205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02220 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_02220  hypothetical protein  100 
 
 		 208 aa  432  1e-120  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.686893  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1051  hypothetical protein  56.93 
 
 		 230 aa  263  2e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.106662  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2217  hypothetical protein  57.21 
 
 		 207 aa  255  3e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0565603 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1011  hypothetical protein  57.21 
 
 		 202 aa  254  7e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000116177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2703  hypothetical protein  55.22 
 
 		 206 aa  253  2.0000000000000002e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.113365  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4002  hypothetical protein  56.72 
 
 		 207 aa  251  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.548606  normal  0.130195 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4462  hypothetical protein  55.72 
 
 		 209 aa  250  8.000000000000001e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.70984  normal  0.854602 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2049  hypothetical protein  55.88 
 
 		 205 aa  249  2e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4298  hypothetical protein  55.72 
 
 		 207 aa  249  3e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4219  hypothetical protein  54.15 
 
 		 205 aa  248  6e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.269485 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4899  hypothetical protein  55.61 
 
 		 205 aa  245  4e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0081  hypothetical protein  54.46 
 
 		 209 aa  243  9.999999999999999e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1359  hypothetical protein  55.72 
 
 		 208 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.262276  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0863  flavin reductase domain protein FMN-binding  53.47 
 
 		 209 aa  243  1.9999999999999999e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0832  hypothetical protein  55.72 
 
 		 206 aa  243  1.9999999999999999e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.158602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4071  hypothetical protein  54.63 
 
 		 205 aa  239  2e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.261199  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1398  hypothetical protein  53.73 
 
 		 201 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.709674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4325  hypothetical protein  53.73 
 
 		 201 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.590963 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0498  flavoprotein oxygenase  55.45 
 
 		 209 aa  238  4e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4414  hypothetical protein  54.23 
 
 		 201 aa  238  5.999999999999999e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1150  flavoprotein oxygenase  52.97 
 
 		 207 aa  237  9e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.462825 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6051  hypothetical protein  51.94 
 
 		 218 aa  236  1e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.52164  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1039  hypothetical protein  52.48 
 
 		 201 aa  235  4e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.708626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2682  hypothetical protein  54.15 
 
 		 205 aa  234  5.0000000000000005e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04002  nitrilotriacetate monooxygenase component B  51.24 
 
 		 209 aa  233  1.0000000000000001e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1469  flavoprotein oxygenase  52.71 
 
 		 212 aa  230  1e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0053  hypothetical protein  51.74 
 
 		 210 aa  229  3e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.234931  normal  0.568294 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6039  hypothetical protein  50.24 
 
 		 206 aa  225  4e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.8711  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0492  flavoprotein oxygenase  51.2 
 
 		 209 aa  222  3e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1242  hypothetical protein  49.52 
 
 		 208 aa  222  3e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1215  hypothetical protein  49.52 
 
 		 208 aa  222  3e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0502  flavoprotein oxygenase  51.94 
 
 		 208 aa  221  4.9999999999999996e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0452  flavoprotein oxygenase  50.24 
 
 		 209 aa  220  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0458  flavoprotein oxygenase  50.24 
 
 		 209 aa  220  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3989  flavoprotein oxygenase  50.24 
 
 		 209 aa  220  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3626  flavoprotein oxygenase  50.48 
 
 		 209 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1122  hypothetical protein  49.04 
 
 		 221 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3355  flavoprotein oxygenase  52.22 
 
 		 210 aa  219  1.9999999999999999e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.522125  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3807  flavin reductase domain protein FMN-binding  49.76 
 
 		 209 aa  218  3.9999999999999997e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0761  hypothetical protein  49.04 
 
 		 208 aa  218  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0503  flavoprotein oxygenase  51.46 
 
 		 208 aa  218  3.9999999999999997e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3528  flavoprotein oxygenase  50.97 
 
 		 208 aa  218  7e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1133  hypothetical protein  48.56 
 
 		 208 aa  217  7.999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.311037 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3864  flavoprotein oxygenase  49.76 
 
 		 209 aa  217  1e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1820  hypothetical protein  49 
 
 		 207 aa  205  4e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4312  hypothetical protein  48.51 
 
 		 205 aa  202  2e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2943  hypothetical protein  46.83 
 
 		 216 aa  202  4e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4267  hypothetical protein  49.5 
 
 		 221 aa  201  9e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.308533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3466  hypothetical protein  45.85 
 
 		 209 aa  196  2.0000000000000003e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.421094 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6898  hypothetical protein  45.85 
 
 		 203 aa  196  3e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.800563  normal  0.546229 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1899  hypothetical protein  47.06 
 
