211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5134 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011368  Rleg2_5134  hypothetical protein  100 
 
 
220 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7599  hypothetical protein  86.36 
 
 
220 aa  401  1e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5370  flavin reductase domain protein FMN-binding  85.58 
 
 
223 aa  390  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.480853 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3148  flavin reductase-like, FMN-binding  56.93 
 
 
219 aa  244  6.999999999999999e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2915  flavin reductase domain protein FMN-binding  52.5 
 
 
203 aa  216  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2654  flavin reductase domain protein FMN-binding  50.5 
 
 
203 aa  209  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0602  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  44.98 
 
 
217 aa  183  2.0000000000000003e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.413112 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2631  hypothetical protein  43.14 
 
 
221 aa  174  7e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.300035  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4644  hypothetical protein  39.63 
 
 
231 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5253  flavin reductase domain protein FMN-binding  41.97 
 
 
196 aa  161  8.000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.504075 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0090  flavin reductase domain-containing protein  43.01 
 
 
210 aa  161  9e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00316855 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1365  hypothetical protein  41.97 
 
 
196 aa  160  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.300021  normal  0.0686539 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5906  hypothetical protein  40.41 
 
 
195 aa  160  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1051  flavin reductase-like, FMN-binding  39.2 
 
 
213 aa  158  6e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0886076 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2914  hypothetical protein  39.79 
 
 
203 aa  150  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.939622 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5786  hypothetical protein  39.49 
 
 
208 aa  150  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.756136  hitchhiker  0.00296108 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2070  hypothetical protein  45.99 
 
 
202 aa  144  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.224794 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1786  flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family-like protein  35.92 
 
 
228 aa  143  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.60124  normal  0.96149 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3465  hypothetical protein  44.92 
 
 
202 aa  142  4e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3110  hypothetical protein  44.92 
 
 
202 aa  142  4e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0966495  normal  0.11855 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0405  hypothetical protein  40.21 
 
 
207 aa  142  6e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5124  flavin reductase-like, FMN-binding  34.01 
 
 
216 aa  137  8.999999999999999e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.178532 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1083  hypothetical protein  37.43 
 
 
204 aa  137  1e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.2808  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1479  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  35.41 
 
 
206 aa  136  3.0000000000000003e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2683  hypothetical protein  36.36 
 
 
203 aa  133  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5247  hypothetical protein  36.82 
 
 
216 aa  133  1.9999999999999998e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.59199 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2740  hypothetical protein  36.36 
 
 
203 aa  133  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43240  hypothetical protein  36.36 
 
 
202 aa  129  3e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.531737 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1916  hypothetical protein  35.75 
 
 
203 aa  128  6e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5507  hypothetical protein  34.01 
 
 
203 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000065263  unclonable  4.40126e-26 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0889  hypothetical protein  34.34 
 
 
200 aa  127  1.0000000000000001e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.581973  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3627  hypothetical protein  35.86 
 
 
202 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.174937  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0364  nitrilotriacetate monooxygenase component B  34.67 
 
 
205 aa  125  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0945  hypothetical protein  33.8 
 
 
210 aa  125  5e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5444  hypothetical protein  33.5 
 
 
203 aa  125  6e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0011476  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5005  flavin reductase  34.01 
 
 
203 aa  124  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000501887  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5021  flavin reductase  34.01 
 
 
203 aa  124  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000378469  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5120  putative flavin reductase  32.99 
 
 
203 aa  124  1e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0364817  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3843  hypothetical protein  32.99 
 
 
203 aa  123  2e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000198663  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5447  hypothetical protein  33.5 
 
 
203 aa  122  3e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000739812  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5500  hypothetical protein  33.5 
 
 
203 aa  122  4e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000371904  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5171  hypothetical protein  33.5 
 
 
203 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000552892  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5565  hypothetical protein  33.5 
 
 
203 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000029994  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5413  hypothetical protein  33.5 
 
 
203 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.81917e-62 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5933  hypothetical protein  31.82 
 
 
209 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0762  flavin reductase domain protein FMN-binding  37.63 
 
 
203 aa  120  1.9999999999999998e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2452  hypothetical protein  32.5 
 
 
201 aa  118  6e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.108576  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2487  hypothetical protein  35 
 
 
203 aa  117  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.239635  normal  0.0244852 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2366  flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family-like protein  34.67 
 
