183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP2269 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP2269  hypothetical protein  100 
 
 		 229 aa  478  1e-134  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2736  hypothetical protein  93.42 
 
 		 230 aa  452  1.0000000000000001e-126  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2679  hypothetical protein  93.42 
 
 		 230 aa  452  1.0000000000000001e-126  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4414  hypothetical protein  59.55 
 
 		 218 aa  266  2e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.629184  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5792  hypothetical protein  58.9 
 
 		 218 aa  258  5.0000000000000005e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.926616 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07162  conserved hypothetical protein  55.07 
 
 		 241 aa  242  3.9999999999999997e-63  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.574629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1494  hypothetical protein  80.83 
 
 		 124 aa  201  7e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.368034 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2065  conserved hypothetical FMN binding protein  41.06 
 
 		 201 aa  168  7e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.111591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3209  flavin reductase-like, FMN-binding  39.9 
 
 		 201 aa  166  4e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2631  hypothetical protein  44.22 
 
 		 202 aa  157  9e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1646  hypothetical protein  40.38 
 
 		 212 aa  155  7e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2591  flavin reductase domain protein FMN-binding  42 
 
 		 201 aa  154  1e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.40537 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2316  hypothetical protein  42 
 
 		 201 aa  154  1e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0978794 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2270  hypothetical protein  42.13 
 
 		 201 aa  153  2e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6295  hypothetical protein  39.59 
 
 		 208 aa  152  4e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.19889  normal  0.194247 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4219  hypothetical protein  42.18 
 
 		 205 aa  152  4e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.269485 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4899  hypothetical protein  42.51 
 
 		 205 aa  149  5e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1899  hypothetical protein  42.44 
 
 		 202 aa  149  5e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.843142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1039  hypothetical protein  41.15 
 
 		 201 aa  148  6e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.708626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0081  hypothetical protein  42.86 
 
 		 209 aa  148  8e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1842  hypothetical protein  41.5 
 
 		 203 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0994516  normal  0.0170416 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7205  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.59 
 
 		 209 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.981743  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0487  flavin reductase domain-containing protein  39.42 
 
 		 194 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.660755  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2041  flavin reductase domain protein FMN-binding  41.5 
 
 		 203 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0801878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2682  hypothetical protein  42.18 
 
 		 205 aa  147  2.0000000000000003e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2319  hypothetical protein  38.65 
 
 		 201 aa  146  3e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2151  hypothetical protein  40.67 
 
 		 203 aa  145  4.0000000000000006e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1838  hypothetical protein  39.61 
 
 		 194 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1469  flavoprotein oxygenase  41.67 
 
 		 212 aa  144  8.000000000000001e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1820  hypothetical protein  44.51 
 
 		 207 aa  144  2e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1051  hypothetical protein  43.19 
 
 		 230 aa  143  2e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.106662  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1150  flavoprotein oxygenase  41.36 
 
 		 207 aa  143  2e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.462825 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1057  hypothetical protein  41.79 
 
 		 200 aa  143  3e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.535631 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2943  hypothetical protein  40.48 
 
 		 216 aa  142  4e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0832  hypothetical protein  39.34 
 
 		 206 aa  142  4e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.158602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0498  flavoprotein oxygenase  41.23 
 
 		 209 aa  142  6e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1398  hypothetical protein  39.23 
 
 		 201 aa  141  7e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.709674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4325  hypothetical protein  39.23 
 
 		 201 aa  141  7e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.590963 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1011  hypothetical protein  41.71 
 
 		 202 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000116177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6898  hypothetical protein  40 
 
 		 203 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.800563  normal  0.546229 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02220  hypothetical protein  41.23 
 
 		 208 aa  140  1.9999999999999998e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.686893  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0627  flavin reductase domain-containing protein  38.65 
 
 		 194 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2221  hypothetical protein  36.5 
 
 		 201 aa  140  1.9999999999999998e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.378667  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1359  hypothetical protein  39.9 
 
 		 208 aa  139  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.262276  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04002  nitrilotriacetate monooxygenase component B  42.25 
 
 		 209 aa  139  3e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3466  hypothetical protein  45.11 
 
 		 209 aa  139  4.999999999999999e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.421094 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4312  hypothetical protein  38.57 
 
 		 205 aa  138  6e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4462  hypothetical protein  40.38 
 
 		 209 aa  138  7e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.70984  normal  0.854602 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4414  hypothetical protein  37.8 
 
