183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4644 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011004  Rpal_4644  hypothetical protein  100 
 
 
231 aa  473  1e-132  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2631  hypothetical protein  53.27 
 
 
221 aa  206  4e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.300035  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5247  hypothetical protein  50.75 
 
 
216 aa  195  6e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.59199 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0602  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  47.57 
 
 
217 aa  188  5e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.413112 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0405  hypothetical protein  49.75 
 
 
207 aa  185  6e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5370  flavin reductase domain protein FMN-binding  42.99 
 
 
223 aa  175  5e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.480853 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3148  flavin reductase-like, FMN-binding  44.67 
 
 
219 aa  171  9e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2915  flavin reductase domain protein FMN-binding  45.5 
 
 
203 aa  168  6e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7599  hypothetical protein  43.94 
 
 
220 aa  167  9e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2654  flavin reductase domain protein FMN-binding  45 
 
 
203 aa  165  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5134  hypothetical protein  39.63 
 
 
220 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1479  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  39.9 
 
 
206 aa  150  2e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2452  hypothetical protein  42.93 
 
 
201 aa  150  2e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.108576  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3627  hypothetical protein  43.14 
 
 
202 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.174937  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1365  hypothetical protein  43.94 
 
 
196 aa  144  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.300021  normal  0.0686539 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2914  hypothetical protein  42.19 
 
 
203 aa  142  3e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.939622 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43240  hypothetical protein  42.65 
 
 
202 aa  142  4e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.531737 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2815  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  43.14 
 
 
219 aa  141  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.112665  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0090  flavin reductase domain-containing protein  44.9 
 
 
210 aa  140  9.999999999999999e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00316855 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5253  flavin reductase domain protein FMN-binding  42.93 
 
 
196 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.504075 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0945  hypothetical protein  40.5 
 
 
210 aa  138  7e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5906  hypothetical protein  43.94 
 
 
195 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1051  flavin reductase-like, FMN-binding  43.65 
 
 
213 aa  135  6.0000000000000005e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0886076 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0889  hypothetical protein  36.14 
 
 
200 aa  131  6.999999999999999e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.581973  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1083  hypothetical protein  38.61 
 
 
204 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.2808  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5786  hypothetical protein  39.49 
 
 
208 aa  129  3e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.756136  hitchhiker  0.00296108 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1786  flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family-like protein  36.5 
 
 
228 aa  130  3e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.60124  normal  0.96149 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0081  hypothetical protein  49.66 
 
 
209 aa  128  7.000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2070  hypothetical protein  45.23 
 
 
202 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.224794 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4410  hypothetical protein  37 
 
 
209 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04002  nitrilotriacetate monooxygenase component B  41.36 
 
 
209 aa  126  3e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2366  flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family-like protein  40.31 
 
 
203 aa  126  3e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.460598  normal  0.14144 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5933  hypothetical protein  41.4 
 
 
209 aa  125  4.0000000000000003e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2487  hypothetical protein  38.97 
 
 
203 aa  125  4.0000000000000003e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.239635  normal  0.0244852 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2435  hypothetical protein  33.66 
 
 
211 aa  124  1e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6314  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  37.63 
 
 
294 aa  124  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3465  hypothetical protein  41.71 
 
 
202 aa  123  2e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3110  hypothetical protein  41.71 
 
 
202 aa  123  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0966495  normal  0.11855 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4219  hypothetical protein  44.83 
 
 
205 aa  122  5e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.269485 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1039  hypothetical protein  35.98 
 
 
201 aa  119  3e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.708626  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6039  hypothetical protein  43.2 
 
 
206 aa  119  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.8711  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1051  hypothetical protein  39.79 
 
 
230 aa  119  3e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.106662  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0053  hypothetical protein  44.44 
 
 
210 aa  119  3.9999999999999996e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.234931  normal  0.568294 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1122  hypothetical protein  35.62 
 
 
221 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2217  hypothetical protein  36.89 
 
 
207 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0565603 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0832  hypothetical protein  43.56 
 
 
206 aa  118  7e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.158602  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1133  hypothetical protein  37.31 
 
 
208 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.311037 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2164  hypothetical protein  33.33 
 
