206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1051 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_1051  hypothetical protein  100 
 
 		 230 aa  477  1e-134  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.106662  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0081  hypothetical protein  78 
 
 		 209 aa  334  5.999999999999999e-91  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4462  hypothetical protein  69.42 
 
 		 209 aa  315  4e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.70984  normal  0.854602 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4002  hypothetical protein  68.97 
 
 		 207 aa  312  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.548606  normal  0.130195 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4298  hypothetical protein  67.65 
 
 		 207 aa  309  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1011  hypothetical protein  71.14 
 
 		 202 aa  302  4.0000000000000003e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000116177  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0863  flavin reductase domain protein FMN-binding  68.97 
 
 		 209 aa  301  6.000000000000001e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2703  hypothetical protein  67 
 
 		 206 aa  293  2e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.113365  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1039  hypothetical protein  65 
 
 		 201 aa  286  2e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.708626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0832  hypothetical protein  65.53 
 
 		 206 aa  285  2.9999999999999996e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.158602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2682  hypothetical protein  66.34 
 
 		 205 aa  284  7e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04002  nitrilotriacetate monooxygenase component B  63.55 
 
 		 209 aa  281  6.000000000000001e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1359  hypothetical protein  63.68 
 
 		 208 aa  281  6.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.262276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2049  hypothetical protein  64 
 
 		 205 aa  276  2e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4414  hypothetical protein  63 
 
 		 201 aa  273  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1398  hypothetical protein  62 
 
 		 201 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.709674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4325  hypothetical protein  62 
 
 		 201 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.590963 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0498  flavoprotein oxygenase  63.86 
 
 		 209 aa  271  8.000000000000001e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1242  hypothetical protein  62 
 
 		 208 aa  270  1e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4071  hypothetical protein  61.69 
 
 		 205 aa  270  2e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.261199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1215  hypothetical protein  62 
 
 		 208 aa  270  2e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2217  hypothetical protein  61 
 
 		 207 aa  269  2e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0565603 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4219  hypothetical protein  61.69 
 
 		 205 aa  269  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.269485 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1150  flavoprotein oxygenase  61 
 
 		 207 aa  267  1e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.462825 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0761  hypothetical protein  61.5 
 
 		 208 aa  266  2e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1122  hypothetical protein  61 
 
 		 221 aa  264  1e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02220  hypothetical protein  56.93 
 
 		 208 aa  263  2e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.686893  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4899  hypothetical protein  59.7 
 
 		 205 aa  262  3e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3626  flavoprotein oxygenase  59.31 
 
 		 209 aa  262  4e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1469  flavoprotein oxygenase  62.25 
 
 		 212 aa  261  6e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1133  hypothetical protein  60.5 
 
 		 208 aa  260  1e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.311037 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3864  flavoprotein oxygenase  60.29 
 
 		 209 aa  256  2e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3989  flavoprotein oxygenase  60.29 
 
 		 209 aa  256  2e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0503  flavoprotein oxygenase  61.19 
 
 		 208 aa  256  2e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0458  flavoprotein oxygenase  60.29 
 
 		 209 aa  256  2e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6039  hypothetical protein  61 
 
 		 206 aa  256  3e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.8711  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0452  flavoprotein oxygenase  60.29 
 
 		 209 aa  256  3e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0492  flavoprotein oxygenase  60.7 
 
 		 209 aa  255  4e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0502  flavoprotein oxygenase  60.7 
 
 		 208 aa  255  4e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3355  flavoprotein oxygenase  59.8 
 
 		 210 aa  255  4e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.522125  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6051  hypothetical protein  58.21 
 
 		 218 aa  255  5e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.52164  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0053  hypothetical protein  59 
 
 		 210 aa  255  5e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.234931  normal  0.568294 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3807  flavin reductase domain protein FMN-binding  60.29 
 
 		 209 aa  254  6e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3528  flavoprotein oxygenase  59.7 
 
 		 208 aa  252  3e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1820  hypothetical protein  57.64 
 
 		 207 aa  248  5e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3466  hypothetical protein  58.5 
 
 		 209 aa  241  9e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.421094 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4267  hypothetical protein  55.5 
 
 		 221 aa  232  3e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.308533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4312  hypothetical protein  55.39 
 
 		 205 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4215  hypothetical protein  54.95 
 
 		 184 aa  226  3e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.380151  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2943  hypothetical protein  53.5 
 
