226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1786 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_1786  flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family-like protein  100 
 
 
228 aa  462  1e-129  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.60124  normal  0.96149 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2631  hypothetical protein  44.17 
 
 
221 aa  183  2.0000000000000003e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.300035  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0602  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  46.19 
 
 
217 aa  179  2.9999999999999997e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.413112 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0405  hypothetical protein  42.5 
 
 
207 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5247  hypothetical protein  42.08 
 
 
216 aa  155  5.0000000000000005e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.59199 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3148  flavin reductase-like, FMN-binding  39.22 
 
 
219 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5370  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.97 
 
 
223 aa  146  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.480853 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5134  hypothetical protein  35.92 
 
 
220 aa  143  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7599  hypothetical protein  36.41 
 
 
220 aa  142  3e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2915  flavin reductase domain protein FMN-binding  37.31 
 
 
203 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2654  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.82 
 
 
203 aa  137  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1479  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  39.5 
 
 
206 aa  136  2e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0889  hypothetical protein  40.31 
 
 
200 aa  134  9.999999999999999e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.581973  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2914  hypothetical protein  38.19 
 
 
203 aa  133  3e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.939622 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5933  hypothetical protein  34.27 
 
 
209 aa  131  6.999999999999999e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2366  flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family-like protein  36.63 
 
 
203 aa  131  9e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.460598  normal  0.14144 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2682  hypothetical protein  40.1 
 
 
205 aa  131  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4644  hypothetical protein  36.5 
 
 
231 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1398  hypothetical protein  36.89 
 
 
201 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.709674  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4325  hypothetical protein  35.44 
 
 
201 aa  128  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.590963 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4414  hypothetical protein  35.92 
 
 
201 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1039  hypothetical protein  37.38 
 
 
201 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.708626  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1083  hypothetical protein  36.61 
 
 
204 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.2808  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1051  flavin reductase-like, FMN-binding  38 
 
 
213 aa  126  3e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0886076 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1359  hypothetical protein  38.92 
 
 
208 aa  125  6e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.262276  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2815  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  41.86 
 
 
219 aa  124  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.112665  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2487  hypothetical protein  35 
 
 
203 aa  123  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.239635  normal  0.0244852 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4219  hypothetical protein  40.09 
 
 
205 aa  123  2e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.269485 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4071  hypothetical protein  40.1 
 
 
205 aa  122  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.261199  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2943  hypothetical protein  38.42 
 
 
216 aa  122  4e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1899  hypothetical protein  43.86 
 
 
202 aa  122  6e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.843142  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5124  flavin reductase-like, FMN-binding  32.04 
 
 
216 aa  121  8e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.178532 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04002  nitrilotriacetate monooxygenase component B  36.55 
 
 
209 aa  121  9e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4899  hypothetical protein  36.89 
 
 
205 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4462  hypothetical protein  39.29 
 
 
209 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.70984  normal  0.854602 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2217  hypothetical protein  38.22 
 
 
207 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0565603 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5906  hypothetical protein  35.23 
 
 
195 aa  119  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6898  hypothetical protein  36.41 
 
 
203 aa  119  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.800563  normal  0.546229 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0832  hypothetical protein  40.93 
 
 
206 aa  119  3.9999999999999996e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.158602  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1150  flavoprotein oxygenase  36 
 
 
207 aa  119  3.9999999999999996e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.462825 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0945  hypothetical protein  35.44 
 
 
210 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2452  hypothetical protein  35.78 
 
 
201 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.108576  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2683  hypothetical protein  31.37 
 
 
203 aa  115  5e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2740  hypothetical protein  31.37 
 
 
203 aa  115  5e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1215  hypothetical protein  39.78 
 
 
208 aa  115  6e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1122  hypothetical protein  39.78 
 
 
221 aa  115  6e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1133  hypothetical protein  40.88 
 
 
208 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.311037 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6314  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  37.43 
 
 
294 aa  114  7.999999999999999e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4298  hypothetical protein  39.01 
 
 
207 aa  114  8.999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1820  hypothetical protein  37.57 
 
 
207 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2631  hypothetical protein  36.32 
 