 
200 aa  117  9.999999999999999e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.341865  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4263  flavin reductase domain-containing protein  36.98 
 
 
210 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.644656 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1011  hypothetical protein  39.27 
 
 
202 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000116177  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0364  nitrilotriacetate monooxygenase component B  32.99 
 
 
205 aa  116  3e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1242  hypothetical protein  36.92 
 
 
208 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1215  hypothetical protein  36.92 
 
 
208 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4462  hypothetical protein  38.22 
 
 
209 aa  115  5e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.70984  normal  0.854602 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1398  hypothetical protein  35.45 
 
 
201 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.709674  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1359  hypothetical protein  37.04 
 
 
208 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.262276  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0863  flavin reductase domain protein FMN-binding  38.74 
 
 
209 aa  114  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4071  hypothetical protein  37.04 
 
 
205 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.261199  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2740  hypothetical protein  32.18 
 
 
203 aa  114  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2683  hypothetical protein  32.18 
 
 
203 aa  114  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4325  hypothetical protein  34.39 
 
 
201 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.590963 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4899  hypothetical protein  42.38 
 
 
205 aa  113  3e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5120  putative flavin reductase  29.85 
 
 
203 aa  113  3e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0364817  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2444  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  41.36 
 
 
199 aa  112  3e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4414  hypothetical protein  34.39 
 
 
201 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0761  hypothetical protein  36.41 
 
 
208 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3064  hypothetical protein  37.24 
 
 
209 aa  112  4.0000000000000004e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.883432  normal  0.0355565 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4215  hypothetical protein  43.97 
 
 
184 aa  112  5e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.380151  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1916  hypothetical protein  31.98 
 
 
203 aa  110  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3293  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  36.18 
 
 
216 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.902968  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5507  hypothetical protein  29.35 
 
 
203 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000065263  unclonable  4.40126e-26 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01680  hypothetical protein  33.33 
 
 
292 aa  109  4.0000000000000004e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3276  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.33 
 
 
295 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0498  flavoprotein oxygenase  36.79 
 
 
209 aa  108  5e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1820  hypothetical protein  39.74 
 
 
207 aa  108  6e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2857  hypothetical protein  32.02 
 
 
200 aa  108  6e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1150  flavoprotein oxygenase  35.23 
 
 
207 aa  108  6e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.462825 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4298  hypothetical protein  34.03 
 
 
207 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5444  hypothetical protein  28.86 
 
 
203 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0011476  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5500  hypothetical protein  29.35 
 
 
203 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000371904  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5447  hypothetical protein  29.35 
 
 
203 aa  107  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000739812  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5005  flavin reductase  29.35 
 
 
203 aa  107  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000501887  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4002  hypothetical protein  34.03 
 
 
207 aa  107  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.548606  normal  0.130195 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0412  hypothetical protein  32.69 
 
 
206 aa  107  2e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.567346  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2049  hypothetical protein  38.41 
 
 
205 aa  107  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2682  hypothetical protein  39.49 
 
 
205 aa  107  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3626  flavoprotein oxygenase  36.08 
 
 
209 aa  107  2e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2943  hypothetical protein  34.92 
 
 
216 aa  106  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5021  flavin reductase  28.86 
 
 
203 aa  106  4e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000378469  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4267  hypothetical protein  38.46 
 
 
221 aa  105  4e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.308533  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0762  flavin reductase domain protein FMN-binding  33 
 
 
203 aa  105  5e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1646  hypothetical protein  34.55 
 
 
212 aa  105  5e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0075  hypothetical protein  32.98 
 
 
196 aa  105  6e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000447764  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1899  hypothetical protein  41.72 
 
 
202 aa  105  6e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.843142  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02220  hypothetical protein  38.93 
 
 
208 aa  105  7e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.686893  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2151  hypothetical protein  34.52 
 
 
203 aa  105  7e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3843  hypothetical protein  29.59 
 
 
203 aa  105  8e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000198663  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5124  flavin reductase-like, FMN-binding  30.77 
 
 
216 aa  104  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.178532 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2703  hypothetical protein  38.41 
 
 
206 aa  104  1e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.113365  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0452  flavoprotein oxygenase  36.08 
 
 
209 aa  104  1e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>