239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5253 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5253  flavin reductase domain protein FMN-binding  100 
 
 
196 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.504075 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1365  hypothetical protein  97.45 
 
 
196 aa  396  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.300021  normal  0.0686539 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5906  hypothetical protein  84.62 
 
 
195 aa  343  6e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1051  flavin reductase-like, FMN-binding  78.97 
 
 
213 aa  328  4e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0886076 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0090  flavin reductase domain-containing protein  73.98 
 
 
210 aa  298  3e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00316855 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2914  hypothetical protein  45.16 
 
 
203 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.939622 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2915  flavin reductase domain protein FMN-binding  47.45 
 
 
203 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5370  flavin reductase domain protein FMN-binding  44.04 
 
 
223 aa  169  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.480853 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2654  flavin reductase domain protein FMN-binding  46.43 
 
 
203 aa  167  9e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7599  hypothetical protein  43.01 
 
 
220 aa  161  5.0000000000000005e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5134  hypothetical protein  41.97 
 
 
220 aa  161  6e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3148  flavin reductase-like, FMN-binding  42.78 
 
 
219 aa  159  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5124  flavin reductase-like, FMN-binding  39.7 
 
 
216 aa  154  6e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.178532 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0602  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  42.13 
 
 
217 aa  151  5e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.413112 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0945  hypothetical protein  39.59 
 
 
210 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3627  hypothetical protein  40.7 
 
 
202 aa  144  1e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.174937  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43240  hypothetical protein  40.7 
 
 
202 aa  142  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.531737 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1479  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  37.06 
 
 
206 aa  141  5e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2631  hypothetical protein  40.91 
 
 
221 aa  141  6e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.300035  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4644  hypothetical protein  42.93 
 
 
231 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5786  hypothetical protein  36.41 
 
 
208 aa  139  3e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.756136  hitchhiker  0.00296108 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5247  hypothetical protein  45.12 
 
 
216 aa  137  7e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.59199 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1916  hypothetical protein  36.68 
 
 
203 aa  135  5e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1083  hypothetical protein  37.1 
 
 
204 aa  133  1.9999999999999998e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.2808  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4410  hypothetical protein  35.75 
 
 
209 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3843  hypothetical protein  35.75 
 
 
203 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000198663  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5120  putative flavin reductase  33.83 
 
 
203 aa  132  5e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0364817  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5021  flavin reductase  34.33 
 
 
203 aa  131  6e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000378469  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5005  flavin reductase  34.33 
 
 
203 aa  131  6.999999999999999e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000501887  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5444  hypothetical protein  34.33 
 
 
203 aa  131  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0011476  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5507  hypothetical protein  33.83 
 
 
203 aa  131  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000065263  unclonable  4.40126e-26 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5447  hypothetical protein  33.83 
 
 
203 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000739812  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5500  hypothetical protein  33.83 
 
 
203 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000371904  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2366  flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family-like protein  41.24 
 
 
203 aa  130  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.460598  normal  0.14144 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5171  hypothetical protein  33.83 
 
 
203 aa  128  4.0000000000000003e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000552892  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5413  hypothetical protein  33.83 
 
 
203 aa  128  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.81917e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5565  hypothetical protein  33.83 
 
 
203 aa  128  4.0000000000000003e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000029994  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2070  hypothetical protein  42.25 
 
 
202 aa  128  5.0000000000000004e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.224794 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5933  hypothetical protein  35.53 
 
 
209 aa  128  5.0000000000000004e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2487  hypothetical protein  40.21 
 
 
203 aa  128  5.0000000000000004e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.239635  normal  0.0244852 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2683  hypothetical protein  36.22 
 
 
203 aa  126  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0762  flavin reductase domain protein FMN-binding  37.31 
 
 
203 aa  127  2.0000000000000002e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2740  hypothetical protein  36.22 
 
 
203 aa  126  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3465  hypothetical protein  40.64 
 
 
202 aa  126  3e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3110  hypothetical protein  40.64 
 
 
202 aa  126  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0966495  normal  0.11855 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0364  nitrilotriacetate monooxygenase component B  34 
 
 
205 aa  124  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2815  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  37.5 
 
 
219 aa  122  3e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.112665  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2452  hypothetical protein  34 
 
 
201 aa  115  3e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.108576  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0075  hypothetical protein  36.13 
 
