209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7205 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_7205  flavin reductase domain protein FMN-binding  100 
 
 
209 aa  427  1e-119  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.981743  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6295  hypothetical protein  89.47 
 
 
208 aa  385  1e-106  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.19889  normal  0.194247 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2270  hypothetical protein  75.25 
 
 
201 aa  322  3e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2316  hypothetical protein  74.75 
 
 
201 aa  320  8e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0978794 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2591  flavin reductase domain protein FMN-binding  74.75 
 
 
201 aa  320  8e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.40537 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0267  hypothetical protein  69.57 
 
 
209 aa  298  6e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1646  hypothetical protein  49.76 
 
 
212 aa  197  1.0000000000000001e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1032  hypothetical protein  51.58 
 
 
203 aa  187  1e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.863891  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1068  hypothetical protein  51.05 
 
 
203 aa  184  1.0000000000000001e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0726405  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2221  hypothetical protein  48.51 
 
 
201 aa  182  2.0000000000000003e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.378667  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2041  flavin reductase domain protein FMN-binding  49.49 
 
 
203 aa  181  5.0000000000000004e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0801878  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6898  hypothetical protein  48.48 
 
 
203 aa  180  1e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.800563  normal  0.546229 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1359  hypothetical protein  46.91 
 
 
208 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.262276  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2943  hypothetical protein  48.48 
 
 
216 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2151  hypothetical protein  46.91 
 
 
203 aa  178  4.999999999999999e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1057  hypothetical protein  48.76 
 
 
200 aa  178  5.999999999999999e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.535631 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1842  hypothetical protein  47.96 
 
 
203 aa  177  8e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0994516  normal  0.0170416 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2631  hypothetical protein  47.96 
 
 
202 aa  177  1e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0053  hypothetical protein  47.32 
 
 
210 aa  175  5e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.234931  normal  0.568294 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4071  hypothetical protein  45.83 
 
 
205 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.261199  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0832  hypothetical protein  44.16 
 
 
206 aa  172  2.9999999999999996e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.158602  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1820  hypothetical protein  48.69 
 
 
207 aa  171  5e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6051  hypothetical protein  45.45 
 
 
218 aa  171  5e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.52164  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4312  hypothetical protein  46.73 
 
 
205 aa  171  5e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4899  hypothetical protein  44.16 
 
 
205 aa  170  1e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1011  hypothetical protein  44.55 
 
 
202 aa  169  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000116177  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0081  hypothetical protein  46.6 
 
 
209 aa  169  2e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1150  flavoprotein oxygenase  43.37 
 
 
207 aa  170  2e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.462825 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2682  hypothetical protein  44.72 
 
 
205 aa  169  3e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1039  hypothetical protein  45.41 
 
 
201 aa  169  3e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.708626  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4219  hypothetical protein  44.27 
 
 
205 aa  168  5e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.269485 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1469  flavoprotein oxygenase  42.72 
 
 
212 aa  167  8e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4462  hypothetical protein  44.9 
 
 
209 aa  167  8e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.70984  normal  0.854602 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4002  hypothetical protein  45.08 
 
 
207 aa  166  2e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.548606  normal  0.130195 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2049  hypothetical protein  42.56 
 
 
205 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4414  hypothetical protein  45.41 
 
 
201 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4325  hypothetical protein  44.9 
 
 
201 aa  165  4e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.590963 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4298  hypothetical protein  45.03 
 
 
207 aa  164  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1398  hypothetical protein  44.39 
 
 
201 aa  164  9e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.709674  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0492  flavoprotein oxygenase  42.41 
 
 
209 aa  162  3e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0863  flavin reductase domain protein FMN-binding  43.88 
 
 
209 aa  162  3e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2703  hypothetical protein  43.59 
 
 
206 aa  162  4.0000000000000004e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.113365  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3626  flavoprotein oxygenase  39.27 
 
 
209 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0502  flavoprotein oxygenase  41.88 
 
 
208 aa  159  2e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2217  hypothetical protein  42.41 
 
 
207 aa  159  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0565603 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0503  flavoprotein oxygenase  41.88 
 
 
208 aa  159  4e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3466  hypothetical protein  45.41 
 
 
209 aa  159  4e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.421094 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1051  hypothetical protein  41.67 
 
 
230 aa  157  1e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.106662  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3528  flavoprotein oxygenase  40.84 
 
