168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1494 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1494  hypothetical protein  100 
 
 
124 aa  259  6e-69  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.368034 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2679  hypothetical protein  83.33 
 
 
230 aa  206  1e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2736  hypothetical protein  83.33 
 
 
230 aa  206  1e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2269  hypothetical protein  80.83 
 
 
229 aa  201  2e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4414  hypothetical protein  68.33 
 
 
218 aa  161  3e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.629184  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5792  hypothetical protein  67.5 
 
 
218 aa  155  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.926616 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07162  conserved hypothetical protein  61.48 
 
 
241 aa  150  4e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.574629  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2631  hypothetical protein  49.07 
 
 
202 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1122  hypothetical protein  46.36 
 
 
221 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1133  hypothetical protein  46.36 
 
 
208 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.311037 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2319  hypothetical protein  48.74 
 
 
201 aa  110  7.000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0832  hypothetical protein  48.15 
 
 
206 aa  109  1.0000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.158602  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1242  hypothetical protein  45.45 
 
 
208 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1215  hypothetical protein  45.45 
 
 
208 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1039  hypothetical protein  44.64 
 
 
201 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.708626  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2221  hypothetical protein  45 
 
 
201 aa  106  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.378667  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1150  flavoprotein oxygenase  43.64 
 
 
207 aa  106  1e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.462825 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1057  hypothetical protein  46.67 
 
 
200 aa  106  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.535631 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1469  flavoprotein oxygenase  48.15 
 
 
212 aa  105  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1842  hypothetical protein  48.15 
 
 
203 aa  104  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0994516  normal  0.0170416 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2065  conserved hypothetical FMN binding protein  43.7 
 
 
201 aa  104  3e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.111591  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0761  hypothetical protein  44.55 
 
 
208 aa  105  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04002  nitrilotriacetate monooxygenase component B  47.27 
 
 
209 aa  104  3e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3355  flavoprotein oxygenase  45.45 
 
 
210 aa  105  3e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.522125  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3209  flavin reductase-like, FMN-binding  45.38 
 
 
201 aa  103  6e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3626  flavoprotein oxygenase  44.55 
 
 
209 aa  103  6e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02220  hypothetical protein  46.61 
 
 
208 aa  103  9e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.686893  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4219  hypothetical protein  45.37 
 
 
205 aa  102  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.269485 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0502  flavoprotein oxygenase  44.55 
 
 
208 aa  102  1e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1359  hypothetical protein  44.14 
 
 
208 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.262276  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3989  flavoprotein oxygenase  43.64 
 
 
209 aa  101  3e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4002  hypothetical protein  45.45 
 
 
207 aa  101  3e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.548606  normal  0.130195 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2682  hypothetical protein  45.76 
 
 
205 aa  101  3e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2041  flavin reductase domain protein FMN-binding  46.3 
 
 
203 aa  102  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0801878  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3807  flavin reductase domain protein FMN-binding  43.64 
 
 
209 aa  101  3e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0452  flavoprotein oxygenase  43.64 
 
 
209 aa  101  3e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0458  flavoprotein oxygenase  43.64 
 
 
209 aa  101  3e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4414  hypothetical protein  44.55 
 
 
201 aa  101  3e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4298  hypothetical protein  45.45 
 
 
207 aa  101  4e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3528  flavoprotein oxygenase  43.64 
 
 
208 aa  101  4e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0081  hypothetical protein  45.76 
 
 
209 aa  100  4e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1899  hypothetical protein  42.86 
 
 
202 aa  100  6e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.843142  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1398  hypothetical protein  42.86 
 
 
201 aa  100  7e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.709674  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1011  hypothetical protein  44.17 
 
 
202 aa  100  7e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000116177  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4325  hypothetical protein  42.86 
 
 
201 aa  100  7e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.590963 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0503  flavoprotein oxygenase  43.64 
 
 
208 aa  100  8e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3466  hypothetical protein  50 
 
 
209 aa  100  8e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.421094 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4899  hypothetical protein  41.82 
 
 
205 aa  100  9e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3864  flavoprotein oxygenase  43.64 
 
 
209 aa  100  9e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2151  hypothetical protein  45.08 
 
 
203 aa  99.8  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0492  flavoprotein oxygenase  42.73 
 
 
209 aa  100  1e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3787  hypothetical protein  44.07 
 
