267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0642 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0642  flavin reductase domain protein FMN-binding  100 
 
 		 190 aa  391  1e-108  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0563737  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1443  flavin reductase-like, FMN-binding  78.72 
 
 		 189 aa  315  2e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0520  flavin reductase domain protein FMN-binding  77.25 
 
 		 189 aa  310  6.999999999999999e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2210  flavin reductase domain-containing protein  75.53 
 
 		 189 aa  304  6e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0805  flavin reductase-like, FMN-binding  75 
 
 		 188 aa  300  6.000000000000001e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0259  flavoredoxin  71.81 
 
 		 189 aa  285  4e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3349  flavoredoxin Flr  64.52 
 
 		 188 aa  254  6e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0445888 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0078  flavoredoxin  61.7 
 
 		 189 aa  251  3e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00025705  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0126  flavin reductase domain protein FMN-binding  61.05 
 
 		 194 aa  251  5.000000000000001e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1572  flavin reductase domain protein FMN-binding  60 
 
 		 190 aa  239  2.9999999999999997e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0187  flavoredoxin  59.26 
 
 		 190 aa  236  2e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.871882  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2181  flavin reductase domain protein FMN-binding  58.51 
 
 		 190 aa  234  6e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3486  flavin reductase domain protein FMN-binding  57.45 
 
 		 192 aa  232  2.0000000000000002e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0347  flavin reductase domain-containing protein  56.38 
 
 		 191 aa  232  2.0000000000000002e-60  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.643208  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2846  flavin reductase domain-containing protein  57.67 
 
 		 200 aa  232  3e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000500824  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2036  flavin reductase domain protein FMN-binding  57.98 
 
 		 190 aa  231  5e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000423527  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2701  flavin reductase domain protein FMN-binding  56.08 
 
 		 189 aa  230  8.000000000000001e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2549  flavin reductase domain-containing protein  54.5 
 
 		 190 aa  226  2e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.355058  normal  0.136226 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0922  flavin reductase domain protein FMN-binding  50.79 
 
 		 195 aa  202  2e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1144  flavin reductase-like, FMN-binding  42.33 
 
 		 189 aa  180  9.000000000000001e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.467484  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25740  conserved protein of DIM6/NTAB family  39.78 
 
 		 187 aa  146  2.0000000000000003e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3444  flavin reductase domain-containing protein  38.22 
 
 		 216 aa  139  1.9999999999999998e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.280033  unclonable  0.00000709652 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3881  flavin reductase domain-containing protein  37.43 
 
 		 209 aa  137  7e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1855  flavin reductase domain-containing protein  37.57 
 
 		 186 aa  124  1e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.165677  normal  0.56563 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0343  flavin reductase-like, FMN-binding  40.28 
 
 		 200 aa  122  3e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.37872  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0249  flavoredoxin, putative  36.84 
 
 		 187 aa  120  9.999999999999999e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000303002  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2225  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.67 
 
 		 195 aa  116  1.9999999999999998e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2479  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.41 
 
 		 186 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.261608 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00650  conserved protein of DIM6/NTAB family  30.43 
 
 		 194 aa  115  5e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0014  flavin reductase domain-containing protein  35.79 
 
 		 189 aa  109  2.0000000000000002e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2040  flavin reductase domain protein FMN-binding  38.22 
 
 		 186 aa  108  6e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.228084  hitchhiker  0.0000000489831 
 
 
-
 
NC_002950  PG0359  flavin reductase domain-containing protein  32.6 
 
 		 195 aa  107  1e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.184245 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1555  flavin reductase domain-containing protein  38.95 
 
 		 186 aa  104  9e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0678  flavoredoxin  33.71 
 
 		 184 aa  102  3e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.616599 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1661  flavoredoxin  31.09 
 
 		 192 aa  101  8e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.600705  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1399  flavin reductase, putative  31.09 
 
 		 192 aa  101  8e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0187374  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0995  hypothetical protein  30 
 
 		 185 aa  95.5  4e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.418174  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1189  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.81 
 
 		 186 aa  91.7  6e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00243403  normal  0.450798 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1524  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.93 
 
 		 215 aa  89.7  3e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0743  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.56 
 
 		 185 aa  76.3  0.0000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0382  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  34.07 
 
 		 160 aa  76.6  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.610168  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1592  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  28.57 
 
 		 193 aa  76.3  0.0000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0644  flavin reductase-like, FMN-binding  76.92 
 
 		 46 aa  74.7  0.0000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000438931  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1270  flavin reductase domain-containing protein  31.98 
 
 		 181 aa  73.6  0.000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.285703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0437  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.48 
 
 		 185 aa  73.2  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0123004 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0401  flavin reductase domain-containing protein  32.54 
 
 		 186 aa  71.6  0.000000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.181273 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1145  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  33.33 
 
 		 197 aa  71.2  0.000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1141  flavin reductase domain-containing protein  31.72 
 