 
202 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1242  hypothetical protein  39.78 
 
 
208 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0053  hypothetical protein  37.91 
 
 
210 aa  114  1.0000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.234931  normal  0.568294 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5786  hypothetical protein  35.11 
 
 
208 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.756136  hitchhiker  0.00296108 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5253  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.37 
 
 
196 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.504075 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3627  hypothetical protein  35.78 
 
 
202 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.174937  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1981  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  35.68 
 
 
197 aa  113  2.0000000000000002e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.780004  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0090  flavin reductase domain-containing protein  35.5 
 
 
210 aa  113  3e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00316855 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4002  hypothetical protein  39.01 
 
 
207 aa  113  3e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.548606  normal  0.130195 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3276  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.16 
 
 
295 aa  112  3e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0081  hypothetical protein  39.38 
 
 
209 aa  113  3e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1011  hypothetical protein  38.2 
 
 
202 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000116177  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1469  flavoprotein oxygenase  39.6 
 
 
212 aa  112  4.0000000000000004e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43240  hypothetical protein  35.78 
 
 
202 aa  111  7.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.531737 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2049  hypothetical protein  37.27 
 
 
205 aa  111  8.000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0863  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.23 
 
 
209 aa  111  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0761  hypothetical protein  39.23 
 
 
208 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1365  hypothetical protein  35.12 
 
 
196 aa  109  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.300021  normal  0.0686539 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4263  flavin reductase domain-containing protein  35.57 
 
 
210 aa  109  4.0000000000000004e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.644656 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2065  conserved hypothetical FMN binding protein  36.46 
 
 
201 aa  108  5e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.111591  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3064  hypothetical protein  35.1 
 
 
209 aa  108  5e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.883432  normal  0.0355565 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4215  hypothetical protein  40.97 
 
 
184 aa  108  9.000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.380151  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2703  hypothetical protein  35.75 
 
 
206 aa  107  1e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.113365  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3626  flavoprotein oxygenase  35.64 
 
 
209 aa  107  1e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0498  flavoprotein oxygenase  35.41 
 
 
209 aa  108  1e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1916  hypothetical protein  29.13 
 
 
203 aa  106  2e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4312  hypothetical protein  34.55 
 
 
205 aa  107  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1051  hypothetical protein  38.46 
 
 
230 aa  105  4e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.106662  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1593  hypothetical protein  31.84 
 
 
291 aa  105  4e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3209  flavin reductase-like, FMN-binding  34.38 
 
 
201 aa  105  7e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02220  hypothetical protein  34.13 
 
 
208 aa  104  1e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.686893  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2319  hypothetical protein  34.9 
 
 
201 aa  104  1e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0492  flavoprotein oxygenase  34.45 
 
 
209 aa  103  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2857  hypothetical protein  35.47 
 
 
200 aa  103  2e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1646  hypothetical protein  33.33 
 
 
212 aa  103  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3989  flavoprotein oxygenase  34.93 
 
 
209 aa  102  3e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6039  hypothetical protein  35.29 
 
 
206 aa  103  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.8711  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6051  hypothetical protein  39.24 
 
 
218 aa  102  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.52164  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3807  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.93 
 
 
209 aa  103  3e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0458  flavoprotein oxygenase  34.93 
 
 
209 aa  102  3e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0452  flavoprotein oxygenase  34.93 
 
 
209 aa  102  5e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3864  flavoprotein oxygenase  34.93 
 
 
209 aa  102  6e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01680  hypothetical protein  31.05 
 
 
292 aa  102  6e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2070  hypothetical protein  36.99 
 
 
202 aa  102  6e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.224794 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2164  hypothetical protein  36.84 
 
 
200 aa  102  7e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.341865  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0627  flavin reductase domain-containing protein  37.87 
 
 
194 aa  101  8e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1057  hypothetical protein  33.65 
 
 
200 aa  101  9e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.535631 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0502  flavoprotein oxygenase  34.93 
 
 
208 aa  101  1e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2221  hypothetical protein  33.65 
 
 
201 aa  101  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.378667  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07162  conserved hypothetical protein  34.34 
 
 
241 aa  100  2e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.574629  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>