214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6898 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6898  hypothetical protein  100 
 
 
203 aa  421  1e-117  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.800563  normal  0.546229 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2943  hypothetical protein  95.07 
 
 
216 aa  402  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4312  hypothetical protein  80 
 
 
205 aa  347  6e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4325  hypothetical protein  63 
 
 
201 aa  260  8e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.590963 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1398  hypothetical protein  63 
 
 
201 aa  260  8.999999999999999e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.709674  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4462  hypothetical protein  62.38 
 
 
209 aa  259  2e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.70984  normal  0.854602 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1039  hypothetical protein  62.5 
 
 
201 aa  259  2e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.708626  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0863  flavin reductase domain protein FMN-binding  63 
 
 
209 aa  258  3e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4414  hypothetical protein  63 
 
 
201 aa  258  6e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2682  hypothetical protein  62.81 
 
 
205 aa  252  2.0000000000000002e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2703  hypothetical protein  63.68 
 
 
206 aa  251  6e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.113365  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4298  hypothetical protein  60.5 
 
 
207 aa  250  8.000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4002  hypothetical protein  60.5 
 
 
207 aa  250  8.000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.548606  normal  0.130195 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2217  hypothetical protein  58 
 
 
207 aa  239  2e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0565603 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1011  hypothetical protein  60.5 
 
 
202 aa  239  2e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000116177  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0081  hypothetical protein  58.59 
 
 
209 aa  237  8e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4219  hypothetical protein  58.08 
 
 
205 aa  233  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.269485 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1899  hypothetical protein  62.11 
 
 
202 aa  233  1.0000000000000001e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.843142  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1820  hypothetical protein  57.5 
 
 
207 aa  233  2.0000000000000002e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0832  hypothetical protein  60.1 
 
 
206 aa  230  1e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.158602  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1359  hypothetical protein  56 
 
 
208 aa  229  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.262276  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1150  flavoprotein oxygenase  55.94 
 
 
207 aa  229  3e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.462825 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04002  nitrilotriacetate monooxygenase component B  56.93 
 
 
209 aa  228  4e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4899  hypothetical protein  56.57 
 
 
205 aa  226  2e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2631  hypothetical protein  56.06 
 
 
202 aa  224  7e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4071  hypothetical protein  55.56 
 
 
205 aa  223  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.261199  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1051  hypothetical protein  53.5 
 
 
230 aa  221  4e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.106662  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1215  hypothetical protein  55.39 
 
 
208 aa  221  4e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1242  hypothetical protein  54.9 
 
 
208 aa  220  9e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3626  flavoprotein oxygenase  53.43 
 
 
209 aa  218  3e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1469  flavoprotein oxygenase  55.61 
 
 
212 aa  216  1e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0761  hypothetical protein  54.41 
 
 
208 aa  217  1e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0498  flavoprotein oxygenase  53.69 
 
 
209 aa  215  2.9999999999999998e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0053  hypothetical protein  57 
 
 
210 aa  215  4e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.234931  normal  0.568294 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2049  hypothetical protein  51 
 
 
205 aa  214  8e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1133  hypothetical protein  53.92 
 
 
208 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.311037 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3466  hypothetical protein  54.95 
 
 
209 aa  213  1.9999999999999998e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.421094 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3355  flavoprotein oxygenase  54.95 
 
 
210 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.522125  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6051  hypothetical protein  51.76 
 
 
218 aa  212  2.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.52164  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1122  hypothetical protein  53.92 
 
 
221 aa  212  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0492  flavoprotein oxygenase  54.19 
 
 
209 aa  211  5.999999999999999e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0502  flavoprotein oxygenase  54.46 
 
 
208 aa  210  1e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6039  hypothetical protein  53 
 
 
206 aa  209  2e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.8711  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1057  hypothetical protein  52.26 
 
 
200 aa  209  2e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.535631 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0452  flavoprotein oxygenase  53.69 
 
 
209 aa  209  2e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3807  flavin reductase domain protein FMN-binding  53.69 
 
 
209 aa  208  4e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3528  flavoprotein oxygenase  53.96 
 
 
208 aa  208  4e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0503  flavoprotein oxygenase  53.96 
 
 
208 aa  207  6e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3864  flavoprotein oxygenase  53.2 
 
 
209 aa  207  7e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0458  flavoprotein oxygenase  53.2 
 
