aa  244  6e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0805  flavin reductase-like, FMN-binding  59.57 
 
 
188 aa  241  3.9999999999999997e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2210  flavin reductase domain-containing protein  58.51 
 
 
189 aa  240  1e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0187  flavoredoxin  59.57 
 
 
190 aa  236  2e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.871882  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0642  flavin reductase domain protein FMN-binding  57.45 
 
 
190 aa  232  2.0000000000000002e-60  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0563737  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0259  flavoredoxin  57.98 
 
 
189 aa  230  8.000000000000001e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1572  flavin reductase domain protein FMN-binding  57.45 
 
 
190 aa  230  1e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0347  flavin reductase domain-containing protein  56.15 
 
 
191 aa  230  1e-59  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.643208  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0520  flavin reductase domain protein FMN-binding  55.85 
 
 
189 aa  227  1e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2701  flavin reductase domain protein FMN-binding  56.38 
 
 
189 aa  225  4e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2549  flavin reductase domain-containing protein  54.79 
 
 
190 aa  220  9.999999999999999e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.355058  normal  0.136226 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0922  flavin reductase domain protein FMN-binding  50 
 
 
195 aa  200  9.999999999999999e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1144  flavin reductase-like, FMN-binding  43.62 
 
 
189 aa  184  5e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.467484  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25740  conserved protein of DIM6/NTAB family  40.66 
 
 
187 aa  143  1e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3444  flavin reductase domain-containing protein  37.1 
 
 
216 aa  131  5e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.280033  unclonable  0.00000709652 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3881  flavin reductase domain-containing protein  35.91 
 
 
209 aa  131  7.999999999999999e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2225  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.26 
 
 
195 aa  130  1.0000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0249  flavoredoxin, putative  39.08 
 
 
187 aa  125  4.0000000000000003e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000303002  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0343  flavin reductase-like, FMN-binding  37.5 
 
 
200 aa  118  4.9999999999999996e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.37872  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0359  flavin reductase domain-containing protein  37.36 
 
 
195 aa  118  6e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.184245 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1555  flavin reductase domain-containing protein  34.74 
 
 
186 aa  115  3e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2479  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.76 
 
 
186 aa  115  3e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.261608 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1855  flavin reductase domain-containing protein  31.55 
 
 
186 aa  113  2.0000000000000002e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.165677  normal  0.56563 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00650  conserved protein of DIM6/NTAB family  30 
 
 
194 aa  112  5e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2040  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.94 
 
 
186 aa  109  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.228084  hitchhiker  0.0000000489831 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1524  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.38 
 
 
215 aa  109  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1189  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.51 
 
 
186 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00243403  normal  0.450798 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0678  flavoredoxin  34.13 
 
 
184 aa  102  3e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.616599 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1661  flavoredoxin  29.26 
 
 
192 aa  100  1e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.600705  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1399  flavin reductase, putative  29.26 
 
 
192 aa  100  1e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0187374  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0014  flavin reductase domain-containing protein  33.52 
 
 
189 aa  98.6  5e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0995  hypothetical protein  27.42 
 
 
185 aa  96.7  2e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.418174  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0437  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.85 
 
 
185 aa  83.2  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0123004 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0743  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.49 
 
 
185 aa  80.9  0.00000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1145  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  33.57 
 
 
197 aa  77  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2559  hypothetical protein  24.71 
 
 
183 aa  74.3  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1150  flavoprotein oxygenase  29.28 
 
 
207 aa  73.9  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.462825 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1592  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  28.65 
 
 
193 aa  72  0.000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1916  putative flavin reductase-like protein  31.3 
 
 
177 aa  71.6  0.000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0609748  normal  0.257395 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3722  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.4 
 
 
176 aa  70.9  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0423931 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0382  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  32.28 
 
 
160 aa  70.1  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.610168  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1925  flavin reductase-like protein  28.87 
 
 
178 aa  70.1  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.802506 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3068  flavin reductase domain-containing protein  30.77 
 
 
176 aa  69.7  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.293275  normal  0.441099 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0862  flavin reductase-like, FMN-binding  29.01 
 
 
178 aa  67.8  0.00000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.374228  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1083  hypothetical protein  24.84 
 
 
204 aa  66.6  0.0000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.2808  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2530  hypothetical protein  33.98 
 
