More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0359 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG0359  flavin reductase domain-containing protein  100 
 
 
195 aa  409  1e-113  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.184245 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3881  flavin reductase domain-containing protein  51.34 
 
 
209 aa  225  4e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0343  flavin reductase-like, FMN-binding  50.78 
 
 
200 aa  210  9e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.37872  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2225  flavin reductase domain protein FMN-binding  49.48 
 
 
195 aa  205  3e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1661  flavoredoxin  42.02 
 
 
192 aa  172  3.9999999999999995e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.600705  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1399  flavin reductase, putative  42.02 
 
 
192 aa  172  3.9999999999999995e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0187374  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2040  flavin reductase domain protein FMN-binding  40 
 
 
186 aa  155  4e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.228084  hitchhiker  0.0000000489831 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0078  flavoredoxin  35.98 
 
 
189 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00025705  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2181  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.56 
 
 
190 aa  122  4e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0805  flavin reductase-like, FMN-binding  35 
 
 
188 aa  121  6e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2036  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.11 
 
 
190 aa  121  6e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000423527  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2846  flavin reductase domain-containing protein  38.12 
 
 
200 aa  121  6e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000500824  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0126  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.03 
 
 
194 aa  121  6e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1572  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.44 
 
 
190 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2210  flavin reductase domain-containing protein  34.39 
 
 
189 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0520  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.89 
 
 
189 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3486  flavin reductase domain protein FMN-binding  37.36 
 
 
192 aa  118  6e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1443  flavin reductase-like, FMN-binding  32.96 
 
 
189 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3444  flavin reductase domain-containing protein  35.64 
 
 
216 aa  117  9.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.280033  unclonable  0.00000709652 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2701  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.89 
 
 
189 aa  115  5e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0347  flavin reductase domain-containing protein  33.33 
 
 
191 aa  114  6e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.643208  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0743  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.69 
 
 
185 aa  109  3e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1144  flavin reductase-like, FMN-binding  31.84 
 
 
189 aa  109  3e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.467484  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0259  flavoredoxin  32.78 
 
 
189 aa  108  6e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2479  flavin reductase domain protein FMN-binding  38.27 
 
 
186 aa  108  6e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.261608 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3349  flavoredoxin Flr  33.89 
 
 
188 aa  107  8.000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0445888 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0642  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.6 
 
 
190 aa  107  1e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0563737  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0187  flavoredoxin  30.56 
 
 
190 aa  103  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.871882  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0922  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.14 
 
 
195 aa  99.4  3e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2549  flavin reductase domain-containing protein  29.44 
 
 
190 aa  97.4  1e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.355058  normal  0.136226 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0382  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  34.04 
 
 
160 aa  94.7  7e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.610168  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1855  flavin reductase domain-containing protein  32.32 
 
 
186 aa  94  1e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.165677  normal  0.56563 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1141  flavin reductase domain-containing protein  31.4 
 
 
183 aa  90.9  9e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.494396  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1524  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.42 
 
 
215 aa  89  4e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00650  conserved protein of DIM6/NTAB family  35.04 
 
 
194 aa  86.7  2e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0995  hypothetical protein  29.89 
 
 
185 aa  86.7  2e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.418174  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0678  flavoredoxin  32.72 
 
 
184 aa  85.1  6e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.616599 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1555  flavin reductase domain-containing protein  32.92 
 
 
186 aa  84.7  7e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40150  Flavin reductase-like protein  34.03 
 
 
177 aa  84.7  8e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.710187  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0437  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.23 
 
 
185 aa  82.8  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0123004 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3753  flavin reductase-like, FMN-binding  33.57 
 
 
186 aa  81.6  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.722732  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0014  flavin reductase domain-containing protein  27.22 
 
 
189 aa  81.3  0.000000000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3276  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.24 
 
 
295 aa  80.9  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1189  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.51 
 
 
186 aa  80.9  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00243403  normal  0.450798 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1226  flavin reductase domain-containing protein  35.04 
 
 
248 aa  79.3  0.00000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.384707 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5713  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.87 
 
 
189 aa  78.2  0.00000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.483715  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0519  flavin reductase domain-containing protein  31.47 
 
 
176 aa  78.2  0.00000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.348159  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0986  flavin reductase domain-containing protein  28.47 
 
 
244 aa  75.9  0.0000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.354559 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1051  flavin reductase-like, FMN-binding  30.87 
 
