208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_2316 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_2316  hypothetical protein  100 
 
 		 201 aa  408  1e-113  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0978794 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2591  flavin reductase domain protein FMN-binding  100 
 
 		 201 aa  408  1e-113  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.40537 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2270  hypothetical protein  97.01 
 
 		 201 aa  398  9.999999999999999e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6295  hypothetical protein  75.74 
 
 		 208 aa  321  5e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.19889  normal  0.194247 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7205  flavin reductase domain protein FMN-binding  74.75 
 
 		 209 aa  320  8e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.981743  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0267  hypothetical protein  72.91 
 
 		 209 aa  303  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1646  hypothetical protein  50.25 
 
 		 212 aa  195  4.0000000000000005e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1032  hypothetical protein  50.5 
 
 		 203 aa  192  3e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.863891  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2151  hypothetical protein  50 
 
 		 203 aa  191  8e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2631  hypothetical protein  50.25 
 
 		 202 aa  190  1e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1068  hypothetical protein  50 
 
 		 203 aa  189  2.9999999999999997e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0726405  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0832  hypothetical protein  48.48 
 
 		 206 aa  185  3e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.158602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6898  hypothetical protein  50.5 
 
 		 203 aa  184  6e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.800563  normal  0.546229 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2682  hypothetical protein  51.58 
 
 		 205 aa  182  2.0000000000000003e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2041  flavin reductase domain protein FMN-binding  46.77 
 
 		 203 aa  181  5.0000000000000004e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0801878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6051  hypothetical protein  48.48 
 
 		 218 aa  181  6e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.52164  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1039  hypothetical protein  48.76 
 
 		 201 aa  180  1e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.708626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1359  hypothetical protein  48.24 
 
 		 208 aa  179  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.262276  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2943  hypothetical protein  50 
 
 		 216 aa  179  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2221  hypothetical protein  46.5 
 
 		 201 aa  179  4e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.378667  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1150  flavoprotein oxygenase  45.27 
 
 		 207 aa  178  4.999999999999999e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.462825 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0053  hypothetical protein  49 
 
 		 210 aa  177  5.999999999999999e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.234931  normal  0.568294 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4325  hypothetical protein  48.76 
 
 		 201 aa  178  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.590963 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1469  flavoprotein oxygenase  48.02 
 
 		 212 aa  177  7e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1842  hypothetical protein  45.77 
 
 		 203 aa  177  9e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0994516  normal  0.0170416 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1398  hypothetical protein  48.26 
 
 		 201 aa  176  1e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.709674  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1820  hypothetical protein  49.74 
 
 		 207 aa  177  1e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4414  hypothetical protein  48.76 
 
 		 201 aa  177  1e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4219  hypothetical protein  47.37 
 
 		 205 aa  176  2e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.269485 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4899  hypothetical protein  46.46 
 
 		 205 aa  176  2e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0081  hypothetical protein  49.21 
 
 		 209 aa  176  2e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4312  hypothetical protein  47.74 
 
 		 205 aa  176  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4002  hypothetical protein  46.5 
 
 		 207 aa  175  4e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.548606  normal  0.130195 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4462  hypothetical protein  47.5 
 
 		 209 aa  174  7e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.70984  normal  0.854602 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4298  hypothetical protein  45.5 
 
 		 207 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2217  hypothetical protein  45.73 
 
 		 207 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0565603 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4071  hypothetical protein  45.79 
 
 		 205 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.261199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3466  hypothetical protein  48.74 
 
 		 209 aa  172  3.9999999999999995e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.421094 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2049  hypothetical protein  43.72 
 
 		 205 aa  168  4e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2703  hypothetical protein  47.89 
 
 		 206 aa  168  5e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.113365  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1011  hypothetical protein  45.45 
 
 		 202 aa  167  9e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000116177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1057  hypothetical protein  45 
 
 		 200 aa  167  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.535631 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1899  hypothetical protein  49.43 
 
 		 202 aa  164  5.9999999999999996e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.843142  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0863  flavin reductase domain protein FMN-binding  44 
 
 		 209 aa  164  5.9999999999999996e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1051  hypothetical protein  45.79 
 
 		 230 aa  164  9e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.106662  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1133  hypothetical protein  45.27 
 
 		 208 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.311037 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3626  flavoprotein oxygenase  42.5 
 
 		 209 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1122  hypothetical protein  44.78 
 
 		 221 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0492  flavoprotein oxygenase  43.78 
 
