221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_7599 on replicon NC_011981
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011981  Avi_7599  hypothetical protein  100 
 
 		 220 aa  455  1e-127  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5370  flavin reductase domain protein FMN-binding  91.87 
 
 		 223 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.480853 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5134  hypothetical protein  86.36 
 
 		 220 aa  401  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3148  flavin reductase-like, FMN-binding  56.93 
 
 		 219 aa  246  2e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2915  flavin reductase domain protein FMN-binding  55 
 
 		 203 aa  226  3e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2654  flavin reductase domain protein FMN-binding  54 
 
 		 203 aa  221  6e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0602  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  46.92 
 
 		 217 aa  193  2e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.413112 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2631  hypothetical protein  46.08 
 
 		 221 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.300035  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4644  hypothetical protein  43.94 
 
 		 231 aa  167  9e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0090  flavin reductase domain-containing protein  43.52 
 
 		 210 aa  163  2.0000000000000002e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00316855 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1365  hypothetical protein  43.52 
 
 		 196 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.300021  normal  0.0686539 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1051  flavin reductase-like, FMN-binding  40.2 
 
 		 213 aa  161  6e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0886076 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5253  flavin reductase domain protein FMN-binding  43.01 
 
 		 196 aa  161  7e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.504075 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5906  hypothetical protein  40.93 
 
 		 195 aa  159  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5786  hypothetical protein  40.31 
 
 		 208 aa  150  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.756136  hitchhiker  0.00296108 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2914  hypothetical protein  40.74 
 
 		 203 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.939622 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2070  hypothetical protein  46.52 
 
 		 202 aa  146  3e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.224794 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3465  hypothetical protein  45.45 
 
 		 202 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3110  hypothetical protein  45.45 
 
 		 202 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0966495  normal  0.11855 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1786  flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family-like protein  36.41 
 
 		 228 aa  142  3e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.60124  normal  0.96149 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5124  flavin reductase-like, FMN-binding  34.27 
 
 		 216 aa  142  3e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.178532 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1479  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  37.07 
 
 		 206 aa  141  6e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1083  hypothetical protein  38.5 
 
 		 204 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.2808  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5247  hypothetical protein  38.07 
 
 		 216 aa  137  1e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.59199 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0405  hypothetical protein  38.14 
 
 		 207 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2740  hypothetical protein  36.87 
 
 		 203 aa  131  6.999999999999999e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2683  hypothetical protein  36.87 
 
 		 203 aa  131  6.999999999999999e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0889  hypothetical protein  36.36 
 
 		 200 aa  130  1.0000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.581973  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1916  hypothetical protein  35.94 
 
 		 203 aa  127  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0945  hypothetical protein  35.29 
 
 		 210 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3627  hypothetical protein  36.68 
 
 		 202 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.174937  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0364  nitrilotriacetate monooxygenase component B  34.34 
 
 		 205 aa  124  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43240  hypothetical protein  36.18 
 
 		 202 aa  124  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.531737 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5447  hypothetical protein  33.68 
 
 		 203 aa  123  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000739812  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3843  hypothetical protein  33.33 
 
 		 203 aa  123  2e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000198663  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5500  hypothetical protein  33.68 
 
 		 203 aa  123  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000371904  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5507  hypothetical protein  32.81 
 
 		 203 aa  123  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000065263  unclonable  4.40126e-26 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5005  flavin reductase  33.85 
 
 		 203 aa  122  3e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000501887  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5021  flavin reductase  33.85 
 
 		 203 aa  123  3e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000378469  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5120  putative flavin reductase  32.29 
 
 		 203 aa  122  5e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0364817  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5933  hypothetical protein  32.84 
 
 		 209 aa  121  8e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5444  hypothetical protein  32.29 
 
 		 203 aa  121  9e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0011476  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5413  hypothetical protein  33.33 
 
 		 203 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.81917e-62 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5171  hypothetical protein  33.33 
 
 		 203 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000552892  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2815  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  35.44 
 
 		 219 aa  119  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.112665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5565  hypothetical protein  33.33 
 
 		 203 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000029994  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2452  hypothetical protein  34 
 
 		 201 aa  119  3e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.108576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4410  hypothetical protein  33.33 
 
 		 209 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0762  flavin reductase domain protein FMN-binding  37.43 
 
 		 203 aa  116  1.9999999999999998e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2366  flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family-like protein  34.67 
 
