213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_01680 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_01680  hypothetical protein  100 
 
 
292 aa  601  1.0000000000000001e-171  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1593  hypothetical protein  62.07 
 
 
291 aa  386  1e-106  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0500  flavin reductase domain protein FMN-binding  57.39 
 
 
294 aa  338  8e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3276  flavin reductase domain protein FMN-binding  55.89 
 
 
295 aa  324  9e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6314  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  49.66 
 
 
294 aa  281  1e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2487  hypothetical protein  40.98 
 
 
203 aa  155  1e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.239635  normal  0.0244852 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2366  flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family-like protein  40.72 
 
 
203 aa  149  5e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.460598  normal  0.14144 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0889  hypothetical protein  40.57 
 
 
200 aa  135  6.0000000000000005e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.581973  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1083  hypothetical protein  37.7 
 
 
204 aa  135  9.999999999999999e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.2808  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2631  hypothetical protein  38.55 
 
 
221 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.300035  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4899  hypothetical protein  36.87 
 
 
205 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4219  hypothetical protein  35.85 
 
 
205 aa  126  5e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.269485 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2435  hypothetical protein  33.16 
 
 
211 aa  125  6e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1916  hypothetical protein  37 
 
 
203 aa  125  8.000000000000001e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1359  hypothetical protein  38.19 
 
 
208 aa  125  9e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.262276  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4071  hypothetical protein  36.32 
 
 
205 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.261199  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2164  hypothetical protein  36.05 
 
 
200 aa  123  3e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.341865  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2452  hypothetical protein  36.36 
 
 
201 aa  124  3e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.108576  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4462  hypothetical protein  37.31 
 
 
209 aa  122  5e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.70984  normal  0.854602 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1820  hypothetical protein  35.86 
 
 
207 aa  122  8e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6039  hypothetical protein  36.92 
 
 
206 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.8711  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1398  hypothetical protein  37.88 
 
 
201 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.709674  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0412  hypothetical protein  30.77 
 
 
206 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.567346  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3064  hypothetical protein  36.68 
 
 
209 aa  119  3.9999999999999996e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.883432  normal  0.0355565 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3148  flavin reductase-like, FMN-binding  36.16 
 
 
219 aa  119  6e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4325  hypothetical protein  37.37 
 
 
201 aa  119  6e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.590963 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0053  hypothetical protein  35.92 
 
 
210 aa  118  9.999999999999999e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.234931  normal  0.568294 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3626  flavoprotein oxygenase  33.84 
 
 
209 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1469  flavoprotein oxygenase  35 
 
 
212 aa  118  9.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4414  hypothetical protein  37.37 
 
 
201 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2857  hypothetical protein  33.15 
 
 
200 aa  117  1.9999999999999998e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1150  flavoprotein oxygenase  35.86 
 
 
207 aa  117  1.9999999999999998e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.462825 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0492  flavoprotein oxygenase  34.34 
 
 
209 aa  115  6e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4298  hypothetical protein  35.86 
 
 
207 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4002  hypothetical protein  35.86 
 
 
207 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.548606  normal  0.130195 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43240  hypothetical protein  35.43 
 
 
202 aa  115  8.999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.531737 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6051  hypothetical protein  38.25 
 
 
218 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.52164  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2217  hypothetical protein  35.12 
 
 
207 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0565603 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0832  hypothetical protein  38.42 
 
 
206 aa  114  2.0000000000000002e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.158602  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2740  hypothetical protein  29.41 
 
 
203 aa  114  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2683  hypothetical protein  29.41 
 
 
203 aa  114  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1039  hypothetical protein  36.36 
 
 
201 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.708626  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4267  hypothetical protein  34.85 
 
 
221 aa  113  5e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.308533  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5370  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.33 
 
 
223 aa  112  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.480853 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3627  hypothetical protein  33.71 
 
 
202 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.174937  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1899  hypothetical protein  36.31 
 
 
202 aa  112  8.000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.843142  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2591  flavin reductase domain protein FMN-binding  34 
 