 		 209 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3355  flavoprotein oxygenase  43.28 
 
 		 210 aa  161  8.000000000000001e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.522125  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4267  hypothetical protein  45.73 
 
 		 221 aa  160  1e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.308533  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02220  hypothetical protein  43.23 
 
 		 208 aa  160  1e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.686893  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0498  flavoprotein oxygenase  43.5 
 
 		 209 aa  160  1e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0502  flavoprotein oxygenase  43.28 
 
 		 208 aa  159  2e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0503  flavoprotein oxygenase  44.27 
 
 		 208 aa  159  2e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6039  hypothetical protein  46.23 
 
 		 206 aa  158  4e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.8711  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04002  nitrilotriacetate monooxygenase component B  44.74 
 
 		 209 aa  157  8e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1242  hypothetical protein  44.28 
 
 		 208 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1215  hypothetical protein  44.28 
 
 		 208 aa  156  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3528  flavoprotein oxygenase  42.29 
 
 		 208 aa  156  2e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3989  flavoprotein oxygenase  42.29 
 
 		 209 aa  155  4e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3864  flavoprotein oxygenase  42.29 
 
 		 209 aa  155  4e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0452  flavoprotein oxygenase  42.29 
 
 		 209 aa  155  4e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0458  flavoprotein oxygenase  42.29 
 
 		 209 aa  155  4e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3807  flavin reductase domain protein FMN-binding  42.29 
 
 		 209 aa  154  8e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2269  hypothetical protein  42 
 
 		 229 aa  154  1e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0761  hypothetical protein  43.78 
 
 		 208 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2736  hypothetical protein  41.5 
 
 		 230 aa  153  2e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2679  hypothetical protein  41.5 
 
 		 230 aa  153  2e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2065  conserved hypothetical FMN binding protein  42.03 
 
 		 201 aa  148  6e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.111591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3064  hypothetical protein  46.49 
 
 		 209 aa  147  9e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.883432  normal  0.0355565 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2435  hypothetical protein  41.62 
 
 		 211 aa  145  3e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0627  flavin reductase domain-containing protein  43.56 
 
 		 194 aa  144  9e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2319  hypothetical protein  42.72 
 
 		 201 aa  143  1e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1838  hypothetical protein  43.07 
 
 		 194 aa  142  2e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3209  flavin reductase-like, FMN-binding  41.75 
 
 		 201 aa  142  2e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0487  flavin reductase domain-containing protein  43.07 
 
 		 194 aa  142  5e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.660755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4215  hypothetical protein  41.21 
 
 		 184 aa  138  3.9999999999999997e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.380151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4414  hypothetical protein  39.41 
 
 		 218 aa  136  2e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.629184  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3621  hypothetical protein  42.51 
 
 		 220 aa  136  2e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5792  hypothetical protein  39.9 
 
 		 218 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.926616 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6309  hypothetical protein  38.19 
 
 		 207 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07162  conserved hypothetical protein  41.94 
 
 		 241 aa  127  1.0000000000000001e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.574629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3787  hypothetical protein  55.08 
 
 		 140 aa  122  5e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1479  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  38.83 
 
 		 206 aa  121  8e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2366  flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family-like protein  43.65 
 
 		 203 aa  120  9.999999999999999e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.460598  normal  0.14144 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2444  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  41.3 
 
 		 199 aa  120  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2487  hypothetical protein  40.89 
 
 		 203 aa  120  9.999999999999999e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.239635  normal  0.0244852 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1083  hypothetical protein  32.8 
 
 		 204 aa  112  3e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.2808  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0889  hypothetical protein  33.67 
 
 		 200 aa  112  3e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.581973  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01680  hypothetical protein  34 
 
 		 292 aa  112  4.0000000000000004e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_33014  predicted protein  40.11 
 
 		 436 aa  111  6e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.111303  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5247  hypothetical protein  39.18 
 
 		 216 aa  108  5e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.59199 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3293  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  41.18 
 
 		 216 aa  107  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.902968  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6314  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  35.98 
 
 		 294 aa  106  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2857  hypothetical protein  35.29 
 
 		 200 aa  104  9e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5507  hypothetical protein  34.74 
 
 		 203 aa  104  9e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000065263  unclonable  4.40126e-26 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1593  hypothetical protein  32.98 
 
 		 291 aa  104  9e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0762  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.15 
 
 		 203 aa  103  2e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0602  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  35.94 
 
 		 217 aa  103  2e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.413112 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>