 		 202 aa  189  2e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.843142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2631  hypothetical protein  43.56 
 
 		 202 aa  186  2e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2151  hypothetical protein  46.27 
 
 		 203 aa  186  2e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6309  hypothetical protein  41.95 
 
 		 207 aa  184  7e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2221  hypothetical protein  46.27 
 
 		 201 aa  183  2.0000000000000003e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.378667  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1032  hypothetical protein  44.28 
 
 		 203 aa  177  7e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.863891  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3787  hypothetical protein  61.24 
 
 		 140 aa  176  2e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2319  hypothetical protein  44.44 
 
 		 201 aa  176  2e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1068  hypothetical protein  43.78 
 
 		 203 aa  175  5e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0726405  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2065  conserved hypothetical FMN binding protein  42.03 
 
 		 201 aa  173  1.9999999999999998e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.111591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1842  hypothetical protein  44.16 
 
 		 203 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0994516  normal  0.0170416 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3209  flavin reductase-like, FMN-binding  42.23 
 
 		 201 aa  171  9e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4215  hypothetical protein  42.5 
 
 		 184 aa  170  2e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.380151  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2041  flavin reductase domain protein FMN-binding  43.15 
 
 		 203 aa  169  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0801878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1057  hypothetical protein  44.1 
 
 		 200 aa  168  5e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.535631 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0627  flavin reductase domain-containing protein  44.5 
 
 		 194 aa  167  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1646  hypothetical protein  43.78 
 
 		 212 aa  165  5e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2591  flavin reductase domain protein FMN-binding  43.23 
 
 		 201 aa  160  1e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.40537 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2316  hypothetical protein  43.23 
 
 		 201 aa  160  1e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0978794 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0487  flavin reductase domain-containing protein  41.5 
 
 		 194 aa  159  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.660755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2270  hypothetical protein  42.71 
 
 		 201 aa  159  3e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1838  hypothetical protein  42 
 
 		 194 aa  157  8e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3621  hypothetical protein  37.32 
 
 		 220 aa  153  1e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6295  hypothetical protein  40.93 
 
 		 208 aa  151  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.19889  normal  0.194247 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0267  hypothetical protein  37.75 
 
 		 209 aa  150  1e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7205  flavin reductase domain protein FMN-binding  40.62 
 
 		 209 aa  148  7e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.981743  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2679  hypothetical protein  42.45 
 
 		 230 aa  146  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2736  hypothetical protein  42.45 
 
 		 230 aa  146  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2269  hypothetical protein  41.23 
 
 		 229 aa  140  9.999999999999999e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3064  hypothetical protein  41.18 
 
 		 209 aa  140  1.9999999999999998e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.883432  normal  0.0355565 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07162  conserved hypothetical protein  40.59 
 
 		 241 aa  137  1e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.574629  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1479  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  43.93 
 
 		 206 aa  132  3.9999999999999996e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1916  hypothetical protein  38.17 
 
 		 203 aa  129  4.0000000000000003e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1981  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  40.68 
 
 		 197 aa  129  4.0000000000000003e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.780004  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0762  flavin reductase domain protein FMN-binding  38.71 
 
 		 203 aa  127  1.0000000000000001e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1083  hypothetical protein  37.23 
 
 		 204 aa  126  2.0000000000000002e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.2808  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5447  hypothetical protein  37.3 
 
 		 203 aa  123  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000739812  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5021  flavin reductase  37.3 
 
 		 203 aa  123  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000378469  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5120  putative flavin reductase  37.3 
 
 		 203 aa  123  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0364817  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5005  flavin reductase  36.76 
 
 		 203 aa  122  3e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000501887  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5444  hypothetical protein  36.76 
 
 		 203 aa  122  4e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0011476  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2452  hypothetical protein  39.79 
 
 		 201 aa  122  5e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.108576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5507  hypothetical protein  36.76 
 
 		 203 aa  122  5e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000065263  unclonable  4.40126e-26 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3843  hypothetical protein  36.22 
 
 		 203 aa  121  7e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000198663  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5500  hypothetical protein  36.76 
 
 		 203 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000371904  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5171  hypothetical protein  36.76 
 
 		 203 aa  119  3e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000552892  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5933  hypothetical protein  36.07 
 
 		 209 aa  119  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0889  hypothetical protein  37.99 
 
 		 200 aa  119  3e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.581973  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5413  hypothetical protein  36.76 
 
 		 203 aa  119  3e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.81917e-62 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2366  flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family-like protein  41.4 
 
 		 203 aa  119  3e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.460598  normal  0.14144 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>