 		 201 aa  138  7.999999999999999e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0863  flavin reductase domain protein FMN-binding  39.34 
 
 		 209 aa  137  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3355  flavoprotein oxygenase  39.79 
 
 		 210 aa  136  2e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.522125  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1068  hypothetical protein  39.91 
 
 		 203 aa  136  3.0000000000000003e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0726405  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1032  hypothetical protein  39.91 
 
 		 203 aa  136  3.0000000000000003e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.863891  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4071  hypothetical protein  39.34 
 
 		 205 aa  135  4e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.261199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3626  flavoprotein oxygenase  37.14 
 
 		 209 aa  135  5e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2435  hypothetical protein  36.19 
 
 		 211 aa  135  7.000000000000001e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4002  hypothetical protein  38.68 
 
 		 207 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.548606  normal  0.130195 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3621  hypothetical protein  36.23 
 
 		 220 aa  135  8e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0053  hypothetical protein  41.15 
 
 		 210 aa  134  9e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.234931  normal  0.568294 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4298  hypothetical protein  38.79 
 
 		 207 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3807  flavin reductase domain protein FMN-binding  39.27 
 
 		 209 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1215  hypothetical protein  37.56 
 
 		 208 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3989  flavoprotein oxygenase  39.27 
 
 		 209 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0502  flavoprotein oxygenase  38.74 
 
 		 208 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0452  flavoprotein oxygenase  39.27 
 
 		 209 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0458  flavoprotein oxygenase  39.27 
 
 		 209 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2703  hypothetical protein  39.52 
 
 		 206 aa  133  3e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.113365  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3528  flavoprotein oxygenase  38.74 
 
 		 208 aa  133  3e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1242  hypothetical protein  37.56 
 
 		 208 aa  132  3e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3864  flavoprotein oxygenase  38.74 
 
 		 209 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4267  hypothetical protein  40.48 
 
 		 221 aa  130  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.308533  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0492  flavoprotein oxygenase  37.7 
 
 		 209 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6039  hypothetical protein  37.62 
 
 		 206 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.8711  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1133  hypothetical protein  37.09 
 
 		 208 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.311037 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0267  hypothetical protein  35.35 
 
 		 209 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0503  flavoprotein oxygenase  38.22 
 
 		 208 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3064  hypothetical protein  36.13 
 
 		 209 aa  130  2.0000000000000002e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.883432  normal  0.0355565 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2049  hypothetical protein  42.13 
 
 		 205 aa  129  3e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0761  hypothetical protein  37.09 
 
 		 208 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2217  hypothetical protein  38.1 
 
 		 207 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0565603 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4215  hypothetical protein  37.68 
 
 		 184 aa  128  7.000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.380151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1122  hypothetical protein  37.09 
 
 		 221 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6051  hypothetical protein  34.91 
 
 		 218 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.52164  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3787  hypothetical protein  47.26 
 
 		 140 aa  119  3.9999999999999996e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1083  hypothetical protein  36.92 
 
 		 204 aa  118  7e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.2808  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2444  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  39.89 
 
 		 199 aa  118  9e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2452  hypothetical protein  33.33 
 
 		 201 aa  115  6e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.108576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0762  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.74 
 
 		 203 aa  115  6.9999999999999995e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1981  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  37.29 
 
 		 197 aa  110  1.0000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.780004  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2487  hypothetical protein  33.33 
 
 		 203 aa  111  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.239635  normal  0.0244852 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0889  hypothetical protein  34.81 
 
 		 200 aa  108  5e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.581973  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43240  hypothetical protein  31.75 
 
 		 202 aa  108  5e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.531737 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01680  hypothetical protein  33.67 
 
 		 292 aa  107  1e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5247  hypothetical protein  34.72 
 
 		 216 aa  106  4e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.59199 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3627  hypothetical protein  31.22 
 
 		 202 aa  106  4e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.174937  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5507  hypothetical protein  29.84 
 
 		 203 aa  105  7e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000065263  unclonable  4.40126e-26 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1593  hypothetical protein  32.64 
 
 		 291 aa  105  8e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5447  hypothetical protein  29.32 
 
 		 203 aa  104  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000739812  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5005  flavin reductase  29.32 
 
 		 203 aa  104  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000501887  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5021  flavin reductase  29.32 
 
 		 203 aa  104  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000378469  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>