 
169 aa  66.2  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0339415  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2753  flavin reductase domain protein FMN-binding  25.5 
 
 
209 aa  66.2  0.0000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1141  flavin reductase domain-containing protein  30.52 
 
 
183 aa  65.9  0.0000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.494396  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1752  flavin reductase domain-containing protein  29.37 
 
 
152 aa  64.7  0.0000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.503981  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1270  flavin reductase domain-containing protein  30.56 
 
 
181 aa  64.3  0.000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.285703  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1228  flavin reductase domain-containing protein  27.66 
 
 
192 aa  63.9  0.000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2311  flavin reductase domain-containing protein  35.92 
 
 
180 aa  63.5  0.000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.833881  hitchhiker  0.000888087 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00640  conserved protein of DIM6/NTAB family  32.14 
 
 
171 aa  62.8  0.000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2915  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.57 
 
 
203 aa  62.8  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5713  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.06 
 
 
189 aa  62.4  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.483715  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0401  flavin reductase domain-containing protein  29.17 
 
 
186 aa  62.4  0.000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.181273 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3276  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.11 
 
 
295 aa  61.6  0.000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2498  flavin reductase domain-containing protein  30.58 
 
 
180 aa  61.2  0.000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.198101  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2041  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.16 
 
 
203 aa  60.8  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0801878  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11280  putative flavoredoxin  25.62 
 
 
168 aa  61.2  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00035262  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40150  Flavin reductase-like protein  29.46 
 
 
177 aa  60.1  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.710187  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0519  flavin reductase domain-containing protein  28.57 
 
 
176 aa  60.1  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.348159  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3951  flavin reductase domain protein FMN-binding  28 
 
 
168 aa  59.3  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00405255 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4048  hypothetical protein  28.12 
 
 
226 aa  59.7  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.293698  normal  0.899235 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0883  hypothetical protein  24.83 
 
 
165 aa  59.3  0.00000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0253557  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0986  flavin reductase domain-containing protein  25.15 
 
 
244 aa  59.7  0.00000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.354559 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1820  hypothetical protein  27.85 
 
 
207 aa  58.9  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1187  hypothetical protein  28.1 
 
 
180 aa  58.9  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0053  hypothetical protein  28 
 
 
210 aa  58.9  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.234931  normal  0.568294 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2654  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.92 
 
 
203 aa  58.9  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1051  flavin reductase-like, FMN-binding  25.9 
 
 
213 aa  58.9  0.00000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0886076 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1850  hypothetical protein  26.76 
 
 
180 aa  58.5  0.00000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.147622 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1226  flavin reductase domain-containing protein  30.18 
 
 
248 aa  58.9  0.00000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.384707 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2217  hypothetical protein  28.45 
 
 
207 aa  58.5  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0565603 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4312  hypothetical protein  27.27 
 
 
205 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2444  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  26.67 
 
 
199 aa  58.5  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3128  flavin reductase domain-containing protein  30.89 
 
 
185 aa  58.2  0.00000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2664  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.27 
 
 
180 aa  57.8  0.00000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1899  hypothetical protein  28.4 
 
 
202 aa  57.8  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.843142  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0590  hypothetical protein  28.81 
 
 
185 aa  57.4  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.237388 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2986  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  24 
 
 
196 aa  57.4  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0597  hypothetical protein  35.19 
 
 
168 aa  57.4  0.0000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7131  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.57 
 
 
194 aa  57  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4414  hypothetical protein  26.99 
 
 
201 aa  57  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0249  putative flavin reductase  28.57 
 
 
195 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.688531  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4899  hypothetical protein  27.22 
 
 
205 aa  57  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2151  hypothetical protein  27.16 
 
 
203 aa  56.6  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0524  hypothetical protein  28.57 
 
 
184 aa  57  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000000440007  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1355  flavin reductase domain protein FMN-binding  22.5 
 
 
196 aa  56.2  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1469  flavoprotein oxygenase  25.27 
 
 
212 aa  55.8  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3148  flavin reductase-like, FMN-binding  22.76 
 
 
219 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0090  flavin reductase domain-containing protein  25.97 
 
 
210 aa  56.2  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00316855 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3626  flavoprotein oxygenase  24.56 
 
 
209 aa  56.2  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>