230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3148 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3148  flavin reductase-like, FMN-binding  100 
 
 
219 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5370  flavin reductase domain protein FMN-binding  58.91 
 
 
223 aa  258  5.0000000000000005e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.480853 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7599  hypothetical protein  56.93 
 
 
220 aa  246  2e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5134  hypothetical protein  56.93 
 
 
220 aa  244  6.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2915  flavin reductase domain protein FMN-binding  57.5 
 
 
203 aa  243  9.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2654  flavin reductase domain protein FMN-binding  57 
 
 
203 aa  241  5e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0602  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  53.92 
 
 
217 aa  213  1.9999999999999998e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.413112 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2631  hypothetical protein  47.55 
 
 
221 aa  192  4e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.300035  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5906  hypothetical protein  45.6 
 
 
195 aa  171  6.999999999999999e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4644  hypothetical protein  44.67 
 
 
231 aa  171  7.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0405  hypothetical protein  45.69 
 
 
207 aa  168  7e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5253  flavin reductase domain protein FMN-binding  42.78 
 
 
196 aa  159  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.504075 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1365  hypothetical protein  42.27 
 
 
196 aa  157  8e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.300021  normal  0.0686539 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5247  hypothetical protein  40.5 
 
 
216 aa  152  2.9999999999999998e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.59199 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1083  hypothetical protein  41.4 
 
 
204 aa  152  5e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.2808  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2914  hypothetical protein  39.58 
 
 
203 aa  149  4e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.939622 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3465  hypothetical protein  45.45 
 
 
202 aa  148  8e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1479  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  38.94 
 
 
206 aa  148  8e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3110  hypothetical protein  45.45 
 
 
202 aa  148  8e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0966495  normal  0.11855 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5124  flavin reductase-like, FMN-binding  35.29 
 
 
216 aa  147  1.0000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.178532 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0090  flavin reductase domain-containing protein  40.89 
 
 
210 aa  147  1.0000000000000001e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00316855 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1786  flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family-like protein  39.22 
 
 
228 aa  147  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.60124  normal  0.96149 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0889  hypothetical protein  41.92 
 
 
200 aa  144  1e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.581973  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2070  hypothetical protein  45.45 
 
 
202 aa  142  5e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.224794 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2740  hypothetical protein  38.34 
 
 
203 aa  142  5e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2683  hypothetical protein  38.34 
 
 
203 aa  142  5e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2452  hypothetical protein  39.59 
 
 
201 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.108576  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1051  flavin reductase-like, FMN-binding  39 
 
 
213 aa  140  9.999999999999999e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0886076 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0945  hypothetical protein  39.81 
 
 
210 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3627  hypothetical protein  39.2 
 
 
202 aa  139  3e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.174937  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2366  flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family-like protein  40.1 
 
 
203 aa  137  2e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.460598  normal  0.14144 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43240  hypothetical protein  38.19 
 
 
202 aa  135  5e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.531737 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0364  nitrilotriacetate monooxygenase component B  37.25 
 
 
205 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5786  hypothetical protein  37.63 
 
 
208 aa  134  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.756136  hitchhiker  0.00296108 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3276  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.08 
 
 
295 aa  134  9.999999999999999e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2487  hypothetical protein  38.78 
 
 
203 aa  129  3e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.239635  normal  0.0244852 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1916  hypothetical protein  36.92 
 
 
203 aa  129  4.0000000000000003e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0075  hypothetical protein  34.52 
 
 
196 aa  129  4.0000000000000003e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000447764  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0762  flavin reductase domain protein FMN-binding  37.13 
 
 
203 aa  129  5.0000000000000004e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3843  hypothetical protein  33.66 
 
 
203 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000198663  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5120  putative flavin reductase  32.67 
 
 
203 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0364817  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5507  hypothetical protein  32.67 
 
 
203 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000065263  unclonable  4.40126e-26 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5500  hypothetical protein  32.67 
 
 
203 aa  125  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000371904  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5447  hypothetical protein  32.67 
 
 
203 aa  125  5e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000739812  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5005  flavin reductase  32.18 
 
 
203 aa  124  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000501887  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5021  flavin reductase  32.18 
 
 
203 aa  124  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000378469  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5444  hypothetical protein  32.18 
 
 
203 aa  124  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0011476  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5413  hypothetical protein  31.68 
 