 
213 aa  76.3  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0886076 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0053  hypothetical protein  32 
 
 
210 aa  75.9  0.0000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.234931  normal  0.568294 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2217  hypothetical protein  29.24 
 
 
207 aa  75.5  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0565603 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2205  flavin reductase-like, FMN-binding  29.63 
 
 
162 aa  74.7  0.0000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.361259  normal  0.347764 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4414  hypothetical protein  28.09 
 
 
201 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1145  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  30.22 
 
 
197 aa  74.3  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1228  flavin reductase domain-containing protein  30.15 
 
 
192 aa  74.3  0.000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2510  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.43 
 
 
186 aa  74.3  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.365491  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1398  hypothetical protein  27.53 
 
 
201 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.709674  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1925  flavin reductase-like protein  28.57 
 
 
178 aa  73.6  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.802506 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3355  flavoprotein oxygenase  32 
 
 
210 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.522125  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4325  hypothetical protein  27.53 
 
 
201 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.590963 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3807  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.67 
 
 
209 aa  72.4  0.000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0862  flavin reductase-like, FMN-binding  30.37 
 
 
178 aa  72.4  0.000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.374228  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2444  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  29.81 
 
 
199 aa  72.4  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0452  flavoprotein oxygenase  30.67 
 
 
209 aa  72.4  0.000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4071  hypothetical protein  27.75 
 
 
205 aa  72  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.261199  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0124  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.65 
 
 
186 aa  72  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0883  hypothetical protein  24.53 
 
 
165 aa  72  0.000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0253557  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1230  flavin reductase domain-containing protein  29.17 
 
 
177 aa  71.6  0.000000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.407466  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0458  flavoprotein oxygenase  30 
 
 
209 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3722  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.67 
 
 
176 aa  70.9  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0423931 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3989  flavoprotein oxygenase  30 
 
 
209 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0249  putative flavin reductase  31.95 
 
 
195 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.688531  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7131  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.95 
 
 
194 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0249  flavoredoxin, putative  26.97 
 
 
187 aa  70.5  0.00000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000303002  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0726  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.68 
 
 
159 aa  70.1  0.00000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1593  hypothetical protein  27.65 
 
 
291 aa  70.1  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1786  flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family-like protein  28.57 
 
 
228 aa  70.1  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.60124  normal  0.96149 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4219  hypothetical protein  27.17 
 
 
205 aa  70.5  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.269485 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1150  flavoprotein oxygenase  29.14 
 
 
207 aa  69.7  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.462825 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1083  hypothetical protein  25.88 
 
 
204 aa  69.7  0.00000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.2808  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6898  hypothetical protein  30.43 
 
 
203 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.800563  normal  0.546229 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1752  flavin reductase domain-containing protein  28.57 
 
 
152 aa  69.3  0.00000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.503981  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2631  hypothetical protein  26.99 
 
 
202 aa  68.6  0.00000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3068  flavin reductase domain-containing protein  29.37 
 
 
176 aa  68.6  0.00000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.293275  normal  0.441099 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2151  hypothetical protein  28.48 
 
 
203 aa  68.2  0.00000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2943  hypothetical protein  29.19 
 
 
216 aa  68.2  0.00000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01680  hypothetical protein  27.87 
 
 
292 aa  68.2  0.00000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1944  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.65 
 
 
180 aa  68.2  0.00000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.334773  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1039  hypothetical protein  26.97 
 
 
201 aa  67.8  0.00000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.708626  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3864  flavoprotein oxygenase  29.33 
 
 
209 aa  67.8  0.00000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3970  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.58 
 
 
193 aa  67.8  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.169391  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0503  flavoprotein oxygenase  30.2 
 
 
208 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4899  hypothetical protein  28.57 
 
 
205 aa  67.8  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3128  flavin reductase domain-containing protein  31.16 
 
 
185 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4462  hypothetical protein  29.71 
 
 
209 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.70984  normal  0.854602 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1359  hypothetical protein  28.32 
 
 
208 aa  66.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.262276  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4083  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.58 
 
 
225 aa  67  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.575581 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0502  flavoprotein oxygenase  29.53 
 
 
208 aa  67  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3528  flavoprotein oxygenase  29.53 
 
 
208 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2682  hypothetical protein  28 
 
 
205 aa  66.2  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>