213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_2270 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_2270  hypothetical protein  100 
 
 
201 aa  408  1e-113  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2316  hypothetical protein  97.01 
 
 
201 aa  398  9.999999999999999e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0978794 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2591  flavin reductase domain protein FMN-binding  97.01 
 
 
201 aa  398  9.999999999999999e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.40537 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7205  flavin reductase domain protein FMN-binding  75.25 
 
 
209 aa  322  2e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.981743  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6295  hypothetical protein  76.24 
 
 
208 aa  322  2e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.19889  normal  0.194247 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0267  hypothetical protein  73.66 
 
 
209 aa  308  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1646  hypothetical protein  52.6 
 
 
212 aa  198  5e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2631  hypothetical protein  50.75 
 
 
202 aa  190  1e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1032  hypothetical protein  50 
 
 
203 aa  190  1e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.863891  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2151  hypothetical protein  49.5 
 
 
203 aa  189  4e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1068  hypothetical protein  49.5 
 
 
203 aa  187  1e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0726405  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0832  hypothetical protein  48.72 
 
 
206 aa  186  2e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.158602  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2682  hypothetical protein  51.58 
 
 
205 aa  184  6e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6898  hypothetical protein  51.05 
 
 
203 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.800563  normal  0.546229 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2221  hypothetical protein  48 
 
 
201 aa  181  6e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.378667  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1820  hypothetical protein  50.79 
 
 
207 aa  180  1e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1359  hypothetical protein  48.95 
 
 
208 aa  180  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.262276  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2041  flavin reductase domain protein FMN-binding  48.95 
 
 
203 aa  179  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0801878  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6051  hypothetical protein  47.26 
 
 
218 aa  179  2.9999999999999997e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.52164  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2943  hypothetical protein  50.53 
 
 
216 aa  178  4e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4899  hypothetical protein  46.67 
 
 
205 aa  177  8e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0053  hypothetical protein  49.48 
 
 
210 aa  177  8e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.234931  normal  0.568294 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1039  hypothetical protein  47.26 
 
 
201 aa  177  9e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.708626  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0081  hypothetical protein  49.21 
 
 
209 aa  177  9e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4219  hypothetical protein  46.84 
 
 
205 aa  177  1e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.269485 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4325  hypothetical protein  48.24 
 
 
201 aa  176  1e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.590963 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4414  hypothetical protein  48.24 
 
 
201 aa  175  3e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4312  hypothetical protein  48.95 
 
 
205 aa  175  3e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1398  hypothetical protein  47.74 
 
 
201 aa  175  4e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.709674  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4002  hypothetical protein  47.37 
 
 
207 aa  175  4e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.548606  normal  0.130195 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1842  hypothetical protein  47.37 
 
 
203 aa  174  5e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0994516  normal  0.0170416 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1150  flavoprotein oxygenase  45.13 
 
 
207 aa  174  6e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.462825 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4462  hypothetical protein  47.47 
 
 
209 aa  173  9.999999999999999e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.70984  normal  0.854602 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1469  flavoprotein oxygenase  47 
 
 
212 aa  173  9.999999999999999e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4071  hypothetical protein  45.79 
 
 
205 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.261199  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4298  hypothetical protein  46.32 
 
 
207 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3466  hypothetical protein  48.98 
 
 
209 aa  172  1.9999999999999998e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.421094 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2217  hypothetical protein  46.32 
 
 
207 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0565603 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2703  hypothetical protein  47.42 
 
 
206 aa  171  5e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.113365  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1011  hypothetical protein  45.77 
 
 
202 aa  171  9e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000116177  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1899  hypothetical protein  48.88 
 
 
202 aa  166  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.843142  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2049  hypothetical protein  43.81 
 
 
205 aa  167  1e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1051  hypothetical protein  45.26 
 
 
230 aa  165  2.9999999999999998e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.106662  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3626  flavoprotein oxygenase  43.98 
 
 
209 aa  165  4e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1057  hypothetical protein  46.56 
 
 
200 aa  165  4e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.535631 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0863  flavin reductase domain protein FMN-binding  44.22 
 
 
209 aa  165  5e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4267  hypothetical protein  46.6 
 
 
221 aa  161  7e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.308533  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3355  flavoprotein oxygenase  44.27 
 
 
210 aa  161  7e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.522125  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1133  hypothetical protein  44.5 
 
