187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3787 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_3787  hypothetical protein  100 
 
 
140 aa  290  6e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1051  hypothetical protein  78.63 
 
 
230 aa  220  4.9999999999999996e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.106662  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4462  hypothetical protein  77.44 
 
 
209 aa  216  1e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.70984  normal  0.854602 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4298  hypothetical protein  73.68 
 
 
207 aa  212  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4002  hypothetical protein  73.68 
 
 
207 aa  211  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.548606  normal  0.130195 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2703  hypothetical protein  74.44 
 
 
206 aa  209  1e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.113365  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1011  hypothetical protein  78.12 
 
 
202 aa  208  2e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000116177  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0863  flavin reductase domain protein FMN-binding  78.91 
 
 
209 aa  207  3e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0081  hypothetical protein  78.12 
 
 
209 aa  206  1e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1039  hypothetical protein  71.88 
 
 
201 aa  201  3e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.708626  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04002  nitrilotriacetate monooxygenase component B  73.48 
 
 
209 aa  199  8e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1215  hypothetical protein  66.43 
 
 
208 aa  197  3e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1242  hypothetical protein  66.43 
 
 
208 aa  197  3e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1398  hypothetical protein  70.31 
 
 
201 aa  196  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.709674  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4325  hypothetical protein  70.31 
 
 
201 aa  196  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.590963 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4414  hypothetical protein  69.53 
 
 
201 aa  195  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0761  hypothetical protein  65.71 
 
 
208 aa  195  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1133  hypothetical protein  67.42 
 
 
208 aa  193  8.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.311037 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1122  hypothetical protein  67.42 
 
 
221 aa  192  1e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1359  hypothetical protein  68.75 
 
 
208 aa  190  7e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.262276  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0832  hypothetical protein  68.42 
 
 
206 aa  188  2e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.158602  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2049  hypothetical protein  66.17 
 
 
205 aa  188  2.9999999999999997e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0498  flavoprotein oxygenase  64.29 
 
 
209 aa  187  5.999999999999999e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1150  flavoprotein oxygenase  67.19 
 
 
207 aa  186  5.999999999999999e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.462825 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4219  hypothetical protein  69.53 
 
 
205 aa  184  3e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.269485 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2682  hypothetical protein  63.31 
 
 
205 aa  184  3e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3626  flavoprotein oxygenase  62.69 
 
 
209 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0492  flavoprotein oxygenase  65.62 
 
 
209 aa  181  4.0000000000000006e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0502  flavoprotein oxygenase  63.16 
 
 
208 aa  181  4.0000000000000006e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3989  flavoprotein oxygenase  64.39 
 
 
209 aa  180  5.0000000000000004e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0458  flavoprotein oxygenase  64.39 
 
 
209 aa  180  5.0000000000000004e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0452  flavoprotein oxygenase  64.39 
 
 
209 aa  180  6e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3807  flavin reductase domain protein FMN-binding  64.39 
 
 
209 aa  180  7e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4899  hypothetical protein  65.62 
 
 
205 aa  179  9.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1469  flavoprotein oxygenase  63.64 
 
 
212 aa  179  1e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3528  flavoprotein oxygenase  62.41 
 
 
208 aa  179  1e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3355  flavoprotein oxygenase  62.96 
 
 
210 aa  179  1e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.522125  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4071  hypothetical protein  66.41 
 
 
205 aa  178  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.261199  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2217  hypothetical protein  61.76 
 
 
207 aa  178  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0565603 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0503  flavoprotein oxygenase  62.41 
 
 
208 aa  177  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3864  flavoprotein oxygenase  63.64 
 
 
209 aa  177  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02220  hypothetical protein  61.24 
 
 
208 aa  176  9e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.686893  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2943  hypothetical protein  63.91 
 
 
216 aa  176  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0053  hypothetical protein  65.62 
 
 
210 aa  175  2e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.234931  normal  0.568294 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6898  hypothetical protein  64.62 
 
 
203 aa  174  4e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.800563  normal  0.546229 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4312  hypothetical protein  62.41 
 
 
205 aa  174  4e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1820  hypothetical protein  67.97 
 
 
207 aa  174  5e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4215  hypothetical protein  60.9 
 
 
184 aa  172  9.999999999999999e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.380151  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6051  hypothetical protein  60.94 
 
 
218 aa  171  2.9999999999999996e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.52164  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6039  hypothetical protein  61.72 
 
 
206 aa  162  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.8711  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2631  hypothetical protein  61.29 
 
