222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4312 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_4312  hypothetical protein  100 
 
 		 205 aa  426  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6898  hypothetical protein  80 
 
 		 203 aa  347  6e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.800563  normal  0.546229 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2943  hypothetical protein  80 
 
 		 216 aa  344  6e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4462  hypothetical protein  62.32 
 
 		 209 aa  271  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.70984  normal  0.854602 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0863  flavin reductase domain protein FMN-binding  59.31 
 
 		 209 aa  261  6.999999999999999e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4002  hypothetical protein  57.97 
 
 		 207 aa  253  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.548606  normal  0.130195 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4325  hypothetical protein  60.3 
 
 		 201 aa  252  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.590963 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1398  hypothetical protein  60.3 
 
 		 201 aa  252  3e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.709674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2682  hypothetical protein  61.19 
 
 		 205 aa  252  3e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4298  hypothetical protein  57 
 
 		 207 aa  251  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4414  hypothetical protein  59.8 
 
 		 201 aa  249  2e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1039  hypothetical protein  59.8 
 
 		 201 aa  248  6e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.708626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2703  hypothetical protein  58.54 
 
 		 206 aa  246  1e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.113365  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1011  hypothetical protein  59.9 
 
 		 202 aa  246  2e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000116177  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0832  hypothetical protein  58.74 
 
 		 206 aa  246  2e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.158602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2217  hypothetical protein  56.93 
 
 		 207 aa  238  5e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0565603 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2631  hypothetical protein  58.13 
 
 		 202 aa  236  1e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1820  hypothetical protein  55.88 
 
 		 207 aa  236  2e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1899  hypothetical protein  57.87 
 
 		 202 aa  233  2.0000000000000002e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.843142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4219  hypothetical protein  55.17 
 
 		 205 aa  232  3e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.269485 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1051  hypothetical protein  55.39 
 
 		 230 aa  232  3e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.106662  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0081  hypothetical protein  56.22 
 
 		 209 aa  232  3e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1150  flavoprotein oxygenase  55.22 
 
 		 207 aa  230  8.000000000000001e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.462825 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6051  hypothetical protein  55.67 
 
 		 218 aa  229  1e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.52164  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4899  hypothetical protein  54.19 
 
 		 205 aa  228  4e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1359  hypothetical protein  51.92 
 
 		 208 aa  222  3e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.262276  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04002  nitrilotriacetate monooxygenase component B  53.2 
 
 		 209 aa  221  4.9999999999999996e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1469  flavoprotein oxygenase  54.15 
 
 		 212 aa  220  9.999999999999999e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4071  hypothetical protein  53.69 
 
 		 205 aa  220  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.261199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3466  hypothetical protein  55.5 
 
 		 209 aa  216  1e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.421094 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3355  flavoprotein oxygenase  54.63 
 
 		 210 aa  214  5e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.522125  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0502  flavoprotein oxygenase  53.88 
 
 		 208 aa  214  5.9999999999999996e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0053  hypothetical protein  53.69 
 
 		 210 aa  213  9.999999999999999e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.234931  normal  0.568294 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3626  flavoprotein oxygenase  50.24 
 
 		 209 aa  212  2.9999999999999995e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3528  flavoprotein oxygenase  52.91 
 
 		 208 aa  211  4.9999999999999996e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0492  flavoprotein oxygenase  52.68 
 
 		 209 aa  211  5.999999999999999e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0503  flavoprotein oxygenase  53.4 
 
 		 208 aa  211  5.999999999999999e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0452  flavoprotein oxygenase  53.17 
 
 		 209 aa  211  7.999999999999999e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3807  flavin reductase domain protein FMN-binding  53.17 
 
 		 209 aa  210  1e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1215  hypothetical protein  51.94 
 
 		 208 aa  210  1e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0498  flavoprotein oxygenase  53 
 
 		 209 aa  210  1e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2049  hypothetical protein  49.76 
 
 		 205 aa  209  2e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0458  flavoprotein oxygenase  52.68 
 
 		 209 aa  209  2e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3989  flavoprotein oxygenase  52.68 
 
 		 209 aa  209  2e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4267  hypothetical protein  52.97 
 
 		 221 aa  209  3e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.308533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1242  hypothetical protein  51.46 
 
 		 208 aa  208  3e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3864  flavoprotein oxygenase  52.68 
 
 		 209 aa  208  4e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0761  hypothetical protein  50.97 
 
 		 208 aa  205  4e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1133  hypothetical protein  50.97 
 
 		 208 aa  205  4e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.311037 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1122  hypothetical protein  50.97 
 
