238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_1215 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_1215  hypothetical protein  100 
 
 
208 aa  428  1e-119  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1242  hypothetical protein  99.52 
 
 
208 aa  426  1e-119  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0761  hypothetical protein  99.04 
 
 
208 aa  423  1e-118  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1122  hypothetical protein  94.23 
 
 
221 aa  407  1e-113  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1133  hypothetical protein  93.27 
 
 
208 aa  401  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.311037 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4462  hypothetical protein  65.84 
 
 
209 aa  281  7.000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.70984  normal  0.854602 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0081  hypothetical protein  64.88 
 
 
209 aa  278  3e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4298  hypothetical protein  62.5 
 
 
207 aa  275  4e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4002  hypothetical protein  62.5 
 
 
207 aa  274  9e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.548606  normal  0.130195 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0863  flavin reductase domain protein FMN-binding  63.5 
 
 
209 aa  273  1.0000000000000001e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1039  hypothetical protein  64.36 
 
 
201 aa  270  8.000000000000001e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.708626  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1150  flavoprotein oxygenase  62.38 
 
 
207 aa  270  1e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.462825 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1051  hypothetical protein  62 
 
 
230 aa  270  2e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.106662  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1359  hypothetical protein  61.84 
 
 
208 aa  265  4e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.262276  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0832  hypothetical protein  63.37 
 
 
206 aa  262  3e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.158602  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4325  hypothetical protein  61.88 
 
 
201 aa  261  4e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.590963 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1398  hypothetical protein  61.39 
 
 
201 aa  260  1e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.709674  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4414  hypothetical protein  61.88 
 
 
201 aa  259  2e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2703  hypothetical protein  60 
 
 
206 aa  253  1.0000000000000001e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.113365  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0458  flavoprotein oxygenase  59.62 
 
 
209 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3989  flavoprotein oxygenase  59.62 
 
 
209 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0452  flavoprotein oxygenase  59.62 
 
 
209 aa  252  3e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4219  hypothetical protein  60.19 
 
 
205 aa  251  4.0000000000000004e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.269485 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3807  flavin reductase domain protein FMN-binding  59.62 
 
 
209 aa  251  5.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2217  hypothetical protein  57.97 
 
 
207 aa  250  9.000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0565603 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3864  flavoprotein oxygenase  59.62 
 
 
209 aa  250  9.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1469  flavoprotein oxygenase  59.33 
 
 
212 aa  250  9.000000000000001e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4899  hypothetical protein  58.25 
 
 
205 aa  250  1e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0498  flavoprotein oxygenase  59.42 
 
 
209 aa  249  2e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3626  flavoprotein oxygenase  57.97 
 
 
209 aa  248  3e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04002  nitrilotriacetate monooxygenase component B  56.86 
 
 
209 aa  248  4e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3355  flavoprotein oxygenase  59.33 
 
 
210 aa  248  6e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.522125  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2682  hypothetical protein  59.61 
 
 
205 aa  248  7e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6051  hypothetical protein  57.07 
 
 
218 aa  247  9e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.52164  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0492  flavoprotein oxygenase  58.17 
 
 
209 aa  247  1e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4071  hypothetical protein  58.25 
 
 
205 aa  247  1e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.261199  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0502  flavoprotein oxygenase  57.56 
 
 
208 aa  243  9.999999999999999e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1011  hypothetical protein  58.42 
 
 
202 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000116177  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3528  flavoprotein oxygenase  57.07 
 
 
208 aa  241  7e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0503  flavoprotein oxygenase  56.59 
 
 
208 aa  239  2e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0053  hypothetical protein  57.92 
 
 
210 aa  235  3e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.234931  normal  0.568294 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1820  hypothetical protein  58 
 
 
207 aa  232  2.0000000000000002e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6039  hypothetical protein  55.34 
 
 
206 aa  231  8.000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.8711  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4267  hypothetical protein  54.73 
 
 
221 aa  226  1e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.308533  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2943  hypothetical protein  53.85 
 
 
216 aa  223  2e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02220  hypothetical protein  49.52 
 
 
208 aa  222  3e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.686893  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6898  hypothetical protein  55.39 
 
 
203 aa  221  4e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.800563  normal  0.546229 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2049  hypothetical protein  50 
 
 
205 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4312  hypothetical protein  51.94 
 
 
205 aa  210  1e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3466  hypothetical protein  52.94 
 
