169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3621 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_3621  hypothetical protein  100 
 
 		 220 aa  456  1e-127  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2319  hypothetical protein  61.31 
 
 		 201 aa  263  2e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2065  conserved hypothetical FMN binding protein  63.32 
 
 		 201 aa  259  2e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.111591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0627  flavin reductase domain-containing protein  60.61 
 
 		 194 aa  257  8e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1838  hypothetical protein  59.09 
 
 		 194 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0487  flavin reductase domain-containing protein  58.59 
 
 		 194 aa  250  1e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.660755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3209  flavin reductase-like, FMN-binding  57.29 
 
 		 201 aa  243  1.9999999999999999e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2151  hypothetical protein  46.08 
 
 		 203 aa  178  4e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1068  hypothetical protein  47.06 
 
 		 203 aa  178  4.999999999999999e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0726405  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1032  hypothetical protein  47.06 
 
 		 203 aa  178  4.999999999999999e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.863891  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1057  hypothetical protein  46.34 
 
 		 200 aa  169  4e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.535631 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2221  hypothetical protein  42.93 
 
 		 201 aa  168  6e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.378667  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1646  hypothetical protein  45.37 
 
 		 212 aa  164  8e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1899  hypothetical protein  44.83 
 
 		 202 aa  160  1e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.843142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1842  hypothetical protein  44.39 
 
 		 203 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0994516  normal  0.0170416 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1242  hypothetical protein  44.39 
 
 		 208 aa  159  3e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1215  hypothetical protein  44.39 
 
 		 208 aa  159  3e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2631  hypothetical protein  43 
 
 		 202 aa  158  6e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2041  flavin reductase domain protein FMN-binding  44.39 
 
 		 203 aa  158  6e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0801878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1133  hypothetical protein  41.75 
 
 		 208 aa  157  8e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.311037 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1122  hypothetical protein  41.2 
 
 		 221 aa  157  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2943  hypothetical protein  44.12 
 
 		 216 aa  155  4e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0761  hypothetical protein  43.85 
 
 		 208 aa  155  4e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6898  hypothetical protein  44.61 
 
 		 203 aa  154  8e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.800563  normal  0.546229 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2049  hypothetical protein  43.65 
 
 		 205 aa  154  1e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02220  hypothetical protein  37.32 
 
 		 208 aa  153  2e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.686893  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0863  flavin reductase domain protein FMN-binding  46.02 
 
 		 209 aa  152  4e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1398  hypothetical protein  40.69 
 
 		 201 aa  151  1e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.709674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4325  hypothetical protein  40.69 
 
 		 201 aa  150  1e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.590963 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4462  hypothetical protein  44.89 
 
 		 209 aa  150  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.70984  normal  0.854602 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1039  hypothetical protein  40.69 
 
 		 201 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.708626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2217  hypothetical protein  39.62 
 
 		 207 aa  150  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0565603 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4414  hypothetical protein  40.69 
 
 		 201 aa  149  4e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1011  hypothetical protein  43.2 
 
 		 202 aa  147  8e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000116177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2703  hypothetical protein  40.28 
 
 		 206 aa  146  3e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.113365  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04002  nitrilotriacetate monooxygenase component B  42.23 
 
 		 209 aa  146  3e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0081  hypothetical protein  41.51 
 
 		 209 aa  145  4.0000000000000006e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0053  hypothetical protein  43.9 
 
 		 210 aa  144  7.0000000000000006e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.234931  normal  0.568294 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6051  hypothetical protein  42.54 
 
 		 218 aa  144  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.52164  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1051  hypothetical protein  42.23 
 
 		 230 aa  143  2e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.106662  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3626  flavoprotein oxygenase  43.18 
 
 		 209 aa  142  3e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1150  flavoprotein oxygenase  39.32 
 
 		 207 aa  142  3e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.462825 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1820  hypothetical protein  40.98 
 
 		 207 aa  142  4e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4312  hypothetical protein  39.71 
 
 		 205 aa  142  5e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4298  hypothetical protein  41.71 
 
 		 207 aa  142  6e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4002  hypothetical protein  41.14 
 
 		 207 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.548606  normal  0.130195 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0498  flavoprotein oxygenase  39.72 
 
 		 209 aa  138  4.999999999999999e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2682  hypothetical protein  42.45 
 
 		 205 aa  138  7e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2591  flavin reductase domain protein FMN-binding  42.51 
 