 
208 aa  156  2e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3355  flavoprotein oxygenase  40.31 
 
 
210 aa  155  3e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.522125  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04002  nitrilotriacetate monooxygenase component B  42.93 
 
 
209 aa  155  4e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1899  hypothetical protein  45.25 
 
 
202 aa  155  5.0000000000000005e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.843142  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3989  flavoprotein oxygenase  39.38 
 
 
209 aa  154  1e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0452  flavoprotein oxygenase  39.38 
 
 
209 aa  154  1e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0458  flavoprotein oxygenase  39.38 
 
 
209 aa  154  1e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6039  hypothetical protein  42.35 
 
 
206 aa  153  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.8711  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3807  flavin reductase domain protein FMN-binding  39.38 
 
 
209 aa  153  2e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3864  flavoprotein oxygenase  39.38 
 
 
209 aa  152  4e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3064  hypothetical protein  45.81 
 
 
209 aa  152  5e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.883432  normal  0.0355565 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2435  hypothetical protein  41.58 
 
 
211 aa  151  8e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0498  flavoprotein oxygenase  40.93 
 
 
209 aa  151  8e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4267  hypothetical protein  44.22 
 
 
221 aa  150  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.308533  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2679  hypothetical protein  37.93 
 
 
230 aa  150  1e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2736  hypothetical protein  37.93 
 
 
230 aa  150  1e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1122  hypothetical protein  41.84 
 
 
221 aa  149  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1133  hypothetical protein  41.84 
 
 
208 aa  149  3e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.311037 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02220  hypothetical protein  40.62 
 
 
208 aa  148  7e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.686893  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2269  hypothetical protein  36.59 
 
 
229 aa  146  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1242  hypothetical protein  41.84 
 
 
208 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1215  hypothetical protein  41.84 
 
 
208 aa  144  6e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0761  hypothetical protein  41.33 
 
 
208 aa  142  4e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2065  conserved hypothetical FMN binding protein  42.29 
 
 
201 aa  141  6e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.111591  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4414  hypothetical protein  38.5 
 
 
218 aa  139  3.9999999999999997e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.629184  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2319  hypothetical protein  42.64 
 
 
201 aa  137  8.999999999999999e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3209  flavin reductase-like, FMN-binding  41.06 
 
 
201 aa  137  1e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0627  flavin reductase domain-containing protein  41.45 
 
 
194 aa  137  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1838  hypothetical protein  41.45 
 
 
194 aa  137  2e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0487  flavin reductase domain-containing protein  41.45 
 
 
194 aa  135  4e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.660755  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5792  hypothetical protein  38.97 
 
 
218 aa  132  3e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.926616 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4215  hypothetical protein  38.05 
 
 
184 aa  130  1.0000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.380151  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07162  conserved hypothetical protein  39.39 
 
 
241 aa  125  5e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.574629  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2366  flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family-like protein  43.75 
 
 
203 aa  124  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.460598  normal  0.14144 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3621  hypothetical protein  41.62 
 
 
220 aa  124  1e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3787  hypothetical protein  52.54 
 
 
140 aa  123  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6309  hypothetical protein  37.31 
 
 
207 aa  122  4e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2487  hypothetical protein  42.05 
 
 
203 aa  119  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.239635  normal  0.0244852 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1479  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  38.3 
 
 
206 aa  114  7.999999999999999e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1083  hypothetical protein  32.26 
 
 
204 aa  108  4.0000000000000004e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.2808  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2444  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  35.68 
 
 
199 aa  108  7.000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5247  hypothetical protein  35.61 
 
 
216 aa  107  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.59199 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01680  hypothetical protein  34 
 
 
292 aa  105  5e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_33014  predicted protein  38.55 
 
 
436 aa  104  1e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.111303  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6314  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  36.65 
 
 
294 aa  103  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5507  hypothetical protein  34.95 
 
 
203 aa  103  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000065263  unclonable  4.40126e-26 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0602  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  36.27 
 
 
217 aa  102  4e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.413112 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5444  hypothetical protein  34.95 
 
 
203 aa  102  5e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0011476  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5413  hypothetical protein  34.41 
 
 
203 aa  101  6e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.81917e-62 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5171  hypothetical protein  34.59 
 
 
203 aa  101  7e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000552892  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5565  hypothetical protein  34.59 
 
 
203 aa  101  7e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000029994  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0500  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.33 
 
 
294 aa  101  7e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>