 
202 aa  158  2e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1899  hypothetical protein  60.94 
 
 
202 aa  158  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.843142  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3466  hypothetical protein  60.47 
 
 
209 aa  155  2e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.421094 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4267  hypothetical protein  60.94 
 
 
221 aa  155  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.308533  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1057  hypothetical protein  55.88 
 
 
200 aa  148  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.535631 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6309  hypothetical protein  55.97 
 
 
207 aa  144  5e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2151  hypothetical protein  54.33 
 
 
203 aa  139  9.999999999999999e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2221  hypothetical protein  50.38 
 
 
201 aa  135  1e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.378667  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1646  hypothetical protein  52.67 
 
 
212 aa  133  9e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2065  conserved hypothetical FMN binding protein  50.75 
 
 
201 aa  132  9.999999999999999e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.111591  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07162  conserved hypothetical protein  54.07 
 
 
241 aa  130  6.999999999999999e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.574629  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2319  hypothetical protein  49.25 
 
 
201 aa  130  6.999999999999999e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1068  hypothetical protein  50.39 
 
 
203 aa  127  5.0000000000000004e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0726405  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1032  hypothetical protein  50.39 
 
 
203 aa  127  5.0000000000000004e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.863891  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6295  hypothetical protein  52.54 
 
 
208 aa  124  5e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.19889  normal  0.194247 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7205  flavin reductase domain protein FMN-binding  52.54 
 
 
209 aa  123  7e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.981743  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2270  hypothetical protein  55.08 
 
 
201 aa  122  1e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3209  flavin reductase-like, FMN-binding  48.51 
 
 
201 aa  122  1e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2591  flavin reductase domain protein FMN-binding  55.08 
 
 
201 aa  122  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.40537 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2316  hypothetical protein  55.08 
 
 
201 aa  122  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0978794 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1842  hypothetical protein  52.17 
 
 
203 aa  121  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0994516  normal  0.0170416 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2041  flavin reductase domain protein FMN-binding  49.6 
 
 
203 aa  121  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0801878  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1838  hypothetical protein  51.18 
 
 
194 aa  120  7e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0487  flavin reductase domain-containing protein  51.18 
 
 
194 aa  120  8e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.660755  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0627  flavin reductase domain-containing protein  48.82 
 
 
194 aa  120  8e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2269  hypothetical protein  47.26 
 
 
229 aa  119  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2736  hypothetical protein  46.58 
 
 
230 aa  117  7.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2679  hypothetical protein  46.58 
 
 
230 aa  117  7.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0267  hypothetical protein  50 
 
 
209 aa  114  5e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3621  hypothetical protein  43.66 
 
 
220 aa  112  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5792  hypothetical protein  46.21 
 
 
218 aa  106  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.926616 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2444  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  47.79 
 
 
199 aa  103  6e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2435  hypothetical protein  45.16 
 
 
211 aa  103  9e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3064  hypothetical protein  45.45 
 
 
209 aa  101  3e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.883432  normal  0.0355565 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4644  hypothetical protein  45.83 
 
 
231 aa  102  3e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4414  hypothetical protein  43.94 
 
 
218 aa  100  6e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.629184  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3293  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  44.62 
 
 
216 aa  100  9e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.902968  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1494  hypothetical protein  44.07 
 
 
124 aa  99.8  1e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.368034 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1479  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  42.11 
 
 
206 aa  95.9  2e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0762  flavin reductase domain protein FMN-binding  41.94 
 
 
203 aa  92  2e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1786  flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family-like protein  41.88 
 
 
228 aa  91.7  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.60124  normal  0.96149 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2631  hypothetical protein  45.31 
 
 
221 aa  90.1  8e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.300035  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1083  hypothetical protein  39.13 
 
 
204 aa  89.4  1e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.2808  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3148  flavin reductase-like, FMN-binding  36.8 
 
 
219 aa  89  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5247  hypothetical protein  44.92 
 
 
216 aa  89  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.59199 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1916  hypothetical protein  36.94 
 
 
203 aa  85.9  2e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0889  hypothetical protein  36.8 
 
 
200 aa  85.5  2e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.581973  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5120  putative flavin reductase  38.52 
 
 
203 aa  84.7  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0364817  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5253  flavin reductase domain protein FMN-binding  39.83 
 
 
196 aa  85.1  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.504075 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0405  hypothetical protein  39.06 
 
 
207 aa  84.7  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>