 		 203 aa  115  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.460598  normal  0.14144 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2487  hypothetical protein  35 
 
 		 203 aa  115  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.239635  normal  0.0244852 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6314  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  32.34 
 
 		 294 aa  112  4.0000000000000004e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0075  hypothetical protein  31.05 
 
 		 196 aa  111  1.0000000000000001e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000447764  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1899  hypothetical protein  41.22 
 
 		 202 aa  109  4.0000000000000004e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.843142  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2444  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  31.77 
 
 		 199 aa  107  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01680  hypothetical protein  32.77 
 
 		 292 aa  107  1e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4263  flavin reductase domain-containing protein  34.78 
 
 		 210 aa  106  3e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.644656 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2435  hypothetical protein  25.63 
 
 		 211 aa  105  4e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2164  hypothetical protein  33.85 
 
 		 200 aa  105  5e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.341865  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3293  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  31.92 
 
 		 216 aa  105  5e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.902968  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2857  hypothetical protein  32.32 
 
 		 200 aa  105  7e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_78913  flavoprotein oxygenase  32.26 
 
 		 287 aa  105  7e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2065  conserved hypothetical FMN binding protein  34.64 
 
 		 201 aa  104  1e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.111591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3064  hypothetical protein  30.1 
 
 		 209 aa  104  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.883432  normal  0.0355565 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3276  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.35 
 
 		 295 aa  103  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1646  hypothetical protein  31.77 
 
 		 212 aa  100  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00876  conserved hypothetical protein  32.98 
 
 		 313 aa  100  2e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.799702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1593  hypothetical protein  31.84 
 
 		 291 aa  100  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2703  hypothetical protein  32.8 
 
 		 206 aa  100  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.113365  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2319  hypothetical protein  33.89 
 
 		 201 aa  100  2e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02220  hypothetical protein  32.61 
 
 		 208 aa  100  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.686893  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0053  hypothetical protein  37.58 
 
 		 210 aa  99.4  4e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.234931  normal  0.568294 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04002  nitrilotriacetate monooxygenase component B  33.53 
 
 		 209 aa  99  5e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1133  hypothetical protein  32.27 
 
 		 208 aa  97.4  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.311037 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3209  flavin reductase-like, FMN-binding  33.33 
 
 		 201 aa  96.3  3e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2217  hypothetical protein  29.91 
 
 		 207 aa  95.9  4e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0565603 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6039  hypothetical protein  33.33 
 
 		 206 aa  95.5  6e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.8711  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02124  hypothetical protein  32.12 
 
 		 169 aa  95.5  6e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0412  hypothetical protein  28.79 
 
 		 206 aa  95.5  6e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.567346  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0500  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.51 
 
 		 294 aa  95.5  6e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1981  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  32.07 
 
 		 197 aa  95.5  6e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.780004  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1122  hypothetical protein  34.83 
 
 		 221 aa  95.1  8e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07162  conserved hypothetical protein  32.07 
 
 		 241 aa  94.4  1e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.574629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1011  hypothetical protein  35.17 
 
 		 202 aa  94.4  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000116177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2631  hypothetical protein  35.17 
 
 		 202 aa  93.6  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4219  hypothetical protein  31.48 
 
 		 205 aa  92.8  3e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.269485 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2682  hypothetical protein  32.95 
 
 		 205 aa  92.4  5e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1068  hypothetical protein  34.57 
 
 		 203 aa  92.4  5e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0726405  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1051  hypothetical protein  30.98 
 
 		 230 aa  92.4  5e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.106662  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2049  hypothetical protein  28.4 
 
 		 205 aa  92.4  5e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3626  flavoprotein oxygenase  30.36 
 
 		 209 aa  92  6e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1469  flavoprotein oxygenase  31.76 
 
 		 212 aa  90.9  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1398  hypothetical protein  29.73 
 
 		 201 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.709674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4462  hypothetical protein  30.18 
 
 		 209 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.70984  normal  0.854602 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4215  hypothetical protein  37.9 
 
 		 184 aa  90.9  1e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.380151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4325  hypothetical protein  29.73 
 
 		 201 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.590963 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1215  hypothetical protein  33.14 
 
 		 208 aa  90.9  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4414  hypothetical protein  29.73 
 
 		 201 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1032  hypothetical protein  35.68 
 
 		 203 aa  90.1  2e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.863891  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1242  hypothetical protein  33.14 
 
 		 208 aa  90.9  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>