189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2049 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_2049  hypothetical protein  100 
 
 		 205 aa  428  1e-119  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1051  hypothetical protein  64 
 
 		 230 aa  276  1e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.106662  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1150  flavoprotein oxygenase  62 
 
 		 207 aa  266  1e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.462825 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2703  hypothetical protein  60 
 
 		 206 aa  266  2e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.113365  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2682  hypothetical protein  61 
 
 		 205 aa  265  4e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0081  hypothetical protein  60.19 
 
 		 209 aa  260  8.999999999999999e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4002  hypothetical protein  57.07 
 
 		 207 aa  256  1e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.548606  normal  0.130195 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4298  hypothetical protein  56.59 
 
 		 207 aa  256  2e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4899  hypothetical protein  58.13 
 
 		 205 aa  254  5e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1359  hypothetical protein  58.5 
 
 		 208 aa  254  7e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.262276  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4462  hypothetical protein  58.05 
 
 		 209 aa  253  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.70984  normal  0.854602 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0503  flavoprotein oxygenase  58.74 
 
 		 208 aa  253  1.0000000000000001e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0502  flavoprotein oxygenase  58.25 
 
 		 208 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0492  flavoprotein oxygenase  58.54 
 
 		 209 aa  252  3e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4219  hypothetical protein  58.13 
 
 		 205 aa  252  3e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.269485 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0498  flavoprotein oxygenase  57.71 
 
 		 209 aa  252  3e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1011  hypothetical protein  58.5 
 
 		 202 aa  251  5.000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000116177  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0863  flavin reductase domain protein FMN-binding  58 
 
 		 209 aa  251  6e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4071  hypothetical protein  57.64 
 
 		 205 aa  250  1e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.261199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02220  hypothetical protein  55.88 
 
 		 208 aa  249  2e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.686893  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3528  flavoprotein oxygenase  57.28 
 
 		 208 aa  249  2e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3355  flavoprotein oxygenase  57.43 
 
 		 210 aa  248  4e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.522125  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1039  hypothetical protein  56 
 
 		 201 aa  246  1e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.708626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3864  flavoprotein oxygenase  57.14 
 
 		 209 aa  245  3e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04002  nitrilotriacetate monooxygenase component B  54.5 
 
 		 209 aa  245  4e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3989  flavoprotein oxygenase  56.65 
 
 		 209 aa  245  4e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0452  flavoprotein oxygenase  56.65 
 
 		 209 aa  244  4e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0458  flavoprotein oxygenase  56.65 
 
 		 209 aa  245  4e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3807  flavin reductase domain protein FMN-binding  56.65 
 
 		 209 aa  244  9e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3626  flavoprotein oxygenase  55.17 
 
 		 209 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2217  hypothetical protein  56 
 
 		 207 aa  242  3e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0565603 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4414  hypothetical protein  54 
 
 		 201 aa  238  5e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6039  hypothetical protein  54.19 
 
 		 206 aa  236  1e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.8711  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0832  hypothetical protein  55 
 
 		 206 aa  236  1e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.158602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1469  flavoprotein oxygenase  55.12 
 
 		 212 aa  236  2e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1398  hypothetical protein  53 
 
 		 201 aa  236  2e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.709674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4325  hypothetical protein  53 
 
 		 201 aa  236  2e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.590963 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0053  hypothetical protein  53 
 
 		 210 aa  231  4.0000000000000004e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.234931  normal  0.568294 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6051  hypothetical protein  51.26 
 
 		 218 aa  230  1e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.52164  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1820  hypothetical protein  52.91 
 
 		 207 aa  228  3e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3466  hypothetical protein  51.72 
 
 		 209 aa  224  7e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.421094 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1242  hypothetical protein  50 
 
 		 208 aa  216  2e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1215  hypothetical protein  50 
 
 		 208 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6898  hypothetical protein  51 
 
 		 203 aa  214  8e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.800563  normal  0.546229 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2943  hypothetical protein  49.76 
 
 		 216 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0761  hypothetical protein  49.51 
 
 		 208 aa  212  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1122  hypothetical protein  49.51 
 
 		 221 aa  212  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1133  hypothetical protein  49.02 
 
 		 208 aa  210  1e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.311037 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4312  hypothetical protein  49.76 
 
 		 205 aa  209  2e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6309  hypothetical protein  48.53 
 
 		 207 aa  200  9e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1899  hypothetical protein  51.05 
 
