186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_5247 on replicon NC_010335
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010335  Caul_5247  hypothetical protein  100 
 
 
216 aa  437  9.999999999999999e-123  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.59199 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4644  hypothetical protein  50.75 
 
 
231 aa  195  6e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0405  hypothetical protein  47.32 
 
 
207 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2631  hypothetical protein  45.5 
 
 
221 aa  180  1e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.300035  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0602  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  47.52 
 
 
217 aa  176  2e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.413112 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2452  hypothetical protein  42.65 
 
 
201 aa  159  2e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.108576  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3627  hypothetical protein  42.16 
 
 
202 aa  159  3e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.174937  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43240  hypothetical protein  42.16 
 
 
202 aa  157  1e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.531737 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1786  flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family-like protein  42.08 
 
 
228 aa  155  5.0000000000000005e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.60124  normal  0.96149 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3148  flavin reductase-like, FMN-binding  40.5 
 
 
219 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2654  flavin reductase domain protein FMN-binding  41.79 
 
 
203 aa  151  8.999999999999999e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2915  flavin reductase domain protein FMN-binding  40.2 
 
 
203 aa  147  8e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3465  hypothetical protein  44.88 
 
 
202 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3110  hypothetical protein  44.88 
 
 
202 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0966495  normal  0.11855 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2914  hypothetical protein  41.45 
 
 
203 aa  145  3e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.939622 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0945  hypothetical protein  43.16 
 
 
210 aa  145  6e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0090  flavin reductase domain-containing protein  42.65 
 
 
210 aa  145  6e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00316855 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2070  hypothetical protein  46.5 
 
 
202 aa  144  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.224794 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5370  flavin reductase domain protein FMN-binding  37.62 
 
 
223 aa  142  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.480853 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1051  flavin reductase-like, FMN-binding  38.57 
 
 
213 aa  139  3e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0886076 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0889  hypothetical protein  41.15 
 
 
200 aa  138  7e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.581973  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5253  flavin reductase domain protein FMN-binding  45.12 
 
 
196 aa  137  7.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.504075 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7599  hypothetical protein  38.07 
 
 
220 aa  137  1e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1365  hypothetical protein  45.12 
 
 
196 aa  137  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.300021  normal  0.0686539 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1479  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  38 
 
 
206 aa  134  9.999999999999999e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5906  hypothetical protein  39.9 
 
 
195 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5134  hypothetical protein  36.82 
 
 
220 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5933  hypothetical protein  38.19 
 
 
209 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2164  hypothetical protein  36.27 
 
 
200 aa  129  4.0000000000000003e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.341865  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2444  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  42.08 
 
 
199 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0081  hypothetical protein  41.97 
 
 
209 aa  125  5e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2366  flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family-like protein  39.49 
 
 
203 aa  124  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.460598  normal  0.14144 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1916  hypothetical protein  33.17 
 
 
203 aa  123  2e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2740  hypothetical protein  33.66 
 
 
203 aa  123  2e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2683  hypothetical protein  33.66 
 
 
203 aa  123  2e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5124  flavin reductase-like, FMN-binding  35.71 
 
 
216 aa  122  4e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.178532 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4263  flavin reductase domain-containing protein  37.97 
 
 
210 aa  121  6e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.644656 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2435  hypothetical protein  35.23 
 
 
211 aa  121  8e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5786  hypothetical protein  37.23 
 
 
208 aa  121  8e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.756136  hitchhiker  0.00296108 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6314  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  36.63 
 
 
294 aa  121  9e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2857  hypothetical protein  33.33 
 
 
200 aa  120  1.9999999999999998e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2487  hypothetical protein  38.62 
 
 
203 aa  119  3e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.239635  normal  0.0244852 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0053  hypothetical protein  39.52 
 
 
210 aa  119  3.9999999999999996e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.234931  normal  0.568294 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1051  hypothetical protein  39.38 
 
 
230 aa  118  4.9999999999999996e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.106662  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3064  hypothetical protein  37.37 
 
 
209 aa  119  4.9999999999999996e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.883432  normal  0.0355565 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0364  nitrilotriacetate monooxygenase component B  35.57 
 
 
205 aa  118  7e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5500  hypothetical protein  34.47 
 
 
203 aa  118  9e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000371904  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2049  hypothetical protein  38.58 
 