 
203 aa  116  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.460598  normal  0.14144 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2815  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  35.05 
 
 
219 aa  116  3e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.112665  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6314  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  31.34 
 
 
294 aa  113  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4410  hypothetical protein  31.82 
 
 
209 aa  113  3e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01680  hypothetical protein  33.9 
 
 
292 aa  112  6e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3276  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.43 
 
 
295 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_78913  flavoprotein oxygenase  31.72 
 
 
287 aa  108  8.000000000000001e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4263  flavin reductase domain-containing protein  34.33 
 
 
210 aa  107  1e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.644656 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2164  hypothetical protein  33.85 
 
 
200 aa  105  4e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.341865  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2857  hypothetical protein  32.32 
 
 
200 aa  104  1e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1899  hypothetical protein  39.19 
 
 
202 aa  103  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.843142  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0075  hypothetical protein  29.63 
 
 
196 aa  103  3e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000447764  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1593  hypothetical protein  32.58 
 
 
291 aa  101  9e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1981  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  33.7 
 
 
197 aa  100  1e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.780004  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0500  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.07 
 
 
294 aa  100  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00876  conserved hypothetical protein  31.09 
 
 
313 aa  99.8  3e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.799702  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2444  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  31.79 
 
 
199 aa  99.8  3e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3293  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  30.54 
 
 
216 aa  99.8  3e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.902968  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3626  flavoprotein oxygenase  31.76 
 
 
209 aa  99  5e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2065  conserved hypothetical FMN binding protein  32.96 
 
 
201 aa  99  5e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.111591  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3064  hypothetical protein  29.1 
 
 
209 aa  99  5e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.883432  normal  0.0355565 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2435  hypothetical protein  26.74 
 
 
211 aa  98.2  9e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2319  hypothetical protein  32.78 
 
 
201 aa  97.8  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04002  nitrilotriacetate monooxygenase component B  32.31 
 
 
209 aa  97.4  1e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02220  hypothetical protein  32.53 
 
 
208 aa  97.1  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.686893  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0863  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.12 
 
 
209 aa  97.1  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02124  hypothetical protein  32.73 
 
 
169 aa  95.9  4e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2703  hypothetical protein  33.12 
 
 
206 aa  95.5  5e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.113365  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0412  hypothetical protein  29.29 
 
 
206 aa  95.1  8e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.567346  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3209  flavin reductase-like, FMN-binding  32.22 
 
 
201 aa  94.4  1e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1011  hypothetical protein  32.9 
 
 
202 aa  94.7  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000116177  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2920  hypothetical protein  30.3 
 
 
202 aa  93.6  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1398  hypothetical protein  29.23 
 
 
201 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.709674  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4462  hypothetical protein  31.61 
 
 
209 aa  94  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.70984  normal  0.854602 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0053  hypothetical protein  33.33 
 
 
210 aa  93.6  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.234931  normal  0.568294 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4325  hypothetical protein  29.23 
 
 
201 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.590963 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2049  hypothetical protein  28.99 
 
 
205 aa  93.2  3e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1646  hypothetical protein  31.46 
 
 
212 aa  92.8  4e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07162  conserved hypothetical protein  30.98 
 
 
241 aa  92  6e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.574629  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3355  flavoprotein oxygenase  30.16 
 
 
210 aa  92  6e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.522125  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2151  hypothetical protein  31.96 
 
 
203 aa  91.7  8e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4414  hypothetical protein  28.21 
 
 
201 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4215  hypothetical protein  36.88 
 
 
184 aa  91.3  1e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.380151  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0452  flavoprotein oxygenase  30.16 
 
 
209 aa  91.3  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3807  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.16 
 
 
209 aa  90.5  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1051  hypothetical protein  31.18 
 
 
230 aa  90.1  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.106662  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3989  flavoprotein oxygenase  29.63 
 
 
209 aa  89.7  3e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4002  hypothetical protein  30.32 
 
 
207 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.548606  normal  0.130195 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3528  flavoprotein oxygenase  29.63 
 
 
208 aa  89.7  3e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0458  flavoprotein oxygenase  29.63 
 
 
209 aa  89.7  3e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4298  hypothetical protein  28.89 
 
 
207 aa  89.4  4e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3621  hypothetical protein  30.43 
 
 
220 aa  89.4  4e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>