 
208 aa  161  8.000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.311037 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0492  flavoprotein oxygenase  44.27 
 
 
209 aa  160  1e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1122  hypothetical protein  44 
 
 
221 aa  160  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0498  flavoprotein oxygenase  43 
 
 
209 aa  160  1e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6039  hypothetical protein  46.46 
 
 
206 aa  159  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.8711  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04002  nitrilotriacetate monooxygenase component B  45.26 
 
 
209 aa  159  2e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02220  hypothetical protein  42.71 
 
 
208 aa  159  3e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.686893  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0503  flavoprotein oxygenase  43.75 
 
 
208 aa  158  5e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0502  flavoprotein oxygenase  43.75 
 
 
208 aa  158  6e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3528  flavoprotein oxygenase  43.23 
 
 
208 aa  156  2e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3989  flavoprotein oxygenase  43.23 
 
 
209 aa  155  4e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3864  flavoprotein oxygenase  43.23 
 
 
209 aa  155  4e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0452  flavoprotein oxygenase  43.23 
 
 
209 aa  155  4e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0458  flavoprotein oxygenase  43.23 
 
 
209 aa  155  4e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1242  hypothetical protein  43.5 
 
 
208 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1215  hypothetical protein  43.5 
 
 
208 aa  154  8e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3807  flavin reductase domain protein FMN-binding  43.23 
 
 
209 aa  154  8e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2269  hypothetical protein  42.13 
 
 
229 aa  153  2e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2736  hypothetical protein  41.12 
 
 
230 aa  152  5e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0761  hypothetical protein  43 
 
 
208 aa  151  5e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2679  hypothetical protein  41.12 
 
 
230 aa  152  5e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2065  conserved hypothetical FMN binding protein  42.79 
 
 
201 aa  150  2e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.111591  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0627  flavin reductase domain-containing protein  45.83 
 
 
194 aa  149  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2435  hypothetical protein  40.1 
 
 
211 aa  147  8e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3064  hypothetical protein  45.74 
 
 
209 aa  147  1.0000000000000001e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.883432  normal  0.0355565 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1838  hypothetical protein  45.31 
 
 
194 aa  145  3e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0487  flavin reductase domain-containing protein  45.31 
 
 
194 aa  145  6e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.660755  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2319  hypothetical protein  43.88 
 
 
201 aa  144  1e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4215  hypothetical protein  41.84 
 
 
184 aa  141  8e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.380151  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3209  flavin reductase-like, FMN-binding  40.78 
 
 
201 aa  140  1.9999999999999998e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3621  hypothetical protein  42.86 
 
 
220 aa  135  4e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4414  hypothetical protein  38.42 
 
 
218 aa  133  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.629184  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6309  hypothetical protein  39.79 
 
 
207 aa  131  6.999999999999999e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5792  hypothetical protein  39.05 
 
 
218 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.926616 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07162  conserved hypothetical protein  41.27 
 
 
241 aa  128  5.0000000000000004e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.574629  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3787  hypothetical protein  55.08 
 
 
140 aa  122  3e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1479  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  38.83 
 
 
206 aa  122  5e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2444  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  41.04 
 
 
199 aa  121  7e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2487  hypothetical protein  41.79 
 
 
203 aa  121  8e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.239635  normal  0.0244852 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2366  flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family-like protein  43.09 
 
 
203 aa  118  4.9999999999999996e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.460598  normal  0.14144 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1083  hypothetical protein  33.33 
 
 
204 aa  115  3.9999999999999997e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.2808  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0889  hypothetical protein  33.7 
 
 
200 aa  111  9e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.581973  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01680  hypothetical protein  33.51 
 
 
292 aa  110  2.0000000000000002e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_33014  predicted protein  39.11 
 
 
436 aa  108  7.000000000000001e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.111303  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3293  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  41.18 
 
 
216 aa  107  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.902968  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6314  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  35.98 
 
 
294 aa  105  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5247  hypothetical protein  38.66 
 
 
216 aa  105  4e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.59199 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0602  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  35.38 
 
 
217 aa  104  7e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.413112 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1593  hypothetical protein  32.46 
 
 
291 aa  103  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1916  hypothetical protein  30.29 
 
 
203 aa  102  4e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5507  hypothetical protein  34.21 
 
 
203 aa  102  4e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000065263  unclonable  4.40126e-26 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0762  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.6 
 
 
203 aa  102  4e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>