 		 202 aa  196  2.0000000000000003e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.843142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4215  hypothetical protein  47.74 
 
 		 184 aa  196  3e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.380151  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2631  hypothetical protein  49 
 
 		 202 aa  194  5.000000000000001e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4267  hypothetical protein  47.5 
 
 		 221 aa  194  7e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.308533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3787  hypothetical protein  66.17 
 
 		 140 aa  188  5.999999999999999e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1057  hypothetical protein  46.39 
 
 		 200 aa  181  9.000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.535631 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2151  hypothetical protein  48.33 
 
 		 203 aa  181  1e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0627  flavin reductase domain-containing protein  47.24 
 
 		 194 aa  177  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2065  conserved hypothetical FMN binding protein  44.17 
 
 		 201 aa  175  3e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.111591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2319  hypothetical protein  47.09 
 
 		 201 aa  176  3e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1842  hypothetical protein  45.86 
 
 		 203 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0994516  normal  0.0170416 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1032  hypothetical protein  46.11 
 
 		 203 aa  171  5e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.863891  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0487  flavin reductase domain-containing protein  45.23 
 
 		 194 aa  170  1e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.660755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3209  flavin reductase-like, FMN-binding  45.63 
 
 		 201 aa  169  2e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2041  flavin reductase domain protein FMN-binding  45.66 
 
 		 203 aa  169  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0801878  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1068  hypothetical protein  45.56 
 
 		 203 aa  169  4e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0726405  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2316  hypothetical protein  43.72 
 
 		 201 aa  168  4e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0978794 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1838  hypothetical protein  44.72 
 
 		 194 aa  169  4e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2591  flavin reductase domain protein FMN-binding  43.72 
 
 		 201 aa  168  4e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.40537 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2270  hypothetical protein  43.81 
 
 		 201 aa  167  1e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6295  hypothetical protein  42.56 
 
 		 208 aa  166  2e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.19889  normal  0.194247 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7205  flavin reductase domain protein FMN-binding  42.56 
 
 		 209 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.981743  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1646  hypothetical protein  45.26 
 
 		 212 aa  164  8e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0267  hypothetical protein  43.07 
 
 		 209 aa  162  3e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2221  hypothetical protein  39 
 
 		 201 aa  160  9e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.378667  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3621  hypothetical protein  43.65 
 
 		 220 aa  154  1e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07162  conserved hypothetical protein  41.27 
 
 		 241 aa  138  6e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.574629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3064  hypothetical protein  40 
 
 		 209 aa  137  1e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.883432  normal  0.0355565 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2736  hypothetical protein  41.45 
 
 		 230 aa  133  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2679  hypothetical protein  41.45 
 
 		 230 aa  133  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2269  hypothetical protein  42.13 
 
 		 229 aa  129  3e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2444  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  36.75 
 
 		 199 aa  118  4.9999999999999996e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4414  hypothetical protein  36.36 
 
 		 218 aa  118  6e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.629184  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5247  hypothetical protein  38.58 
 
 		 216 aa  117  7.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.59199 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5792  hypothetical protein  35.83 
 
 		 218 aa  115  5e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.926616 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2435  hypothetical protein  38.54 
 
 		 211 aa  115  6e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0889  hypothetical protein  36.05 
 
 		 200 aa  113  3e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.581973  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2366  flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family-like protein  37.63 
 
 		 203 aa  112  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.460598  normal  0.14144 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3293  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  35.93 
 
 		 216 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.902968  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1786  flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family-like protein  37.27 
 
 		 228 aa  111  6e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.60124  normal  0.96149 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1916  hypothetical protein  34.95 
 
 		 203 aa  111  7.000000000000001e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0405  hypothetical protein  35.29 
 
 		 207 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1981  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  36.31 
 
 		 197 aa  110  1.0000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.780004  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2914  hypothetical protein  38.56 
 
 		 203 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.939622 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0602  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  34.55 
 
 		 217 aa  109  3e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.413112 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2487  hypothetical protein  37.1 
 
 		 203 aa  109  3e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.239635  normal  0.0244852 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2857  hypothetical protein  36.36 
 
 		 200 aa  108  4.0000000000000004e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0762  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.22 
 
 		 203 aa  107  9.000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1083  hypothetical protein  35.64 
 
 		 204 aa  107  9.000000000000001e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.2808  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1479  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  37.63 
 
 		 206 aa  107  1e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>