 		 183 aa  69.7  0.00000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.494396  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1032  hypothetical protein  29.57 
 
 		 203 aa  68.9  0.00000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.863891  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3068  flavin reductase domain-containing protein  30.66 
 
 		 176 aa  66.2  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.293275  normal  0.441099 
 
 
-
 
NC_004310  BR1068  hypothetical protein  29.03 
 
 		 203 aa  66.2  0.0000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0726405  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1222  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.77 
 
 		 215 aa  65.9  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.996876  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0883  hypothetical protein  28.15 
 
 		 165 aa  65.9  0.0000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0253557  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01420  hypothetical protein  32.48 
 
 		 189 aa  65.5  0.0000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01432  hypothetical protein  32.48 
 
 		 189 aa  65.5  0.0000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1643  flavin reductase domain-containing protein  32.48 
 
 		 189 aa  65.5  0.0000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2194  flavin reductase domain-containing protein  32.48 
 
 		 189 aa  64.7  0.0000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2185  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  30.67 
 
 		 189 aa  63.2  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00717772  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1820  hypothetical protein  29.71 
 
 		 207 aa  62.8  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2559  hypothetical protein  23.67 
 
 		 183 aa  62.8  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1469  flavoprotein oxygenase  26.04 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1228  flavin reductase domain-containing protein  25.66 
 
 		 192 aa  62.8  0.000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1712  flavin reductase domain-containing protein  31.21 
 
 		 189 aa  62.4  0.000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.190889  normal  0.0473113 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4765  flavin reductase-like, FMN-binding  34.69 
 
 		 199 aa  62.4  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.119665 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2041  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.49 
 
 		 203 aa  62.4  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0801878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1253  flavin reductase-like, FMN-binding protein  31.58 
 
 		 164 aa  62.4  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.516374  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1546  flavin reductase domain-containing protein  30.57 
 
 		 189 aa  61.6  0.000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.917994  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2221  hypothetical protein  29.65 
 
 		 201 aa  60.8  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.378667  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2151  hypothetical protein  29.24 
 
 		 203 aa  60.8  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5713  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.37 
 
 		 189 aa  60.8  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.483715  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1150  flavoprotein oxygenase  25.44 
 
 		 207 aa  60.1  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.462825 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40150  Flavin reductase-like protein  31.16 
 
 		 177 aa  59.7  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.710187  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2978  flavin reductase-like, FMN-binding  31.13 
 
 		 205 aa  59.7  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1925  flavin reductase-like protein  27.78 
 
 		 178 aa  58.9  0.00000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.802506 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2083  flavin reductase-like, FMN-binding  28.65 
 
 		 208 aa  58.9  0.00000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0524  hypothetical protein  31.11 
 
 		 184 aa  58.9  0.00000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000000440007  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1051  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  28.28 
 
 		 216 aa  58.9  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.136443 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0001  flavin reductase domain-containing protein  25.68 
 
 		 171 aa  58.9  0.00000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.117623  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6309  hypothetical protein  27.33 
 
 		 207 aa  58.5  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1850  hypothetical protein  27.33 
 
 		 180 aa  58.9  0.00000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.147622 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2435  hypothetical protein  24.58 
 
 		 211 aa  58.2  0.00000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2498  flavin reductase domain-containing protein  31.25 
 
 		 180 aa  58.2  0.00000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.198101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2682  hypothetical protein  27.81 
 
 		 205 aa  57.8  0.00000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2444  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  26.14 
 
 		 199 aa  57.4  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1752  flavin reductase domain-containing protein  25.97 
 
 		 152 aa  57  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.503981  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2839  flavin reductase-like, FMN-binding  30.72 
 
 		 202 aa  57.8  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4312  hypothetical protein  25.27 
 
 		 205 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3466  hypothetical protein  28.81 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.421094 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1916  putative flavin reductase-like protein  28.68 
 
 		 177 aa  57  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0609748  normal  0.257395 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1083  hypothetical protein  23.57 
 
 		 204 aa  57  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.2808  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0081  hypothetical protein  28.02 
 
 		 209 aa  56.6  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1288  flavin reductase-like, FMN-binding  31.76 
 
 		 229 aa  56.2  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000609223 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2311  flavin reductase domain-containing protein  35.64 
 
 		 180 aa  55.8  0.0000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.833881  hitchhiker  0.000888087 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0862  flavin reductase-like, FMN-binding  28.47 
 
 		 178 aa  55.8  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.374228  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0590  hypothetical protein  26.95 
 
 		 185 aa  55.8  0.0000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.237388 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_33014  predicted protein  27.16 
 
 		 436 aa  55.8  0.0000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.111303  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0053  hypothetical protein  28.22 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.234931  normal  0.568294 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1187  hypothetical protein  28.1 
 
 		 180 aa  55.1  0.0000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0519  flavin reductase domain-containing protein  31.62 
 
 		 176 aa  55.5  0.0000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.348159  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3626  flavoprotein oxygenase  21.91 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>