 
201 aa  112  9e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.40537 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2682  hypothetical protein  34.43 
 
 
205 aa  112  9e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2316  hypothetical protein  34 
 
 
201 aa  112  9e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0978794 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3807  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.84 
 
 
209 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1051  hypothetical protein  35.32 
 
 
230 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.106662  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5134  hypothetical protein  33.9 
 
 
220 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0762  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.47 
 
 
203 aa  112  1.0000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2815  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  35.61 
 
 
219 aa  111  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.112665  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0452  flavoprotein oxygenase  33.84 
 
 
209 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5247  hypothetical protein  34.74 
 
 
216 aa  110  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.59199 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2679  hypothetical protein  33.67 
 
 
230 aa  111  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2736  hypothetical protein  33.67 
 
 
230 aa  111  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3355  flavoprotein oxygenase  34.34 
 
 
210 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.522125  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2270  hypothetical protein  33.51 
 
 
201 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0458  flavoprotein oxygenase  33.33 
 
 
209 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3989  flavoprotein oxygenase  33.33 
 
 
209 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1215  hypothetical protein  36.11 
 
 
208 aa  109  6e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1242  hypothetical protein  36.11 
 
 
208 aa  109  6e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1133  hypothetical protein  35.56 
 
 
208 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.311037 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4644  hypothetical protein  33.33 
 
 
231 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0863  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.35 
 
 
209 aa  108  8.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1122  hypothetical protein  35.56 
 
 
221 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0081  hypothetical protein  35.71 
 
 
209 aa  108  8.000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3466  hypothetical protein  35.15 
 
 
209 aa  108  8.000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.421094 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1842  hypothetical protein  35.2 
 
 
203 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0994516  normal  0.0170416 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3864  flavoprotein oxygenase  33.33 
 
 
209 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7599  hypothetical protein  32.77 
 
 
220 aa  107  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2269  hypothetical protein  33.67 
 
 
229 aa  107  2e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1646  hypothetical protein  32.02 
 
 
212 aa  107  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0502  flavoprotein oxygenase  32.83 
 
 
208 aa  108  2e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2041  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.69 
 
 
203 aa  107  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0801878  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0405  hypothetical protein  35.6 
 
 
207 aa  107  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02220  hypothetical protein  35.29 
 
 
208 aa  107  3e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.686893  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4215  hypothetical protein  36.16 
 
 
184 aa  107  3e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.380151  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_78913  flavoprotein oxygenase  34.29 
 
 
287 aa  107  3e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0498  flavoprotein oxygenase  32 
 
 
209 aa  107  3e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3528  flavoprotein oxygenase  32.83 
 
 
208 aa  106  4e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1011  hypothetical protein  33.33 
 
 
202 aa  106  5e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000116177  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2915  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.53 
 
 
203 aa  105  7e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2654  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.95 
 
 
203 aa  105  8e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7205  flavin reductase domain protein FMN-binding  34 
 
 
209 aa  105  9e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.981743  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3209  flavin reductase-like, FMN-binding  35.52 
 
 
201 aa  104  1e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0761  hypothetical protein  35.56 
 
 
208 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0503  flavoprotein oxygenase  32.18 
 
 
208 aa  104  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2065  conserved hypothetical FMN binding protein  32.32 
 
 
201 aa  104  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.111591  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04002  nitrilotriacetate monooxygenase component B  32.32 
 
 
209 aa  103  3e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6295  hypothetical protein  32.5 
 
 
208 aa  103  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.19889  normal  0.194247 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1981  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  33.53 
 
 
197 aa  103  4e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.780004  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2444  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  36.81 
 
 
199 aa  103  5e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0364  nitrilotriacetate monooxygenase component B  31.71 
 
 
205 aa  103  5e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2631  hypothetical protein  34.64 
 
 
202 aa  102  6e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2943  hypothetical protein  35 
 
 
216 aa  102  6e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4414  hypothetical protein  31.71 
 
 
218 aa  102  8e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.629184  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1786  flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family-like protein  31.05 
 
 
228 aa  102  9e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.60124  normal  0.96149 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>