 
196 aa  116  3e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000447764  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1786  flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family-like protein  35.37 
 
 
228 aa  114  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.60124  normal  0.96149 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4263  flavin reductase domain-containing protein  35.33 
 
 
210 aa  113  2.0000000000000002e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.644656 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0405  hypothetical protein  35.35 
 
 
207 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2444  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  39.89 
 
 
199 aa  110  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0053  hypothetical protein  47.06 
 
 
210 aa  108  7.000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.234931  normal  0.568294 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3293  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  36.21 
 
 
216 aa  107  1e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.902968  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3064  hypothetical protein  31.09 
 
 
209 aa  106  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.883432  normal  0.0355565 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3276  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.97 
 
 
295 aa  105  5e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1359  hypothetical protein  33.51 
 
 
208 aa  104  9e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.262276  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02124  hypothetical protein  34.55 
 
 
169 aa  103  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2065  conserved hypothetical FMN binding protein  34.07 
 
 
201 aa  102  3e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.111591  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0889  hypothetical protein  30.15 
 
 
200 aa  102  4e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.581973  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1150  flavoprotein oxygenase  36.13 
 
 
207 aa  102  5e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.462825 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6295  hypothetical protein  34.16 
 
 
208 aa  101  7e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.19889  normal  0.194247 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4071  hypothetical protein  34.41 
 
 
205 aa  101  8e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.261199  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6314  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  36.15 
 
 
294 aa  100  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1981  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  30.16 
 
 
197 aa  100  1e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.780004  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2217  hypothetical protein  32.64 
 
 
207 aa  100  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0565603 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4219  hypothetical protein  33.87 
 
 
205 aa  99.4  3e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.269485 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1646  hypothetical protein  35.03 
 
 
212 aa  99  4e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0081  hypothetical protein  41.94 
 
 
209 aa  99  4e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1133  hypothetical protein  35.71 
 
 
208 aa  98.6  5e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.311037 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4899  hypothetical protein  33.33 
 
 
205 aa  97.8  8e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07162  conserved hypothetical protein  31.89 
 
 
241 aa  97.8  9e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.574629  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4267  hypothetical protein  37.59 
 
 
221 aa  97.4  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.308533  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1011  hypothetical protein  38.96 
 
 
202 aa  97.4  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000116177  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2319  hypothetical protein  33.52 
 
 
201 aa  97.1  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4414  hypothetical protein  31.38 
 
 
218 aa  97.4  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.629184  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2682  hypothetical protein  39.84 
 
 
205 aa  97.1  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1215  hypothetical protein  35.71 
 
 
208 aa  96.7  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0492  flavoprotein oxygenase  33.97 
 
 
209 aa  96.7  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1122  hypothetical protein  35.71 
 
 
221 aa  97.1  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1242  hypothetical protein  35.71 
 
 
208 aa  96.7  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4215  hypothetical protein  39.57 
 
 
184 aa  95.9  3e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.380151  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7205  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.17 
 
 
209 aa  96.3  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.981743  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2679  hypothetical protein  30.81 
 
 
230 aa  95.5  4e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2736  hypothetical protein  30.81 
 
 
230 aa  95.5  4e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2316  hypothetical protein  32 
 
 
201 aa  94.4  9e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0978794 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2591  flavin reductase domain protein FMN-binding  32 
 
 
201 aa  94.4  9e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.40537 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4462  hypothetical protein  35.62 
 
 
209 aa  94  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.70984  normal  0.854602 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2943  hypothetical protein  32.98 
 
 
216 aa  94  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2435  hypothetical protein  28.57 
 
 
211 aa  93.6  2e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4414  hypothetical protein  32.8 
 
 
201 aa  93.2  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1469  flavoprotein oxygenase  34.19 
 
 
212 aa  93.2  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1593  hypothetical protein  31.36 
 
 
291 aa  93.2  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0502  flavoprotein oxygenase  32.48 
 
 
208 aa  93.6  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3626  flavoprotein oxygenase  32.48 
 
 
209 aa  93.2  2e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2920  hypothetical protein  30 
 
 
202 aa  92.4  3e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0761  hypothetical protein  35.06 
 
 
208 aa  92.8  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3528  flavoprotein oxygenase  32.48 
 
 
208 aa  92.8  3e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1039  hypothetical protein  32.8 
 
 
201 aa  92.8  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.708626  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>