 
203 aa  121  8e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.81917e-62 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5171  hypothetical protein  31.68 
 
 
203 aa  121  8e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000552892  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5565  hypothetical protein  31.68 
 
 
203 aa  121  8e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000029994  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2435  hypothetical protein  34.5 
 
 
211 aa  121  9.999999999999999e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2815  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  39.06 
 
 
219 aa  120  9.999999999999999e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.112665  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01680  hypothetical protein  36.16 
 
 
292 aa  119  3.9999999999999996e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0053  hypothetical protein  36.71 
 
 
210 aa  117  9.999999999999999e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.234931  normal  0.568294 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4263  flavin reductase domain-containing protein  37.77 
 
 
210 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.644656 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_78913  flavoprotein oxygenase  34.04 
 
 
287 aa  117  9.999999999999999e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5933  hypothetical protein  35.75 
 
 
209 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6314  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  32.98 
 
 
294 aa  116  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2164  hypothetical protein  33.84 
 
 
200 aa  114  1.0000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.341865  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4325  hypothetical protein  35.75 
 
 
201 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.590963 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1593  hypothetical protein  35.2 
 
 
291 aa  114  1.0000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1398  hypothetical protein  34.72 
 
 
201 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.709674  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4414  hypothetical protein  34.2 
 
 
201 aa  112  6e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0412  hypothetical protein  33.01 
 
 
206 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.567346  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6051  hypothetical protein  36.21 
 
 
218 aa  109  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.52164  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1039  hypothetical protein  34.2 
 
 
201 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.708626  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2319  hypothetical protein  35.56 
 
 
201 aa  108  5e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1899  hypothetical protein  38.92 
 
 
202 aa  108  6e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.843142  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3064  hypothetical protein  31.96 
 
 
209 aa  108  6e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.883432  normal  0.0355565 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2631  hypothetical protein  36.09 
 
 
202 aa  108  9.000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4410  hypothetical protein  31.12 
 
 
209 aa  107  1e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0500  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.9 
 
 
294 aa  107  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2920  hypothetical protein  33.33 
 
 
202 aa  107  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1359  hypothetical protein  34.78 
 
 
208 aa  106  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.262276  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3293  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  30.66 
 
 
216 aa  105  4e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.902968  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1981  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  31.38 
 
 
197 aa  105  5e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.780004  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2217  hypothetical protein  35.33 
 
 
207 aa  104  9e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0565603 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4298  hypothetical protein  31.43 
 
 
207 aa  104  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4002  hypothetical protein  31.9 
 
 
207 aa  104  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.548606  normal  0.130195 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4219  hypothetical protein  34.05 
 
 
205 aa  104  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.269485 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2065  conserved hypothetical FMN binding protein  36.26 
 
 
201 aa  103  1e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.111591  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2857  hypothetical protein  33.5 
 
 
200 aa  103  1e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4899  hypothetical protein  37.09 
 
 
205 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1057  hypothetical protein  34.2 
 
 
200 aa  102  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.535631 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4462  hypothetical protein  32.18 
 
 
209 aa  102  4e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.70984  normal  0.854602 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0832  hypothetical protein  35.4 
 
 
206 aa  102  5e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.158602  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1133  hypothetical protein  32.32 
 
 
208 aa  102  6e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.311037 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4071  hypothetical protein  34.59 
 
 
205 aa  101  7e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.261199  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2682  hypothetical protein  32.02 
 
 
205 aa  101  8e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1820  hypothetical protein  33.33 
 
 
207 aa  101  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3209  flavin reductase-like, FMN-binding  36.26 
 
 
201 aa  100  1e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00876  conserved hypothetical protein  33.85 
 
 
313 aa  100  2e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.799702  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02220  hypothetical protein  32.62 
 
 
208 aa  100  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.686893  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1011  hypothetical protein  32.66 
 
 
202 aa  100  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000116177  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1150  flavoprotein oxygenase  33.33 
 
 
207 aa  100  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.462825 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1122  hypothetical protein  33.33 
 
 
221 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0081  hypothetical protein  32.68 
 
 
209 aa  100  2e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0627  flavin reductase domain-containing protein  33.33 
 
 
194 aa  99.4  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4215  hypothetical protein  39.72 
 
 
184 aa  98.6  6e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.380151  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4312  hypothetical protein  31.44 
 
 
205 aa  98.6  7e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>