 
209 aa  209  2e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.421094 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4215  hypothetical protein  52.76 
 
 
184 aa  208  5e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.380151  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2631  hypothetical protein  49.5 
 
 
202 aa  204  7e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1899  hypothetical protein  52.41 
 
 
202 aa  199  3e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.843142  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3787  hypothetical protein  66.43 
 
 
140 aa  197  6e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6309  hypothetical protein  46.12 
 
 
207 aa  179  2.9999999999999997e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1057  hypothetical protein  46.11 
 
 
200 aa  178  5.999999999999999e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.535631 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2221  hypothetical protein  46.23 
 
 
201 aa  177  9e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.378667  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2151  hypothetical protein  43.22 
 
 
203 aa  177  1e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1646  hypothetical protein  48.62 
 
 
212 aa  176  2e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1032  hypothetical protein  45.23 
 
 
203 aa  176  2e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.863891  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1842  hypothetical protein  46.11 
 
 
203 aa  175  5e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0994516  normal  0.0170416 
 
 
-
 
NC_004310  BR1068  hypothetical protein  44.72 
 
 
203 aa  173  9.999999999999999e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0726405  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2041  flavin reductase domain protein FMN-binding  47.22 
 
 
203 aa  171  9e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0801878  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2065  conserved hypothetical FMN binding protein  43.75 
 
 
201 aa  166  2e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.111591  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0627  flavin reductase domain-containing protein  47.25 
 
 
194 aa  164  8e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3209  flavin reductase-like, FMN-binding  45.45 
 
 
201 aa  160  1e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1838  hypothetical protein  46.7 
 
 
194 aa  159  2e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0487  flavin reductase domain-containing protein  46.7 
 
 
194 aa  159  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.660755  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3621  hypothetical protein  44.39 
 
 
220 aa  159  3e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2319  hypothetical protein  42.03 
 
 
201 aa  158  5e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2591  flavin reductase domain protein FMN-binding  44.28 
 
 
201 aa  156  2e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.40537 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2316  hypothetical protein  44.28 
 
 
201 aa  156  2e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0978794 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0267  hypothetical protein  42.86 
 
 
209 aa  154  6e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2270  hypothetical protein  43.5 
 
 
201 aa  154  9e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07162  conserved hypothetical protein  43.27 
 
 
241 aa  154  1e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.574629  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7205  flavin reductase domain protein FMN-binding  41.84 
 
 
209 aa  144  6e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.981743  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3064  hypothetical protein  40 
 
 
209 aa  141  6e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.883432  normal  0.0355565 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6295  hypothetical protein  41.15 
 
 
208 aa  139  3e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.19889  normal  0.194247 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1479  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  41.58 
 
 
206 aa  135  4e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2679  hypothetical protein  38.5 
 
 
230 aa  134  7.000000000000001e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2736  hypothetical protein  38.5 
 
 
230 aa  134  7.000000000000001e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2269  hypothetical protein  37.56 
 
 
229 aa  133  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0889  hypothetical protein  39.66 
 
 
200 aa  130  2.0000000000000002e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.581973  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1083  hypothetical protein  36.7 
 
 
204 aa  125  5e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.2808  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2435  hypothetical protein  35 
 
 
211 aa  123  2e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2487  hypothetical protein  42.47 
 
 
203 aa  123  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.239635  normal  0.0244852 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0412  hypothetical protein  35.12 
 
 
206 aa  122  3e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.567346  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6314  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  39.89 
 
 
294 aa  122  3e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4414  hypothetical protein  37.63 
 
 
218 aa  122  3e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.629184  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2366  flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family-like protein  43.37 
 
 
203 aa  122  4e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.460598  normal  0.14144 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3276  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.17 
 
 
295 aa  122  5e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2444  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  42.76 
 
 
199 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1981  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  36.42 
 
 
197 aa  118  7e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.780004  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4644  hypothetical protein  36.92 
 
 
231 aa  115  3e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1786  flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family-like protein  39.78 
 
 
228 aa  115  5e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.60124  normal  0.96149 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2815  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  39.6 
 
 
219 aa  114  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.112665  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5792  hypothetical protein  37.71 
 
 
218 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.926616 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3293  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  39.47 
 
 
216 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.902968  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4263  flavin reductase domain-containing protein  36.42 
 
 
210 aa  112  4.0000000000000004e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.644656 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0602  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  34.9 
 
 
217 aa  112  5e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.413112 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>