 
205 aa  117  9e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2682  hypothetical protein  39.9 
 
 
205 aa  117  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5447  hypothetical protein  34.3 
 
 
203 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000739812  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5021  flavin reductase  34.47 
 
 
203 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000378469  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3209  flavin reductase-like, FMN-binding  38.3 
 
 
201 aa  117  9.999999999999999e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1083  hypothetical protein  32.18 
 
 
204 aa  117  9.999999999999999e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.2808  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5005  flavin reductase  34.47 
 
 
203 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000501887  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1593  hypothetical protein  32.13 
 
 
291 aa  116  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4219  hypothetical protein  38.97 
 
 
205 aa  116  3e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.269485 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5444  hypothetical protein  33.82 
 
 
203 aa  116  3e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0011476  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2319  hypothetical protein  38.83 
 
 
201 aa  116  3e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6295  hypothetical protein  38.94 
 
 
208 aa  116  3e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.19889  normal  0.194247 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0412  hypothetical protein  36.87 
 
 
206 aa  115  3.9999999999999997e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.567346  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1359  hypothetical protein  38.97 
 
 
208 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.262276  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2815  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  44.02 
 
 
219 aa  115  6e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.112665  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1469  flavoprotein oxygenase  40.41 
 
 
212 aa  115  6.9999999999999995e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5171  hypothetical protein  33.98 
 
 
203 aa  114  8.999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000552892  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5565  hypothetical protein  33.98 
 
 
203 aa  114  8.999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000029994  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5413  hypothetical protein  33.82 
 
 
203 aa  114  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.81917e-62 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3276  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.66 
 
 
295 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4071  hypothetical protein  37.95 
 
 
205 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.261199  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5120  putative flavin reductase  33.5 
 
 
203 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0364817  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5507  hypothetical protein  33.33 
 
 
203 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000065263  unclonable  4.40126e-26 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0498  flavoprotein oxygenase  38.78 
 
 
209 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02220  hypothetical protein  36.65 
 
 
208 aa  114  2.0000000000000002e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.686893  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3626  flavoprotein oxygenase  37.63 
 
 
209 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3843  hypothetical protein  33.01 
 
 
203 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000198663  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3355  flavoprotein oxygenase  38.34 
 
 
210 aa  111  7.000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.522125  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6898  hypothetical protein  38.86 
 
 
203 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.800563  normal  0.546229 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0502  flavoprotein oxygenase  37.82 
 
 
208 aa  111  9e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01680  hypothetical protein  34.74 
 
 
292 aa  110  1.0000000000000001e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2736  hypothetical protein  36.27 
 
 
230 aa  110  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2679  hypothetical protein  36.27 
 
 
230 aa  110  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1646  hypothetical protein  37.5 
 
 
212 aa  110  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4267  hypothetical protein  38.58 
 
 
221 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.308533  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2631  hypothetical protein  39.27 
 
 
202 aa  109  3e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0503  flavoprotein oxygenase  37.31 
 
 
208 aa  109  3e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4899  hypothetical protein  37.44 
 
 
205 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3293  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  38.98 
 
 
216 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.902968  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2217  hypothetical protein  37.44 
 
 
207 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0565603 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0492  flavoprotein oxygenase  40.94 
 
 
209 aa  108  5e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2591  flavin reductase domain protein FMN-binding  39.18 
 
 
201 aa  108  6e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.40537 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2151  hypothetical protein  36.65 
 
 
203 aa  108  6e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3528  flavoprotein oxygenase  36.79 
 
 
208 aa  108  6e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2316  hypothetical protein  39.18 
 
 
201 aa  108  6e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0978794 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1039  hypothetical protein  35.23 
 
 
201 aa  108  6e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.708626  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2703  hypothetical protein  39.18 
 
 
206 aa  108  8.000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.113365  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1981  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  33.5 
 
 
197 aa  108  8.000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.780004  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1068  hypothetical protein  36.65 
 
 
203 aa  107  1e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0726405  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4002  hypothetical protein  37.31 
 
 
207 aa  107  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.548606  normal  0.130195 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0458  flavoprotein oxygenase  36.79 
 
 
209 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1032  hypothetical protein  36.65 
 
 
203 aa  107  1e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.863891  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1842  hypothetical protein  36.41 
 
 
203 aa  107  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0994516  normal  0.0170416 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>