 		 201 aa  136  2e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.40537 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2316  hypothetical protein  42.51 
 
 		 201 aa  136  2e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0978794 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2679  hypothetical protein  37.32 
 
 		 230 aa  136  2e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2736  hypothetical protein  37.32 
 
 		 230 aa  136  2e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2270  hypothetical protein  42.86 
 
 		 201 aa  135  5e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3355  flavoprotein oxygenase  43.27 
 
 		 210 aa  135  5e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.522125  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2269  hypothetical protein  36.23 
 
 		 229 aa  135  7.000000000000001e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1359  hypothetical protein  39.13 
 
 		 208 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.262276  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2435  hypothetical protein  35.5 
 
 		 211 aa  133  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4215  hypothetical protein  46.53 
 
 		 184 aa  133  1.9999999999999998e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.380151  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0832  hypothetical protein  42.29 
 
 		 206 aa  132  3e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.158602  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0492  flavoprotein oxygenase  42.37 
 
 		 209 aa  132  5e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0267  hypothetical protein  42.08 
 
 		 209 aa  131  6.999999999999999e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07162  conserved hypothetical protein  35.75 
 
 		 241 aa  130  1.0000000000000001e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.574629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3466  hypothetical protein  42.31 
 
 		 209 aa  130  1.0000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.421094 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0452  flavoprotein oxygenase  40.68 
 
 		 209 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0502  flavoprotein oxygenase  42.11 
 
 		 208 aa  129  3e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3807  flavin reductase domain protein FMN-binding  40.68 
 
 		 209 aa  129  3e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0458  flavoprotein oxygenase  40.11 
 
 		 209 aa  128  6e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3989  flavoprotein oxygenase  40.11 
 
 		 209 aa  128  6e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1469  flavoprotein oxygenase  41.01 
 
 		 212 aa  128  6e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4071  hypothetical protein  36.89 
 
 		 205 aa  128  7.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.261199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3864  flavoprotein oxygenase  40.68 
 
 		 209 aa  128  8.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4899  hypothetical protein  36.59 
 
 		 205 aa  128  8.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3064  hypothetical protein  37.07 
 
 		 209 aa  128  8.000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.883432  normal  0.0355565 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3528  flavoprotein oxygenase  41.52 
 
 		 208 aa  127  9.000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4414  hypothetical protein  37.07 
 
 		 218 aa  127  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.629184  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0503  flavoprotein oxygenase  42.11 
 
 		 208 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4219  hypothetical protein  36.59 
 
 		 205 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.269485 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6295  hypothetical protein  42.64 
 
 		 208 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.19889  normal  0.194247 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1981  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  39.89 
 
 		 197 aa  126  2.0000000000000002e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.780004  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6039  hypothetical protein  40.91 
 
 		 206 aa  124  8.000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.8711  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7205  flavin reductase domain protein FMN-binding  41.62 
 
 		 209 aa  124  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.981743  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5792  hypothetical protein  36.59 
 
 		 218 aa  121  9e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.926616 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2487  hypothetical protein  37.56 
 
 		 203 aa  114  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.239635  normal  0.0244852 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1916  hypothetical protein  31.55 
 
 		 203 aa  112  3e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3787  hypothetical protein  43.66 
 
 		 140 aa  112  6e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0412  hypothetical protein  34.43 
 
 		 206 aa  111  9e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.567346  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4267  hypothetical protein  37.07 
 
 		 221 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.308533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2366  flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family-like protein  36.55 
 
 		 203 aa  110  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.460598  normal  0.14144 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0889  hypothetical protein  30.1 
 
 		 200 aa  107  1e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.581973  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2452  hypothetical protein  34.76 
 
 		 201 aa  105  4e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.108576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1479  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  35.87 
 
 		 206 aa  105  6e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6309  hypothetical protein  38.29 
 
 		 207 aa  104  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4263  flavin reductase domain-containing protein  36.05 
 
 		 210 aa  101  7e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.644656 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0602  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  35.29 
 
 		 217 aa  101  1e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.413112 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2444  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  33.5 
 
 		 199 aa  99.4  3e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3293  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  33.33 
 
 		 216 aa  97.8  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.902968  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43240  hypothetical protein  33.16 
 
 		 202 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.531737 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3276  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.16 
 
 		 295 aa  96.3  4e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0405  hypothetical protein  33 
 
 		 207 aa  95.1  7e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01680  hypothetical protein  31.44 
 
 		 292 aa  94.4  1e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>