223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0863 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0863  flavin reductase domain protein FMN-binding  100 
 
 		 209 aa  431  1e-120  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4462  hypothetical protein  79.8 
 
 		 209 aa  345  3e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.70984  normal  0.854602 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4002  hypothetical protein  73.53 
 
 		 207 aa  324  6e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.548606  normal  0.130195 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4298  hypothetical protein  73.04 
 
 		 207 aa  323  1e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1011  hypothetical protein  76.62 
 
 		 202 aa  321  4e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000116177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1039  hypothetical protein  74.26 
 
 		 201 aa  317  1e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.708626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4325  hypothetical protein  75.12 
 
 		 201 aa  315  3e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.590963 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1398  hypothetical protein  75.12 
 
 		 201 aa  315  4e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.709674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4414  hypothetical protein  74.13 
 
 		 201 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0081  hypothetical protein  72.77 
 
 		 209 aa  312  1.9999999999999998e-84  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2703  hypothetical protein  71.92 
 
 		 206 aa  311  3.9999999999999997e-84  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.113365  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1051  hypothetical protein  68.97 
 
 		 230 aa  301  5.000000000000001e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.106662  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04002  nitrilotriacetate monooxygenase component B  68.27 
 
 		 209 aa  293  2e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0832  hypothetical protein  67.98 
 
 		 206 aa  283  1.0000000000000001e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.158602  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1820  hypothetical protein  63.9 
 
 		 207 aa  281  4.0000000000000003e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1150  flavoprotein oxygenase  64.68 
 
 		 207 aa  279  2e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.462825 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2217  hypothetical protein  61.39 
 
 		 207 aa  274  6e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0565603 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1242  hypothetical protein  63.5 
 
 		 208 aa  274  7e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1215  hypothetical protein  63.5 
 
 		 208 aa  273  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2682  hypothetical protein  64.18 
 
 		 205 aa  271  4.0000000000000004e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1359  hypothetical protein  61.88 
 
 		 208 aa  271  4.0000000000000004e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.262276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0761  hypothetical protein  63 
 
 		 208 aa  271  7e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4219  hypothetical protein  60.89 
 
 		 205 aa  266  2e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.269485 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4899  hypothetical protein  60.4 
 
 		 205 aa  265  2.9999999999999995e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6039  hypothetical protein  62.87 
 
 		 206 aa  264  5.999999999999999e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.8711  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1122  hypothetical protein  60.39 
 
 		 221 aa  264  7e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3626  flavoprotein oxygenase  59.8 
 
 		 209 aa  261  4e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1133  hypothetical protein  61.5 
 
 		 208 aa  261  4.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.311037 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4071  hypothetical protein  59.9 
 
 		 205 aa  261  6.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.261199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4312  hypothetical protein  59.31 
 
 		 205 aa  261  8e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0498  flavoprotein oxygenase  62.69 
 
 		 209 aa  260  8.999999999999999e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0452  flavoprotein oxygenase  60.49 
 
 		 209 aa  259  2e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6898  hypothetical protein  63 
 
 		 203 aa  258  3e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.800563  normal  0.546229 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6051  hypothetical protein  57.71 
 
 		 218 aa  258  4e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.52164  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0458  flavoprotein oxygenase  60 
 
 		 209 aa  258  5.0000000000000005e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3989  flavoprotein oxygenase  60 
 
 		 209 aa  258  5.0000000000000005e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3807  flavin reductase domain protein FMN-binding  60 
 
 		 209 aa  258  6e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3355  flavoprotein oxygenase  60 
 
 		 210 aa  256  2e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.522125  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3864  flavoprotein oxygenase  59.51 
 
 		 209 aa  256  2e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2943  hypothetical protein  62.5 
 
 		 216 aa  255  3e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0502  flavoprotein oxygenase  59.9 
 
 		 208 aa  255  3e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0492  flavoprotein oxygenase  57.69 
 
 		 209 aa  254  6e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1469  flavoprotein oxygenase  60.87 
 
 		 212 aa  253  2.0000000000000002e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3528  flavoprotein oxygenase  58.91 
 
 		 208 aa  252  3e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0503  flavoprotein oxygenase  59.41 
 
 		 208 aa  251  4.0000000000000004e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3466  hypothetical protein  60.2 
 
 		 209 aa  251  5.000000000000001e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.421094 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2049  hypothetical protein  58 
 
 		 205 aa  251  6e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02220  hypothetical protein  53.47 
 
 		 208 aa  243  1.9999999999999999e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.686893  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4215  hypothetical protein  57.56 
 