 		 221 aa  204  5e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02220  hypothetical protein  48.51 
 
 		 208 aa  202  2e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.686893  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2221  hypothetical protein  48.24 
 
 		 201 aa  202  4e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.378667  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1057  hypothetical protein  48.99 
 
 		 200 aa  196  1.0000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.535631 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6039  hypothetical protein  49.01 
 
 		 206 aa  196  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.8711  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6309  hypothetical protein  48.02 
 
 		 207 aa  194  7e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2151  hypothetical protein  48.73 
 
 		 203 aa  192  3e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1032  hypothetical protein  48.73 
 
 		 203 aa  185  5e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.863891  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4215  hypothetical protein  49.02 
 
 		 184 aa  185  5e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.380151  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1068  hypothetical protein  48.22 
 
 		 203 aa  182  4.0000000000000006e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0726405  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2041  flavin reductase domain protein FMN-binding  47.37 
 
 		 203 aa  180  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0801878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2316  hypothetical protein  47.74 
 
 		 201 aa  176  2e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0978794 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2591  flavin reductase domain protein FMN-binding  47.74 
 
 		 201 aa  176  2e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.40537 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1842  hypothetical protein  45.79 
 
 		 203 aa  176  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0994516  normal  0.0170416 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2270  hypothetical protein  48.95 
 
 		 201 aa  175  4e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3787  hypothetical protein  62.41 
 
 		 140 aa  174  9e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7205  flavin reductase domain protein FMN-binding  46.73 
 
 		 209 aa  171  5e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.981743  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0267  hypothetical protein  48.47 
 
 		 209 aa  171  5e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2319  hypothetical protein  47.06 
 
 		 201 aa  171  5.999999999999999e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6295  hypothetical protein  47.37 
 
 		 208 aa  169  2e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.19889  normal  0.194247 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1646  hypothetical protein  43.94 
 
 		 212 aa  166  2e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2065  conserved hypothetical FMN binding protein  44.61 
 
 		 201 aa  166  2.9999999999999998e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.111591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0627  flavin reductase domain-containing protein  46.7 
 
 		 194 aa  164  8e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1838  hypothetical protein  44.16 
 
 		 194 aa  159  3e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0487  flavin reductase domain-containing protein  44.16 
 
 		 194 aa  159  3e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.660755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3209  flavin reductase-like, FMN-binding  42.93 
 
 		 201 aa  153  2e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07162  conserved hypothetical protein  45.67 
 
 		 241 aa  152  2.9999999999999998e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.574629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2736  hypothetical protein  39.52 
 
 		 230 aa  144  1e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2679  hypothetical protein  39.52 
 
 		 230 aa  144  1e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3621  hypothetical protein  39.71 
 
 		 220 aa  142  4e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2269  hypothetical protein  38.57 
 
 		 229 aa  138  4.999999999999999e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3064  hypothetical protein  39.81 
 
 		 209 aa  136  2e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.883432  normal  0.0355565 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2444  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  40.11 
 
 		 199 aa  123  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2435  hypothetical protein  34.69 
 
 		 211 aa  119  4.9999999999999996e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1083  hypothetical protein  34.76 
 
 		 204 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.2808  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4414  hypothetical protein  35.29 
 
 		 218 aa  110  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.629184  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2366  flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family-like protein  37.44 
 
 		 203 aa  108  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.460598  normal  0.14144 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0889  hypothetical protein  34.54 
 
 		 200 aa  108  7.000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.581973  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1786  flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family-like protein  34.55 
 
 		 228 aa  107  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.60124  normal  0.96149 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2487  hypothetical protein  36.04 
 
 		 203 aa  106  3e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.239635  normal  0.0244852 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0762  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.87 
 
 		 203 aa  105  5e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5507  hypothetical protein  33.7 
 
 		 203 aa  104  8e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000065263  unclonable  4.40126e-26 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4263  flavin reductase domain-containing protein  33.7 
 
 		 210 aa  104  9e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.644656 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1479  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  34.65 
 
 		 206 aa  103  1e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5120  putative flavin reductase  34.24 
 
 		 203 aa  103  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0364817  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1916  hypothetical protein  32.98 
 
 		 203 aa  102  3e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5444  hypothetical protein  33.15 
 
 		 203 aa  102  6e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0011476  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5447  hypothetical protein  32.61 
 
 		 203 aa  101  7e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000739812  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5021  flavin reductase  32.61 
 
 		 203 aa  101  7e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000378469  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5005  flavin reductase  32.61 
 
 		 203 aa  101  8e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000501887  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3843  hypothetical protein  33.7 
 
 		 203 aa  101  8e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000198663  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>