 
209 aa  207  8e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3989  flavoprotein oxygenase  53.2 
 
 
209 aa  207  8e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2151  hypothetical protein  51.78 
 
 
203 aa  206  2e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1032  hypothetical protein  51.78 
 
 
203 aa  204  9e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.863891  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1068  hypothetical protein  51.27 
 
 
203 aa  201  6e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0726405  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2221  hypothetical protein  48.74 
 
 
201 aa  201  6e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.378667  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4267  hypothetical protein  53 
 
 
221 aa  201  6e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.308533  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02220  hypothetical protein  45.85 
 
 
208 aa  196  2.0000000000000003e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.686893  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4215  hypothetical protein  51.78 
 
 
184 aa  187  7e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.380151  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2041  flavin reductase domain protein FMN-binding  46.46 
 
 
203 aa  187  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0801878  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1646  hypothetical protein  50 
 
 
212 aa  186  2e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1842  hypothetical protein  47.37 
 
 
203 aa  185  4e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0994516  normal  0.0170416 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2316  hypothetical protein  50.5 
 
 
201 aa  184  7e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0978794 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2591  flavin reductase domain protein FMN-binding  50.5 
 
 
201 aa  184  7e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.40537 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6309  hypothetical protein  47 
 
 
207 aa  182  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2270  hypothetical protein  51.05 
 
 
201 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7205  flavin reductase domain protein FMN-binding  48.48 
 
 
209 aa  180  1e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.981743  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0267  hypothetical protein  49.75 
 
 
209 aa  178  4.999999999999999e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6295  hypothetical protein  48.99 
 
 
208 aa  178  5.999999999999999e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.19889  normal  0.194247 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2065  conserved hypothetical FMN binding protein  48.04 
 
 
201 aa  177  1e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.111591  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2319  hypothetical protein  46.57 
 
 
201 aa  176  3e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3787  hypothetical protein  64.62 
 
 
140 aa  174  8e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0487  flavin reductase domain-containing protein  46.7 
 
 
194 aa  171  7.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.660755  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1838  hypothetical protein  46.7 
 
 
194 aa  170  1e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0627  flavin reductase domain-containing protein  46.7 
 
 
194 aa  170  1e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3209  flavin reductase-like, FMN-binding  46.08 
 
 
201 aa  167  1e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07162  conserved hypothetical protein  46.86 
 
 
241 aa  160  1e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.574629  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3621  hypothetical protein  44.61 
 
 
220 aa  154  7e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3064  hypothetical protein  42.16 
 
 
209 aa  149  2e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.883432  normal  0.0355565 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2679  hypothetical protein  40.48 
 
 
230 aa  143  2e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2736  hypothetical protein  40.48 
 
 
230 aa  143  2e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2269  hypothetical protein  40 
 
 
229 aa  140  9.999999999999999e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2444  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  40.11 
 
 
199 aa  129  3e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2435  hypothetical protein  34.83 
 
 
211 aa  122  4e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4414  hypothetical protein  38.05 
 
 
218 aa  121  6e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.629184  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1786  flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family-like protein  36.41 
 
 
228 aa  119  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.60124  normal  0.96149 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1479  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  38.12 
 
 
206 aa  118  7e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5792  hypothetical protein  36.59 
 
 
218 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.926616 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3293  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  34 
 
 
216 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.902968  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0405  hypothetical protein  37.56 
 
 
207 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5247  hypothetical protein  38.86 
 
 
216 aa  111  7.000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.59199 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4263  flavin reductase domain-containing protein  37.5 
 
 
210 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.644656 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0602  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  36.18 
 
 
217 aa  108  4.0000000000000004e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.413112 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5933  hypothetical protein  32.61 
 
 
209 aa  105  4e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2366  flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family-like protein  36.41 
 
 
203 aa  105  4e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.460598  normal  0.14144 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0762  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.33 
 
 
203 aa  105  6e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2815  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  42.31 
 
 
219 aa  104  9e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.112665  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3843  hypothetical protein  33.7 
 
 
203 aa  103  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000198663  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4644  hypothetical protein  34.92 
 
 
231 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0945  hypothetical protein  34.33 
 
 
210 aa  103  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5507  hypothetical protein  32.97 
 
 
203 aa  103  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000065263  unclonable  4.40126e-26 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>