 		 184 aa  243  1.9999999999999999e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.380151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4267  hypothetical protein  58.42 
 
 		 221 aa  236  2e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.308533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6309  hypothetical protein  56.59 
 
 		 207 aa  234  8e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0053  hypothetical protein  55.72 
 
 		 210 aa  234  9e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.234931  normal  0.568294 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2631  hypothetical protein  52.22 
 
 		 202 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3787  hypothetical protein  78.91 
 
 		 140 aa  207  7e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1899  hypothetical protein  54.01 
 
 		 202 aa  205  4e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.843142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2151  hypothetical protein  47.26 
 
 		 203 aa  193  2e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1057  hypothetical protein  46 
 
 		 200 aa  181  5.0000000000000004e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.535631 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1032  hypothetical protein  45 
 
 		 203 aa  176  2e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.863891  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2065  conserved hypothetical FMN binding protein  46.6 
 
 		 201 aa  174  7e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.111591  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1068  hypothetical protein  44.5 
 
 		 203 aa  173  1.9999999999999998e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0726405  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2221  hypothetical protein  43 
 
 		 201 aa  171  9e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.378667  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1646  hypothetical protein  47.76 
 
 		 212 aa  170  2e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1842  hypothetical protein  46.35 
 
 		 203 aa  169  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0994516  normal  0.0170416 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1838  hypothetical protein  49.44 
 
 		 194 aa  167  1e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0487  flavin reductase domain-containing protein  49.44 
 
 		 194 aa  167  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.660755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2270  hypothetical protein  44.22 
 
 		 201 aa  165  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0627  flavin reductase domain-containing protein  47.78 
 
 		 194 aa  165  5.9999999999999996e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2591  flavin reductase domain protein FMN-binding  44 
 
 		 201 aa  164  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.40537 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2316  hypothetical protein  44 
 
 		 201 aa  164  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0978794 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2041  flavin reductase domain protein FMN-binding  44.56 
 
 		 203 aa  164  9e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0801878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3209  flavin reductase-like, FMN-binding  44.17 
 
 		 201 aa  162  3e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7205  flavin reductase domain protein FMN-binding  43.88 
 
 		 209 aa  162  3e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.981743  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6295  hypothetical protein  43.88 
 
 		 208 aa  161  6e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.19889  normal  0.194247 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2319  hypothetical protein  44.66 
 
 		 201 aa  161  6e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0267  hypothetical protein  43.65 
 
 		 209 aa  161  6e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3621  hypothetical protein  46.02 
 
 		 220 aa  152  2.9999999999999998e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07162  conserved hypothetical protein  45.79 
 
 		 241 aa  147  2.0000000000000003e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.574629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2736  hypothetical protein  41.23 
 
 		 230 aa  143  2e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2679  hypothetical protein  41.23 
 
 		 230 aa  143  2e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2269  hypothetical protein  39.34 
 
 		 229 aa  137  1e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3064  hypothetical protein  40.49 
 
 		 209 aa  133  1.9999999999999998e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.883432  normal  0.0355565 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0889  hypothetical protein  39.89 
 
 		 200 aa  126  2.0000000000000002e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.581973  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2435  hypothetical protein  38.04 
 
 		 211 aa  117  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2444  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  39.16 
 
 		 199 aa  114  7.999999999999999e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4644  hypothetical protein  38.74 
 
 		 231 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1479  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  41.62 
 
 		 206 aa  114  1.0000000000000001e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4263  flavin reductase domain-containing protein  39.31 
 
 		 210 aa  112  4.0000000000000004e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.644656 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4414  hypothetical protein  36.41 
 
 		 218 aa  111  7.000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.629184  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1083  hypothetical protein  33.68 
 
 		 204 aa  111  8.000000000000001e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.2808  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3293  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  34.21 
 
 		 216 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.902968  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1786  flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family-like protein  35.23 
 
 		 228 aa  111  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.60124  normal  0.96149 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0412  hypothetical protein  34.78 
 
 		 206 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.567346  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0405  hypothetical protein  37.32 
 
 		 207 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01680  hypothetical protein  35.35 
 
 		 292 aa  108  4.0000000000000004e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1981  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  34.57 
 
 		 197 aa  108  7.000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.780004  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0602  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  35.24 
 
 		 217 aa  107  1e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.413112 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2366  flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family-like protein  38.55 
 
 		 203 aa  106  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.460598  normal  0.14144 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3276  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.11 
 
 		 295 aa  105  5e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5933  hypothetical protein  36.42 
 
 		 209 aa  105  5e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1593  hypothetical protein  37.11 
 
 		 291 aa  103  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>