 		 216 aa  224  1e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6309  hypothetical protein  55.72 
 
 		 207 aa  222  3e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6898  hypothetical protein  53.5 
 
 		 203 aa  221  6e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.800563  normal  0.546229 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3787  hypothetical protein  78.63 
 
 		 140 aa  220  9.999999999999999e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2631  hypothetical protein  53.5 
 
 		 202 aa  211  7.999999999999999e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1899  hypothetical protein  53.23 
 
 		 202 aa  198  6e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.843142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2151  hypothetical protein  49.75 
 
 		 203 aa  194  1e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1057  hypothetical protein  47.5 
 
 		 200 aa  181  9.000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.535631 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1032  hypothetical protein  46.23 
 
 		 203 aa  179  2.9999999999999997e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.863891  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1068  hypothetical protein  45.73 
 
 		 203 aa  176  2e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0726405  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2221  hypothetical protein  42.29 
 
 		 201 aa  176  2e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.378667  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2041  flavin reductase domain protein FMN-binding  45.31 
 
 		 203 aa  169  5e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0801878  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1842  hypothetical protein  46.88 
 
 		 203 aa  166  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0994516  normal  0.0170416 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0627  flavin reductase domain-containing protein  46.73 
 
 		 194 aa  166  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2270  hypothetical protein  45.26 
 
 		 201 aa  165  4e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2319  hypothetical protein  46.6 
 
 		 201 aa  164  8e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2316  hypothetical protein  45.79 
 
 		 201 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0978794 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2591  flavin reductase domain protein FMN-binding  45.79 
 
 		 201 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.40537 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2065  conserved hypothetical FMN binding protein  43.69 
 
 		 201 aa  162  3e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.111591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0487  flavin reductase domain-containing protein  44.72 
 
 		 194 aa  160  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.660755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1838  hypothetical protein  44.72 
 
 		 194 aa  159  3e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3209  flavin reductase-like, FMN-binding  43.96 
 
 		 201 aa  158  6e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1646  hypothetical protein  41.79 
 
 		 212 aa  157  1e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0267  hypothetical protein  43.37 
 
 		 209 aa  157  1e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6295  hypothetical protein  42.41 
 
 		 208 aa  157  1e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.19889  normal  0.194247 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7205  flavin reductase domain protein FMN-binding  41.67 
 
 		 209 aa  157  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.981743  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2736  hypothetical protein  43.66 
 
 		 230 aa  144  8.000000000000001e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2679  hypothetical protein  43.66 
 
 		 230 aa  144  8.000000000000001e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2269  hypothetical protein  43.19 
 
 		 229 aa  143  2e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3621  hypothetical protein  42.23 
 
 		 220 aa  143  2e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07162  conserved hypothetical protein  44.44 
 
 		 241 aa  141  7e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.574629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3064  hypothetical protein  39.81 
 
 		 209 aa  140  9.999999999999999e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.883432  normal  0.0355565 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0889  hypothetical protein  42.69 
 
 		 200 aa  134  1.9999999999999998e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.581973  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2435  hypothetical protein  38.34 
 
 		 211 aa  124  1e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1083  hypothetical protein  36.17 
 
 		 204 aa  122  6e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.2808  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4644  hypothetical protein  39.79 
 
 		 231 aa  119  3e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5247  hypothetical protein  39.38 
 
 		 216 aa  118  6e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.59199 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2452  hypothetical protein  39.68 
 
 		 201 aa  118  9e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.108576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1479  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  38.51 
 
 		 206 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2444  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  41.45 
 
 		 199 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4414  hypothetical protein  36.1 
 
 		 218 aa  116  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.629184  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1916  hypothetical protein  35.48 
 
 		 203 aa  115  3.9999999999999997e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1981  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  37.79 
 
 		 197 aa  115  5e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.780004  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0762  flavin reductase domain protein FMN-binding  37.84 
 
 		 203 aa  115  5e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0412  hypothetical protein  34.24 
 
 		 206 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.567346  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2857  hypothetical protein  34.9 
 
 		 200 aa  113  3e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01680  hypothetical protein  35.32 
 
 		 292 aa  112  7.000000000000001e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5933  hypothetical protein  35.56 
 
 		 209 aa  109  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5792  hypothetical protein  34.63 
 
 		 218 aa  109  3e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.926616 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1593  hypothetical protein  36.17 
 
 		 291 aa  109  3e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3293  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  37.72 
 
 		 216 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.902968  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>