 
140 aa  99.8  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2049  hypothetical protein  39.64 
 
 
205 aa  99.8  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7205  flavin reductase domain protein FMN-binding  41.67 
 
 
209 aa  99.4  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.981743  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1820  hypothetical protein  47.22 
 
 
207 aa  99.4  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6051  hypothetical protein  39.34 
 
 
218 aa  99  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.52164  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0498  flavoprotein oxygenase  43.64 
 
 
209 aa  98.6  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2316  hypothetical protein  46.23 
 
 
201 aa  98.6  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0978794 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2591  flavin reductase domain protein FMN-binding  46.23 
 
 
201 aa  98.6  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.40537 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4215  hypothetical protein  46.36 
 
 
184 aa  98.2  3e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.380151  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4267  hypothetical protein  45.37 
 
 
221 aa  98.2  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.308533  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2270  hypothetical protein  42.5 
 
 
201 aa  97.8  4e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4462  hypothetical protein  41.67 
 
 
209 aa  97.8  5e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.70984  normal  0.854602 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6898  hypothetical protein  45.13 
 
 
203 aa  97.4  6e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.800563  normal  0.546229 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2943  hypothetical protein  44.25 
 
 
216 aa  97.4  6e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0863  flavin reductase domain protein FMN-binding  43.64 
 
 
209 aa  97.1  7e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6039  hypothetical protein  46.73 
 
 
206 aa  97.1  7e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.8711  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1051  hypothetical protein  42.74 
 
 
230 aa  96.7  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.106662  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1646  hypothetical protein  40.83 
 
 
212 aa  96.3  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2703  hypothetical protein  43.22 
 
 
206 aa  96.3  1e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.113365  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4312  hypothetical protein  42.48 
 
 
205 aa  95.5  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6295  hypothetical protein  40 
 
 
208 aa  94.7  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.19889  normal  0.194247 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2217  hypothetical protein  40.83 
 
 
207 aa  95.1  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0565603 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4071  hypothetical protein  40.54 
 
 
205 aa  94.4  5e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.261199  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1068  hypothetical protein  44.17 
 
 
203 aa  93.2  9e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0726405  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3064  hypothetical protein  44 
 
 
209 aa  93.2  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.883432  normal  0.0355565 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1032  hypothetical protein  44.17 
 
 
203 aa  93.2  1e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.863891  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3621  hypothetical protein  42.86 
 
 
220 aa  87.8  4e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0053  hypothetical protein  40.5 
 
 
210 aa  85.9  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.234931  normal  0.568294 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43240  hypothetical protein  41 
 
 
202 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.531737 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3627  hypothetical protein  42 
 
 
202 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.174937  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0627  flavin reductase domain-containing protein  41.18 
 
 
194 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0267  hypothetical protein  38.52 
 
 
209 aa  81.3  0.000000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0889  hypothetical protein  42.11 
 
 
200 aa  81.3  0.000000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.581973  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2435  hypothetical protein  37.96 
 
 
211 aa  80.9  0.000000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2366  flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family-like protein  44.9 
 
 
203 aa  80.1  0.000000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.460598  normal  0.14144 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1479  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  45.26 
 
 
206 aa  80.1  0.000000000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0487  flavin reductase domain-containing protein  39.5 
 
 
194 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.660755  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1838  hypothetical protein  39.5 
 
 
194 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0762  flavin reductase domain protein FMN-binding  38.89 
 
 
203 aa  78.2  0.00000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2487  hypothetical protein  44.44 
 
 
203 aa  77.8  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.239635  normal  0.0244852 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2444  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  43.16 
 
 
199 aa  77.8  0.00000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1981  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  42 
 
 
197 aa  77  0.00000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.780004  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1083  hypothetical protein  42.42 
 
 
204 aa  76.6  0.0000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.2808  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2452  hypothetical protein  39 
 
 
201 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.108576  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00876  conserved hypothetical protein  45.54 
 
 
313 aa  74.7  0.0000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.799702  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2164  hypothetical protein  39.05 
 
 
200 aa  73.2  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.341865  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5507  hypothetical protein  36.63 
 
 
203 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000065263  unclonable  4.40126e-26 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2683  hypothetical protein  34.34 
 
 
203 aa  72.4  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2740  hypothetical protein  34.34 
 
 
203 aa  72.4  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>